MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 plasmid pHALXA03

Total Repeats: 1060

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015659	CGA	2	6	191	196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251461
2	NC_015659	GAC	2	6	207	212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251461
3	NC_015659	TCG	2	6	213	218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251461
4	NC_015659	GCT	2	6	266	271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251461
5	NC_015659	CGA	2	6	341	346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251461
6	NC_015659	CGA	2	6	350	355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251461
7	NC_015659	CGT	2	6	362	367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251461
8	NC_015659	ACC	2	6	529	534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336251462
9	NC_015659	ATG	2	6	586	591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251462
10	NC_015659	TCG	2	6	600	605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251462
11	NC_015659	CGT	2	6	624	629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251462
12	NC_015659	TTC	2	6	642	647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251462
13	NC_015659	CGT	2	6	666	671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251462
14	NC_015659	AGA	2	6	750	755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251462
15	NC_015659	GCT	2	6	873	878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251462
16	NC_015659	TAC	3	9	1021	1029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251462
17	NC_015659	CGA	3	9	1080	1088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251462
18	NC_015659	CGA	2	6	1134	1139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251462
19	NC_015659	CAG	2	6	1317	1322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251463
20	NC_015659	CTG	2	6	1426	1431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251463
21	NC_015659	CAG	2	6	1650	1655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251463
22	NC_015659	TGA	2	6	1677	1682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251463
23	NC_015659	TCC	2	6	1790	1795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251463
24	NC_015659	TGC	2	6	1886	1891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251463
25	NC_015659	CGA	2	6	1957	1962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251463
26	NC_015659	GAC	2	6	1969	1974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251463
27	NC_015659	CGT	2	6	2007	2012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251463
28	NC_015659	TGG	2	6	2047	2052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336251463
29	NC_015659	CAT	2	6	2092	2097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251463
30	NC_015659	CGT	2	6	2151	2156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251463
31	NC_015659	TCT	2	6	2175	2180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251463
32	NC_015659	TCG	2	6	2210	2215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251463
33	NC_015659	GTC	2	6	2416	2421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251463
34	NC_015659	ACG	2	6	2478	2483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251463
35	NC_015659	GCC	2	6	2511	2516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251463
36	NC_015659	GAG	2	6	2530	2535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251463
37	NC_015659	GGA	2	6	2565	2570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251463
38	NC_015659	CGA	2	6	2739	2744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251463
39	NC_015659	CCT	2	6	2745	2750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251463
40	NC_015659	AGC	2	6	2765	2770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251463
41	NC_015659	GTC	2	6	3236	3241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251464
42	NC_015659	CGT	2	6	3457	3462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251464
43	NC_015659	TCG	2	6	3475	3480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251464
44	NC_015659	GCT	2	6	3502	3507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251464
45	NC_015659	AAG	2	6	3551	3556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251464
46	NC_015659	TTC	2	6	3620	3625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251464
47	NC_015659	TTC	2	6	3674	3679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251464
48	NC_015659	CGA	2	6	3688	3693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251464
49	NC_015659	CGA	2	6	3742	3747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251464
50	NC_015659	TCG	2	6	3759	3764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251464
51	NC_015659	GAA	2	6	3902	3907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251464
52	NC_015659	GCC	2	6	3989	3994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251464
53	NC_015659	GCC	2	6	4065	4070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251464
54	NC_015659	GTC	2	6	4071	4076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251464
55	NC_015659	CTC	2	6	4082	4087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251464
56	NC_015659	CTG	2	6	4106	4111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251464
57	NC_015659	TCG	2	6	4122	4127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251464
58	NC_015659	GTC	2	6	4133	4138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251464
59	NC_015659	ACT	2	6	4565	4570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251465
60	NC_015659	GCC	2	6	4643	4648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251465
61	NC_015659	CAG	2	6	4660	4665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251465
62	NC_015659	AAC	2	6	4700	4705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251465
63	NC_015659	GTC	2	6	4870	4875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251465
64	NC_015659	CTC	2	6	4955	4960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251466
65	NC_015659	GCT	2	6	4966	4971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251466
66	NC_015659	CTC	2	6	5020	5025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251467
67	NC_015659	AAC	2	6	5095	5100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251467
68	NC_015659	GAC	3	9	5113	5121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251467
69	NC_015659	GAA	2	6	5158	5163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251467
70	NC_015659	TCG	2	6	5192	5197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251467
71	NC_015659	CGG	2	6	5298	5303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251467
72	NC_015659	TCG	2	6	5325	5330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251467
73	NC_015659	TCG	2	6	5333	5338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251467
74	NC_015659	GTC	2	6	5389	5394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251467
75	NC_015659	GTC	2	6	5421	5426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251467
76	NC_015659	CGC	2	6	5850	5855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251468
77	NC_015659	CCG	2	6	5856	5861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251468
78	NC_015659	GCG	2	6	5961	5966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251468
79	NC_015659	GAC	2	6	6038	6043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251468
80	NC_015659	CCG	2	6	6060	6065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251468
81	NC_015659	CGA	2	6	6070	6075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251468
82	NC_015659	CAG	2	6	6121	6126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251468
83	NC_015659	GCC	2	6	6178	6183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251468
84	NC_015659	GTG	2	6	6242	6247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336251468
85	NC_015659	CGA	2	6	6274	6279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251468
86	NC_015659	TGT	2	6	6321	6326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336251468
87	NC_015659	ACT	2	6	6339	6344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251468
88	NC_015659	CGG	2	6	6388	6393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251468
89	NC_015659	CTA	2	6	6394	6399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251468
90	NC_015659	AGC	2	6	6429	6434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251468
91	NC_015659	CGT	2	6	6469	6474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251468
92	NC_015659	CGT	2	6	6481	6486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251468
93	NC_015659	CGG	2	6	6715	6720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251468
94	NC_015659	CCG	2	6	6773	6778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251468
95	NC_015659	AAG	2	6	6806	6811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251468
96	NC_015659	CTA	2	6	6817	6822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251468
97	NC_015659	TCG	2	6	6828	6833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251468
98	NC_015659	GCG	2	6	6840	6845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251468
99	NC_015659	GCG	2	6	6869	6874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251468
100	NC_015659	CGA	2	6	6877	6882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251468
101	NC_015659	TCG	2	6	6926	6931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251469
102	NC_015659	CTT	2	6	6991	6996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251469
103	NC_015659	TCC	2	6	7001	7006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251469
104	NC_015659	CGT	2	6	7047	7052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251469
105	NC_015659	GCC	2	6	7055	7060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251469
106	NC_015659	GCT	2	6	7535	7540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251471
107	NC_015659	TTC	2	6	7554	7559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251471
108	NC_015659	GTC	2	6	7569	7574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251471
109	NC_015659	TCC	2	6	7618	7623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251471
110	NC_015659	TTC	2	6	7657	7662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251471
111	NC_015659	CGA	2	6	7790	7795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251471
112	NC_015659	ACC	2	6	8253	8258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336251472
113	NC_015659	ACC	2	6	8262	8267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336251472
114	NC_015659	CCG	2	6	8319	8324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251472
115	NC_015659	CGA	2	6	8901	8906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251473
116	NC_015659	CGA	3	9	8935	8943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251473
117	NC_015659	CGA	2	6	8955	8960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251473
118	NC_015659	GAA	2	6	8967	8972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251473
119	NC_015659	CGA	2	6	9000	9005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251473
120	NC_015659	CGA	2	6	9012	9017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251473
121	NC_015659	TCG	2	6	9153	9158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251473
122	NC_015659	TGG	2	6	9193	9198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336251473
123	NC_015659	GCT	2	6	9216	9221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251473
124	NC_015659	GGC	2	6	9291	9296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251473
125	NC_015659	GAC	3	9	9318	9326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251473
126	NC_015659	GGA	2	6	9384	9389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251473
127	NC_015659	TAC	2	6	9420	9425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251473
128	NC_015659	CGA	2	6	9440	9445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251473
129	NC_015659	ATC	2	6	9662	9667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251474
130	NC_015659	TTC	2	6	9693	9698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251474
131	NC_015659	ACT	2	6	9703	9708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251474
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133	NC_015659	GAC	2	6	9834	9839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251474
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247	NC_015659	CGA	2	6	15950	15955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251479
248	NC_015659	CGA	2	6	16040	16045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251479
249	NC_015659	ACG	2	6	16188	16193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251479
250	NC_015659	GCC	2	6	16292	16297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251480
251	NC_015659	GCG	2	6	16416	16421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251480
252	NC_015659	AAC	2	6	16480	16485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251481
253	NC_015659	CGA	2	6	16520	16525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251481
254	NC_015659	CGA	2	6	16584	16589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251481
255	NC_015659	CGA	2	6	16610	16615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251481
256	NC_015659	CGT	2	6	16688	16693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251481
257	NC_015659	CGA	2	6	16701	16706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251481
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496	NC_015659	CGA	2	6	31761	31766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251514
497	NC_015659	CCG	2	6	31820	31825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251514
498	NC_015659	CGA	2	6	31911	31916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251514
499	NC_015659	TCG	2	6	31949	31954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251514
500	NC_015659	GCG	2	6	31961	31966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251514

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