MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Lacinutrix sp. 5H-3-7-4 chromosome

Total Repeats: 2148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015638	GATGTC	2	12	337	348	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	336171144
2	NC_015638	TGAAAA	2	12	3487	3498	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	336171147
3	NC_015638	ATCAAA	2	12	7107	7118	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	336171151
4	NC_015638	TTTCAT	2	12	7139	7150	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	336171151
5	NC_015638	TGCATG	2	12	7194	7205	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	336171151
6	NC_015638	GACGTG	2	12	10866	10877	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	336171154
7	NC_015638	AATACA	2	12	12184	12195	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	336171156
8	NC_015638	AAAGAA	2	12	15718	15729	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	336171161
9	NC_015638	ATCTTG	2	12	17742	17753	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	336171163
10	NC_015638	TTTCTG	2	12	19691	19702	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	336171164
11	NC_015638	CTGGTG	2	12	19814	19825	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	336171164
12	NC_015638	GCTAAA	2	12	19945	19956	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	336171164
13	NC_015638	TTCAAT	2	12	23039	23050	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	336171167
14	NC_015638	ATATTA	2	12	24258	24269	50 %	50 %	0 %	0 %	336171169
15	NC_015638	TACAAA	2	12	24746	24757	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	336171170
16	NC_015638	GTATTT	2	12	25920	25931	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	336171170
17	NC_015638	ATTTTA	2	12	27312	27323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171171
18	NC_015638	ATTTTT	2	12	28604	28615	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	336171172
19	NC_015638	ATTAAA	2	12	29707	29718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171173
20	NC_015638	TTAAAT	2	12	41414	41425	50 %	50 %	0 %	0 %	336171181
21	NC_015638	ATTTAA	2	12	42048	42059	50 %	50 %	0 %	0 %	336171181
22	NC_015638	TAATAG	2	12	42351	42362	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	336171181
23	NC_015638	GTATTT	2	12	42629	42640	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	336171182
24	NC_015638	CCTTTT	2	12	42998	43009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336171183
25	NC_015638	ACCATC	2	12	43339	43350	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	336171183
26	NC_015638	TGCTTC	2	12	43522	43533	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	336171183
27	NC_015638	GTAAAT	2	12	48899	48910	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	336171187
28	NC_015638	AAACAG	2	12	49149	49160	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	336171188
29	NC_015638	GGAAAA	2	12	52009	52020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336171190
30	NC_015638	TGGTTT	2	12	53348	53359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336171192
31	NC_015638	AGAATC	2	12	53923	53934	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	336171193
32	NC_015638	ACCATC	2	12	53950	53961	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	336171193
33	NC_015638	CATCTG	2	12	53985	53996	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	336171193
34	NC_015638	ACCATC	2	12	54019	54030	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	336171193
35	NC_015638	TATCAT	2	12	54129	54140	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	336171193
36	NC_015638	TCACCA	2	12	54191	54202	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	336171193
37	NC_015638	TCTATC	2	12	54931	54942	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	336171193
38	NC_015638	AAACGA	2	12	57444	57455	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	336171197
39	NC_015638	TAATTT	2	12	57837	57848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171197
40	NC_015638	TCCTGG	2	12	59253	59264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336171198
41	NC_015638	TACAAA	2	12	60890	60901	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	336171201
42	NC_015638	ATTCTC	2	12	61732	61743	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	336171201
43	NC_015638	AAATTA	2	12	62124	62135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171202
44	NC_015638	TAAATT	2	12	62487	62498	50 %	50 %	0 %	0 %	336171203
45	NC_015638	ATTTAA	2	12	63204	63215	50 %	50 %	0 %	0 %	336171203
46	NC_015638	TTAGCT	2	12	66260	66271	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	336171206
47	NC_015638	TCTGCA	2	12	66401	66412	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	336171206
48	NC_015638	ATATCG	2	12	67277	67288	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	336171206
49	NC_015638	GCATCT	2	12	68143	68154	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	336171207
50	NC_015638	TGTAAA	2	12	68364	68375	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	336171207
51	NC_015638	CTTCAG	2	12	70772	70783	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	336171209
52	NC_015638	TTTAAA	2	12	73717	73728	50 %	50 %	0 %	0 %	336171211
53	NC_015638	TTACAT	2	12	76333	76344	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	336171213
54	NC_015638	TTTCTT	2	12	77430	77441	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	336171215
55	NC_015638	TCTAAG	2	12	77904	77915	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	336171216
56	NC_015638	TTTGTT	2	12	78728	78739	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	336171216
57	NC_015638	AAATTA	2	12	80809	80820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171218
58	NC_015638	CCTAAA	2	12	84914	84925	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	336171222
59	NC_015638	AAACCA	2	12	87819	87830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336171223
60	NC_015638	TACAAA	2	12	92471	92482	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	336171228
61	NC_015638	ATACCA	2	12	92647	92658	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	336171228
62	NC_015638	ACTTAA	2	12	93044	93055	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	336171228
63	NC_015638	ATTTTT	2	12	95886	95897	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	336171231
64	NC_015638	CTATTG	2	12	96062	96073	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	336171231
65	NC_015638	CCTGTT	2	12	97092	97103	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	336171232
66	NC_015638	TTTAAA	2	12	97692	97703	50 %	50 %	0 %	0 %	336171233
67	NC_015638	GTTTTT	2	12	99442	99453	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	336171234
68	NC_015638	CTATAC	2	12	102018	102029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336171236
69	NC_015638	CTCACT	2	12	103578	103589	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	336171239
70	NC_015638	GTTTAG	2	12	106281	106292	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	336171241
71	NC_015638	TAAATA	2	12	106748	106759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171242
72	NC_015638	AAAAAC	2	12	106766	106777	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	336171242
73	NC_015638	AGTTTA	2	12	110014	110025	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	336171244
74	NC_015638	TTTAAA	2	12	113610	113621	50 %	50 %	0 %	0 %	336171247
75	NC_015638	TTTAAA	2	12	115787	115798	50 %	50 %	0 %	0 %	336171249
76	NC_015638	CGCCTT	2	12	116230	116241	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	336171249
77	NC_015638	CATAAT	2	12	119232	119243	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	336171252
78	NC_015638	TTAATG	2	12	119991	120002	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	336171253
79	NC_015638	TTTTTA	2	12	122486	122497	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	336171255
80	NC_015638	GCAAAA	2	12	124312	124323	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	336171257
81	NC_015638	TTTTCA	2	12	126002	126013	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	336171259
82	NC_015638	TTTTAA	2	12	127584	127595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171261
83	NC_015638	ATAATT	2	12	131025	131036	50 %	50 %	0 %	0 %	336171264
84	NC_015638	TTTTCT	2	12	131393	131404	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	336171265
85	NC_015638	ATTAAA	2	12	132958	132969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171267
86	NC_015638	ATACTT	2	12	133941	133952	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	336171268
87	NC_015638	TACTGG	2	12	136435	136446	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	336171270
88	NC_015638	TAATAC	2	12	136804	136815	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	336171271
89	NC_015638	ATTTAG	2	12	141524	141535	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	336171274
90	NC_015638	AAATCT	2	12	141805	141816	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	336171274
91	NC_015638	TAAATA	2	12	143980	143991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171276
92	NC_015638	TTACTG	2	12	145346	145357	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	336171278
93	NC_015638	ATTTCA	2	12	145668	145679	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	336171278
94	NC_015638	TTTGAG	2	12	147511	147522	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	336171278
95	NC_015638	AATTTA	2	12	148916	148927	50 %	50 %	0 %	0 %	336171280
96	NC_015638	AAATCT	2	12	148971	148982	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	336171280
97	NC_015638	AAATGT	2	12	149043	149054	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	336171280
98	NC_015638	TCTATA	2	12	149948	149959	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	336171281
99	NC_015638	TGTTTT	2	12	151784	151795	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	336171283
100	NC_015638	CTTCGG	2	12	152184	152195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336171283
101	NC_015638	TTTTCA	2	12	158191	158202	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	336171291
102	NC_015638	ATTTTC	2	12	163635	163646	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	336171296
103	NC_015638	TGTATT	2	12	164293	164304	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	336171296
104	NC_015638	TTTACT	2	12	165669	165680	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	336171297
105	NC_015638	TTTAGT	2	12	166634	166645	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	336171297
106	NC_015638	ATAACT	2	12	168857	168868	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	336171300
107	NC_015638	TTTAAC	2	12	169142	169153	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	336171301
108	NC_015638	TCCTGG	2	12	172501	172512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336171304
109	NC_015638	TAAAAT	2	12	174880	174891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171305
110	NC_015638	TTAAAT	2	12	177273	177284	50 %	50 %	0 %	0 %	336171307
111	NC_015638	CACCAA	2	12	181002	181013	50 %	0 %	0 %	50 %	336171310
112	NC_015638	ATGCAA	2	12	182933	182944	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	336171314
113	NC_015638	TGCTTT	2	12	184700	184711	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	336171316
114	NC_015638	TCTAAA	2	12	187984	187995	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	336171321
115	NC_015638	AATACT	2	12	188548	188559	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	336171321
116	NC_015638	TGATGC	2	12	188607	188618	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	336171321
117	NC_015638	TAAAAT	2	12	188627	188638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171321
118	NC_015638	GCTGGT	2	12	189815	189826	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	336171322
119	NC_015638	TCCTGT	2	12	189907	189918	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	336171322
120	NC_015638	ACCTTC	2	12	190120	190131	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	336171322
121	NC_015638	ATTTTT	2	12	190570	190581	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	336171323
122	NC_015638	TTATTT	2	12	191390	191401	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	336171323
123	NC_015638	TTTAAA	2	12	192969	192980	50 %	50 %	0 %	0 %	336171325
124	NC_015638	TGAAAT	2	12	194628	194639	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	336171327
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130	NC_015638	ATTAAT	2	12	200994	201005	50 %	50 %	0 %	0 %	336171330
131	NC_015638	ACACCA	2	12	201199	201210	50 %	0 %	0 %	50 %	336171330
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225	NC_015638	TATCAA	2	12	346209	346220	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	336171452
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230	NC_015638	GAATTT	2	12	351111	351122	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	336171454
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233	NC_015638	TTCTGC	2	12	354607	354618	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	336171460
234	NC_015638	ATTTTC	2	12	354923	354934	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	336171460
235	NC_015638	ACCAAT	2	12	356060	356071	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	336171461
236	NC_015638	CTTCAC	2	12	358603	358614	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	336171461
237	NC_015638	GTAAGC	2	12	359397	359408	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336171461
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241	NC_015638	TCTATA	2	12	365861	365872	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	336171470
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348	NC_015638	AAAGAA	2	12	515208	515219	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	336171617
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350	NC_015638	TTTATA	2	12	516056	516067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171619
351	NC_015638	TGTTTG	2	12	517753	517764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336171619
352	NC_015638	GAGTAA	2	12	519074	519085	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	336171619
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355	NC_015638	ATGCTA	2	12	527501	527512	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	336171626
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360	NC_015638	GTTACA	2	12	535212	535223	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	336171632
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362	NC_015638	CGGTTA	2	12	535810	535821	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	336171632
363	NC_015638	TGATTT	2	12	535835	535846	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	336171632
364	NC_015638	CGGTTA	2	12	536110	536121	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	336171632
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370	NC_015638	ATGTTA	2	12	537481	537492	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	336171632
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373	NC_015638	TGATTT	2	12	537926	537937	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	336171632
374	NC_015638	GATAAT	2	12	538053	538064	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	336171632
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377	NC_015638	ATAATG	2	12	538618	538629	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	336171632
378	NC_015638	GTTACA	2	12	538863	538874	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	336171632
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447	NC_015638	CCAAAT	3	18	639388	639405	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	336171720
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451	NC_015638	TTTACA	2	12	650299	650310	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	336171731
452	NC_015638	TACCAT	2	12	651493	651504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336171733
453	NC_015638	CAAGGT	2	12	656634	656645	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336171736
454	NC_015638	CTATTG	2	12	657176	657187	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	336171737
455	NC_015638	TTGCCA	2	12	662545	662556	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	336171741
456	NC_015638	CACCTT	2	12	662697	662708	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	336171741
457	NC_015638	GTTGGT	2	12	667570	667581	0 %	50 %	50 %	0 %	336171743
458	NC_015638	AGCTAA	2	12	667599	667610	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	336171743
459	NC_015638	TATTGA	2	12	668355	668366	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	336171743
460	NC_015638	AATTAG	2	12	668984	668995	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	336171743
461	NC_015638	GGTATT	2	12	670816	670827	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	336171745
462	NC_015638	CTAAAG	2	12	671179	671190	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	336171745
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