MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Methanothermococcus okinawensis IH1 chromosome

Total Repeats: 1182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015636	ACAATA	2	12	3746	3757	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	336121005
2	NC_015636	AATATA	2	12	4463	4474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121006
3	NC_015636	AAAATA	2	12	4781	4792	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015636	TTTCTA	2	12	7573	7584	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	336121009
5	NC_015636	ATAAAA	3	18	7595	7612	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	336121009
6	NC_015636	TAGATG	2	12	9280	9291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121012
7	NC_015636	AGATAT	2	12	9338	9349	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	336121012
8	NC_015636	AAATGA	2	12	11237	11248	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	336121014
9	NC_015636	ATTAAA	2	12	12041	12052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015636	AATATG	2	12	12662	12673	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	336121016
11	NC_015636	GTTTTT	2	12	13851	13862	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	336121017
12	NC_015636	AATCAA	2	12	15491	15502	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	336121019
13	NC_015636	GCAAAC	2	12	17102	17113	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	336121021
14	NC_015636	TAAAAT	2	12	21685	21696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121027
15	NC_015636	ATTTAT	2	12	22207	22218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121027
16	NC_015636	TTTTAT	2	12	23662	23673	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	336121028
17	NC_015636	ATTTTA	2	12	25245	25256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121028
18	NC_015636	TTTTTA	2	12	25934	25945	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	336121030
19	NC_015636	CTTTTA	2	12	26016	26027	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	336121030
20	NC_015636	TTTATA	2	12	26126	26137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015636	ATTAAA	2	12	30161	30172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015636	AAATTA	2	12	32825	32836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015636	AAAATA	2	12	34000	34011	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015636	TATCAA	2	12	44702	44713	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	336121050
25	NC_015636	TCCTTT	2	12	45928	45939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336121052
26	NC_015636	GTCGTT	2	12	49757	49768	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	336121054
27	NC_015636	ATTTAT	2	12	50019	50030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121055
28	NC_015636	TCTATC	2	12	51049	51060	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	336121056
29	NC_015636	TTATTT	2	12	52737	52748	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	336121056
30	NC_015636	ATCTAT	2	12	53647	53658	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	336121056
31	NC_015636	TATTTA	2	12	53864	53875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121057
32	NC_015636	ATTTGC	2	12	54033	54044	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	336121057
33	NC_015636	ATATTT	2	12	54415	54426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121057
34	NC_015636	ATTTAT	2	12	55200	55211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121058
35	NC_015636	CATTAT	2	12	55717	55728	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_015636	ATTTAT	2	12	55931	55942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015636	TAATAT	2	12	55966	55977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015636	AAAAAC	2	12	57246	57257	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	336121059
39	NC_015636	AATTAA	2	12	58430	58441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015636	AAATTA	2	12	58460	58471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015636	TGAAGG	2	12	61407	61418	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	336121063
42	NC_015636	GTAAAT	2	12	61603	61614	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	336121063
43	NC_015636	ATAGAT	2	12	61912	61923	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	336121063
44	NC_015636	ATTTAA	2	12	62406	62417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015636	TCAAAA	2	12	65927	65938	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	336121068
46	NC_015636	AATGAA	2	12	68714	68725	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	336121072
47	NC_015636	GAAAAA	2	12	69282	69293	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	336121073
48	NC_015636	AATGGA	2	12	70393	70404	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	336121073
49	NC_015636	AAAACC	2	12	70590	70601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336121074
50	NC_015636	CTAATG	2	12	74994	75005	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	336121079
51	NC_015636	TAAAAA	2	12	76127	76138	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015636	ACATCA	2	12	77782	77793	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	336121082
53	NC_015636	TTAATA	2	12	78048	78059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015636	TTTTTA	2	12	78120	78131	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015636	TAAAAG	2	12	80397	80408	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015636	ATTAAA	2	12	80783	80794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015636	AAAGAA	2	12	81116	81127	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015636	ATATTT	2	12	83737	83748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015636	ATTAAA	2	12	83936	83947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015636	TCGCTT	2	12	85897	85908	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	336121091
61	NC_015636	GAAAAA	2	12	88512	88523	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	336121097
62	NC_015636	GAAAAT	2	12	88641	88652	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	336121097
63	NC_015636	ATTTTT	2	12	88829	88840	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	336121097
64	NC_015636	AAAAAT	2	12	88983	88994	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	336121097
65	NC_015636	TAAAAA	2	12	89341	89352	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	336121097
66	NC_015636	TGAAAT	2	12	90090	90101	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	336121098
67	NC_015636	CAGAAA	2	12	91363	91374	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	336121100
68	NC_015636	CAGAAC	2	12	91378	91389	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	336121100
69	NC_015636	TCTTTA	2	12	92978	92989	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	336121102
70	NC_015636	ATATTA	2	12	93316	93327	50 %	50 %	0 %	0 %	336121102
71	NC_015636	AGTTAA	2	12	93617	93628	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	336121103
72	NC_015636	ATAAAA	2	12	97606	97617	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015636	TATGAA	2	12	99179	99190	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	336121107
74	NC_015636	GCTATG	2	12	100894	100905	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	336121108
75	NC_015636	ATAATT	2	12	103642	103653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015636	TCAAAA	2	12	105636	105647	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	336121111
77	NC_015636	TTTTTC	2	12	106136	106147	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	336121111
78	NC_015636	TAGTTT	2	12	108312	108323	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	336121115
79	NC_015636	ATAAAA	2	12	109404	109415	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	336121115
80	NC_015636	ATCATT	2	12	110032	110043	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_015636	TTTTCA	2	12	110809	110820	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	336121117
82	NC_015636	CTTTAT	2	12	111140	111151	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	336121117
83	NC_015636	AATCCA	2	12	111819	111830	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	336121118
84	NC_015636	TTTCTT	2	12	113863	113874	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	336121118
85	NC_015636	AACATT	2	12	114677	114688	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	336121119
86	NC_015636	TTCAAT	2	12	115988	115999	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	336121121
87	NC_015636	TTTTAG	2	12	117209	117220	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015636	TTAGAT	2	12	119494	119505	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	336121122
89	NC_015636	TGGATG	2	12	119950	119961	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	336121123
90	NC_015636	CAACAC	2	12	120768	120779	50 %	0 %	0 %	50 %	336121124
91	NC_015636	TATGAA	2	12	125228	125239	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015636	TATTTT	2	12	127788	127799	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015636	ATTCAT	2	12	127824	127835	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_015636	AATAAA	2	12	129207	129218	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	336121133
95	NC_015636	TGGAAC	2	12	129855	129866	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336121133
96	NC_015636	AATAAA	2	12	130078	130089	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015636	CTTCCA	2	12	130262	130273	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	336121134
98	NC_015636	TAAAAA	2	12	132899	132910	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015636	CAAACT	2	12	133193	133204	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	336121136
100	NC_015636	GAGAAA	2	12	134234	134245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121136
101	NC_015636	AATAGA	2	12	136739	136750	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	336121139
102	NC_015636	AAATAA	2	12	137842	137853	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	336121139
103	NC_015636	AAAATT	2	12	138434	138445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121140
104	NC_015636	TTTATT	2	12	139555	139566	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015636	ATTTTA	2	12	141115	141126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121143
106	NC_015636	AAATTT	2	12	141171	141182	50 %	50 %	0 %	0 %	336121143
107	NC_015636	TTTTAT	2	12	146213	146224	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015636	AGTGGA	2	12	147739	147750	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	336121148
109	NC_015636	TTCGAT	2	12	148750	148761	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	336121149
110	NC_015636	CTACAA	2	12	152051	152062	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	336121151
111	NC_015636	AAAAGA	2	12	154057	154068	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	336121152
112	NC_015636	AATAAA	2	12	154069	154080	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	336121152
113	NC_015636	TATTAA	2	12	154166	154177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015636	ATAAAA	2	12	157098	157109	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	336121155
115	NC_015636	TAATTT	2	12	158288	158299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015636	GCTGTT	2	12	159178	159189	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	336121158
117	NC_015636	TTATTT	2	12	160767	160778	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	336121159
118	NC_015636	ATCAAT	2	12	160907	160918	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	336121160
119	NC_015636	TTTTGA	2	12	162055	162066	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	336121161
120	NC_015636	CATTTT	2	12	163366	163377	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	336121161
121	NC_015636	ATTTTT	2	12	163795	163806	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	336121161
122	NC_015636	ATTTTT	2	12	164100	164111	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015636	ATTTTA	2	12	164415	164426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015636	GAGGCA	2	12	168486	168497	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	336121164
125	NC_015636	TAATAT	2	12	170674	170685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015636	TTTATG	2	12	170734	170745	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015636	TTAATT	2	12	175292	175303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015636	TAAAAA	2	12	175620	175631	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015636	ATTCTT	2	12	177247	177258	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	336121174
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135	NC_015636	AAATTA	2	12	184534	184545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015636	CTTGAA	2	12	185691	185702	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	336121182
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141	NC_015636	ATTTAA	2	12	198003	198014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015636	ATGAAT	2	12	198504	198515	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	336121193
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161	NC_015636	GGAGAT	2	12	226228	226239	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
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238	NC_015636	ACATTG	2	12	340509	340520	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	336121321
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240	NC_015636	ATAAAA	2	12	346682	346693	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
241	NC_015636	CAAAAG	2	12	347915	347926	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	336121327
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490	NC_015636	AAATAC	2	12	710680	710691	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	336121683
491	NC_015636	TTCAAT	2	12	712126	712137	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	336121683
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