MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 plasmid pHALXA01

Total Repeats: 1106

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015658	CGAT	2	8	438	445	25 %	25 %	25 %	25 %	336251751
2	NC_015658	GCCG	2	8	447	454	0 %	0 %	50 %	50 %	336251751
3	NC_015658	GATC	2	8	498	505	25 %	25 %	25 %	25 %	336251751
4	NC_015658	GTCT	2	8	4810	4817	0 %	50 %	25 %	25 %	336251754
5	NC_015658	GAAA	2	8	5061	5068	75 %	0 %	25 %	0 %	336251754
6	NC_015658	ATCT	2	8	5501	5508	25 %	50 %	0 %	25 %	336251754
7	NC_015658	GCGT	2	8	5767	5774	0 %	25 %	50 %	25 %	336251755
8	NC_015658	CGGC	2	8	8095	8102	0 %	0 %	50 %	50 %	336251757
9	NC_015658	CTCG	3	12	10192	10203	0 %	25 %	25 %	50 %	336251758
10	NC_015658	GACG	2	8	10411	10418	25 %	0 %	50 %	25 %	336251758
11	NC_015658	CGGC	2	8	10888	10895	0 %	0 %	50 %	50 %	336251758
12	NC_015658	CGGC	2	8	12927	12934	0 %	0 %	50 %	50 %	336251760
13	NC_015658	CGGT	2	8	13187	13194	0 %	25 %	50 %	25 %	336251760
14	NC_015658	GAAC	2	8	15286	15293	50 %	0 %	25 %	25 %	336251761
15	NC_015658	GGAT	2	8	15350	15357	25 %	25 %	50 %	0 %	336251761
16	NC_015658	AATA	2	8	16377	16384	75 %	25 %	0 %	0 %	336251762
17	NC_015658	CCGA	2	8	16585	16592	25 %	0 %	25 %	50 %	336251762
18	NC_015658	GATA	2	8	18388	18395	50 %	25 %	25 %	0 %	336251764
19	NC_015658	CCGA	2	8	19132	19139	25 %	0 %	25 %	50 %	336251765
20	NC_015658	GCCG	2	8	19151	19158	0 %	0 %	50 %	50 %	336251765
21	NC_015658	CCGG	2	8	19382	19389	0 %	0 %	50 %	50 %	336251765
22	NC_015658	GCTC	2	8	19457	19464	0 %	25 %	25 %	50 %	336251765
23	NC_015658	GAGC	2	8	19622	19629	25 %	0 %	50 %	25 %	336251765
24	NC_015658	GCTC	2	8	20624	20631	0 %	25 %	25 %	50 %	336251766
25	NC_015658	CCTG	2	8	20706	20713	0 %	25 %	25 %	50 %	336251766
26	NC_015658	TCCG	2	8	20767	20774	0 %	25 %	25 %	50 %	336251766
27	NC_015658	CTCG	2	8	20907	20914	0 %	25 %	25 %	50 %	336251766
28	NC_015658	TCGA	2	8	20957	20964	25 %	25 %	25 %	25 %	336251766
29	NC_015658	TCGA	2	8	21289	21296	25 %	25 %	25 %	25 %	336251766
30	NC_015658	GCCG	2	8	21397	21404	0 %	0 %	50 %	50 %	336251766
31	NC_015658	CGAA	2	8	21815	21822	50 %	0 %	25 %	25 %	336251766
32	NC_015658	CGCC	2	8	22232	22239	0 %	0 %	25 %	75 %	336251767
33	NC_015658	GCGA	2	8	22333	22340	25 %	0 %	50 %	25 %	336251767
34	NC_015658	TCGG	2	8	23199	23206	0 %	25 %	50 %	25 %	336251769
35	NC_015658	GTTC	2	8	23964	23971	0 %	50 %	25 %	25 %	336251770
36	NC_015658	CCCG	2	8	24208	24215	0 %	0 %	25 %	75 %	336251770
37	NC_015658	GAGC	2	8	24784	24791	25 %	0 %	50 %	25 %	336251770
38	NC_015658	GTTC	2	8	24835	24842	0 %	50 %	25 %	25 %	336251770
39	NC_015658	TCGA	2	8	24954	24961	25 %	25 %	25 %	25 %	336251770
40	NC_015658	CGGA	2	8	25185	25192	25 %	0 %	50 %	25 %	336251770
41	NC_015658	TGAG	2	8	25272	25279	25 %	25 %	50 %	0 %	336251770
42	NC_015658	CAGT	2	8	25661	25668	25 %	25 %	25 %	25 %	336251771
43	NC_015658	ACTG	2	8	25682	25689	25 %	25 %	25 %	25 %	336251771
44	NC_015658	TCGA	2	8	25698	25705	25 %	25 %	25 %	25 %	336251771
45	NC_015658	AAGG	2	8	25728	25735	50 %	0 %	50 %	0 %	336251771
46	NC_015658	TCCA	2	8	25779	25786	25 %	25 %	0 %	50 %	336251771
47	NC_015658	CGTA	2	8	26520	26527	25 %	25 %	25 %	25 %	336251772
48	NC_015658	GTCG	2	8	26635	26642	0 %	25 %	50 %	25 %	336251772
49	NC_015658	CAGC	2	8	26861	26868	25 %	0 %	25 %	50 %	336251773
50	NC_015658	GAGC	2	8	26887	26894	25 %	0 %	50 %	25 %	336251773
51	NC_015658	TTCG	2	8	27160	27167	0 %	50 %	25 %	25 %	336251773
52	NC_015658	CGAA	2	8	27208	27215	50 %	0 %	25 %	25 %	336251773
53	NC_015658	ACGC	2	8	27622	27629	25 %	0 %	25 %	50 %	336251773
54	NC_015658	TAAC	2	8	27816	27823	50 %	25 %	0 %	25 %	336251773
55	NC_015658	CGCA	2	8	27915	27922	25 %	0 %	25 %	50 %	336251773
56	NC_015658	TCGG	2	8	28620	28627	0 %	25 %	50 %	25 %	336251774
57	NC_015658	ACGT	2	8	28915	28922	25 %	25 %	25 %	25 %	336251774
58	NC_015658	CAGA	2	8	29304	29311	50 %	0 %	25 %	25 %	336251775
59	NC_015658	TCGA	2	8	29472	29479	25 %	25 %	25 %	25 %	336251775
60	NC_015658	TGCT	2	8	29831	29838	0 %	50 %	25 %	25 %	336251775
61	NC_015658	GACC	2	8	29901	29908	25 %	0 %	25 %	50 %	336251775
62	NC_015658	CAAA	2	8	30209	30216	75 %	0 %	0 %	25 %	336251775
63	NC_015658	AATT	2	8	30767	30774	50 %	50 %	0 %	0 %	336251776
64	NC_015658	AAAC	2	8	31842	31849	75 %	0 %	0 %	25 %	336251776
65	NC_015658	ATCT	2	8	31870	31877	25 %	50 %	0 %	25 %	336251776
66	NC_015658	CGAA	2	8	32109	32116	50 %	0 %	25 %	25 %	336251777
67	NC_015658	ATTC	2	8	32267	32274	25 %	50 %	0 %	25 %	336251777
68	NC_015658	CGAA	2	8	32612	32619	50 %	0 %	25 %	25 %	336251777
69	NC_015658	GGTC	2	8	33036	33043	0 %	25 %	50 %	25 %	336251777
70	NC_015658	GAAC	2	8	33380	33387	50 %	0 %	25 %	25 %	336251777
71	NC_015658	ATTT	2	8	34494	34501	25 %	75 %	0 %	0 %	336251778
72	NC_015658	TTCT	2	8	34723	34730	0 %	75 %	0 %	25 %	336251778
73	NC_015658	CGAT	2	8	34970	34977	25 %	25 %	25 %	25 %	336251778
74	NC_015658	ATCC	2	8	35124	35131	25 %	25 %	0 %	50 %	336251778
75	NC_015658	ACGA	3	12	35270	35281	50 %	0 %	25 %	25 %	336251778
76	NC_015658	ACCG	2	8	35481	35488	25 %	0 %	25 %	50 %	336251779
77	NC_015658	ATTT	2	8	35498	35505	25 %	75 %	0 %	0 %	336251779
78	NC_015658	ATCG	2	8	36869	36876	25 %	25 %	25 %	25 %	336251780
79	NC_015658	CGTC	2	8	37249	37256	0 %	25 %	25 %	50 %	336251780
80	NC_015658	TTCC	2	8	37604	37611	0 %	50 %	0 %	50 %	336251780
81	NC_015658	GTTC	2	8	37829	37836	0 %	50 %	25 %	25 %	336251780
82	NC_015658	TTCG	2	8	38265	38272	0 %	50 %	25 %	25 %	336251781
83	NC_015658	CTCC	2	8	38298	38305	0 %	25 %	0 %	75 %	336251781
84	NC_015658	GACG	2	8	38539	38546	25 %	0 %	50 %	25 %	336251781
85	NC_015658	CCGA	2	8	38770	38777	25 %	0 %	25 %	50 %	336251781
86	NC_015658	GAAC	2	8	38928	38935	50 %	0 %	25 %	25 %	336251781
87	NC_015658	CGAC	2	8	39149	39156	25 %	0 %	25 %	50 %	336251781
88	NC_015658	CGTC	2	8	39686	39693	0 %	25 %	25 %	50 %	336251782
89	NC_015658	ACGA	2	8	39807	39814	50 %	0 %	25 %	25 %	336251782
90	NC_015658	CGTG	2	8	39824	39831	0 %	25 %	50 %	25 %	336251782
91	NC_015658	CGTG	2	8	40142	40149	0 %	25 %	50 %	25 %	336251782
92	NC_015658	AGAA	2	8	40168	40175	75 %	0 %	25 %	0 %	336251782
93	NC_015658	CGTT	2	8	40216	40223	0 %	50 %	25 %	25 %	336251782
94	NC_015658	CGAC	2	8	41397	41404	25 %	0 %	25 %	50 %	336251783
95	NC_015658	ACGT	2	8	42521	42528	25 %	25 %	25 %	25 %	336251784
96	NC_015658	CCCG	2	8	42838	42845	0 %	0 %	25 %	75 %	336251784
97	NC_015658	CGTT	2	8	43136	43143	0 %	50 %	25 %	25 %	336251785
98	NC_015658	CGGT	2	8	43418	43425	0 %	25 %	50 %	25 %	336251785
99	NC_015658	GTCG	2	8	43537	43544	0 %	25 %	50 %	25 %	336251785
100	NC_015658	TACG	2	8	44559	44566	25 %	25 %	25 %	25 %	336251786
101	NC_015658	CCGT	2	8	44707	44714	0 %	25 %	25 %	50 %	336251786
102	NC_015658	TCGA	2	8	44876	44883	25 %	25 %	25 %	25 %	336251786
103	NC_015658	GACG	2	8	45147	45154	25 %	0 %	50 %	25 %	336251786
104	NC_015658	CGGT	2	8	45210	45217	0 %	25 %	50 %	25 %	336251786
105	NC_015658	GATG	2	8	45615	45622	25 %	25 %	50 %	0 %	336251786
106	NC_015658	CGTC	2	8	45852	45859	0 %	25 %	25 %	50 %	336251787
107	NC_015658	CGTC	2	8	45888	45895	0 %	25 %	25 %	50 %	336251787
108	NC_015658	GTCG	2	8	45981	45988	0 %	25 %	50 %	25 %	336251787
109	NC_015658	CGCC	2	8	46222	46229	0 %	0 %	25 %	75 %	336251787
110	NC_015658	TCGA	2	8	46250	46257	25 %	25 %	25 %	25 %	336251787
111	NC_015658	GCTG	2	8	46266	46273	0 %	25 %	50 %	25 %	336251787
112	NC_015658	CGAG	2	8	46593	46600	25 %	0 %	50 %	25 %	336251787
113	NC_015658	CGGT	2	8	46650	46657	0 %	25 %	50 %	25 %	336251787
114	NC_015658	TTAC	2	8	47401	47408	25 %	50 %	0 %	25 %	336251788
115	NC_015658	ACCG	2	8	47782	47789	25 %	0 %	25 %	50 %	336251788
116	NC_015658	ACGA	2	8	48120	48127	50 %	0 %	25 %	25 %	336251789
117	NC_015658	TCGA	2	8	48189	48196	25 %	25 %	25 %	25 %	336251789
118	NC_015658	TCGA	2	8	48513	48520	25 %	25 %	25 %	25 %	336251789
119	NC_015658	GGTT	2	8	48567	48574	0 %	50 %	50 %	0 %	336251789
120	NC_015658	GATC	2	8	49576	49583	25 %	25 %	25 %	25 %	336251790
121	NC_015658	CGAG	2	8	49695	49702	25 %	0 %	50 %	25 %	336251790
122	NC_015658	TCGC	2	8	50081	50088	0 %	25 %	25 %	50 %	336251790
123	NC_015658	TCGG	2	8	50510	50517	0 %	25 %	50 %	25 %	336251790
124	NC_015658	GATT	2	8	50710	50717	25 %	50 %	25 %	0 %	336251790
125	NC_015658	GTCC	2	8	50910	50917	0 %	25 %	25 %	50 %	336251791
126	NC_015658	CAGT	2	8	50950	50957	25 %	25 %	25 %	25 %	336251791
127	NC_015658	GTTC	2	8	50958	50965	0 %	50 %	25 %	25 %	336251791
128	NC_015658	GACG	2	8	51387	51394	25 %	0 %	50 %	25 %	336251792
129	NC_015658	CTCG	2	8	51628	51635	0 %	25 %	25 %	50 %	336251792
130	NC_015658	CACG	2	8	51834	51841	25 %	0 %	25 %	50 %	336251792
131	NC_015658	GACG	2	8	52005	52012	25 %	0 %	50 %	25 %	336251792
132	NC_015658	TCGT	2	8	52119	52126	0 %	50 %	25 %	25 %	336251792
133	NC_015658	CTCG	2	8	52477	52484	0 %	25 %	25 %	50 %	336251793
134	NC_015658	TCGA	2	8	53129	53136	25 %	25 %	25 %	25 %	336251793
135	NC_015658	CGTC	2	8	53185	53192	0 %	25 %	25 %	50 %	336251793
136	NC_015658	GCCG	2	8	55296	55303	0 %	0 %	50 %	50 %	336251796
137	NC_015658	CGGT	2	8	56649	56656	0 %	25 %	50 %	25 %	336251797
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