MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Geobacillus thermoglucosidasius C56-YS93 plasmid pGEOTH02

Total Repeats: 256

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015661	AAC	2	6	109	114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336237225
2	NC_015661	TGA	2	6	119	124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237225
3	NC_015661	GAA	2	6	199	204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237225
4	NC_015661	TAT	2	6	219	224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336237225
5	NC_015661	GCT	2	6	252	257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237225
6	NC_015661	GGC	2	6	330	335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336237225
7	NC_015661	TTA	2	6	403	408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336237225
8	NC_015661	ACA	2	6	412	417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336237225
9	NC_015661	ATG	2	6	425	430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237225
10	NC_015661	AGA	2	6	469	474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237225
11	NC_015661	CAA	2	6	515	520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336237225
12	NC_015661	ACA	2	6	551	556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336237225
13	NC_015661	ATT	2	6	567	572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336237225
14	NC_015661	GAA	2	6	586	591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237225
15	NC_015661	TGC	2	6	867	872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237225
16	NC_015661	TTC	2	6	887	892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237225
17	NC_015661	AGG	2	6	978	983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336237225
18	NC_015661	GAA	2	6	1087	1092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237225
19	NC_015661	GAA	2	6	1097	1102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237225
20	NC_015661	AGA	2	6	1209	1214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237225
21	NC_015661	ATA	2	6	1236	1241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336237225
22	NC_015661	TCC	2	6	1254	1259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_015661	TTG	2	6	1292	1297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336237226
24	NC_015661	ATC	2	6	1324	1329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237226
25	NC_015661	CTT	2	6	1332	1337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237226
26	NC_015661	TCT	2	6	1385	1390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237226
27	NC_015661	TCA	2	6	1436	1441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237226
28	NC_015661	CAT	2	6	1549	1554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237226
29	NC_015661	AAT	2	6	1562	1567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336237226
30	NC_015661	CTC	2	6	1691	1696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_015661	TTA	2	6	1757	1762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015661	AAC	2	6	1964	1969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015661	GGA	2	6	1999	2004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015661	ACA	2	6	2076	2081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015661	CAC	2	6	2111	2116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_015661	TCC	2	6	2142	2147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_015661	CTT	2	6	2164	2169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015661	ATA	2	6	2216	2221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015661	ACA	2	6	2304	2309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015661	ATT	2	6	2399	2404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015661	TTG	2	6	2706	2711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336237227
42	NC_015661	TTC	2	6	2720	2725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237227
43	NC_015661	AAT	2	6	2747	2752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336237227
44	NC_015661	TGC	2	6	2771	2776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237227
45	NC_015661	TCG	2	6	2789	2794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237227
46	NC_015661	ACG	2	6	2815	2820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336237227
47	NC_015661	ATC	2	6	2863	2868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237227
48	NC_015661	TTC	2	6	2893	2898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237227
49	NC_015661	GAT	2	6	2920	2925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237227
50	NC_015661	TCG	2	6	3020	3025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237227
51	NC_015661	CCG	2	6	3542	3547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336237227
52	NC_015661	GCT	2	6	3627	3632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237227
53	NC_015661	TCT	2	6	3638	3643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237227
54	NC_015661	TGG	2	6	3720	3725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336237227
55	NC_015661	TTC	2	6	3872	3877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237227
56	NC_015661	TTC	2	6	3904	3909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237227
57	NC_015661	CAA	2	6	3931	3936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336237227
58	NC_015661	CAA	2	6	3986	3991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015661	TAT	2	6	4052	4057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015661	GTG	2	6	4073	4078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015661	GGT	2	6	4080	4085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015661	AAG	2	6	4209	4214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015661	TGC	2	6	4293	4298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015661	TCG	2	6	4553	4558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237228
65	NC_015661	ATC	2	6	4569	4574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237228
66	NC_015661	CAT	2	6	4609	4614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237229
67	NC_015661	TCC	2	6	4615	4620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336237229
68	NC_015661	AAG	2	6	4746	4751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237229
69	NC_015661	CCA	2	6	4895	4900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336237229
70	NC_015661	CAT	2	6	4907	4912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237229
71	NC_015661	ATT	2	6	5061	5066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015661	TAT	2	6	5073	5078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015661	GTT	2	6	5194	5199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336237230
74	NC_015661	AGC	2	6	5236	5241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336237230
75	NC_015661	CAA	2	6	5272	5277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336237230
76	NC_015661	TGA	2	6	5362	5367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237230
77	NC_015661	TCC	2	6	5389	5394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_015661	GAT	2	6	5539	5544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015661	GTA	2	6	5639	5644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015661	GAT	2	6	5701	5706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015661	AAT	2	6	6174	6179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336237231
82	NC_015661	TAT	2	6	6183	6188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336237231
83	NC_015661	TAC	2	6	6268	6273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237231
84	NC_015661	TGA	3	9	6286	6294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237231
85	NC_015661	TAC	2	6	6313	6318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237231
86	NC_015661	CCG	2	6	6383	6388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336237231
87	NC_015661	TCT	2	6	6541	6546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015661	CGT	2	6	6687	6692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237232
89	NC_015661	TTG	2	6	7176	7181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336237232
90	NC_015661	AAG	2	6	7318	7323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237232
91	NC_015661	GTT	2	6	7355	7360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336237232
92	NC_015661	CTT	2	6	7448	7453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237232
93	NC_015661	TAA	2	6	7499	7504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015661	ATC	5	15	7569	7583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015661	TAT	2	6	7602	7607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015661	ATT	2	6	7613	7618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015661	TCA	2	6	7663	7668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015661	CCA	3	9	7701	7709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_015661	GAT	2	6	7760	7765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237233
100	NC_015661	ACG	2	6	7917	7922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336237233
101	NC_015661	AGT	2	6	7958	7963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237233
102	NC_015661	CAG	2	6	8009	8014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336237233
103	NC_015661	GAT	2	6	8069	8074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237233
104	NC_015661	ATG	2	6	8129	8134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237233
105	NC_015661	CAA	2	6	8144	8149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336237233
106	NC_015661	AGA	2	6	8262	8267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237233
107	NC_015661	CAT	2	6	8332	8337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015661	TAT	2	6	8419	8424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015661	TAA	2	6	8450	8455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015661	GCC	2	6	8498	8503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_015661	GTT	2	6	8513	8518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015661	ATA	2	6	8648	8653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015661	TTG	2	6	8659	8664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015661	GCC	2	6	8912	8917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_015661	CCT	2	6	8982	8987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_015661	TAA	2	6	9183	9188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015661	GAT	2	6	9315	9320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015661	CCG	2	6	9342	9347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_015661	TCC	2	6	9551	9556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336237234
120	NC_015661	CTT	2	6	9589	9594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237234
121	NC_015661	GTA	2	6	9601	9606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237234
122	NC_015661	CCG	2	6	9614	9619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336237234
123	NC_015661	ACC	2	6	9720	9725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336237234
124	NC_015661	TCC	2	6	9741	9746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_015661	CCT	2	6	9897	9902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336237236
126	NC_015661	TTC	2	6	9913	9918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237236
127	NC_015661	CAT	2	6	9967	9972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237236
128	NC_015661	ATG	2	6	9995	10000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237236
129	NC_015661	CTT	2	6	10002	10007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237236
130	NC_015661	CTT	2	6	10009	10014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237236
131	NC_015661	TGT	2	6	10026	10031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336237236
132	NC_015661	TAA	2	6	10186	10191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015661	GTT	2	6	10198	10203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015661	TGT	2	6	10306	10311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015661	AAT	2	6	10320	10325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015661	CTA	2	6	10327	10332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015661	AGG	2	6	10370	10375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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255	NC_015661	TAA	2	6	19605	19610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_015661	ATA	3	9	19618	19626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.