MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Geobacillus thermoglucosidasius C56-YS93 plasmid pGEOTH02

Total Repeats: 190

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015661	AAC	2	6	109	114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336237225
2	NC_015661	TGA	2	6	119	124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237225
3	NC_015661	GAA	2	6	199	204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237225
4	NC_015661	TAT	2	6	219	224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336237225
5	NC_015661	GCT	2	6	252	257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237225
6	NC_015661	GGC	2	6	330	335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336237225
7	NC_015661	TTA	2	6	403	408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336237225
8	NC_015661	ACA	2	6	412	417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336237225
9	NC_015661	ATG	2	6	425	430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237225
10	NC_015661	AGA	2	6	469	474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237225
11	NC_015661	CAA	2	6	515	520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336237225
12	NC_015661	ACA	2	6	551	556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336237225
13	NC_015661	ATT	2	6	567	572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336237225
14	NC_015661	GAA	2	6	586	591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237225
15	NC_015661	TGC	2	6	867	872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237225
16	NC_015661	TTC	2	6	887	892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237225
17	NC_015661	AGG	2	6	978	983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336237225
18	NC_015661	GAA	2	6	1087	1092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237225
19	NC_015661	GAA	2	6	1097	1102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237225
20	NC_015661	AGA	2	6	1209	1214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237225
21	NC_015661	ATA	2	6	1236	1241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336237225
22	NC_015661	TTG	2	6	1292	1297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336237226
23	NC_015661	ATC	2	6	1324	1329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237226
24	NC_015661	CTT	2	6	1332	1337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237226
25	NC_015661	TCT	2	6	1385	1390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237226
26	NC_015661	TCA	2	6	1436	1441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237226
27	NC_015661	CAT	2	6	1549	1554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237226
28	NC_015661	AAT	2	6	1562	1567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336237226
29	NC_015661	TTG	2	6	2706	2711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336237227
30	NC_015661	TTC	2	6	2720	2725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237227
31	NC_015661	AAT	2	6	2747	2752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336237227
32	NC_015661	TGC	2	6	2771	2776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237227
33	NC_015661	TCG	2	6	2789	2794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237227
34	NC_015661	ACG	2	6	2815	2820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336237227
35	NC_015661	ATC	2	6	2863	2868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237227
36	NC_015661	TTC	2	6	2893	2898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237227
37	NC_015661	GAT	2	6	2920	2925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237227
38	NC_015661	TCG	2	6	3020	3025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237227
39	NC_015661	CCG	2	6	3542	3547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336237227
40	NC_015661	GCT	2	6	3627	3632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237227
41	NC_015661	TCT	2	6	3638	3643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237227
42	NC_015661	TGG	2	6	3720	3725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336237227
43	NC_015661	TTC	2	6	3872	3877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237227
44	NC_015661	TTC	2	6	3904	3909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237227
45	NC_015661	CAA	2	6	3931	3936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336237227
46	NC_015661	TCG	2	6	4553	4558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237228
47	NC_015661	ATC	2	6	4569	4574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237228
48	NC_015661	CAT	2	6	4609	4614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237229
49	NC_015661	TCC	2	6	4615	4620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336237229
50	NC_015661	AAG	2	6	4746	4751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237229
51	NC_015661	CCA	2	6	4895	4900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336237229
52	NC_015661	CAT	2	6	4907	4912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237229
53	NC_015661	GTT	2	6	5194	5199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336237230
54	NC_015661	AGC	2	6	5236	5241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336237230
55	NC_015661	CAA	2	6	5272	5277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336237230
56	NC_015661	TGA	2	6	5362	5367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237230
57	NC_015661	AAT	2	6	6174	6179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336237231
58	NC_015661	TAT	2	6	6183	6188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336237231
59	NC_015661	TAC	2	6	6268	6273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237231
60	NC_015661	TGA	3	9	6286	6294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237231
61	NC_015661	TAC	2	6	6313	6318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237231
62	NC_015661	CCG	2	6	6383	6388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336237231
63	NC_015661	CGT	2	6	6687	6692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237232
64	NC_015661	TTG	2	6	7176	7181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336237232
65	NC_015661	AAG	2	6	7318	7323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237232
66	NC_015661	GTT	2	6	7355	7360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336237232
67	NC_015661	CTT	2	6	7448	7453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237232
68	NC_015661	GAT	2	6	7760	7765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237233
69	NC_015661	ACG	2	6	7917	7922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336237233
70	NC_015661	AGT	2	6	7958	7963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237233
71	NC_015661	CAG	2	6	8009	8014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336237233
72	NC_015661	GAT	2	6	8069	8074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237233
73	NC_015661	ATG	2	6	8129	8134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237233
74	NC_015661	CAA	2	6	8144	8149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336237233
75	NC_015661	AGA	2	6	8262	8267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237233
76	NC_015661	TCC	2	6	9551	9556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336237234
77	NC_015661	CTT	2	6	9589	9594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237234
78	NC_015661	GTA	2	6	9601	9606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237234
79	NC_015661	CCG	2	6	9614	9619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336237234
80	NC_015661	ACC	2	6	9720	9725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336237234
81	NC_015661	CCT	2	6	9897	9902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336237236
82	NC_015661	TTC	2	6	9913	9918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237236
83	NC_015661	CAT	2	6	9967	9972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237236
84	NC_015661	ATG	2	6	9995	10000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237236
85	NC_015661	CTT	2	6	10002	10007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237236
86	NC_015661	CTT	2	6	10009	10014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237236
87	NC_015661	TGT	2	6	10026	10031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336237236
88	NC_015661	ATT	2	6	10395	10400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336237237
89	NC_015661	ACT	2	6	10432	10437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237237
90	NC_015661	AGA	2	6	10485	10490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237237
91	NC_015661	GAT	2	6	10537	10542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237237
92	NC_015661	TTG	2	6	10613	10618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336237237
93	NC_015661	TAT	2	6	10635	10640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336237237
94	NC_015661	TTC	2	6	10656	10661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237237
95	NC_015661	AAT	2	6	10708	10713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336237237
96	NC_015661	ATG	2	6	10745	10750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237237
97	NC_015661	TTA	2	6	10796	10801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336237237
98	NC_015661	AGA	2	6	10878	10883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237237
99	NC_015661	AAT	2	6	10939	10944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336237237
100	NC_015661	AAT	2	6	10948	10953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336237237
101	NC_015661	ATA	2	6	12049	12054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336237238
102	NC_015661	CTC	2	6	12077	12082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336237238
103	NC_015661	TGC	2	6	13387	13392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237239
104	NC_015661	ATT	2	6	13616	13621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336237239
105	NC_015661	TCT	2	6	13639	13644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237239
106	NC_015661	TGT	2	6	13646	13651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336237239
107	NC_015661	ATA	2	6	13749	13754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336237240
108	NC_015661	ATA	2	6	13831	13836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336237240
109	NC_015661	ATC	2	6	13876	13881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237240
110	NC_015661	AGG	2	6	13968	13973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336237240
111	NC_015661	GCA	2	6	14003	14008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336237240
112	NC_015661	GAT	2	6	14179	14184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237241
113	NC_015661	TCA	2	6	14195	14200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237241
114	NC_015661	TGA	2	6	14249	14254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237241
115	NC_015661	TCT	2	6	14486	14491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237241
116	NC_015661	ATC	2	6	14582	14587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237241
117	NC_015661	CTT	2	6	14652	14657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237241
118	NC_015661	TCG	2	6	14716	14721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237241
119	NC_015661	TTC	2	6	14803	14808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237241
120	NC_015661	GAT	2	6	14844	14849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237241
121	NC_015661	ATG	2	6	14885	14890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237241
122	NC_015661	AGC	2	6	14987	14992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336237241
123	NC_015661	CCT	2	6	15043	15048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336237242
124	NC_015661	GAA	2	6	15130	15135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237242
125	NC_015661	CGT	2	6	15148	15153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237242
126	NC_015661	CTG	2	6	15215	15220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237242
127	NC_015661	GCG	2	6	15228	15233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336237242
128	NC_015661	TAA	2	6	15308	15313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336237242
129	NC_015661	ATG	2	6	15345	15350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237242
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.