MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lacinutrix sp. 5H-3-7-4 chromosome

Total Repeats: 47407

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015638	ATT	2	6	250	255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171144
2	NC_015638	CTG	2	6	320	325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336171144
3	NC_015638	AGG	2	6	516	521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336171144
4	NC_015638	CTT	2	6	524	529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336171144
5	NC_015638	TTA	2	6	538	543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171144
6	NC_015638	TAT	2	6	629	634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171144
7	NC_015638	ACA	2	6	657	662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336171144
8	NC_015638	GAT	2	6	739	744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336171144
9	NC_015638	TAT	2	6	881	886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171144
10	NC_015638	AGA	2	6	990	995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336171144
11	NC_015638	TAT	2	6	996	1001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171144
12	NC_015638	TAA	2	6	1083	1088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171144
13	NC_015638	AGT	2	6	1179	1184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336171144
14	NC_015638	ATT	2	6	1190	1195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171144
15	NC_015638	ATC	2	6	1377	1382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336171144
16	NC_015638	CTC	2	6	1496	1501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336171145
17	NC_015638	AGA	2	6	1668	1673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336171145
18	NC_015638	TAA	2	6	1794	1799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171145
19	NC_015638	CTA	2	6	1821	1826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336171145
20	NC_015638	TGG	2	6	1827	1832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336171145
21	NC_015638	TGA	2	6	1845	1850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336171145
22	NC_015638	TGA	2	6	1866	1871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336171145
23	NC_015638	AAC	2	6	1892	1897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336171145
24	NC_015638	ACA	2	6	2042	2047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336171146
25	NC_015638	ATT	2	6	2110	2115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171146
26	NC_015638	ATT	2	6	2135	2140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171146
27	NC_015638	TGG	2	6	2209	2214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336171146
28	NC_015638	TTA	2	6	2225	2230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171146
29	NC_015638	TAA	3	9	2287	2295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171146
30	NC_015638	TGG	2	6	2401	2406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336171146
31	NC_015638	AAC	2	6	2498	2503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336171146
32	NC_015638	CTG	2	6	2664	2669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336171146
33	NC_015638	GAA	2	6	2690	2695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336171146
34	NC_015638	TGG	2	6	2869	2874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336171146
35	NC_015638	TTC	2	6	2938	2943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336171146
36	NC_015638	AGT	2	6	2960	2965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336171146
37	NC_015638	ACT	2	6	3023	3028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336171146
38	NC_015638	AGG	2	6	3064	3069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336171146
39	NC_015638	ATT	3	9	3131	3139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171146
40	NC_015638	ATA	2	6	3236	3241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171146
41	NC_015638	TAA	2	6	3357	3362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171146
42	NC_015638	ACA	2	6	3404	3409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336171147
43	NC_015638	TGT	2	6	3481	3486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336171147
44	NC_015638	AGA	2	6	3506	3511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336171147
45	NC_015638	ATA	2	6	3708	3713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171147
46	NC_015638	AGT	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336171147
47	NC_015638	ATG	2	6	3758	3763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336171147
48	NC_015638	GTT	2	6	3883	3888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336171147
49	NC_015638	CTT	2	6	4216	4221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336171148
50	NC_015638	TGC	3	9	4257	4265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336171148
51	NC_015638	CGC	2	6	4292	4297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336171148
52	NC_015638	TCT	2	6	4329	4334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336171148
53	NC_015638	TTA	2	6	4345	4350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171148
54	NC_015638	ATT	2	6	4494	4499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171148
55	NC_015638	CAA	2	6	4631	4636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336171148
56	NC_015638	CAG	2	6	4643	4648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336171148
57	NC_015638	TTA	2	6	4693	4698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171148
58	NC_015638	TAC	2	6	4710	4715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336171148
59	NC_015638	ACA	2	6	4843	4848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015638	CAA	2	6	5077	5082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336171149
61	NC_015638	ATA	2	6	5101	5106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171149
62	NC_015638	TAC	2	6	5155	5160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336171149
63	NC_015638	AAG	2	6	5166	5171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336171149
64	NC_015638	GCA	2	6	5265	5270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336171149
65	NC_015638	CTG	2	6	5353	5358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336171149
66	NC_015638	ACC	2	6	5450	5455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336171149
67	NC_015638	TAT	2	6	5572	5577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171149
68	NC_015638	TAA	2	6	5636	5641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171149
69	NC_015638	ACC	2	6	5648	5653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336171149
70	NC_015638	TGC	2	6	5657	5662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336171149
71	NC_015638	ACA	2	6	5673	5678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336171149
72	NC_015638	TCT	2	6	5684	5689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336171149
73	NC_015638	TGC	2	6	5852	5857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336171150
74	NC_015638	CAA	2	6	5904	5909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336171150
75	NC_015638	TGG	2	6	5983	5988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336171150
76	NC_015638	TTA	2	6	6054	6059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171150
77	NC_015638	TGC	2	6	6205	6210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336171150
78	NC_015638	TAG	2	6	6427	6432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336171150
79	NC_015638	TCT	2	6	6479	6484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336171150
80	NC_015638	TAA	2	6	6543	6548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171150
81	NC_015638	ATT	2	6	6553	6558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171150
82	NC_015638	CTT	2	6	6717	6722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336171150
83	NC_015638	ATT	2	6	6724	6729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171150
84	NC_015638	AAT	2	6	6799	6804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171150
85	NC_015638	ATT	2	6	6836	6841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171150
86	NC_015638	TTA	2	6	7220	7225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171151
87	NC_015638	TCG	2	6	7273	7278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336171151
88	NC_015638	TCT	2	6	7306	7311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336171151
89	NC_015638	GTT	2	6	7422	7427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336171152
90	NC_015638	CTT	2	6	7474	7479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336171152
91	NC_015638	CTG	2	6	7519	7524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336171152
92	NC_015638	TCT	2	6	7554	7559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336171152
93	NC_015638	CTC	2	6	7561	7566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336171152
94	NC_015638	CAA	2	6	7609	7614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336171152
95	NC_015638	CTG	2	6	7630	7635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336171152
96	NC_015638	CAT	2	6	7636	7641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336171152
97	NC_015638	TGC	2	6	7661	7666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336171152
98	NC_015638	ATT	2	6	7697	7702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171152
99	NC_015638	TTG	2	6	7810	7815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336171152
100	NC_015638	TAA	2	6	7979	7984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171152
101	NC_015638	TAT	2	6	8044	8049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171152
102	NC_015638	TTG	2	6	8052	8057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336171152
103	NC_015638	ATT	2	6	8141	8146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015638	GCA	2	6	8147	8152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015638	TTG	2	6	8178	8183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015638	TTA	2	6	8244	8249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015638	AGG	2	6	8307	8312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336171153
108	NC_015638	AGA	2	6	8352	8357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336171153
109	NC_015638	GCT	2	6	8428	8433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336171153
110	NC_015638	TGC	2	6	8457	8462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336171153
111	NC_015638	GTA	2	6	8482	8487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336171153
112	NC_015638	ACA	2	6	8553	8558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336171153
113	NC_015638	GTG	2	6	8582	8587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336171153
114	NC_015638	TTA	2	6	8588	8593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171153
115	NC_015638	TTA	2	6	8630	8635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171153
116	NC_015638	TTG	2	6	8693	8698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336171153
117	NC_015638	TGA	2	6	8703	8708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336171153
118	NC_015638	GAC	2	6	8743	8748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336171153
119	NC_015638	TAC	2	6	8760	8765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336171153
120	NC_015638	CTG	2	6	8846	8851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336171153
121	NC_015638	ATT	2	6	8854	8859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171153
122	NC_015638	TGG	2	6	8940	8945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336171153
123	NC_015638	GTT	2	6	9109	9114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336171153
124	NC_015638	GGT	2	6	9115	9120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336171153
125	NC_015638	GAA	2	6	9190	9195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336171153
126	NC_015638	GTG	2	6	9227	9232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336171153
127	NC_015638	ATT	2	6	9235	9240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171153
128	NC_015638	TGA	2	6	9249	9254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336171153
129	NC_015638	ATA	2	6	9314	9319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171153
130	NC_015638	TAT	2	6	9408	9413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171153
131	NC_015638	GAA	2	6	9520	9525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336171153
132	NC_015638	TAA	2	6	9546	9551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171153
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