MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Frankia symbiont of Datisca glomerata chromosome

Total Repeats: 105721

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015656	CCG	2	6	15	20	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_015656	GAG	2	6	244	249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336176140
3	NC_015656	GAC	2	6	250	255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176140
4	NC_015656	CTC	2	6	271	276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336176140
5	NC_015656	GAC	2	6	292	297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176140
6	NC_015656	GAC	2	6	325	330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176140
7	NC_015656	CCG	2	6	399	404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176140
8	NC_015656	CGC	3	9	428	436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176140
9	NC_015656	TCT	2	6	483	488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336176140
10	NC_015656	CAG	2	6	550	555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176140
11	NC_015656	CGA	2	6	570	575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176140
12	NC_015656	CGA	2	6	630	635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176140
13	NC_015656	AGC	2	6	641	646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176140
14	NC_015656	CGG	2	6	660	665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176140
15	NC_015656	CCG	2	6	714	719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176140
16	NC_015656	TCC	2	6	734	739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336176140
17	NC_015656	CCG	2	6	740	745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176140
18	NC_015656	CGG	3	9	816	824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176140
19	NC_015656	TCA	2	6	846	851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336176140
20	NC_015656	AGC	2	6	853	858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015656	GCC	2	6	964	969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176141
22	NC_015656	ACC	2	6	997	1002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336176141
23	NC_015656	CGT	2	6	1056	1061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176141
24	NC_015656	GCT	2	6	1182	1187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176141
25	NC_015656	GCC	2	6	1213	1218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176141
26	NC_015656	TTG	2	6	1259	1264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336176141
27	NC_015656	CGG	2	6	1332	1337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176141
28	NC_015656	TTG	2	6	1382	1387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336176141
29	NC_015656	TTC	2	6	1439	1444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336176141
30	NC_015656	TTC	2	6	1457	1462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336176141
31	NC_015656	GGC	3	9	1517	1525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176141
32	NC_015656	TCT	2	6	1527	1532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336176141
33	NC_015656	CTG	2	6	1546	1551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176141
34	NC_015656	TGG	2	6	1569	1574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336176141
35	NC_015656	CAG	2	6	1585	1590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176141
36	NC_015656	CTG	2	6	1669	1674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176141
37	NC_015656	CGT	2	6	1723	1728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176141
38	NC_015656	CGA	3	9	1807	1815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176141
39	NC_015656	AGC	2	6	1844	1849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176141
40	NC_015656	CTG	2	6	1864	1869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176141
41	NC_015656	CGC	2	6	1914	1919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176141
42	NC_015656	AGC	2	6	2006	2011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176141
43	NC_015656	CTG	2	6	2056	2061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176141
44	NC_015656	CAG	2	6	2182	2187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176141
45	NC_015656	GAC	2	6	2188	2193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176141
46	NC_015656	GAA	2	6	2209	2214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336176141
47	NC_015656	AGA	2	6	2253	2258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336176141
48	NC_015656	CGC	2	6	2269	2274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176141
49	NC_015656	CGG	2	6	2415	2420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176142
50	NC_015656	CCG	2	6	2444	2449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176142
51	NC_015656	GGC	2	6	2460	2465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176142
52	NC_015656	GCC	2	6	2535	2540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176142
53	NC_015656	GCC	2	6	2543	2548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176142
54	NC_015656	GCC	2	6	2554	2559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176142
55	NC_015656	ACG	2	6	2575	2580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176142
56	NC_015656	ATC	2	6	2669	2674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336176142
57	NC_015656	CAC	2	6	2704	2709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336176142
58	NC_015656	GCC	2	6	2742	2747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176142
59	NC_015656	GGC	2	6	2761	2766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176142
60	NC_015656	ACG	2	6	2780	2785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176142
61	NC_015656	GGT	2	6	2856	2861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336176143
62	NC_015656	CGG	2	6	3020	3025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176143
63	NC_015656	ACG	2	6	3112	3117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176143
64	NC_015656	GAC	2	6	3141	3146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176143
65	NC_015656	ACC	2	6	3156	3161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336176143
66	NC_015656	GCA	2	6	3281	3286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176143
67	NC_015656	GCG	2	6	3346	3351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176144
68	NC_015656	CGG	2	6	3422	3427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176144
69	NC_015656	ACA	2	6	3487	3492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015656	CGC	2	6	3549	3554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_015656	CCG	2	6	3581	3586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_015656	CGG	2	6	3600	3605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015656	GCG	2	6	3640	3645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015656	GAC	2	6	3693	3698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015656	GGT	2	6	3723	3728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015656	GGA	2	6	3772	3777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015656	CCG	2	6	3812	3817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176145
78	NC_015656	CCG	2	6	3857	3862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176145
79	NC_015656	CAG	2	6	3910	3915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176145
80	NC_015656	GCT	2	6	3966	3971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176145
81	NC_015656	CTG	2	6	4408	4413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176145
82	NC_015656	GGA	2	6	4476	4481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336176145
83	NC_015656	TCA	2	6	4496	4501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336176145
84	NC_015656	GAC	2	6	4513	4518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176145
85	NC_015656	GCA	2	6	4521	4526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176145
86	NC_015656	CGC	2	6	4537	4542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176145
87	NC_015656	GAC	2	6	4570	4575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176145
88	NC_015656	AGG	2	6	4607	4612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336176145
89	NC_015656	TTC	2	6	4615	4620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336176145
90	NC_015656	TGC	2	6	4634	4639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176145
91	NC_015656	TCC	2	6	4666	4671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336176145
92	NC_015656	AGC	2	6	4685	4690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176145
93	NC_015656	GGA	2	6	4701	4706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336176145
94	NC_015656	GAA	2	6	4788	4793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336176145
95	NC_015656	GCC	2	6	4795	4800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176145
96	NC_015656	GGA	2	6	5043	5048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336176145
97	NC_015656	CGG	2	6	5157	5162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176145
98	NC_015656	CTG	2	6	5361	5366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015656	CGG	2	6	5450	5455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015656	AAC	2	6	5516	5521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015656	CGG	2	6	5548	5553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015656	ACG	2	6	5665	5670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015656	AAC	2	6	5691	5696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015656	GCC	2	6	5852	5857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_015656	TGG	2	6	5900	5905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015656	GTC	2	6	5977	5982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015656	GCC	2	6	5985	5990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_015656	GCA	2	6	5992	5997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015656	CAG	3	9	6019	6027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015656	GAC	2	6	6103	6108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176146
111	NC_015656	GCC	2	6	6241	6246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176146
112	NC_015656	CGA	2	6	6263	6268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176146
113	NC_015656	AGG	2	6	6275	6280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336176146
114	NC_015656	GCT	2	6	6303	6308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176146
115	NC_015656	GGT	2	6	6369	6374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336176146
116	NC_015656	GAC	2	6	6421	6426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176146
117	NC_015656	GCC	2	6	6438	6443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176146
118	NC_015656	CGG	2	6	6449	6454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176146
119	NC_015656	GCG	2	6	6475	6480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176146
120	NC_015656	GAC	2	6	6523	6528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176146
121	NC_015656	GGC	2	6	6781	6786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176146
122	NC_015656	TGG	2	6	6806	6811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336176146
123	NC_015656	GCT	2	6	6837	6842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176146
124	NC_015656	CGC	2	6	6918	6923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176146
125	NC_015656	CGA	2	6	6954	6959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176146
126	NC_015656	ACG	2	6	7025	7030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176146
127	NC_015656	CGT	2	6	7058	7063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176146
128	NC_015656	GTC	2	6	7099	7104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176146
129	NC_015656	TGA	2	6	7125	7130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336176146
130	NC_015656	AAG	2	6	7147	7152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336176146
131	NC_015656	CGA	2	6	7179	7184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176146
132	NC_015656	TGG	2	6	7263	7268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336176147
133	NC_015656	CTG	2	6	7295	7300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176147
134	NC_015656	TCG	2	6	7323	7328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176147
135	NC_015656	CTG	2	6	7355	7360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176147
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254	NC_015656	GAG	2	6	13529	13534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336176150
255	NC_015656	TCG	2	6	13545	13550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176150
256	NC_015656	CGA	2	6	13561	13566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176150
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258	NC_015656	CGT	3	9	13633	13641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176150
259	NC_015656	CGG	2	6	13654	13659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176150
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385	NC_015656	GCT	2	6	19969	19974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176154
386	NC_015656	CGC	2	6	19987	19992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176154
387	NC_015656	GCC	2	6	20063	20068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176154
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406	NC_015656	GCA	2	6	20733	20738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176154
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414	NC_015656	CAA	2	6	21039	21044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336176155
415	NC_015656	TGC	2	6	21059	21064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176155
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427	NC_015656	GCC	2	6	21709	21714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176155
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439	NC_015656	GCG	2	6	22208	22213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176156
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442	NC_015656	TCG	2	6	22354	22359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176156
443	NC_015656	GCA	2	6	22620	22625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176156
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446	NC_015656	CGA	2	6	22729	22734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176157
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451	NC_015656	GCC	2	6	22847	22852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176157
452	NC_015656	GAG	2	6	22895	22900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336176157
453	NC_015656	CGA	2	6	22954	22959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176157
454	NC_015656	ACG	2	6	22989	22994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176157
455	NC_015656	CAT	2	6	22999	23004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336176157
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458	NC_015656	CAC	2	6	23259	23264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336176158
459	NC_015656	GGC	2	6	23314	23319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176158
460	NC_015656	TCG	2	6	23375	23380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176158
461	NC_015656	ACC	2	6	23383	23388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336176158
462	NC_015656	CGT	2	6	23409	23414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176158
463	NC_015656	CGG	2	6	23415	23420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176158
464	NC_015656	CCG	2	6	23429	23434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176158
465	NC_015656	GAG	2	6	23473	23478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336176158
466	NC_015656	CGC	2	6	23510	23515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176158
467	NC_015656	ATG	2	6	23560	23565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336176158
468	NC_015656	CGC	2	6	23591	23596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176158
469	NC_015656	GTC	2	6	23683	23688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176158
470	NC_015656	CGC	2	6	23696	23701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176158
471	NC_015656	CCG	2	6	23702	23707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176158
472	NC_015656	CGA	3	9	23799	23807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176158
473	NC_015656	CGA	2	6	23853	23858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176158
474	NC_015656	GGA	2	6	23946	23951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336176158
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477	NC_015656	CCG	3	9	24143	24151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176158
478	NC_015656	GGA	2	6	24174	24179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336176158
479	NC_015656	CGC	2	6	24231	24236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176158
480	NC_015656	TGC	2	6	24239	24244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176158
481	NC_015656	GTC	2	6	24316	24321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176158
482	NC_015656	GCG	2	6	24323	24328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176158
483	NC_015656	GGC	2	6	24348	24353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176158
484	NC_015656	CGT	2	6	24381	24386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176158
485	NC_015656	ACC	2	6	24400	24405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336176158
486	NC_015656	CGC	2	6	24477	24482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176158
487	NC_015656	GGT	2	6	24483	24488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336176158
488	NC_015656	CGC	3	9	24573	24581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176158
489	NC_015656	TGC	2	6	24602	24607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176158
490	NC_015656	CGT	2	6	24609	24614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176158
491	NC_015656	GCT	2	6	24654	24659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176158
492	NC_015656	GCC	2	6	24694	24699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176158
493	NC_015656	GCA	2	6	24749	24754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
494	NC_015656	GCC	2	6	24920	24925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
495	NC_015656	GGT	2	6	25064	25069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336176159
496	NC_015656	GGT	2	6	25145	25150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336176159
497	NC_015656	CGG	2	6	25205	25210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176159
498	NC_015656	CGA	2	6	25232	25237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176159
499	NC_015656	GAC	2	6	25254	25259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176159
500	NC_015656	CGG	2	6	25409	25414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176159

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