MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Geobacillus thermoglucosidasius C56-YS93 chromosome

Total Repeats: 3193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015660	GAAAA	2	10	497	506	80 %	0 %	20 %	0 %	336233547
2	NC_015660	AAGAA	2	10	1586	1595	80 %	0 %	20 %	0 %	336233547
3	NC_015660	AAAAC	2	10	2685	2694	80 %	0 %	0 %	20 %	336233548
4	NC_015660	TAAAA	2	10	3181	3190	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015660	TACGA	2	10	6864	6873	40 %	20 %	20 %	20 %	336233552
6	NC_015660	GGTGA	2	10	7170	7179	20 %	20 %	60 %	0 %	336233552
7	NC_015660	GAAAA	2	10	7452	7461	80 %	0 %	20 %	0 %	336233552
8	NC_015660	TGCAA	2	10	7577	7586	40 %	20 %	20 %	20 %	336233552
9	NC_015660	TAATC	2	10	7787	7796	40 %	40 %	0 %	20 %	336233552
10	NC_015660	AATTA	2	10	9668	9677	60 %	40 %	0 %	0 %	336233553
11	NC_015660	TCGTG	2	10	11753	11762	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_015660	GAAAA	2	10	12262	12271	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015660	TTTAT	2	10	16064	16073	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015660	TAAAA	2	10	16878	16887	80 %	20 %	0 %	0 %	336233554
15	NC_015660	CTATT	2	10	18682	18691	20 %	60 %	0 %	20 %	336233555
16	NC_015660	CCGTT	2	10	20665	20674	0 %	40 %	20 %	40 %	336233557
17	NC_015660	GCTTG	2	10	21218	21227	0 %	40 %	40 %	20 %	336233558
18	NC_015660	GGCAA	2	10	21674	21683	40 %	0 %	40 %	20 %	336233558
19	NC_015660	TTTTA	2	10	22080	22089	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015660	ATGTA	2	10	24406	24415	40 %	40 %	20 %	0 %	336233561
21	NC_015660	TAACG	2	10	25886	25895	40 %	20 %	20 %	20 %	336233562
22	NC_015660	AAAAT	2	10	27490	27499	80 %	20 %	0 %	0 %	336233564
23	NC_015660	GAAAT	2	10	28404	28413	60 %	20 %	20 %	0 %	336233564
24	NC_015660	TCGTG	2	10	32058	32067	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_015660	GAAAA	2	10	32567	32576	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015660	TTTCA	2	10	36906	36915	20 %	60 %	0 %	20 %	336233570
27	NC_015660	GAAAA	2	10	37151	37160	80 %	0 %	20 %	0 %	336233570
28	NC_015660	AGACA	2	10	38970	38979	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015660	GGATT	2	10	39776	39785	20 %	40 %	40 %	0 %	336233572
30	NC_015660	GAAAT	2	10	40322	40331	60 %	20 %	20 %	0 %	336233573
31	NC_015660	GAAAA	2	10	41061	41070	80 %	0 %	20 %	0 %	336233574
32	NC_015660	ATATT	2	10	42820	42829	40 %	60 %	0 %	0 %	336233576
33	NC_015660	CTCTC	2	10	43272	43281	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
34	NC_015660	TAAAA	2	10	43625	43634	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015660	AAAAT	2	10	45632	45641	80 %	20 %	0 %	0 %	336233578
36	NC_015660	GAAAC	2	10	46428	46437	60 %	0 %	20 %	20 %	336233579
37	NC_015660	TGACG	2	10	46879	46888	20 %	20 %	40 %	20 %	336233581
38	NC_015660	AAGAA	2	10	46972	46981	80 %	0 %	20 %	0 %	336233581
39	NC_015660	GAAAA	2	10	49503	49512	80 %	0 %	20 %	0 %	336233583
40	NC_015660	CCGTT	2	10	50587	50596	0 %	40 %	20 %	40 %	336233584
41	NC_015660	GGATG	2	10	52142	52151	20 %	20 %	60 %	0 %	336233587
42	NC_015660	GAGCA	2	10	54441	54450	40 %	0 %	40 %	20 %	336233591
43	NC_015660	ATTGC	2	10	56495	56504	20 %	40 %	20 %	20 %	336233592
44	NC_015660	ATGAA	2	10	56580	56589	60 %	20 %	20 %	0 %	336233592
45	NC_015660	GCATT	2	10	58018	58027	20 %	40 %	20 %	20 %	336233595
46	NC_015660	GGCTG	2	10	58444	58453	0 %	20 %	60 %	20 %	336233596
47	NC_015660	TTTCA	2	10	58498	58507	20 %	60 %	0 %	20 %	336233596
48	NC_015660	GTTTT	2	10	66835	66844	0 %	80 %	20 %	0 %	336233602
49	NC_015660	GGATT	2	10	68352	68361	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015660	CTTTT	2	10	68866	68875	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_015660	TTTGC	2	10	69135	69144	0 %	60 %	20 %	20 %	336233605
52	NC_015660	GTTGC	2	10	69198	69207	0 %	40 %	40 %	20 %	336233605
53	NC_015660	TTCGG	2	10	70698	70707	0 %	40 %	40 %	20 %	336233605
54	NC_015660	CGAGG	2	10	71831	71840	20 %	0 %	60 %	20 %	336233606
55	NC_015660	ATGTT	2	10	72889	72898	20 %	60 %	20 %	0 %	336233607
56	NC_015660	GAAAA	2	10	74268	74277	80 %	0 %	20 %	0 %	336233608
57	NC_015660	CGCAG	2	10	75607	75616	20 %	0 %	40 %	40 %	336233610
58	NC_015660	GCCGG	2	10	76541	76550	0 %	0 %	60 %	40 %	336233610
59	NC_015660	GATAT	2	10	77282	77291	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015660	GAAGA	2	10	78675	78684	60 %	0 %	40 %	0 %	336233612
61	NC_015660	GCGCG	2	10	79477	79486	0 %	0 %	60 %	40 %	336233613
62	NC_015660	GACAA	2	10	82774	82783	60 %	0 %	20 %	20 %	336233616
63	NC_015660	TCGTG	2	10	90725	90734	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_015660	TCGTG	2	10	96755	96764	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_015660	AAAGC	2	10	97550	97559	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_015660	AAAAG	2	10	100798	100807	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015660	ATGAT	2	10	100835	100844	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015660	CCAAT	2	10	101230	101239	40 %	20 %	0 %	40 %	336233624
69	NC_015660	AGGGG	2	10	101409	101418	20 %	0 %	80 %	0 %	336233624
70	NC_015660	TCTGC	2	10	101587	101596	0 %	40 %	20 %	40 %	336233625
71	NC_015660	CTGGA	2	10	104515	104524	20 %	20 %	40 %	20 %	336233627
72	NC_015660	GTTGT	2	10	104906	104915	0 %	60 %	40 %	0 %	336233627
73	NC_015660	AGATG	2	10	104917	104926	40 %	20 %	40 %	0 %	336233627
74	NC_015660	GAAAG	2	10	105124	105133	60 %	0 %	40 %	0 %	336233627
75	NC_015660	TCGAT	2	10	106108	106117	20 %	40 %	20 %	20 %	336233628
76	NC_015660	CAAAA	2	10	106205	106214	80 %	0 %	0 %	20 %	336233628
77	NC_015660	GATTA	2	10	109455	109464	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015660	TGATT	2	10	110576	110585	20 %	60 %	20 %	0 %	336233632
79	NC_015660	GAAAA	2	10	110899	110908	80 %	0 %	20 %	0 %	336233632
80	NC_015660	AAAGG	2	10	111920	111929	60 %	0 %	40 %	0 %	336233633
81	NC_015660	TGAAG	2	10	112122	112131	40 %	20 %	40 %	0 %	336233634
82	NC_015660	TTTAA	2	10	112912	112921	40 %	60 %	0 %	0 %	336233634
83	NC_015660	AGGAA	2	10	113749	113758	60 %	0 %	40 %	0 %	336233635
84	NC_015660	GACAA	2	10	115400	115409	60 %	0 %	20 %	20 %	336233638
85	NC_015660	ATCGG	2	10	115466	115475	20 %	20 %	40 %	20 %	336233638
86	NC_015660	TGTTT	2	10	116274	116283	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015660	AAACC	2	10	116292	116301	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_015660	AAAAG	2	10	116506	116515	80 %	0 %	20 %	0 %	336233641
89	NC_015660	AAAAG	2	10	116788	116797	80 %	0 %	20 %	0 %	336233641
90	NC_015660	GAACC	2	10	117387	117396	40 %	0 %	20 %	40 %	336233642
91	NC_015660	CGCGG	2	10	117827	117836	0 %	0 %	60 %	40 %	336233643
92	NC_015660	GCCGC	2	10	120714	120723	0 %	0 %	40 %	60 %	336233647
93	NC_015660	GGAAT	2	10	122430	122439	40 %	20 %	40 %	0 %	336233647
94	NC_015660	AGATG	2	10	126745	126754	40 %	20 %	40 %	0 %	336233648
95	NC_015660	TGGCG	2	10	134249	134258	0 %	20 %	60 %	20 %	336233656
96	NC_015660	AATTT	2	10	134680	134689	40 %	60 %	0 %	0 %	336233657
97	NC_015660	AAACG	2	10	136094	136103	60 %	0 %	20 %	20 %	336233659
98	NC_015660	GTTCC	2	10	140730	140739	0 %	40 %	20 %	40 %	336233671
99	NC_015660	ACGGA	2	10	141998	142007	40 %	0 %	40 %	20 %	336233674
100	NC_015660	TCGAT	2	10	146855	146864	20 %	40 %	20 %	20 %	336233682
101	NC_015660	TGCCG	2	10	149503	149512	0 %	20 %	40 %	40 %	336233685
102	NC_015660	TTCAT	2	10	150688	150697	20 %	60 %	0 %	20 %	336233687
103	NC_015660	CGGAC	2	10	152907	152916	20 %	0 %	40 %	40 %	336233691
104	NC_015660	GTTTT	2	10	156626	156635	0 %	80 %	20 %	0 %	336233695
105	NC_015660	TCGTG	2	10	158465	158474	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_015660	AAAGC	2	10	159260	159269	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_015660	TATGT	2	10	163279	163288	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015660	ATATG	2	10	166210	166219	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015660	AGTGA	2	10	166912	166921	40 %	20 %	40 %	0 %	336233700
110	NC_015660	TCTTT	2	10	167136	167145	0 %	80 %	0 %	20 %	336233701
111	NC_015660	TTGAT	2	10	167532	167541	20 %	60 %	20 %	0 %	336233701
112	NC_015660	CAAAC	2	10	167590	167599	60 %	0 %	0 %	40 %	336233701
113	NC_015660	AAGTG	2	10	169452	169461	40 %	20 %	40 %	0 %	336233702
114	NC_015660	GGAAC	2	10	169600	169609	40 %	0 %	40 %	20 %	336233702
115	NC_015660	TAAAA	2	10	169708	169717	80 %	20 %	0 %	0 %	336233702
116	NC_015660	ATTCT	2	10	169753	169762	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_015660	TGCGG	2	10	173979	173988	0 %	20 %	60 %	20 %	336233705
118	NC_015660	ATAAA	2	10	175553	175562	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015660	TGAAG	2	10	176276	176285	40 %	20 %	40 %	0 %	336233706
120	NC_015660	AAAAT	2	10	179465	179474	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015660	CCAGC	2	10	181239	181248	20 %	0 %	20 %	60 %	336233709
122	NC_015660	AATGG	2	10	181297	181306	40 %	20 %	40 %	0 %	336233709
123	NC_015660	CGAAT	2	10	182474	182483	40 %	20 %	20 %	20 %	336233710
124	NC_015660	TGCTT	2	10	182500	182509	0 %	60 %	20 %	20 %	336233710
125	NC_015660	TGCCT	2	10	182538	182547	0 %	40 %	20 %	40 %	336233710
126	NC_015660	GATTT	2	10	182627	182636	20 %	60 %	20 %	0 %	336233710
127	NC_015660	ATGGC	2	10	183215	183224	20 %	20 %	40 %	20 %	336233710
128	NC_015660	CTTTC	2	10	185054	185063	0 %	60 %	0 %	40 %	336233712
129	NC_015660	TTCGC	2	10	185325	185334	0 %	40 %	20 %	40 %	336233712
130	NC_015660	CCGCT	2	10	185694	185703	0 %	20 %	20 %	60 %	336233712
131	NC_015660	ATTGC	2	10	186949	186958	20 %	40 %	20 %	20 %	336233712
132	NC_015660	ATCAA	2	10	187372	187381	60 %	20 %	0 %	20 %	336233712
133	NC_015660	AGCAA	2	10	187519	187528	60 %	0 %	20 %	20 %	336233712
134	NC_015660	CAACG	2	10	190942	190951	40 %	0 %	20 %	40 %	336233713
135	NC_015660	AGATC	2	10	191604	191613	40 %	20 %	20 %	20 %	336233714
136	NC_015660	TGGAG	2	10	192077	192086	20 %	20 %	60 %	0 %	336233714
137	NC_015660	AAAGT	2	10	195887	195896	60 %	20 %	20 %	0 %	336233717
138	NC_015660	TCTAT	2	10	197508	197517	20 %	60 %	0 %	20 %	336233720
139	NC_015660	GAATG	2	10	197861	197870	40 %	20 %	40 %	0 %	336233720
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151	NC_015660	TAACG	2	10	213204	213213	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
152	NC_015660	AGCAA	2	10	213939	213948	60 %	0 %	20 %	20 %	336233734
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404	NC_015660	ACAGA	2	10	529038	529047	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
405	NC_015660	AAGGA	2	10	529305	529314	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
406	NC_015660	GTTGA	2	10	529535	529544	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
407	NC_015660	GAGAT	2	10	531960	531969	40 %	20 %	40 %	0 %	336233999
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