MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 plasmid pHALXA01

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015658	C	6	6	2139	2144	0 %	0 %	0 %	100 %	336251752
2	NC_015658	A	6	6	3253	3258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015658	C	6	6	4638	4643	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4	NC_015658	G	7	7	9797	9803	0 %	0 %	100 %	0 %	336251758
5	NC_015658	C	6	6	21562	21567	0 %	0 %	0 %	100 %	336251766
6	NC_015658	A	6	6	23927	23932	100 %	0 %	0 %	0 %	336251770
7	NC_015658	A	6	6	31180	31185	100 %	0 %	0 %	0 %	336251776
8	NC_015658	T	6	6	33812	33817	0 %	100 %	0 %	0 %	336251777
9	NC_015658	T	6	6	36549	36554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015658	T	6	6	36835	36840	0 %	100 %	0 %	0 %	336251780
11	NC_015658	T	6	6	38755	38760	0 %	100 %	0 %	0 %	336251781
12	NC_015658	C	6	6	38866	38871	0 %	0 %	0 %	100 %	336251781
13	NC_015658	C	6	6	44661	44666	0 %	0 %	0 %	100 %	336251786
14	NC_015658	A	6	6	47034	47039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015658	C	6	6	57990	57995	0 %	0 %	0 %	100 %	336251798
16	NC_015658	G	6	6	88931	88936	0 %	0 %	100 %	0 %	336251816
17	NC_015658	G	6	6	106582	106587	0 %	0 %	100 %	0 %	336251830
18	NC_015658	C	6	6	111340	111345	0 %	0 %	0 %	100 %	336251833
19	NC_015658	A	6	6	122971	122976	100 %	0 %	0 %	0 %	336251844
20	NC_015658	G	6	6	156216	156221	0 %	0 %	100 %	0 %	336251877
21	NC_015658	C	6	6	161491	161496	0 %	0 %	0 %	100 %	336251880
22	NC_015658	G	6	6	162014	162019	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015658	G	6	6	183804	183809	0 %	0 %	100 %	0 %	336251899
24	NC_015658	C	6	6	184356	184361	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25	NC_015658	G	6	6	185631	185636	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015658	A	6	6	192632	192637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015658	T	6	6	201839	201844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015658	C	6	6	205648	205653	0 %	0 %	0 %	100 %	336251913
29	NC_015658	G	6	6	208307	208312	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015658	G	6	6	221996	222001	0 %	0 %	100 %	0 %	336251923
31	NC_015658	T	6	6	243512	243517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015658	G	6	6	247140	247145	0 %	0 %	100 %	0 %	336251947
33	NC_015658	G	6	6	249744	249749	0 %	0 %	100 %	0 %	336251950
34	NC_015658	C	6	6	250248	250253	0 %	0 %	0 %	100 %	336251951
35	NC_015658	C	6	6	255400	255405	0 %	0 %	0 %	100 %	336251954
36	NC_015658	C	6	6	258271	258276	0 %	0 %	0 %	100 %	336251955
37	NC_015658	G	6	6	261801	261806	0 %	0 %	100 %	0 %	336251956
38	NC_015658	C	6	6	272560	272565	0 %	0 %	0 %	100 %	336251962
39	NC_015658	C	6	6	273257	273262	0 %	0 %	0 %	100 %	336251963
40	NC_015658	G	6	6	285759	285764	0 %	0 %	100 %	0 %	336251977
41	NC_015658	A	6	6	292510	292515	100 %	0 %	0 %	0 %	336251984
42	NC_015658	A	6	6	293064	293069	100 %	0 %	0 %	0 %	336251984
43	NC_015658	G	6	6	305751	305756	0 %	0 %	100 %	0 %	336251994
44	NC_015658	G	6	6	316200	316205	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015658	C	6	6	320561	320566	0 %	0 %	0 %	100 %	336252006
46	NC_015658	A	6	6	321419	321424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015658	A	6	6	322744	322749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015658	A	6	6	325486	325491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015658	A	6	6	326209	326214	100 %	0 %	0 %	0 %	336252011
50	NC_015658	A	6	6	326951	326956	100 %	0 %	0 %	0 %	336252012
51	NC_015658	T	6	6	334057	334062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015658	G	6	6	344741	344746	0 %	0 %	100 %	0 %	336252029
53	NC_015658	C	8	8	401006	401013	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
54	NC_015658	C	6	6	401836	401841	0 %	0 %	0 %	100 %	336252074
55	NC_015658	A	6	6	403985	403990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015658	G	6	6	414420	414425	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015658	A	6	6	421394	421399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015658	T	6	6	433611	433616	0 %	100 %	0 %	0 %	336252094
59	NC_015658	A	7	7	435081	435087	100 %	0 %	0 %	0 %	336252095

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.