MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lacinutrix sp. 5H-3-7-4 chromosome

Total Repeats: 166

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015638	TTAAAA	2	12	12109	12120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015638	TATAAT	2	12	20444	20455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015638	TTAGTT	2	12	23550	23561	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015638	ATTTAA	2	12	45231	45242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015638	GTTTAA	2	12	67310	67321	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015638	ACATTA	2	12	81290	81301	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_015638	TTAAAT	2	12	90458	90469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015638	TTTAAT	2	12	96342	96353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015638	TAATTA	2	12	120536	120547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015638	AGCAAA	2	12	135739	135750	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015638	TTTTGA	2	12	140889	140900	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015638	TATCTT	2	12	152470	152481	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_015638	TTTCGC	2	12	153136	153147	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015638	GGTTTT	2	12	157830	157841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015638	TAAAAT	2	12	161000	161011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015638	TTACTT	2	12	185842	185853	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_015638	TTTTTG	2	12	206530	206541	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015638	TTTTTA	2	12	217681	217692	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015638	GAAAAA	2	12	289170	289181	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015638	ACTTTA	2	12	292822	292833	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015638	ACAATT	2	12	304263	304274	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_015638	GTACAA	2	12	304276	304287	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_015638	CAGTTA	2	12	304333	304344	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015638	TTTTTA	2	12	305448	305459	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015638	TATACA	2	12	331825	331836	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_015638	TTACAT	2	12	340196	340207	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015638	AATTCA	2	12	349089	349100	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_015638	CAATAA	2	12	365395	365406	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_015638	TTAAAA	2	12	401974	401985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015638	TTTTAT	2	12	476009	476020	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015638	ATTTTA	2	12	481673	481684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015638	GAATTT	2	12	486538	486549	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015638	TTTCGC	2	12	549431	549442	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015638	AATATA	2	12	582619	582630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015638	TTTTGT	2	12	596845	596856	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015638	TTTAAT	2	12	628046	628057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015638	AAATTA	2	12	640604	640615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015638	TTTTTA	2	12	649317	649328	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015638	ATTTAT	2	12	714403	714414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015638	TAAAAA	2	12	792589	792600	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015638	CTTTTA	2	12	806763	806774	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_015638	TAAAAA	2	12	840907	840918	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015638	TTTTAT	2	12	843747	843758	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015638	CTCTTT	2	12	846936	846947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015638	TTTTAA	2	12	851845	851856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015638	TAAATA	2	12	869318	869329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015638	TTTTAA	2	12	880987	880998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015638	TAAAAT	2	12	900303	900314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015638	TTTTGT	2	12	916099	916110	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015638	ACAAAC	2	12	943627	943638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015638	ATTTTT	2	12	1048963	1048974	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015638	TAAAAA	2	12	1100595	1100606	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015638	AATTTT	2	12	1102101	1102112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015638	AAATTC	2	12	1123570	1123581	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_015638	CTTAAA	2	12	1148704	1148715	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015638	TTTAAG	2	12	1163495	1163506	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015638	TATTTT	2	12	1163752	1163763	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015638	TATTTT	2	12	1181853	1181864	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015638	ATTTTC	2	12	1240807	1240818	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015638	GAAAAA	2	12	1257448	1257459	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015638	TTTTTA	2	12	1271684	1271695	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015638	TTAAAA	2	12	1274282	1274293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015638	AGAAAT	2	12	1352386	1352397	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015638	TAATTT	2	12	1355626	1355637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015638	CTGTTT	2	12	1359109	1359120	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_015638	ATTTTT	2	12	1374675	1374686	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015638	TTAATT	2	12	1385144	1385155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015638	TTTTTC	2	12	1388733	1388744	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_015638	ACATTT	2	12	1414936	1414947	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_015638	AAGAAA	2	12	1448555	1448566	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015638	AACTAA	2	12	1468562	1468573	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015638	AAATTT	2	12	1475854	1475865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015638	GTAAAA	2	12	1482918	1482929	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015638	TAACTT	2	12	1489307	1489318	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_015638	TATAAT	2	12	1493985	1493996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015638	ATTGTT	2	12	1496710	1496721	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015638	TTTTTA	2	12	1502777	1502788	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015638	TAATTT	2	12	1548589	1548600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015638	AAATTA	2	12	1563638	1563649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015638	TTTTTG	2	12	1575962	1575973	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015638	AATTTT	2	12	1611352	1611363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015638	AAAAAT	2	12	1611419	1611430	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015638	ACTTTA	2	12	1687930	1687941	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_015638	CTTAAA	2	12	1698056	1698067	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_015638	TTTGAT	2	12	1702154	1702165	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015638	TAAAAA	2	12	1702217	1702228	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015638	TCGCGC	2	12	1724264	1724275	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015638	TATTTT	2	12	1741295	1741306	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015638	GATTAA	2	12	1741714	1741725	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015638	TTTTTA	2	12	1765408	1765419	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015638	ATTCTA	2	12	1775673	1775684	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_015638	TAAAAA	2	12	1803284	1803295	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015638	GTATTA	2	12	1873933	1873944	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015638	ATTTTT	2	12	1891531	1891542	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015638	ATTAAT	2	12	1893726	1893737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015638	AGCTTT	2	12	1901841	1901852	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_015638	AATAAA	2	12	1931342	1931353	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015638	TATAAA	2	12	1952369	1952380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015638	TTAAAA	2	12	1955361	1955372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015638	TCAAAA	2	12	1961660	1961671	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_015638	ATAAAA	2	12	1970383	1970394	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015638	AATGAA	2	12	1980775	1980786	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015638	TAAAAA	2	12	2002481	2002492	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015638	AAGAAA	2	12	2011706	2011717	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015638	TTATAA	2	12	2027186	2027197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015638	ATTTTT	2	12	2035731	2035742	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015638	ATTAAA	2	12	2056887	2056898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015638	AGTTTT	2	12	2122507	2122518	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015638	AATTAA	2	12	2126054	2126065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015638	TGTTTT	2	12	2131417	2131428	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015638	TTTGTT	2	12	2141991	2142002	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015638	TTTAAA	2	12	2148002	2148013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015638	TTTACT	2	12	2156229	2156240	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_015638	AGCAAT	2	12	2163381	2163392	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_015638	TTAATT	2	12	2206464	2206475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015638	TTTAAA	2	12	2254723	2254734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015638	TCTAAA	4	24	2268053	2268076	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_015638	TTTAAA	2	12	2294166	2294177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015638	TTAAAA	2	12	2304058	2304069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015638	GTAAAA	2	12	2317093	2317104	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015638	TGATAA	2	12	2357296	2357307	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015638	ATTTTA	2	12	2381316	2381327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015638	ATACTT	2	12	2381400	2381411	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_015638	TATCAT	2	12	2381721	2381732	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_015638	AATAAA	2	12	2381828	2381839	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015638	TTAAAC	2	12	2406264	2406275	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_015638	AAATTA	2	12	2408873	2408884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015638	TAAAAA	2	12	2411141	2411152	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015638	TAACAC	2	12	2428503	2428514	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015638	AAAAAT	2	12	2467683	2467694	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015638	CATTTT	2	12	2469644	2469655	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_015638	TTTTTC	2	12	2484241	2484252	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_015638	ATATTA	2	12	2506822	2506833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015638	AACAAT	2	12	2513415	2513426	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_015638	TAATTT	2	12	2524905	2524916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015638	AATAAA	2	12	2536431	2536442	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015638	TATAAA	2	12	2549425	2549436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_015638	AAACCA	2	12	2562678	2562689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.