MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 plasmid pHALXA01

Total Repeats: 7986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015658	AAG	2	6	8	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015658	CTC	2	6	69	74	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251751
3	NC_015658	TCA	2	6	91	96	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251751
4	NC_015658	CTC	2	6	114	119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251751
5	NC_015658	GCA	2	6	187	192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251751
6	NC_015658	CTT	2	6	257	262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251751
7	NC_015658	CCT	2	6	348	353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251751
8	NC_015658	CGA	2	6	491	496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251751
9	NC_015658	AGT	2	6	595	600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251751
10	NC_015658	TAG	2	6	613	618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251751
11	NC_015658	CTT	2	6	626	631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251751
12	NC_015658	TTC	2	6	735	740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251751
13	NC_015658	TAA	2	6	833	838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015658	TCC	2	6	1034	1039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_015658	TTC	2	6	1055	1060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015658	ATT	2	6	1522	1527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015658	TGG	2	6	1600	1605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015658	AGA	2	6	1705	1710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015658	GTT	2	6	1776	1781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015658	TTC	2	6	1803	1808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015658	CCG	2	6	1830	1835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_015658	GTC	2	6	1853	1858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015658	GTT	2	6	1916	1921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015658	GTC	2	6	2121	2126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251752
25	NC_015658	CGC	2	6	2181	2186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_015658	CGC	3	9	2232	2240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_015658	GCA	2	6	2251	2256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015658	CAC	2	6	2289	2294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_015658	CCT	2	6	2318	2323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_015658	CTG	2	6	2405	2410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015658	TCG	2	6	2430	2435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015658	CTC	2	6	2490	2495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_015658	ATT	2	6	2508	2513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015658	GCC	2	6	2774	2779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_015658	TGG	2	6	2874	2879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015658	TAC	2	6	2910	2915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015658	CTG	2	6	2991	2996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015658	TAA	2	6	3014	3019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015658	CTT	2	6	3089	3094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015658	AGG	2	6	3147	3152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015658	TGC	2	6	3345	3350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015658	AGG	2	6	3462	3467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015658	AGT	2	6	3586	3591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015658	GAT	2	6	3617	3622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015658	TCC	2	6	3858	3863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_015658	ATG	2	6	3911	3916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015658	TCT	2	6	3957	3962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015658	AGA	2	6	4010	4015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015658	TCT	2	6	4021	4026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015658	TCG	2	6	4172	4177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015658	CTG	2	6	4255	4260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251753
52	NC_015658	GAC	3	9	4264	4272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251753
53	NC_015658	ATC	2	6	4306	4311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251753
54	NC_015658	CGA	2	6	4335	4340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251753
55	NC_015658	AAC	2	6	4958	4963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251754
56	NC_015658	ATT	2	6	5147	5152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336251754
57	NC_015658	CGG	2	6	5215	5220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251754
58	NC_015658	ATC	2	6	5278	5283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251754
59	NC_015658	AAC	2	6	5300	5305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251754
60	NC_015658	AGG	2	6	5321	5326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251754
61	NC_015658	TGA	2	6	5328	5333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251754
62	NC_015658	ACT	2	6	5488	5493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251754
63	NC_015658	TTC	2	6	5515	5520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015658	ACA	2	6	5563	5568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015658	CCT	2	6	5577	5582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_015658	CCA	2	6	5668	5673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336251755
67	NC_015658	CGT	2	6	5675	5680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251755
68	NC_015658	GTC	2	6	5860	5865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251755
69	NC_015658	ACG	2	6	5919	5924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251755
70	NC_015658	GTC	3	9	5951	5959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251755
71	NC_015658	CTG	2	6	6016	6021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251755
72	NC_015658	CAA	2	6	6093	6098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251755
73	NC_015658	TCG	2	6	6105	6110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251755
74	NC_015658	ACG	2	6	6220	6225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251755
75	NC_015658	TTC	2	6	6275	6280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251755
76	NC_015658	AAC	2	6	6301	6306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251755
77	NC_015658	TGC	2	6	6308	6313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251755
78	NC_015658	TGA	2	6	6587	6592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015658	CTA	2	6	6700	6705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015658	GCC	3	9	6764	6772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_015658	TCG	2	6	6869	6874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015658	CTG	2	6	6899	6904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015658	TCG	2	6	6922	6927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251756
84	NC_015658	GAT	2	6	6960	6965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251756
85	NC_015658	GTC	2	6	6981	6986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251756
86	NC_015658	CGA	3	9	6992	7000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251756
87	NC_015658	TCG	2	6	7048	7053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251756
88	NC_015658	CTG	2	6	7077	7082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251756
89	NC_015658	TGG	2	6	7114	7119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336251756
90	NC_015658	TCG	2	6	7138	7143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251756
91	NC_015658	TCG	2	6	7195	7200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251756
92	NC_015658	TGA	2	6	7391	7396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251756
93	NC_015658	GAC	2	6	7418	7423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251756
94	NC_015658	TAC	2	6	7627	7632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015658	CGA	3	9	7738	7746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251757
96	NC_015658	CGA	2	6	7751	7756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251757
97	NC_015658	GTC	3	9	7764	7772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251757
98	NC_015658	GAC	2	6	7798	7803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251757
99	NC_015658	CGA	2	6	7805	7810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251757
100	NC_015658	GAG	2	6	7836	7841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251757
101	NC_015658	CGG	2	6	7874	7879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251757
102	NC_015658	CGA	2	6	7919	7924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251757
103	NC_015658	ACT	2	6	7931	7936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251757
104	NC_015658	TCC	2	6	7957	7962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251757
105	NC_015658	GAG	2	6	7986	7991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251757
106	NC_015658	GAT	2	6	8024	8029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251757
107	NC_015658	GAC	3	9	8039	8047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251757
108	NC_015658	CGA	2	6	8177	8182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251757
109	NC_015658	CGA	2	6	8231	8236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251757
110	NC_015658	CGA	2	6	8417	8422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251757
111	NC_015658	CGA	2	6	8438	8443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251757
112	NC_015658	GTC	2	6	8445	8450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251757
113	NC_015658	ACT	2	6	8489	8494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251757
114	NC_015658	ACG	2	6	8608	8613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251757
115	NC_015658	CCG	2	6	8616	8621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251757
116	NC_015658	AAC	2	6	8625	8630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251757
117	NC_015658	CCT	2	6	8666	8671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251757
118	NC_015658	CGA	2	6	8681	8686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251757
119	NC_015658	CGC	2	6	8699	8704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251757
120	NC_015658	CAT	2	6	8801	8806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251757
121	NC_015658	CGC	2	6	8836	8841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251757
122	NC_015658	GAC	2	6	8883	8888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251757
123	NC_015658	CGA	2	6	8954	8959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251757
124	NC_015658	GAG	2	6	8997	9002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251757
125	NC_015658	ATA	2	6	9201	9206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015658	ATG	2	6	9224	9229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015658	TAT	2	6	9238	9243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015658	TAG	2	6	9254	9259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015658	CGC	2	6	9327	9332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_015658	AAT	2	6	9335	9340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015658	GCC	2	6	9387	9392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_015658	AAC	2	6	9474	9479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015658	GTC	2	6	9734	9739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251758
134	NC_015658	GCC	2	6	9813	9818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251758
135	NC_015658	CGA	2	6	9889	9894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251758
136	NC_015658	TGA	2	6	9925	9930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251758
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138	NC_015658	CGT	2	6	9970	9975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251758
139	NC_015658	CTG	2	6	10010	10015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251758
140	NC_015658	TGA	2	6	10084	10089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251758
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143	NC_015658	TCC	2	6	10236	10241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251758
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159	NC_015658	ACG	2	6	10998	11003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_015658	GTG	2	6	11137	11142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336251759
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252	NC_015658	ATA	2	6	16360	16365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336251762
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260	NC_015658	ATA	2	6	16777	16782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336251762
261	NC_015658	TCT	2	6	16783	16788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251762
262	NC_015658	CCG	2	6	16848	16853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251762
263	NC_015658	TTA	2	6	16858	16863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336251762
264	NC_015658	GTC	2	6	16884	16889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251762
265	NC_015658	TCG	2	6	17052	17057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_015658	CGA	2	6	17108	17113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_015658	ACG	2	6	17225	17230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_015658	ACT	2	6	17253	17258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
269	NC_015658	GCG	2	6	17298	17303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_015658	ACG	2	6	17308	17313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_015658	GAG	2	6	17322	17327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
272	NC_015658	GAC	2	6	17378	17383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_015658	TCC	2	6	17600	17605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251763
274	NC_015658	TCG	2	6	17765	17770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251763
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280	NC_015658	TCG	2	6	18304	18309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251764
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293	NC_015658	CGA	2	6	19571	19576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251765
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310	NC_015658	CTC	2	6	20235	20240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251766
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312	NC_015658	CGA	2	6	20310	20315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251766
313	NC_015658	CGA	2	6	20325	20330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251766
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343	NC_015658	GAG	2	6	21955	21960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251766
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345	NC_015658	ACC	2	6	22080	22085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
346	NC_015658	TGG	2	6	22310	22315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336251767
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379	NC_015658	GAT	2	6	23990	23995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251770
380	NC_015658	CGT	2	6	24001	24006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251770
381	NC_015658	GCT	2	6	24094	24099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251770
382	NC_015658	GCC	2	6	24119	24124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251770
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