MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Geobacillus thermoglucosidasius C56-YS93 plasmid pGEOTH02

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015661	GTTA	2	8	91	98	25 %	50 %	25 %	0 %	336237225
2	NC_015661	GAGG	2	8	312	319	25 %	0 %	75 %	0 %	336237225
3	NC_015661	TAAA	2	8	671	678	75 %	25 %	0 %	0 %	336237225
4	NC_015661	CTAT	2	8	781	788	25 %	50 %	0 %	25 %	336237225
5	NC_015661	TAAG	2	8	845	852	50 %	25 %	25 %	0 %	336237225
6	NC_015661	CAAG	2	8	1302	1309	50 %	0 %	25 %	25 %	336237226
7	NC_015661	ATAA	2	8	1808	1815	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015661	TTCC	2	8	1851	1858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015661	GTCT	2	8	2024	2031	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015661	CGAA	2	8	2034	2041	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015661	TCCA	2	8	2364	2371	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015661	GCTT	2	8	3113	3120	0 %	50 %	25 %	25 %	336237227
13	NC_015661	CAAT	2	8	3677	3684	50 %	25 %	0 %	25 %	336237227
14	NC_015661	ACAA	2	8	3856	3863	75 %	0 %	0 %	25 %	336237227
15	NC_015661	TCTG	2	8	4151	4158	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015661	TAAT	2	8	4253	4260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015661	TCCA	2	8	4467	4474	25 %	25 %	0 %	50 %	336237228
18	NC_015661	TGAT	2	8	5863	5870	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015661	TGTA	2	8	5878	5885	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015661	TACT	2	8	6099	6106	25 %	50 %	0 %	25 %	336237231
21	NC_015661	GAAT	2	8	6148	6155	50 %	25 %	25 %	0 %	336237231
22	NC_015661	CTTT	2	8	6240	6247	0 %	75 %	0 %	25 %	336237231
23	NC_015661	TTTA	2	8	6625	6632	25 %	75 %	0 %	0 %	336237232
24	NC_015661	ACTC	2	8	6884	6891	25 %	25 %	0 %	50 %	336237232
25	NC_015661	TTTC	2	8	6902	6909	0 %	75 %	0 %	25 %	336237232
26	NC_015661	TCAT	2	8	6949	6956	25 %	50 %	0 %	25 %	336237232
27	NC_015661	TCAT	2	8	7024	7031	25 %	50 %	0 %	25 %	336237232
28	NC_015661	TAAC	2	8	7082	7089	50 %	25 %	0 %	25 %	336237232
29	NC_015661	CAAA	2	8	8101	8108	75 %	0 %	0 %	25 %	336237233
30	NC_015661	ATAG	2	8	8299	8306	50 %	25 %	25 %	0 %	336237233
31	NC_015661	CTCA	2	8	8425	8432	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015661	CCGT	2	8	9271	9278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015661	CCAC	2	8	9279	9286	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_015661	ACCA	2	8	9404	9411	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015661	TCAA	2	8	9832	9839	50 %	25 %	0 %	25 %	336237235
36	NC_015661	CATT	2	8	10261	10268	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015661	TAAT	2	8	10333	10340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015661	CTTG	2	8	11053	11060	0 %	50 %	25 %	25 %	336237237
39	NC_015661	AAAG	2	8	11112	11119	75 %	0 %	25 %	0 %	336237237
40	NC_015661	AAAT	2	8	11151	11158	75 %	25 %	0 %	0 %	336237237
41	NC_015661	CTTT	2	8	11398	11405	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015661	CAAA	2	8	11447	11454	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015661	AAAC	2	8	11673	11680	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015661	TTGG	2	8	11991	11998	0 %	50 %	50 %	0 %	336237238
45	NC_015661	GAAG	2	8	12280	12287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015661	TTTC	2	8	12350	12357	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015661	ATTT	2	8	12430	12437	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015661	TATC	2	8	13432	13439	25 %	50 %	0 %	25 %	336237239
49	NC_015661	TAAA	2	8	13504	13511	75 %	25 %	0 %	0 %	336237239
50	NC_015661	CCAT	2	8	13588	13595	25 %	25 %	0 %	50 %	336237239
51	NC_015661	TGAA	2	8	14240	14247	50 %	25 %	25 %	0 %	336237241
52	NC_015661	CTTT	2	8	14402	14409	0 %	75 %	0 %	25 %	336237241
53	NC_015661	GAAA	2	8	14477	14484	75 %	0 %	25 %	0 %	336237241
54	NC_015661	CAAG	2	8	14508	14515	50 %	0 %	25 %	25 %	336237241
55	NC_015661	CGGC	2	8	15187	15194	0 %	0 %	50 %	50 %	336237242
56	NC_015661	AAAC	2	8	15254	15261	75 %	0 %	0 %	25 %	336237242
57	NC_015661	CTTT	2	8	15361	15368	0 %	75 %	0 %	25 %	336237242
58	NC_015661	GCAA	2	8	15662	15669	50 %	0 %	25 %	25 %	336237242
59	NC_015661	CTTG	2	8	16384	16391	0 %	50 %	25 %	25 %	336237242
60	NC_015661	CTTT	2	8	16439	16446	0 %	75 %	0 %	25 %	336237243
61	NC_015661	AATC	2	8	17312	17319	50 %	25 %	0 %	25 %	336237244
62	NC_015661	GTTT	2	8	17592	17599	0 %	75 %	25 %	0 %	336237244
63	NC_015661	AGAA	2	8	17670	17677	75 %	0 %	25 %	0 %	336237244
64	NC_015661	AGCT	2	8	18101	18108	25 %	25 %	25 %	25 %	336237244
65	NC_015661	TGAT	2	8	18117	18124	25 %	50 %	25 %	0 %	336237244
66	NC_015661	GTCC	2	8	18145	18152	0 %	25 %	25 %	50 %	336237244
67	NC_015661	TTCT	2	8	18275	18282	0 %	75 %	0 %	25 %	336237244
68	NC_015661	CCAT	2	8	18505	18512	25 %	25 %	0 %	50 %	336237244
69	NC_015661	TGTA	2	8	18517	18524	25 %	50 %	25 %	0 %	336237244
70	NC_015661	TGAA	2	8	18552	18559	50 %	25 %	25 %	0 %	336237244
71	NC_015661	TGAT	2	8	18951	18958	25 %	50 %	25 %	0 %	336237244

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.