MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 plasmid pHALXA03

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015659	CG	3	6	102	107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015659	CG	3	6	315	320	0 %	0 %	50 %	50 %	336251461
3	NC_015659	AC	3	6	325	330	50 %	0 %	0 %	50 %	336251461
4	NC_015659	CA	3	6	1254	1259	50 %	0 %	0 %	50 %	336251462
5	NC_015659	CG	3	6	1278	1283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015659	AG	3	6	1385	1390	50 %	0 %	50 %	0 %	336251463
7	NC_015659	TC	3	6	1433	1438	0 %	50 %	0 %	50 %	336251463
8	NC_015659	GT	3	6	1585	1590	0 %	50 %	50 %	0 %	336251463
9	NC_015659	AG	3	6	1830	1835	50 %	0 %	50 %	0 %	336251463
10	NC_015659	CA	3	6	3097	3102	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015659	AG	3	6	3923	3928	50 %	0 %	50 %	0 %	336251464
12	NC_015659	GT	3	6	4321	4326	0 %	50 %	50 %	0 %	336251464
13	NC_015659	CG	3	6	4517	4522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015659	CG	3	6	4907	4912	0 %	0 %	50 %	50 %	336251466
15	NC_015659	CG	3	6	5264	5269	0 %	0 %	50 %	50 %	336251467
16	NC_015659	CG	3	6	5708	5713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015659	GA	3	6	5740	5745	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015659	CG	3	6	6448	6453	0 %	0 %	50 %	50 %	336251468
19	NC_015659	CG	3	6	6675	6680	0 %	0 %	50 %	50 %	336251468
20	NC_015659	AG	3	6	7174	7179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015659	AT	3	6	7278	7283	50 %	50 %	0 %	0 %	336251470
22	NC_015659	GC	3	6	8194	8199	0 %	0 %	50 %	50 %	336251472
23	NC_015659	CG	3	6	8274	8279	0 %	0 %	50 %	50 %	336251472
24	NC_015659	TC	3	6	8786	8791	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015659	GA	3	6	9552	9557	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015659	CG	3	6	10105	10110	0 %	0 %	50 %	50 %	336251474
27	NC_015659	GC	3	6	10801	10806	0 %	0 %	50 %	50 %	336251474
28	NC_015659	CA	3	6	10816	10821	50 %	0 %	0 %	50 %	336251474
29	NC_015659	TG	3	6	10828	10833	0 %	50 %	50 %	0 %	336251474
30	NC_015659	CG	3	6	11832	11837	0 %	0 %	50 %	50 %	336251475
31	NC_015659	TG	3	6	11976	11981	0 %	50 %	50 %	0 %	336251475
32	NC_015659	CG	3	6	12436	12441	0 %	0 %	50 %	50 %	336251476
33	NC_015659	AC	3	6	13751	13756	50 %	0 %	0 %	50 %	336251477
34	NC_015659	CG	3	6	14567	14572	0 %	0 %	50 %	50 %	336251478
35	NC_015659	CT	3	6	14947	14952	0 %	50 %	0 %	50 %	336251478
36	NC_015659	CG	3	6	14958	14963	0 %	0 %	50 %	50 %	336251478
37	NC_015659	GC	3	6	16034	16039	0 %	0 %	50 %	50 %	336251479
38	NC_015659	GA	3	6	16811	16816	50 %	0 %	50 %	0 %	336251481
39	NC_015659	CG	4	8	19079	19086	0 %	0 %	50 %	50 %	336251484
40	NC_015659	TC	3	6	19337	19342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015659	CG	3	6	20717	20722	0 %	0 %	50 %	50 %	336251486
42	NC_015659	GC	3	6	22996	23001	0 %	0 %	50 %	50 %	336251492
43	NC_015659	TC	3	6	24541	24546	0 %	50 %	0 %	50 %	336251497
44	NC_015659	GT	3	6	24790	24795	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015659	GC	3	6	25093	25098	0 %	0 %	50 %	50 %	336251498
46	NC_015659	CA	3	6	25160	25165	50 %	0 %	0 %	50 %	336251498
47	NC_015659	AC	4	8	25505	25512	50 %	0 %	0 %	50 %	336251498
48	NC_015659	CG	3	6	26551	26556	0 %	0 %	50 %	50 %	336251500
49	NC_015659	CA	3	6	26744	26749	50 %	0 %	0 %	50 %	336251500
50	NC_015659	TG	4	8	27281	27288	0 %	50 %	50 %	0 %	336251500
51	NC_015659	CT	3	6	28194	28199	0 %	50 %	0 %	50 %	336251502
52	NC_015659	TG	3	6	28682	28687	0 %	50 %	50 %	0 %	336251504
53	NC_015659	CG	3	6	28752	28757	0 %	0 %	50 %	50 %	336251505
54	NC_015659	CG	3	6	29283	29288	0 %	0 %	50 %	50 %	336251506
55	NC_015659	CG	3	6	29427	29432	0 %	0 %	50 %	50 %	336251506
56	NC_015659	GC	4	8	29612	29619	0 %	0 %	50 %	50 %	336251507
57	NC_015659	CG	3	6	29649	29654	0 %	0 %	50 %	50 %	336251507
58	NC_015659	GC	3	6	30291	30296	0 %	0 %	50 %	50 %	336251510
59	NC_015659	GA	3	6	31007	31012	50 %	0 %	50 %	0 %	336251511
60	NC_015659	TC	3	6	32013	32018	0 %	50 %	0 %	50 %	336251514
61	NC_015659	TC	3	6	32543	32548	0 %	50 %	0 %	50 %	336251515
62	NC_015659	CG	3	6	33346	33351	0 %	0 %	50 %	50 %	336251517
63	NC_015659	AC	3	6	33870	33875	50 %	0 %	0 %	50 %	336251520
64	NC_015659	TC	3	6	33993	33998	0 %	50 %	0 %	50 %	336251520
65	NC_015659	TG	3	6	34016	34021	0 %	50 %	50 %	0 %	336251520
66	NC_015659	GC	3	6	34990	34995	0 %	0 %	50 %	50 %	336251522
67	NC_015659	AC	3	6	36310	36315	50 %	0 %	0 %	50 %	336251525
68	NC_015659	CG	3	6	36359	36364	0 %	0 %	50 %	50 %	336251525
69	NC_015659	AC	3	6	36504	36509	50 %	0 %	0 %	50 %	336251525
70	NC_015659	AG	3	6	36911	36916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015659	GC	3	6	38094	38099	0 %	0 %	50 %	50 %	336251527
72	NC_015659	AC	3	6	39360	39365	50 %	0 %	0 %	50 %	336251529
73	NC_015659	CG	3	6	40778	40783	0 %	0 %	50 %	50 %	336251532
74	NC_015659	GC	3	6	41563	41568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015659	GA	3	6	41916	41921	50 %	0 %	50 %	0 %	336251534
76	NC_015659	GA	3	6	42035	42040	50 %	0 %	50 %	0 %	336251534
77	NC_015659	CG	3	6	42443	42448	0 %	0 %	50 %	50 %	336251535
78	NC_015659	CG	3	6	42471	42476	0 %	0 %	50 %	50 %	336251535
79	NC_015659	TC	3	6	43223	43228	0 %	50 %	0 %	50 %	336251535
80	NC_015659	TC	3	6	43714	43719	0 %	50 %	0 %	50 %	336251536
81	NC_015659	CG	3	6	43818	43823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015659	CG	3	6	44224	44229	0 %	0 %	50 %	50 %	336251538
83	NC_015659	CG	3	6	44772	44777	0 %	0 %	50 %	50 %	336251539
84	NC_015659	GA	3	6	45346	45351	50 %	0 %	50 %	0 %	336251539
85	NC_015659	CG	3	6	45681	45686	0 %	0 %	50 %	50 %	336251539
86	NC_015659	CG	3	6	45904	45909	0 %	0 %	50 %	50 %	336251539
87	NC_015659	TC	3	6	46105	46110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015659	GT	3	6	46206	46211	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015659	GC	3	6	46230	46235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015659	CG	3	6	47137	47142	0 %	0 %	50 %	50 %	336251540
91	NC_015659	CG	3	6	47559	47564	0 %	0 %	50 %	50 %	336251541
92	NC_015659	TC	3	6	49884	49889	0 %	50 %	0 %	50 %	336251542
93	NC_015659	CG	3	6	50261	50266	0 %	0 %	50 %	50 %	336251542
94	NC_015659	CG	3	6	51413	51418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_015659	CT	3	6	52450	52455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015659	TC	3	6	54440	54445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015659	GA	3	6	58941	58946	50 %	0 %	50 %	0 %	336251552
98	NC_015659	GT	3	6	60040	60045	0 %	50 %	50 %	0 %	336251553
99	NC_015659	AC	3	6	60453	60458	50 %	0 %	0 %	50 %	336251554
100	NC_015659	GC	3	6	60464	60469	0 %	0 %	50 %	50 %	336251554
101	NC_015659	CG	3	6	60810	60815	0 %	0 %	50 %	50 %	336251554
102	NC_015659	GA	3	6	64023	64028	50 %	0 %	50 %	0 %	336251557
103	NC_015659	CG	3	6	64040	64045	0 %	0 %	50 %	50 %	336251557
104	NC_015659	CG	3	6	64054	64059	0 %	0 %	50 %	50 %	336251557
105	NC_015659	TC	3	6	64614	64619	0 %	50 %	0 %	50 %	336251557
106	NC_015659	GC	4	8	65276	65283	0 %	0 %	50 %	50 %	336251558
107	NC_015659	CG	3	6	65331	65336	0 %	0 %	50 %	50 %	336251558
108	NC_015659	TC	3	6	65840	65845	0 %	50 %	0 %	50 %	336251558
109	NC_015659	CG	3	6	66453	66458	0 %	0 %	50 %	50 %	336251558
110	NC_015659	CA	3	6	68412	68417	50 %	0 %	0 %	50 %	336251559
111	NC_015659	GC	3	6	68600	68605	0 %	0 %	50 %	50 %	336251559

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.