MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Geobacillus thermoglucosidasius C56-YS93 chromosome

Total Repeats: 302

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015660	TTTTAT	2	12	1927	1938	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015660	GCTGAA	2	12	10643	10654	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015660	TGCGTC	2	12	12592	12603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015660	ATTTTT	2	12	23653	23664	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015660	AGAAAA	2	12	25046	25057	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015660	TTCTAT	2	12	27317	27328	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_015660	TTTTTG	2	12	51086	51097	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015660	ATTCTA	2	12	56664	56675	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_015660	GATGTT	2	12	61916	61927	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015660	AAGAAA	2	12	89280	89291	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015660	TGCGTC	2	12	91382	91393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015660	TGCGTC	2	12	97413	97424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015660	AGCGAA	2	12	99468	99479	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015660	AGTCAA	2	12	100913	100924	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_015660	GTTTGC	2	12	132741	132752	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015660	TGAAAA	2	12	132788	132799	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015660	CCCTTA	2	12	155262	155273	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015660	TGCGTC	2	12	159123	159134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015660	AGCGAA	2	12	161178	161189	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_015660	TAAAAA	2	12	172238	172249	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015660	TCTTTT	2	12	173846	173857	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_015660	AGTGTA	2	12	175762	175773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015660	ATGATA	2	12	179873	179884	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015660	TTTACG	2	12	193388	193399	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015660	GCGGGA	2	12	198730	198741	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_015660	GAAAAA	2	12	200574	200585	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015660	GCATCG	2	12	200604	200615	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015660	GCTTCC	2	12	231299	231310	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015660	TTGCCG	2	12	233243	233254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015660	GAAAAG	2	12	235185	235196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015660	AGGGAG	2	12	284019	284030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015660	TGTTTC	2	12	302950	302961	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_015660	AGAATT	2	12	309579	309590	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015660	CCTGAT	2	12	316828	316839	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015660	GTTACA	2	12	324186	324197	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_015660	AACTGT	2	12	324323	324334	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015660	TACAAT	2	12	324728	324739	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015660	AAAATA	2	12	329991	330002	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015660	GGAAAT	2	12	341612	341623	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015660	GAAAAA	2	12	347035	347046	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015660	TAATGA	2	12	382565	382576	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015660	TTATAA	2	12	409262	409273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015660	TAAAAT	2	12	420571	420582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015660	AGTCCA	2	12	444998	445009	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015660	TTTTAT	2	12	452507	452518	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015660	GGGGAG	2	12	464075	464086	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015660	GAAAAA	2	12	479499	479510	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015660	GAGAAA	2	12	481635	481646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015660	CGACTC	2	12	493797	493808	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015660	CGAAAA	2	12	498469	498480	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_015660	GTAAAG	2	12	502117	502128	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015660	AAAATA	2	12	502363	502374	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015660	TGGAGT	2	12	510701	510712	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015660	CGAAAA	2	12	511853	511864	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_015660	TATTTT	2	12	517388	517399	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015660	GATGTC	2	12	518499	518510	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_015660	TGGAGT	2	12	524967	524978	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015660	CGAAAA	2	12	526120	526131	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_015660	GAAGGG	2	12	527718	527729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015660	GGTTAG	2	12	529492	529503	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015660	CGAAAA	2	12	529949	529960	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_015660	AGCATT	2	12	535440	535451	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_015660	CTGGAA	2	12	536272	536283	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_015660	AAAATA	2	12	541613	541624	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015660	ATAATT	2	12	556150	556161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015660	AAGAAA	2	12	565589	565600	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015660	AAAAAG	2	12	583711	583722	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015660	TTTGGC	2	12	585330	585341	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_015660	AAAATA	2	12	590155	590166	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015660	ATAATG	2	12	621766	621777	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015660	AAAAGG	2	12	623232	623243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015660	TAAAAT	2	12	632954	632965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015660	GTTATT	2	12	634272	634283	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015660	GCAAAA	2	12	649042	649053	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_015660	CTTTTT	2	12	649744	649755	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_015660	AAAAAT	2	12	656450	656461	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015660	TTTTAT	2	12	661118	661129	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015660	CCTTAA	2	12	668865	668876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015660	TAAATT	2	12	669692	669703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015660	AAAATA	2	12	671300	671311	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015660	TATGAA	2	12	682903	682914	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015660	GAAGGG	2	12	683993	684004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015660	CAATGG	2	12	692550	692561	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_015660	CCAAAA	2	12	697448	697459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015660	GCGGAA	2	12	735031	735042	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_015660	GTGGAG	2	12	747058	747069	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015660	TTTTGA	2	12	763341	763352	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015660	CAAAAA	2	12	765476	765487	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_015660	AACGCA	2	12	789324	789335	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015660	TCAATA	2	12	854524	854535	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_015660	CTTCTA	2	12	876557	876568	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015660	AATAAA	2	12	922419	922430	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015660	TTTATA	2	12	928081	928092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015660	ATCATT	2	12	936532	936543	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_015660	TTTATA	2	12	941598	941609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015660	AATGGA	2	12	943804	943815	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015660	TGTTCC	2	12	952394	952405	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015660	GAGTCT	2	12	1011273	1011284	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_015660	AATGGG	2	12	1033385	1033396	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015660	CTGTTT	2	12	1052296	1052307	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_015660	ATTCAA	2	12	1062626	1062637	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_015660	AATTCA	2	12	1081753	1081764	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_015660	GAAAAA	2	12	1119922	1119933	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015660	ACATTG	2	12	1127709	1127720	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_015660	AAAGTC	2	12	1131471	1131482	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_015660	AAACAG	2	12	1202001	1202012	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_015660	AAAATG	2	12	1205043	1205054	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015660	TCTCAT	2	12	1207663	1207674	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015660	TAAAAA	2	12	1212111	1212122	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015660	TGGCAA	2	12	1216691	1216702	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_015660	GGAAAA	2	12	1242348	1242359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015660	AAGGGC	2	12	1259700	1259711	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_015660	TTGCAT	2	12	1348581	1348592	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_015660	TTACAA	2	12	1349077	1349088	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_015660	TCATAT	2	12	1378414	1378425	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_015660	CCCCTT	2	12	1427346	1427357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_015660	AAAGAG	2	12	1474178	1474189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015660	AATAGA	2	12	1475514	1475525	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015660	GAAAAG	2	12	1488105	1488116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015660	GGAAAT	2	12	1552763	1552774	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015660	GAAAGA	2	12	1554388	1554399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015660	AACGTA	2	12	1570935	1570946	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_015660	TGAAAA	2	12	1587365	1587376	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015660	TGCTTG	2	12	1599526	1599537	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_015660	AGCAAA	2	12	1606646	1606657	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_015660	AGATAA	2	12	1628202	1628213	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015660	CTAACA	2	12	1630112	1630123	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015660	GGGAGA	2	12	1671760	1671771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015660	GTTTTC	2	12	1721764	1721775	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_015660	TTTCAA	2	12	1733811	1733822	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_015660	TTGTTT	2	12	1735809	1735820	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_015660	TTAACT	2	12	3335443	3335454	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
253	NC_015660	TAGTTT	2	12	3335457	3335468	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
254	NC_015660	ATTTTC	2	12	3335615	3335626	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
255	NC_015660	TATATT	2	12	3339783	3339794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_015660	TTTCAA	2	12	3343554	3343565	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
257	NC_015660	TAAAAA	2	12	3347641	3347652	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_015660	TATTTT	2	12	3353287	3353298	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.