MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanothermococcus okinawensis IH1 chromosome

Total Repeats: 5522

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015636	TAA	2	6	12	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015636	TAT	2	6	28	33	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015636	ATT	2	6	78	83	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015636	ATT	2	6	577	582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015636	ACC	2	6	592	597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_015636	ATA	2	6	598	603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015636	ATT	2	6	629	634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015636	ATT	2	6	1298	1303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015636	ATT	3	9	1311	1319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015636	ATT	2	6	1322	1327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015636	ATA	2	6	1343	1348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015636	TAA	2	6	1365	1370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015636	ATA	2	6	3105	3110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015636	ATA	2	6	3117	3122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015636	TAA	2	6	3133	3138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015636	TAA	2	6	3143	3148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015636	ATT	2	6	3160	3165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015636	CTT	2	6	3174	3179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015636	TAT	2	6	3182	3187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015636	ATT	3	9	3188	3196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015636	TAT	3	9	3197	3205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015636	ATT	4	12	3215	3226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015636	TAA	2	6	4775	4780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015636	ATT	2	6	4827	4832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015636	ATG	2	6	4842	4847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015636	ATT	2	6	6060	6065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015636	ATA	2	6	6083	6088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015636	TTC	2	6	6114	6119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015636	TAT	2	6	6201	6206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015636	TAT	2	6	6213	6218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015636	TTA	2	6	6219	6224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015636	ATA	2	6	6488	6493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015636	ATT	3	9	6522	6530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015636	TGG	2	6	6566	6571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015636	TTA	2	6	8908	8913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015636	ATA	2	6	8970	8975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015636	AAT	2	6	8980	8985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015636	GTA	2	6	9087	9092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015636	TGG	2	6	10375	10380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015636	TGT	2	6	10564	10569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015636	TAA	2	6	11026	11031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015636	ATA	3	9	11059	11067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015636	TAA	3	9	11921	11929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015636	TAA	2	6	11940	11945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015636	ATA	2	6	11962	11967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015636	TAA	2	6	11985	11990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015636	AAT	2	6	11991	11996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015636	ATA	2	6	14044	14049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015636	TAA	3	9	14057	14065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015636	TAA	2	6	14082	14087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015636	AAT	2	6	14088	14093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015636	AAT	2	6	14108	14113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015636	ATC	3	9	15109	15117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015636	ATT	2	6	15173	15178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015636	TAA	2	6	15210	15215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015636	ATA	2	6	15363	15368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015636	TAT	2	6	15372	15377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015636	AAT	2	6	16131	16136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015636	AAT	2	6	16155	16160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015636	TAA	2	6	16174	16179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015636	TTA	2	6	16569	16574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015636	TAG	2	6	16577	16582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015636	TTA	2	6	16606	16611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015636	AGG	2	6	16687	16692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015636	CTA	2	6	18374	18379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015636	ATA	2	6	18388	18393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015636	TAA	2	6	18404	18409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015636	TAA	2	6	18412	18417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015636	TAA	3	9	18847	18855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015636	ATA	2	6	18856	18861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015636	ATT	2	6	21037	21042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015636	TAT	2	6	21045	21050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015636	ATT	3	9	21056	21064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015636	TTA	3	9	21065	21073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015636	TTA	2	6	21076	21081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015636	ATT	2	6	21085	21090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015636	ATT	2	6	21105	21110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015636	ATT	2	6	21167	21172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015636	ATT	2	6	21215	21220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015636	GTT	2	6	22934	22939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015636	ATT	2	6	22951	22956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015636	ATC	2	6	25355	25360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015636	TAA	2	6	25391	25396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015636	AAT	2	6	27346	27351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015636	TAA	2	6	27354	27359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015636	ATT	2	6	27378	27383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015636	ATT	2	6	27395	27400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015636	TAT	2	6	27412	27417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015636	TAT	2	6	27437	27442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015636	TAA	2	6	27445	27450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015636	TAT	2	6	27452	27457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015636	TAT	2	6	27465	27470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015636	ATA	2	6	27514	27519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015636	TAA	2	6	28144	28149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015636	TTA	2	6	28160	28165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015636	TAT	2	6	28169	28174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015636	TTA	2	6	28175	28180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015636	TCT	2	6	29155	29160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015636	ATT	2	6	29208	29213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015636	TAT	2	6	29226	29231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015636	GTT	2	6	29267	29272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015636	TAA	2	6	30092	30097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015636	TAA	3	9	30099	30107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015636	TAA	2	6	30125	30130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015636	ATA	2	6	30146	30151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015636	AAT	3	9	30152	30160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015636	TTA	2	6	30202	30207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015636	ATA	2	6	30217	30222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015636	AAG	2	6	31367	31372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015636	TAA	2	6	31407	31412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015636	TTA	2	6	32814	32819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015636	ATA	2	6	32931	32936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015636	TAA	2	6	32956	32961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015636	TAA	2	6	33958	33963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015636	TAA	2	6	33988	33993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015636	TAA	2	6	34023	34028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015636	TTC	2	6	34039	34044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015636	TAC	2	6	34046	34051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015636	ATT	2	6	34894	34899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015636	AAT	2	6	34927	34932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015636	TGA	2	6	34962	34967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015636	TAA	2	6	34985	34990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015636	AGG	2	6	35019	35024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015636	GAA	2	6	35035	35040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015636	AAT	2	6	35058	35063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015636	CAA	2	6	35117	35122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015636	TTA	2	6	36221	36226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015636	ATA	2	6	36238	36243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015636	TAA	2	6	36263	36268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015636	TTA	2	6	37003	37008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015636	ATT	2	6	41249	41254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015636	TAT	2	6	44091	44096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015636	TAT	2	6	44121	44126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015636	ACT	2	6	44132	44137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015636	TAA	2	6	44197	44202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015636	CCA	2	6	50004	50009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_015636	ATT	2	6	54770	54775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015636	ATT	2	6	54781	54786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015636	ACC	2	6	55660	55665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_015636	TTG	2	6	55689	55694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015636	TAT	2	6	55695	55700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015636	TAT	2	6	55749	55754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015636	ATT	2	6	55812	55817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015636	ACA	2	6	55859	55864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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