MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Methanothermococcus okinawensis IH1 chromosome

Total Repeats: 4125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015636	AT	4	8	274	281	50 %	50 %	0 %	0 %	336121002
2	NC_015636	AT	3	6	538	543	50 %	50 %	0 %	0 %	336121002
3	NC_015636	TA	3	6	724	729	50 %	50 %	0 %	0 %	336121003
4	NC_015636	AT	3	6	748	753	50 %	50 %	0 %	0 %	336121003
5	NC_015636	AT	3	6	755	760	50 %	50 %	0 %	0 %	336121003
6	NC_015636	AT	4	8	799	806	50 %	50 %	0 %	0 %	336121003
7	NC_015636	AT	3	6	912	917	50 %	50 %	0 %	0 %	336121003
8	NC_015636	TA	3	6	962	967	50 %	50 %	0 %	0 %	336121003
9	NC_015636	AT	3	6	1649	1654	50 %	50 %	0 %	0 %	336121004
10	NC_015636	TA	3	6	1799	1804	50 %	50 %	0 %	0 %	336121004
11	NC_015636	AT	3	6	1969	1974	50 %	50 %	0 %	0 %	336121004
12	NC_015636	TC	3	6	2601	2606	0 %	50 %	0 %	50 %	336121004
13	NC_015636	GA	3	6	3603	3608	50 %	0 %	50 %	0 %	336121005
14	NC_015636	AT	3	6	3961	3966	50 %	50 %	0 %	0 %	336121006
15	NC_015636	TA	3	6	4577	4582	50 %	50 %	0 %	0 %	336121006
16	NC_015636	AT	4	8	5207	5214	50 %	50 %	0 %	0 %	336121007
17	NC_015636	AT	3	6	5290	5295	50 %	50 %	0 %	0 %	336121007
18	NC_015636	AT	3	6	5423	5428	50 %	50 %	0 %	0 %	336121007
19	NC_015636	GA	3	6	5569	5574	50 %	0 %	50 %	0 %	336121007
20	NC_015636	AT	3	6	5861	5866	50 %	50 %	0 %	0 %	336121007
21	NC_015636	TG	3	6	6396	6401	0 %	50 %	50 %	0 %	336121008
22	NC_015636	AT	3	6	6403	6408	50 %	50 %	0 %	0 %	336121008
23	NC_015636	TA	3	6	6449	6454	50 %	50 %	0 %	0 %	336121008
24	NC_015636	AT	3	6	6749	6754	50 %	50 %	0 %	0 %	336121009
25	NC_015636	AT	3	6	7351	7356	50 %	50 %	0 %	0 %	336121009
26	NC_015636	TA	3	6	8097	8102	50 %	50 %	0 %	0 %	336121010
27	NC_015636	AT	3	6	8131	8136	50 %	50 %	0 %	0 %	336121011
28	NC_015636	TA	3	6	8418	8423	50 %	50 %	0 %	0 %	336121011
29	NC_015636	AT	3	6	8424	8429	50 %	50 %	0 %	0 %	336121011
30	NC_015636	AT	3	6	8590	8595	50 %	50 %	0 %	0 %	336121011
31	NC_015636	TA	3	6	8808	8813	50 %	50 %	0 %	0 %	336121011
32	NC_015636	TA	3	6	10045	10050	50 %	50 %	0 %	0 %	336121012
33	NC_015636	GA	3	6	10173	10178	50 %	0 %	50 %	0 %	336121012
34	NC_015636	AT	3	6	10237	10242	50 %	50 %	0 %	0 %	336121012
35	NC_015636	CA	3	6	11322	11327	50 %	0 %	0 %	50 %	336121014
36	NC_015636	AT	3	6	11629	11634	50 %	50 %	0 %	0 %	336121015
37	NC_015636	AT	3	6	11800	11805	50 %	50 %	0 %	0 %	336121015
38	NC_015636	AT	3	6	11877	11882	50 %	50 %	0 %	0 %	336121015
39	NC_015636	TA	3	6	12246	12251	50 %	50 %	0 %	0 %	336121016
40	NC_015636	GA	3	6	12349	12354	50 %	0 %	50 %	0 %	336121016
41	NC_015636	AT	3	6	12409	12414	50 %	50 %	0 %	0 %	336121016
42	NC_015636	GA	3	6	12426	12431	50 %	0 %	50 %	0 %	336121016
43	NC_015636	GA	3	6	12451	12456	50 %	0 %	50 %	0 %	336121016
44	NC_015636	TA	3	6	13949	13954	50 %	50 %	0 %	0 %	336121017
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48	NC_015636	TA	3	6	15503	15508	50 %	50 %	0 %	0 %	336121019
49	NC_015636	AT	3	6	15550	15555	50 %	50 %	0 %	0 %	336121019
50	NC_015636	TA	5	10	15733	15742	50 %	50 %	0 %	0 %	336121019
51	NC_015636	AT	3	6	16311	16316	50 %	50 %	0 %	0 %	336121020
52	NC_015636	AT	3	6	16393	16398	50 %	50 %	0 %	0 %	336121020
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62	NC_015636	AT	3	6	21265	21270	50 %	50 %	0 %	0 %	336121027
63	NC_015636	AT	3	6	21550	21555	50 %	50 %	0 %	0 %	336121027
64	NC_015636	AT	3	6	21639	21644	50 %	50 %	0 %	0 %	336121027
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69	NC_015636	AT	3	6	23757	23762	50 %	50 %	0 %	0 %	336121028
70	NC_015636	AT	3	6	24881	24886	50 %	50 %	0 %	0 %	336121028
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73	NC_015636	AT	3	6	25686	25691	50 %	50 %	0 %	0 %	336121030
74	NC_015636	AT	3	6	26532	26537	50 %	50 %	0 %	0 %	336121031
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90	NC_015636	TA	3	6	31510	31515	50 %	50 %	0 %	0 %	336121036
91	NC_015636	AT	3	6	31600	31605	50 %	50 %	0 %	0 %	336121036
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101	NC_015636	AT	3	6	35955	35960	50 %	50 %	0 %	0 %	336121040
102	NC_015636	AT	3	6	36014	36019	50 %	50 %	0 %	0 %	336121040
103	NC_015636	AT	3	6	36546	36551	50 %	50 %	0 %	0 %	336121041
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108	NC_015636	AT	3	6	37607	37612	50 %	50 %	0 %	0 %	336121042
109	NC_015636	TA	3	6	37635	37640	50 %	50 %	0 %	0 %	336121042
110	NC_015636	AT	5	10	37894	37903	50 %	50 %	0 %	0 %	336121042
111	NC_015636	AT	4	8	38261	38268	50 %	50 %	0 %	0 %	336121043
112	NC_015636	AT	3	6	39176	39181	50 %	50 %	0 %	0 %	336121043
113	NC_015636	TA	3	6	39385	39390	50 %	50 %	0 %	0 %	336121043
114	NC_015636	TA	3	6	39429	39434	50 %	50 %	0 %	0 %	336121043
115	NC_015636	AT	3	6	39542	39547	50 %	50 %	0 %	0 %	336121044
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118	NC_015636	TA	3	6	41447	41452	50 %	50 %	0 %	0 %	336121046
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120	NC_015636	AT	3	6	42595	42600	50 %	50 %	0 %	0 %	336121047
121	NC_015636	CA	3	6	42658	42663	50 %	0 %	0 %	50 %	336121047
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124	NC_015636	AT	3	6	43718	43723	50 %	50 %	0 %	0 %	336121049
125	NC_015636	TA	3	6	43738	43743	50 %	50 %	0 %	0 %	336121049
126	NC_015636	TA	3	6	43872	43877	50 %	50 %	0 %	0 %	336121049
127	NC_015636	AT	3	6	44001	44006	50 %	50 %	0 %	0 %	336121049
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130	NC_015636	AT	3	6	44821	44826	50 %	50 %	0 %	0 %	336121050
131	NC_015636	AT	3	6	45121	45126	50 %	50 %	0 %	0 %	336121051
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133	NC_015636	AT	3	6	45640	45645	50 %	50 %	0 %	0 %	336121051
134	NC_015636	AT	3	6	45651	45656	50 %	50 %	0 %	0 %	336121051
135	NC_015636	AT	3	6	46106	46111	50 %	50 %	0 %	0 %	336121052
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137	NC_015636	AT	3	6	46161	46166	50 %	50 %	0 %	0 %	336121052
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139	NC_015636	AT	4	8	47257	47264	50 %	50 %	0 %	0 %	336121053
140	NC_015636	AT	3	6	47290	47295	50 %	50 %	0 %	0 %	336121053
141	NC_015636	AT	3	6	47685	47690	50 %	50 %	0 %	0 %	336121053
142	NC_015636	AT	3	6	47825	47830	50 %	50 %	0 %	0 %	336121053
143	NC_015636	TA	3	6	48036	48041	50 %	50 %	0 %	0 %	336121053
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