MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 plasmid pHALXA01

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015658	TGGTTC	2	12	14289	14300	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_015658	ATCCCG	2	12	17859	17870	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015658	GTGTTC	2	12	40792	40803	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015658	TGGTTC	2	12	49474	49485	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015658	CGATCG	2	12	91638	91649	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015658	CGAGCG	2	12	93103	93114	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015658	AGTCAC	2	12	105717	105728	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015658	CGGTAG	2	12	133489	133500	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_015658	TTTCGT	2	12	149061	149072	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015658	ACGCCG	2	12	166279	166290	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015658	GCTTCG	2	12	181029	181040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015658	CGACGT	2	12	198392	198403	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015658	AATACG	2	12	224151	224162	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015658	CAGTTT	3	18	227470	227487	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_015658	TCGAGT	2	12	254116	254127	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015658	AGTGAA	2	12	284634	284645	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015658	ATCGAC	2	12	290275	290286	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015658	CGACCG	2	12	294325	294336	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015658	TCTCGG	2	12	303693	303704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015658	GCCACG	2	12	307784	307795	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015658	CGATAG	2	12	313315	313326	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_015658	TTTCAC	2	12	326622	326633	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015658	GTATCT	2	12	332682	332693	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015658	AATCAC	2	12	362455	362466	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015658	TCCTCG	2	12	370689	370700	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015658	CATATT	2	12	376914	376925	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015658	ATCGAT	2	12	408968	408979	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_015658	AGAGAA	2	12	422101	422112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.