MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 plasmid pHALXA03

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015659	TCGCGA	2	12	4721	4732	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336251465
2	NC_015659	GCCGAC	2	12	4818	4829	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	336251465
3	NC_015659	CGGTGT	2	12	5373	5384	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	336251467
4	NC_015659	TGGGAC	2	12	13005	13016	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	336251477
5	NC_015659	ACGGCC	2	12	21136	21147	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	336251488
6	NC_015659	AAGGCA	2	12	26268	26279	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	336251499
7	NC_015659	TCGTAG	2	12	29246	29257	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	336251506
8	NC_015659	GCCGAC	2	12	29783	29794	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	336251508
9	NC_015659	CCAGCG	2	12	31464	31475	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	336251513
10	NC_015659	ACGAAC	2	12	33932	33943	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	336251520
11	NC_015659	CGGGAT	2	12	35089	35100	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	336251522
12	NC_015659	CCTCGC	2	12	35860	35871	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	336251524
13	NC_015659	GACCGA	2	12	38994	39005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251529
14	NC_015659	CTCGCA	2	12	39850	39861	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	336251531
15	NC_015659	CTGGGG	2	12	41010	41021	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	336251532
16	NC_015659	GTTCGG	2	12	41392	41403	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	336251533
17	NC_015659	GCCGAG	2	12	47980	47991	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	336251541
18	NC_015659	TCGCCG	2	12	49212	49223	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	336251541
19	NC_015659	AGAGGT	2	12	49470	49481	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	336251541
20	NC_015659	CGAGCA	2	12	53560	53571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251543
21	NC_015659	GCCGAT	2	12	55077	55088	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336251547
22	NC_015659	ACGAGC	2	12	56013	56024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251548
23	NC_015659	GCCGAT	2	12	56272	56283	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336251549
24	NC_015659	GAACGA	2	12	58121	58132	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	336251552
25	NC_015659	GAACAG	2	12	59474	59485	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	336251553
26	NC_015659	ATCGCC	2	12	60002	60013	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	336251553
27	NC_015659	CCGTCG	2	12	60162	60173	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	336251553
28	NC_015659	CTCGGT	2	12	63212	63223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251557
29	NC_015659	TCGGCT	2	12	67042	67053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251558
30	NC_015659	CCCACT	2	12	67617	67628	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	336251558

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.