MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Geobacillus thermoglucosidasius C56-YS93 plasmid pGEOTH02

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015661	TCC	2	6	1254	1259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_015661	CTC	2	6	1691	1696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_015661	TTA	2	6	1757	1762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015661	AAC	2	6	1964	1969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015661	GGA	2	6	1999	2004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015661	ACA	2	6	2076	2081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015661	CAC	2	6	2111	2116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_015661	TCC	2	6	2142	2147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_015661	CTT	2	6	2164	2169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015661	ATA	2	6	2216	2221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015661	ACA	2	6	2304	2309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015661	ATT	2	6	2399	2404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015661	CAA	2	6	3986	3991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015661	TAT	2	6	4052	4057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015661	GTG	2	6	4073	4078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015661	GGT	2	6	4080	4085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015661	AAG	2	6	4209	4214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015661	TGC	2	6	4293	4298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015661	ATT	2	6	5061	5066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015661	TAT	2	6	5073	5078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015661	TCC	2	6	5389	5394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_015661	GAT	2	6	5539	5544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015661	GTA	2	6	5639	5644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015661	GAT	2	6	5701	5706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015661	TCT	2	6	6541	6546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015661	TAA	2	6	7499	7504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015661	ATC	5	15	7569	7583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015661	TAT	2	6	7602	7607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015661	ATT	2	6	7613	7618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015661	TCA	2	6	7663	7668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015661	CCA	3	9	7701	7709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_015661	CAT	2	6	8332	8337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015661	TAT	2	6	8419	8424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015661	TAA	2	6	8450	8455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015661	GCC	2	6	8498	8503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_015661	GTT	2	6	8513	8518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015661	ATA	2	6	8648	8653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015661	TTG	2	6	8659	8664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015661	GCC	2	6	8912	8917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_015661	CCT	2	6	8982	8987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_015661	TAA	2	6	9183	9188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015661	GAT	2	6	9315	9320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015661	CCG	2	6	9342	9347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_015661	TCC	2	6	9741	9746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_015661	TAA	2	6	10186	10191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015661	GTT	2	6	10198	10203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015661	TGT	2	6	10306	10311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015661	AAT	2	6	10320	10325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015661	CTA	2	6	10327	10332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015661	AGG	2	6	10370	10375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015661	AGA	2	6	11312	11317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015661	GAA	2	6	11345	11350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015661	AAT	2	6	11470	11475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015661	CTC	2	6	11529	11534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_015661	CGT	2	6	11614	11619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015661	CAG	2	6	11795	11800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015661	CCT	2	6	12101	12106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_015661	TAT	2	6	12360	12365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015661	CAC	2	6	12871	12876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_015661	CTT	2	6	13101	13106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015661	GCC	2	6	13186	13191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_015661	TCA	2	6	14112	14117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015661	CAA	2	6	14124	14129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015661	CCT	2	6	19585	19590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_015661	TAA	2	6	19605	19610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015661	ATA	3	9	19618	19626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.