MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanothermococcus okinawensis IH1 chromosome

Total Repeats: 20674

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015636	TAT	2	6	86	91	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121002
2	NC_015636	CAT	2	6	195	200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336121002
3	NC_015636	CTT	3	9	327	335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336121002
4	NC_015636	ATT	2	6	376	381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121002
5	NC_015636	TGT	2	6	420	425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336121002
6	NC_015636	CAT	2	6	466	471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336121002
7	NC_015636	TAT	2	6	534	539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121002
8	NC_015636	TAT	2	6	558	563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121002
9	NC_015636	ACA	2	6	701	706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336121003
10	NC_015636	CTT	2	6	1055	1060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336121003
11	NC_015636	TAT	2	6	1170	1175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121003
12	NC_015636	ATT	2	6	1198	1203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121003
13	NC_015636	TGT	3	9	1212	1220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336121003
14	NC_015636	TAT	2	6	1398	1403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121004
15	NC_015636	GAA	2	6	1411	1416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121004
16	NC_015636	TAT	2	6	1431	1436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121004
17	NC_015636	ATA	2	6	1489	1494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121004
18	NC_015636	AGA	2	6	1544	1549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121004
19	NC_015636	GAA	2	6	1581	1586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121004
20	NC_015636	TGA	2	6	1607	1612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
21	NC_015636	ATA	2	6	1657	1662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121004
22	NC_015636	ATA	2	6	1666	1671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121004
23	NC_015636	TTG	2	6	1752	1757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336121004
24	NC_015636	TTG	2	6	1836	1841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336121004
25	NC_015636	ATT	2	6	1858	1863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121004
26	NC_015636	CAT	2	6	1879	1884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336121004
27	NC_015636	GAT	2	6	1922	1927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
28	NC_015636	ACA	2	6	1961	1966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336121004
29	NC_015636	AGT	2	6	1988	1993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
30	NC_015636	AGA	2	6	2042	2047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121004
31	NC_015636	ACC	2	6	2157	2162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336121004
32	NC_015636	GAA	2	6	2195	2200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121004
33	NC_015636	TTA	2	6	2229	2234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121004
34	NC_015636	GTA	2	6	2373	2378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
35	NC_015636	GAA	2	6	2415	2420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121004
36	NC_015636	ATT	2	6	2512	2517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121004
37	NC_015636	ATA	2	6	2659	2664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121004
38	NC_015636	TAA	2	6	2732	2737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121004
39	NC_015636	TTA	2	6	2788	2793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121004
40	NC_015636	ATA	2	6	2800	2805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121004
41	NC_015636	GAA	2	6	2832	2837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121004
42	NC_015636	GTT	2	6	2843	2848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336121004
43	NC_015636	ATG	2	6	2860	2865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
44	NC_015636	ATT	2	6	2927	2932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121004
45	NC_015636	TGA	2	6	2954	2959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
46	NC_015636	ATG	2	6	2974	2979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
47	NC_015636	TAA	2	6	2986	2991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121004
48	NC_015636	ATG	2	6	2995	3000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
49	NC_015636	GTG	2	6	3006	3011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336121004
50	NC_015636	TGA	2	6	3028	3033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
51	NC_015636	TAA	2	6	3288	3293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121005
52	NC_015636	AAT	2	6	3388	3393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121005
53	NC_015636	AGA	2	6	3408	3413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121005
54	NC_015636	AAT	3	9	3433	3441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121005
55	NC_015636	ATA	2	6	3542	3547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121005
56	NC_015636	AAT	2	6	3550	3555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121005
57	NC_015636	TAT	2	6	3609	3614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121005
58	NC_015636	TGA	2	6	3624	3629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121005
59	NC_015636	ATA	2	6	3650	3655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121005
60	NC_015636	TAA	2	6	3707	3712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121005
61	NC_015636	GAA	2	6	3898	3903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121006
62	NC_015636	AGA	2	6	3924	3929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121006
63	NC_015636	GAT	2	6	3957	3962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121006
64	NC_015636	CAT	2	6	4021	4026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336121006
65	NC_015636	CAT	2	6	4067	4072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336121006
66	NC_015636	CTG	2	6	4076	4081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336121006
67	NC_015636	ATA	2	6	4109	4114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121006
68	NC_015636	GGT	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336121006
69	NC_015636	AGT	2	6	4239	4244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121006
70	NC_015636	TAA	2	6	4268	4273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121006
71	NC_015636	TGA	2	6	4281	4286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121006
72	NC_015636	AGA	2	6	4299	4304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121006
73	NC_015636	AAG	2	6	4352	4357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121006
74	NC_015636	TAT	2	6	4366	4371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121006
75	NC_015636	ATT	2	6	4496	4501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121006
76	NC_015636	TAT	2	6	4543	4548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121006
77	NC_015636	TAA	2	6	4655	4660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121006
78	NC_015636	AAT	2	6	4683	4688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121006
79	NC_015636	GCA	2	6	4699	4704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336121006
80	NC_015636	AAT	2	6	4757	4762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121006
81	NC_015636	GAT	2	6	4946	4951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121007
82	NC_015636	TTA	2	6	5003	5008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121007
83	NC_015636	AAT	2	6	5077	5082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121007
84	NC_015636	ATG	2	6	5126	5131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121007
85	NC_015636	GAT	2	6	5161	5166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121007
86	NC_015636	TAT	2	6	5183	5188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121007
87	NC_015636	GTT	2	6	5363	5368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336121007
88	NC_015636	GTG	2	6	5436	5441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336121007
89	NC_015636	ATT	2	6	5471	5476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121007
90	NC_015636	TTC	2	6	5490	5495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336121007
91	NC_015636	TGT	3	9	5521	5529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336121007
92	NC_015636	CCT	2	6	5609	5614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336121007
93	NC_015636	TCA	2	6	5615	5620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336121007
94	NC_015636	AGG	2	6	5650	5655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336121007
95	NC_015636	AGG	2	6	5746	5751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336121007
96	NC_015636	GGA	2	6	5783	5788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336121007
97	NC_015636	GTA	2	6	5804	5809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121007
98	NC_015636	TGA	3	9	5836	5844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121007
99	NC_015636	GTG	2	6	5880	5885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336121007
100	NC_015636	ATT	2	6	6004	6009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121007
101	NC_015636	ATA	2	6	6298	6303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121008
102	NC_015636	TCC	2	6	6330	6335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336121008
103	NC_015636	CTT	2	6	6355	6360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336121008
104	NC_015636	CAT	2	6	6443	6448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336121008
105	NC_015636	ATA	2	6	6622	6627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121009
106	NC_015636	ATT	3	9	6643	6651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121009
107	NC_015636	ATA	2	6	6658	6663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121009
108	NC_015636	ATA	2	6	6822	6827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121009
109	NC_015636	CAC	2	6	6908	6913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336121009
110	NC_015636	ATA	2	6	6928	6933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121009
111	NC_015636	TGA	2	6	6944	6949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121009
112	NC_015636	AAT	2	6	7101	7106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121009
113	NC_015636	ATA	2	6	7131	7136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121009
114	NC_015636	TTG	3	9	7153	7161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336121009
115	NC_015636	GAA	2	6	7175	7180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121009
116	NC_015636	TAA	2	6	7384	7389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121009
117	NC_015636	AAG	2	6	7560	7565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121009
118	NC_015636	TAA	2	6	7616	7621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121010
119	NC_015636	ATA	2	6	7663	7668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121010
120	NC_015636	AGA	2	6	7683	7688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121010
121	NC_015636	GAA	2	6	7756	7761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121010
122	NC_015636	TCT	2	6	7782	7787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336121010
123	NC_015636	TTG	2	6	7814	7819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336121010
124	NC_015636	TTG	2	6	7835	7840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336121010
125	NC_015636	TTG	2	6	7913	7918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336121010
126	NC_015636	ACA	2	6	8024	8029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336121010
127	NC_015636	ATT	2	6	8153	8158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121011
128	NC_015636	AAG	2	6	8255	8260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121011
129	NC_015636	ATT	2	6	8291	8296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121011
130	NC_015636	CTA	2	6	8313	8318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336121011
131	NC_015636	AGG	2	6	8341	8346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336121011
132	NC_015636	TCT	2	6	8373	8378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336121011
133	NC_015636	AAT	2	6	8381	8386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121011
134	NC_015636	GAT	2	6	8497	8502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121011
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150	NC_015636	AGG	2	6	9508	9513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336121012
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162	NC_015636	ATA	2	6	10256	10261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121012
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