Hexa-nucleotide Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 plasmid pHALXA01

Total Repeats: 237

Go To Repeat Summary Page

Download The Result in

S.No.Genome IDMotifIterationsLengthStartEndA%T%G%C% Protein ID
1NC_015658TGGTTC21214289143000 %50 %33.33 %16.67 %Non-Coding
2NC_015658ATCCCG212178591787016.67 %16.67 %16.67 %50 %Non-Coding
3NC_015658ACTCGC212222552226616.67 %16.67 %16.67 %50 %336251767
4NC_015658GCTCTC21225441254520 %33.33 %16.67 %50 %336251770
5NC_015658GGCTTT21227545275560 %50 %33.33 %16.67 %336251773
6NC_015658AGCAAC212332203323150 %0 %16.67 %33.33 %336251777
7NC_015658GATACG212348503486133.33 %16.67 %33.33 %16.67 %336251778
8NC_015658CGTCGA212360323604316.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336251779
9NC_015658CGTGGT21239620396310 %33.33 %50 %16.67 %336251782
10NC_015658GTGTTC21240792408030 %50 %33.33 %16.67 %Non-Coding
11NC_015658GGAACG212425374254833.33 %0 %50 %16.67 %336251784
12NC_015658CAGCGT212428174282816.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336251784
13NC_015658TGAACC212451014511233.33 %16.67 %16.67 %33.33 %336251786
14NC_015658TCGCTC21246082460930 %33.33 %16.67 %50 %336251787
15NC_015658CGTCCG21246179461900 %16.67 %33.33 %50 %336251787
16NC_015658TGGTTC21249474494850 %50 %33.33 %16.67 %Non-Coding
17NC_015658CCTCGC21250004500150 %16.67 %16.67 %66.67 %336251790
18NC_015658CTCGCC21256528565390 %16.67 %16.67 %66.67 %336251797
19NC_015658GGCATC212565565656716.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336251797
20NC_015658GTTGAT212566035661416.67 %50 %33.33 %0 %336251797
21NC_015658GCATCC212580575806816.67 %16.67 %16.67 %50 %336251798
22NC_015658GGACGG212593655937616.67 %0 %66.67 %16.67 %336251799
23NC_015658CGACGC212608816089216.67 %0 %33.33 %50 %336251799
24NC_015658TACGAG212619536196433.33 %16.67 %33.33 %16.67 %336251799
25NC_015658CGTCGA212625676257816.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336251800
26NC_015658CTACGA212644846449533.33 %16.67 %16.67 %33.33 %336251800
27NC_015658GGTCGG21267435674460 %16.67 %66.67 %16.67 %336251803
28NC_015658CAACGG212724257243633.33 %0 %33.33 %33.33 %336251805
29NC_015658GAGGGG212728277283816.67 %0 %83.33 %0 %336251806
30NC_015658GTCGAC212737487375916.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336251806
31NC_015658AGCGTC212759507596116.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336251809
32NC_015658CCCGGA212761507616116.67 %0 %33.33 %50 %336251809
33NC_015658TGATCG212789527896316.67 %33.33 %33.33 %16.67 %336251812
34NC_015658TGGTCG21279296793070 %33.33 %50 %16.67 %336251812
35NC_015658AATCGG212794617947233.33 %16.67 %33.33 %16.67 %336251812
36NC_015658CAGCGT212798807989116.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336251812
37NC_015658GGCCGA212818298184016.67 %0 %50 %33.33 %336251813
38NC_015658GTCTCG21284680846910 %33.33 %33.33 %33.33 %336251814
39NC_015658CCACGT212877798779016.67 %16.67 %16.67 %50 %336251816
40NC_015658CGGCGA212903229033316.67 %0 %50 %33.33 %336251817
41NC_015658CGGCGA212913759138616.67 %0 %50 %33.33 %336251817
42NC_015658CGATCG212916389164916.67 %16.67 %33.33 %33.33 %Non-Coding
43NC_015658GACGCT212918719188216.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336251818
44NC_015658GCTCGC21292210922210 %16.67 %33.33 %50 %336251819
45NC_015658CGAGCG212931039311416.67 %0 %50 %33.33 %Non-Coding
46NC_015658GACGCG212933059331616.67 %0 %50 %33.33 %336251820
47NC_015658CTCGAC212936289363916.67 %16.67 %16.67 %50 %336251820
48NC_015658CCGTCG21293675936860 %16.67 %33.33 %50 %336251820
49NC_015658AGCGGC212945389454916.67 %0 %50 %33.33 %336251821
50NC_015658GGAGAT212972029721333.33 %16.67 %50 %0 %336251822
51NC_015658GATCTT21210171810172916.67 %50 %16.67 %16.67 %336251826
52NC_015658AGTCAC21210571710572833.33 %16.67 %16.67 %33.33 %Non-Coding
53NC_015658GCGACG21210666110667216.67 %0 %50 %33.33 %336251830
54NC_015658GCGTCG2121082381082490 %16.67 %50 %33.33 %336251831
55NC_015658CGACGT21210865310866416.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336251831
56NC_015658CGGCAC21210951510952616.67 %0 %33.33 %50 %336251832
57NC_015658CGTCGC2121117371117480 %16.67 %33.33 %50 %336251834
58NC_015658TCGGCG2121135771135880 %16.67 %50 %33.33 %336251836
59NC_015658CAAGGG21211366211367333.33 %0 %50 %16.67 %336251836
60NC_015658TCCGAG21211520511521616.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336251837
61NC_015658ATCGAC21211534911536033.33 %16.67 %16.67 %33.33 %336251837
62NC_015658CACCGA21211557911559033.33 %0 %16.67 %50 %336251837
63NC_015658TCCTCG2121165041165150 %33.33 %16.67 %50 %336251838
64NC_015658CGGCAC21212151912153016.67 %0 %33.33 %50 %336251843
65NC_015658GAGCAG21212436612437733.33 %0 %50 %16.67 %336251844
66NC_015658CCGAGG21212757112758216.67 %0 %50 %33.33 %336251847
67NC_015658CCCGTC2121297271297380 %16.67 %16.67 %66.67 %336251850
68NC_015658TTCGAT21213024713025816.67 %50 %16.67 %16.67 %336251851
69NC_015658CGGTAG21213348913350016.67 %16.67 %50 %16.67 %Non-Coding
70NC_015658TCGGGT2121383431383540 %33.33 %50 %16.67 %336251859
71NC_015658TCGCCG3181402881403050 %16.67 %33.33 %50 %336251861
72NC_015658CGTCGC2121451991452100 %16.67 %33.33 %50 %336251867
73NC_015658TCGAGG21214572014573116.67 %16.67 %50 %16.67 %336251867
74NC_015658TGCGAT21214657614658716.67 %33.33 %33.33 %16.67 %336251867
75NC_015658GACGGC21214772614773716.67 %0 %50 %33.33 %336251868
76NC_015658TTTCGT2121490611490720 %66.67 %16.67 %16.67 %Non-Coding
77NC_015658ACTTTG21215076715077816.67 %50 %16.67 %16.67 %336251872
78NC_015658CCGATC21215444815445916.67 %16.67 %16.67 %50 %336251875
79NC_015658GCCGAC21215486115487216.67 %0 %33.33 %50 %336251875
80NC_015658AGGCGT21215576315577416.67 %16.67 %50 %16.67 %336251877
81NC_015658CGGAGA21216021316022433.33 %0 %50 %16.67 %336251880
82NC_015658GCTCGC2121603671603780 %16.67 %33.33 %50 %336251880
83NC_015658GGCACG21216095616096716.67 %0 %50 %33.33 %336251880
84NC_015658CGCTGT2121616501616610 %33.33 %33.33 %33.33 %336251880
85NC_015658CGGTCG2121649801649910 %16.67 %50 %33.33 %336251883
86NC_015658ACGCCG21216627916629016.67 %0 %33.33 %50 %Non-Coding
87NC_015658CGACGG21216993916995016.67 %0 %50 %33.33 %336251887
88NC_015658CGACGG21217037717038816.67 %0 %50 %33.33 %336251887
89NC_015658CGAGAT21217214417215533.33 %16.67 %33.33 %16.67 %336251889
90NC_015658CGCCGG2121722581722690 %0 %50 %50 %336251889
91NC_015658GTCGCT2121724631724740 %33.33 %33.33 %33.33 %336251889
92NC_015658CGATCG21217513217514316.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336251891
93NC_015658ACCACG21217580317581433.33 %0 %16.67 %50 %336251892
94NC_015658GCGTCG2121771861771970 %16.67 %50 %33.33 %336251893
95NC_015658CGGCGT2121789741789850 %16.67 %50 %33.33 %336251895
96NC_015658GCCGAT21217957117958216.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336251895
97NC_015658GCTTCG2121810291810400 %33.33 %33.33 %33.33 %Non-Coding
98NC_015658CTACCT21218227218228316.67 %33.33 %0 %50 %336251897
99NC_015658CCGTCA21218296018297116.67 %16.67 %16.67 %50 %336251898
100NC_015658GTGGGG2121845291845400 %16.67 %83.33 %0 %336251900
101NC_015658GTGGGT2121846791846900 %33.33 %66.67 %0 %336251900
102NC_015658CGGCTC2121847631847740 %16.67 %33.33 %50 %336251900
103NC_015658GACGTC21218623318624416.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336251901
104NC_015658GCTCGC2121865951866060 %16.67 %33.33 %50 %336251901
105NC_015658CGTGCC2121878521878630 %16.67 %33.33 %50 %336251901
106NC_015658CTCGAT21218844818845916.67 %33.33 %16.67 %33.33 %336251902
107NC_015658GCGAGA21218993518994633.33 %0 %50 %16.67 %336251903
108NC_015658GTCGAC21219012019013116.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336251903
109NC_015658AGGGCC21219038819039916.67 %0 %50 %33.33 %336251903
110NC_015658GCTACG21219155219156316.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336251903
111NC_015658GATCGC31819357819359516.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336251904
112NC_015658TCGACG21219505619506716.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336251904
113NC_015658CGCTCG2121962931963040 %16.67 %33.33 %50 %336251905
114NC_015658TTCGGC2121964901965010 %33.33 %33.33 %33.33 %336251905
115NC_015658GAATTC21219725219726333.33 %33.33 %16.67 %16.67 %336251906
116NC_015658CGACGT21219839219840316.67 %16.67 %33.33 %33.33 %Non-Coding
117NC_015658TCTCGC2122008132008240 %33.33 %16.67 %50 %336251908
118NC_015658GATTCC21220898120899216.67 %33.33 %16.67 %33.33 %336251915
119NC_015658CGTCGC2122163632163740 %16.67 %33.33 %50 %336251921
120NC_015658AGTCGC21221716621717716.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336251921
121NC_015658CGAGCG21221787321788416.67 %0 %50 %33.33 %336251922
122NC_015658ATTCGG21221998021999116.67 %33.33 %33.33 %16.67 %336251922
123NC_015658ACGCCG21222169122170216.67 %0 %33.33 %50 %336251923
124NC_015658CGTCGA21222389522390616.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336251925
125NC_015658AATACG21222415122416250 %16.67 %16.67 %16.67 %Non-Coding
126NC_015658CAGTTT31822747022748716.67 %50 %16.67 %16.67 %Non-Coding
127NC_015658TCGACG21223095223096316.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336251935
128NC_015658CGTGCC2122320982321090 %16.67 %33.33 %50 %336251937
129NC_015658CGTCGG2122323052323160 %16.67 %50 %33.33 %336251937
130NC_015658GACGTC21223331723332816.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336251939
131NC_015658CCGTTT2122337452337560 %50 %16.67 %33.33 %336251939
132NC_015658GAGCTC21223501723502816.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336251940
133NC_015658GTCGCC2122353322353430 %16.67 %33.33 %50 %336251940
134NC_015658GTCGAG21223569523570616.67 %16.67 %50 %16.67 %336251940
135NC_015658CGATCG21224088624089716.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336251943
136NC_015658ACGAGG21224447024448133.33 %0 %50 %16.67 %336251945
137NC_015658GAAGCG21224511724512833.33 %0 %50 %16.67 %336251945
138NC_015658CGATGC21224516924518016.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336251945
139NC_015658GAGCGG21224757524758616.67 %0 %66.67 %16.67 %336251948
140NC_015658CGGACG21224837524838616.67 %0 %50 %33.33 %336251948
141NC_015658GACTCG21225203525204616.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336251951
142NC_015658ACGCAG21225219125220233.33 %0 %33.33 %33.33 %336251952
143NC_015658CGACGG21225367125368216.67 %0 %50 %33.33 %336251952
144NC_015658TCGAGT21225411625412716.67 %33.33 %33.33 %16.67 %Non-Coding
145NC_015658CGACGT21225545325546416.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336251954
146NC_015658TCGCCG2122594662594770 %16.67 %33.33 %50 %336251955
147NC_015658CGATCA21226191226192333.33 %16.67 %16.67 %33.33 %336251956
148NC_015658GGCCGA21226194326195416.67 %0 %50 %33.33 %336251956
149NC_015658CGACGG21226280126281216.67 %0 %50 %33.33 %336251956
150NC_015658GCTCGA21226282226283316.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336251956
151NC_015658GGGAAC21226299726300833.33 %0 %50 %16.67 %336251956
152NC_015658CGGTCA21226372926374016.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336251957
153NC_015658CCGAAA21226388826389950 %0 %16.67 %33.33 %336251957
154NC_015658GGATCG21226666026667116.67 %16.67 %50 %16.67 %336251957
155NC_015658CCGGGA21226673526674616.67 %0 %50 %33.33 %336251957
156NC_015658GAGCGA21227245127246233.33 %0 %50 %16.67 %336251961
157NC_015658CGATCC21227280327281416.67 %16.67 %16.67 %50 %336251962
158NC_015658CGCGAT21227287927289016.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336251962
159NC_015658ACGATC21227704127705233.33 %16.67 %16.67 %33.33 %336251968
160NC_015658TCGAGA21227714027715133.33 %16.67 %33.33 %16.67 %336251968
161NC_015658CCCGAT21227962627963716.67 %16.67 %16.67 %50 %336251970
162NC_015658GCTCGC2122807882807990 %16.67 %33.33 %50 %336251971
163NC_015658CGACGC21228092028093116.67 %0 %33.33 %50 %336251971
164NC_015658TCGGTC2122829062829170 %33.33 %33.33 %33.33 %336251973
165NC_015658AGTGAA21228463428464550 %16.67 %33.33 %0 %Non-Coding
166NC_015658ATCGAC21229027529028633.33 %16.67 %16.67 %33.33 %Non-Coding
167NC_015658TGATCG21229092029093116.67 %33.33 %33.33 %16.67 %336251982
168NC_015658CGAAGA21229291129292250 %0 %33.33 %16.67 %336251984
169NC_015658CGACCG21229432529433616.67 %0 %33.33 %50 %Non-Coding
170NC_015658CGGGGG2122968852968960 %0 %83.33 %16.67 %336251987
171NC_015658CGCTCG2122994862994970 %16.67 %33.33 %50 %336251990
172NC_015658TCGCCT2122995102995210 %33.33 %16.67 %50 %336251990
173NC_015658TCTCGG2123036933037040 %33.33 %33.33 %33.33 %Non-Coding
174NC_015658GGCGAC21230535230536316.67 %0 %50 %33.33 %336251994
175NC_015658AATCTC21230687330688433.33 %33.33 %0 %33.33 %336251995
176NC_015658GCCACG21230778430779516.67 %0 %33.33 %50 %Non-Coding
177NC_015658CGGCGT2123111443111550 %16.67 %50 %33.33 %336251999
178NC_015658CGATAG21231331531332633.33 %16.67 %33.33 %16.67 %Non-Coding
179NC_015658AACACG21231374331375450 %0 %16.67 %33.33 %336252001
180NC_015658CGACGT21231847331848416.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336252005
181NC_015658CGATCC21231953231954316.67 %16.67 %16.67 %50 %336252006
182NC_015658TTTCAC21232662232663316.67 %50 %0 %33.33 %Non-Coding
183NC_015658CTGTCT2123268673268780 %50 %16.67 %33.33 %336252012
184NC_015658CGGAGC21233199633200716.67 %0 %50 %33.33 %336252018
185NC_015658GTATCT21233268233269316.67 %50 %16.67 %16.67 %Non-Coding
186NC_015658GGCCGC2123333363333470 %0 %50 %50 %336252019
187NC_015658AGCCGG21233454933456016.67 %0 %50 %33.33 %336252020
188NC_015658CGTTGT2123368953369060 %50 %33.33 %16.67 %336252023
189NC_015658GTCGGG2123378773378880 %16.67 %66.67 %16.67 %336252023
190NC_015658CGTAGT21233867433868516.67 %33.33 %33.33 %16.67 %336252023
191NC_015658CCTCGT2123388913389020 %33.33 %16.67 %50 %336252024
192NC_015658GCCGTC2123402313402420 %16.67 %33.33 %50 %336252025
193NC_015658TCGACG21234115334116416.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336252025
194NC_015658TCGACA21234157534158633.33 %16.67 %16.67 %33.33 %336252026
195NC_015658CGACCT21234404134405216.67 %16.67 %16.67 %50 %336252028
196NC_015658GATCCC21234469834470916.67 %16.67 %16.67 %50 %336252029
197NC_015658CGCCCT2123514363514470 %16.67 %16.67 %66.67 %336252034
198NC_015658TGATCG21236189736190816.67 %33.33 %33.33 %16.67 %336252045
199NC_015658TCGTCT2123619593619700 %50 %16.67 %33.33 %336252045
200NC_015658AATCAC21236245536246650 %16.67 %0 %33.33 %Non-Coding
201NC_015658CGCGTT2123636043636150 %33.33 %33.33 %33.33 %336252046
202NC_015658ACGCCT21236535336536416.67 %16.67 %16.67 %50 %336252048
203NC_015658TCACGG21236763736764816.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336252050
204NC_015658TCCTCG2123706893707000 %33.33 %16.67 %50 %Non-Coding
205NC_015658TCGGCG2123718673718780 %16.67 %50 %33.33 %336252053
206NC_015658CTCGTC2123721963722070 %33.33 %16.67 %50 %336252053
207NC_015658TCGCGT2123728313728420 %33.33 %33.33 %33.33 %336252054
208NC_015658CGTACT21237325537326616.67 %33.33 %16.67 %33.33 %336252054
209NC_015658GCGTCA21237374937376016.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336252054
210NC_015658TCCGAC21237546637547716.67 %16.67 %16.67 %50 %336252056
211NC_015658CATATT21237691437692533.33 %50 %0 %16.67 %Non-Coding
212NC_015658ATCCGT21237815137816216.67 %33.33 %16.67 %33.33 %336252057
213NC_015658GCCGTA21237959437960516.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336252058
214NC_015658CGTAGG21238012738013816.67 %16.67 %50 %16.67 %336252058
215NC_015658ACGAGG21238714738715833.33 %0 %50 %16.67 %336252066
216NC_015658CGTGAC21238829538830616.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336252068
217NC_015658AGTGGA21239085739086833.33 %16.67 %50 %0 %336252070
218NC_015658ACTACG21239277539278633.33 %16.67 %16.67 %33.33 %336252070
219NC_015658CGATTC21239386539387616.67 %33.33 %16.67 %33.33 %336252071
220NC_015658GTGGGA21239690339691416.67 %16.67 %66.67 %0 %336252072
221NC_015658AGCGAC21239948039949133.33 %0 %33.33 %33.33 %336252073
222NC_015658GACGCG21240324840325916.67 %0 %50 %33.33 %336252076
223NC_015658GTCGGC2124036794036900 %16.67 %50 %33.33 %336252076
224NC_015658ACTCGA21240377440378533.33 %16.67 %16.67 %33.33 %336252076
225NC_015658ATCGAT21240896840897933.33 %33.33 %16.67 %16.67 %Non-Coding
226NC_015658CGTCAC21241184941186016.67 %16.67 %16.67 %50 %336252080
227NC_015658TCGACG21241215441216516.67 %16.67 %33.33 %33.33 %336252080
228NC_015658TCGCCG2124134654134760 %16.67 %33.33 %50 %336252082
229NC_015658TCGATG21242050242051316.67 %33.33 %33.33 %16.67 %336252086
230NC_015658TGATCG21242194742195816.67 %33.33 %33.33 %16.67 %336252087
231NC_015658AGAGAA21242210142211266.67 %0 %33.33 %0 %Non-Coding
232NC_015658ACTCCA21242381742382833.33 %16.67 %0 %50 %336252088
233NC_015658CCGGCT2124249954250060 %16.67 %33.33 %50 %336252088
234NC_015658ACAGCG21242928442929533.33 %0 %33.33 %33.33 %336252091
235NC_015658GTGATC21243240743241816.67 %33.33 %33.33 %16.67 %336252094
236NC_015658GCCGTC2124334774334880 %16.67 %33.33 %50 %336252094
237NC_015658GCCGTC2124339154339260 %16.67 %33.33 %50 %336252094