MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus coagulans 2-6 chromosome

Total Repeats: 204

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015634	TAAGTA	2	12	1912	1923	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015634	AATCAA	2	12	34568	34579	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015634	CTTTTT	2	12	49828	49839	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015634	CCGTTT	2	12	63170	63181	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015634	CGTTTT	2	12	70111	70122	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_015634	CGTTTT	2	12	92828	92839	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_015634	AGTCAA	2	12	96661	96672	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_015634	GAGAAG	2	12	107320	107331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015634	CTTTTT	2	12	117060	117071	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015634	TTCTGT	2	12	120763	120774	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015634	ATTGAA	2	12	142758	142769	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015634	AGGGAG	2	12	153514	153525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015634	GGGGAT	2	12	156802	156813	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015634	CCCCTT	2	12	161620	161631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_015634	CGTTTT	2	12	173729	173740	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015634	CTCAAG	2	12	187943	187954	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015634	TTTTCG	2	12	192198	192209	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015634	GTTTTC	2	12	225647	225658	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_015634	CGGGAA	2	12	232879	232890	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_015634	CCTGGA	2	12	239350	239361	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015634	ATCATT	2	12	244128	244139	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_015634	TCATTT	2	12	245433	245444	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_015634	TATTTT	2	12	251853	251864	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015634	TGAAGC	2	12	260526	260537	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015634	GAAAAT	2	12	263230	263241	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015634	TTTCCT	2	12	272667	272678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015634	TTTTAT	2	12	277975	277986	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015634	CTGTTC	2	12	293522	293533	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015634	TCTTGT	2	12	318274	318285	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_015634	GAAGCG	2	12	319612	319623	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_015634	CGAAAA	2	12	331379	331390	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015634	AAGATA	2	12	339971	339982	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015634	CCCCTG	2	12	340506	340517	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_015634	GCCAAG	2	12	359167	359178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015634	TTATAT	2	12	374365	374376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015634	ATTTTA	2	12	387514	387525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015634	CTTTTC	2	12	391005	391016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015634	GCCCAG	2	12	413018	413029	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015634	TTTTAT	2	12	413923	413934	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015634	ATCCCC	2	12	419260	419271	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_015634	TCGAAG	2	12	427470	427481	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_015634	CTTTTC	2	12	496066	496077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015634	AGTATA	2	12	518948	518959	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015634	GAAAAA	2	12	584534	584545	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015634	CCGGCG	2	12	627315	627326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015634	GAATCC	2	12	630609	630620	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015634	GATGCT	2	12	632942	632953	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_015634	TAAAAA	2	12	633592	633603	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015634	AAAAGG	2	12	648998	649009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015634	TCCTAC	2	12	658838	658849	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015634	TCAAAA	2	12	669085	669096	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_015634	ATAAAA	2	12	671784	671795	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015634	AAAATC	2	12	671929	671940	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_015634	AATGAA	2	12	673332	673343	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015634	TGCCGC	2	12	679636	679647	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015634	TAGCCG	2	12	722760	722771	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015634	TTCCAA	2	12	729457	729468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015634	CATGGC	2	12	744164	744175	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015634	TATTTT	2	12	762271	762282	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015634	TTTGAC	2	12	797729	797740	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_015634	ATATAA	2	12	801721	801732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015634	TTTTTC	2	12	807074	807085	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_015634	AATGAA	2	12	854432	854443	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015634	CAAAAA	2	12	871890	871901	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_015634	GCAAAC	2	12	878558	878569	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015634	TCTTTT	2	12	892392	892403	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_015634	AAATTT	2	12	906886	906897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015634	AAAGAC	2	12	909116	909127	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_015634	GAAGGG	2	12	911777	911788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015634	ACGGAT	2	12	920546	920557	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_015634	GCTACA	2	12	927463	927474	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015634	CAAAAA	2	12	954249	954260	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_015634	TATTTT	2	12	974542	974553	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015634	TTTTAC	2	12	977897	977908	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_015634	AGAGGG	2	12	984016	984027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015634	CAAGGA	2	12	987929	987940	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_015634	ATGGAA	2	12	1002800	1002811	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015634	GTTTTA	2	12	1007939	1007950	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015634	TCAGCA	2	12	1014491	1014502	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015634	CCGGGC	2	12	1022798	1022809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015634	TAACAG	2	12	1030766	1030777	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_015634	AGGCAA	2	12	1040872	1040883	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_015634	AACGGG	2	12	1061808	1061819	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_015634	ACAAAG	2	12	1062418	1062429	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_015634	ACAATA	2	12	1122570	1122581	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_015634	AAAATG	2	12	1122916	1122927	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015634	TCCCTG	2	12	1148678	1148689	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015634	GTGACG	2	12	1152393	1152404	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_015634	CCGGTA	2	12	1180341	1180352	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015634	CAGAAT	2	12	1192983	1192994	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_015634	GCAGGA	2	12	1212758	1212769	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_015634	AAGATA	2	12	1220787	1220798	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015634	TTCCGG	2	12	1247549	1247560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015634	AAAAAG	2	12	1310076	1310087	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015634	TTTTCA	2	12	1312411	1312422	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_015634	TCTTTT	2	12	1326179	1326190	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_015634	ATAAAA	2	12	1328823	1328834	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015634	AAACAA	2	12	1391013	1391024	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_015634	GGAAGT	2	12	1400606	1400617	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015634	TCCCGT	2	12	1410094	1410105	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015634	GGCACC	2	12	1423674	1423685	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015634	CGTTTT	2	12	1438771	1438782	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_015634	GGAAGT	2	12	1442606	1442617	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015634	TTATAA	2	12	1449129	1449140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015634	AAACCG	2	12	1470948	1470959	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015634	GCGGTC	2	12	1483261	1483272	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015634	GTTTTT	2	12	1495883	1495894	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015634	GTTAAA	2	12	1498775	1498786	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015634	CGTTCA	2	12	1516999	1517010	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015634	TCATTT	2	12	1548741	1548752	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_015634	AAAAGG	2	12	1563307	1563318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015634	CTTCCC	2	12	1632329	1632340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_015634	CATTTT	2	12	1637640	1637651	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_015634	GACCAG	2	12	1670827	1670838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015634	ATATGT	2	12	1677584	1677595	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015634	CTTTCC	2	12	1688274	1688285	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_015634	AATGAA	2	12	1751984	1751995	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015634	GACTTT	2	12	1775190	1775201	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_015634	TAAATC	2	12	1799345	1799356	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_015634	TATTTT	2	12	1808233	1808244	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015634	TGCAAA	2	12	1811001	1811012	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_015634	CTTTTC	2	12	1820061	1820072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015634	ATAAAG	2	12	1820161	1820172	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015634	AGACTC	2	12	1877107	1877118	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015634	CTCCTT	2	12	1952958	1952969	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015634	CCCTTG	2	12	1953078	1953089	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
127	NC_015634	TGCCCG	2	12	1959856	1959867	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
128	NC_015634	TAAAAT	2	12	1959997	1960008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015634	TCCCCT	2	12	1977423	1977434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_015634	ATCTTC	2	12	1986753	1986764	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015634	GCCAAT	2	12	1986810	1986821	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015634	CGGGCA	2	12	2014941	2014952	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015634	GCCGGC	2	12	2014969	2014980	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015634	CCCAAA	2	12	2029117	2029128	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015634	ACCCTG	2	12	2031167	2031178	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
136	NC_015634	TTTTCC	2	12	2077159	2077170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015634	AAATAT	2	12	2089136	2089147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015634	TCGGCC	2	12	2102756	2102767	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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140	NC_015634	AACAAA	2	12	2142630	2142641	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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142	NC_015634	CCGGCC	2	12	2168834	2168845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_015634	AAAATC	2	12	2200447	2200458	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_015634	ACTTCC	2	12	2233905	2233916	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015634	TCATCC	2	12	2236726	2236737	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_015634	CTGATG	2	12	2248412	2248423	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_015634	GCATAG	2	12	2308234	2308245	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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149	NC_015634	TATTTT	2	12	2320960	2320971	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015634	TCCAGC	2	12	2329774	2329785	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
151	NC_015634	AAAACG	2	12	2333095	2333106	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_015634	TTCCCA	2	12	2343476	2343487	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_015634	GCCAAT	2	12	2344962	2344973	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_015634	TTTGGA	2	12	2356803	2356814	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015634	CTGTTT	2	12	2394058	2394069	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_015634	TCTTTT	2	12	2451384	2451395	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
157	NC_015634	TCTTAT	2	12	2453782	2453793	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
158	NC_015634	GTTGCA	2	12	2458361	2458372	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
159	NC_015634	AAAAAT	2	12	2461572	2461583	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_015634	AACCTG	2	12	2501466	2501477	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_015634	AAATGC	2	12	2513041	2513052	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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202	NC_015634	AAAGAA	3	18	2999673	2999690	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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204	NC_015634	TCCCGA	2	12	3020237	3020248	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.