MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio anguillarum 775 chromosome II

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015637	GCTCAG	2	12	15625	15636	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015637	AGTTTA	2	12	18529	18540	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015637	AAAAAC	2	12	56784	56795	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015637	CATTTC	2	12	62025	62036	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015637	GCTCGT	2	12	115519	115530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015637	TTGTCG	2	12	180993	181004	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_015637	TTAAAA	2	12	184708	184719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015637	CAAACT	2	12	187836	187847	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015637	ATTTTT	2	12	204572	204583	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015637	TTCTTA	2	12	218198	218209	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015637	TTTGCA	2	12	251873	251884	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_015637	TAAACA	2	12	262908	262919	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_015637	ACTAAG	2	12	266113	266124	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015637	CTTCAA	2	12	280292	280303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015637	ATTTTT	2	12	308313	308324	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015637	TAAAAA	2	12	357326	357337	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015637	ATCGAG	2	12	362641	362652	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015637	TTGAAA	2	12	402534	402545	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015637	AAAGTG	2	12	561483	561494	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015637	TTTGAT	2	12	568220	568231	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015637	ATTTTT	2	12	569726	569737	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015637	CTTTTT	2	12	593542	593553	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_015637	TCTCGC	2	12	688454	688465	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015637	ACGCTG	2	12	710909	710920	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015637	GTTCGC	3	18	726378	726395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015637	ATGAAT	2	12	752874	752885	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015637	TTTTTC	2	12	765351	765362	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_015637	GTTTTA	5	30	787573	787602	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015637	CCTTTT	2	12	895084	895095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015637	TTTTAT	2	12	924035	924046	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015637	GGCAAG	2	12	939290	939301	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015637	GTTTAC	3	18	940576	940593	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_015637	GCTTGA	2	12	947823	947834	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_015637	AATTGC	2	12	974156	974167	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015637	GCTCTA	2	12	975950	975961	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015637	TAGCGC	3	18	983325	983342	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.