MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanothermococcus okinawensis IH1 chromosome

Total Repeats: 896

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015636	TAAAT	2	10	49	58	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015636	ATATA	2	10	9042	9051	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015636	ATATA	2	10	10294	10303	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015636	TAAAA	2	10	10428	10437	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015636	TAAAA	2	10	10448	10457	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015636	TTTAA	2	10	10987	10996	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015636	AATTC	2	10	15222	15231	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_015636	ATATT	2	10	15326	15335	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015636	TTTTA	2	10	20087	20096	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015636	ATTTT	2	10	21093	21102	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015636	TCATA	2	10	25374	25383	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_015636	AGAAT	2	10	25410	25419	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015636	TTTTA	2	10	26143	26152	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015636	TTATT	2	10	26153	26162	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015636	TATTT	2	10	29138	29147	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015636	ATATA	2	10	30189	30198	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015636	TTTTA	2	10	30329	30338	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015636	ATAAA	2	10	35190	35199	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015636	AAAAT	2	10	35220	35229	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015636	ATTAC	2	10	36909	36918	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_015636	ATTCA	2	10	54758	54767	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_015636	AACTA	2	10	55737	55746	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_015636	TTTAA	2	10	56105	56114	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015636	ATAAA	2	10	58394	58403	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015636	TATAA	2	10	59909	59918	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015636	TAAAT	2	10	61037	61046	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015636	AATGA	2	10	62960	62969	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015636	TGTTT	2	10	65728	65737	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015636	ATAAA	2	10	69061	69070	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015636	CGAAG	2	10	72659	72668	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_015636	AATAA	2	10	76335	76344	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015636	AGAAT	2	10	78184	78193	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015636	TTAAT	2	10	82972	82981	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015636	TAATA	3	15	83759	83773	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015636	AAATA	2	10	83897	83906	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015636	GTAAT	2	10	86723	86732	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015636	TAAAT	2	10	88460	88469	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015636	AATAA	2	10	90360	90369	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015636	TATAA	2	10	91446	91455	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015636	AATAT	2	10	91456	91465	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015636	TATTT	2	10	93516	93525	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015636	TTTTA	2	10	97668	97677	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015636	ATTAT	2	10	97758	97767	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015636	TGTAT	2	10	100510	100519	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015636	TTTTA	2	10	101699	101708	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015636	ATTAA	2	10	114406	114415	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015636	TATTT	2	10	114466	114475	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015636	TATAT	2	10	115890	115899	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015636	TTTAT	2	10	115900	115909	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015636	TAATT	2	10	117261	117270	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015636	TTTAT	2	10	119554	119563	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015636	ATTAT	2	10	121095	121104	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015636	TAATA	2	10	125205	125214	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015636	TTATT	2	10	126339	126348	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015636	ATTTT	2	10	126349	126358	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015636	TTTTA	2	10	126438	126447	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015636	AATAT	2	10	127987	127996	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015636	TAATA	2	10	127999	128008	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015636	AATTA	2	10	129102	129111	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015636	TAAAA	2	10	130068	130077	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015636	TAAAA	2	10	130116	130125	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015636	TTATA	2	10	131864	131873	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015636	TTTTA	2	10	131878	131887	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015636	AATAA	2	10	132889	132898	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015636	AACTA	2	10	136063	136072	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_015636	ATTTT	2	10	139542	139551	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015636	GTAGT	2	10	139659	139668	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015636	TAAAA	2	10	145464	145473	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015636	TTAAT	2	10	145480	145489	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015636	TAATT	2	10	146061	146070	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015636	TTATT	2	10	146236	146245	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015636	ATTAA	2	10	146260	146269	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015636	TATAA	2	10	148624	148633	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015636	TTATC	2	10	152785	152794	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_015636	TATTG	2	10	153622	153631	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015636	TAAAT	2	10	153699	153708	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015636	ATTTT	2	10	154426	154435	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015636	TAAAT	2	10	155221	155230	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015636	TTAAT	2	10	158244	158253	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015636	ATTAT	2	10	158267	158276	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015636	TTATT	2	10	164033	164042	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015636	TATTT	2	10	164112	164121	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015636	AATAA	2	10	165989	165998	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015636	ATATA	2	10	166340	166349	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015636	CATTT	2	10	166636	166645	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_015636	AAAAT	2	10	167158	167167	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015636	TATTT	2	10	167250	167259	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015636	AATTA	2	10	167367	167376	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015636	ATCAA	2	10	167458	167467	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_015636	TTATA	2	10	167505	167514	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015636	TAAAA	2	10	172052	172061	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015636	ATATT	2	10	173164	173173	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015636	AGATA	2	10	173219	173228	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015636	ATAAA	2	10	175632	175641	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015636	TAAAA	2	10	176299	176308	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015636	ATATA	2	10	179992	180001	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015636	ATATA	2	10	180004	180013	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015636	TAATT	2	10	186647	186656	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015636	AAATA	2	10	188099	188108	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015636	TAATA	2	10	188161	188170	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015636	TATAT	2	10	192065	192074	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015636	AAATT	2	10	192628	192637	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015636	ATTTA	2	10	193853	193862	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015636	TTTAT	2	10	195238	195247	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015636	TAAAA	2	10	195384	195393	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015636	AAATA	2	10	195394	195403	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015636	TTTAT	2	10	197958	197967	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015636	AAAAG	2	10	201210	201219	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015636	TATCA	2	10	202449	202458	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_015636	AACAT	2	10	202469	202478	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_015636	AATAA	2	10	203753	203762	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015636	AATAT	2	10	206038	206047	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015636	CTTTT	2	10	206974	206983	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_015636	TTTAT	2	10	207148	207157	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015636	TAAAA	2	10	211386	211395	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015636	AATAA	2	10	218111	218120	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015636	AATTA	2	10	218218	218227	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015636	TATTT	2	10	219912	219921	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015636	ATGAT	2	10	220769	220778	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015636	TGCTT	2	10	221978	221987	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_015636	ATATA	2	10	222638	222647	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015636	CCTTT	2	10	225772	225781	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_015636	TTTTA	2	10	229782	229791	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015636	CTATT	2	10	231840	231849	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_015636	TAAAA	2	10	232590	232599	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015636	TAAGA	2	10	233880	233889	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015636	ATTAA	2	10	234078	234087	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015636	TTATT	2	10	238283	238292	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015636	TTATA	2	10	238423	238432	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015636	TATAT	2	10	242267	242276	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015636	ATATA	2	10	244277	244286	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015636	AAAAT	2	10	244975	244984	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015636	TTTAT	2	10	246014	246023	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015636	AATTA	2	10	253105	253114	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015636	AATAA	2	10	253127	253136	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015636	AATTA	2	10	253161	253170	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015636	TTTAA	2	10	257265	257274	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015636	TTATT	2	10	257743	257752	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015636	TTATT	2	10	258028	258037	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015636	TCGCT	2	10	261044	261053	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_015636	ATAAA	2	10	261816	261825	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015636	TAAAC	2	10	261910	261919	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_015636	TTAAT	2	10	265107	265116	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015636	ATTTT	2	10	270428	270437	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015636	ATTTT	2	10	270462	270471	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015636	AATTA	2	10	270628	270637	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015636	TAAAA	2	10	271691	271700	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015636	TATAT	2	10	271742	271751	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015636	ATTTT	2	10	275903	275912	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_015636	TTTAT	2	10	279484	279493	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_015636	ATATA	2	10	293044	293053	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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