MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio anguillarum 775 chromosome I

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015633	AAAATA	2	12	5880	5891	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015633	AGATAC	2	12	10761	10772	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015633	ATTTTC	2	12	11822	11833	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015633	ATTCAA	2	12	12934	12945	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015633	ACGGCA	2	12	24937	24948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015633	GTTTGA	2	12	25283	25294	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015633	TGCGCT	2	12	30515	30526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015633	CTCATG	2	12	49333	49344	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015633	AGAATA	2	12	69224	69235	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015633	ATTTCA	2	12	70539	70550	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015633	TCTTTC	2	12	74888	74899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015633	AAGAAA	2	12	118698	118709	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015633	TAAAAA	4	24	128242	128265	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015633	ATTTCA	2	12	151197	151208	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_015633	GTATCT	2	12	184758	184769	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015633	TTTTTG	2	12	224484	224495	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015633	TGAAAT	2	12	253011	253022	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015633	GTGCGT	2	12	272975	272986	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_015633	TTTTTA	2	12	326104	326115	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015633	TAGGTA	2	12	395803	395814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015633	AAAATG	2	12	406796	406807	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015633	TATGAA	2	12	488707	488718	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015633	TGAAAA	2	12	494533	494544	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015633	AATATT	2	12	499421	499432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015633	AAACCA	2	12	525100	525111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015633	AACGCG	2	12	525367	525378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015633	TAAAAG	2	12	529110	529121	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015633	CTAAGC	2	12	587074	587085	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015633	TCAATC	2	12	613750	613761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015633	TGAAAT	2	12	730149	730160	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015633	TGCGAT	2	12	826619	826630	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015633	GTTGAA	2	12	892591	892602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015633	AATAAA	2	12	939748	939759	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015633	TATTTT	2	12	949851	949862	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015633	AATAAA	2	12	1011841	1011852	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015633	ACCGCA	2	12	1021110	1021121	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015633	GAGATG	2	12	1027233	1027244	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015633	AAAGGG	2	12	1047095	1047106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015633	CTATAA	2	12	1122861	1122872	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_015633	ATTAAC	2	12	1139177	1139188	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015633	ATTATA	2	12	1246810	1246821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015633	ATTTTA	2	12	1290626	1290637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015633	TGAGTT	2	12	1296410	1296421	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015633	AACATA	2	12	1368986	1368997	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_015633	GTTTTA	2	12	1410985	1410996	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015633	GTTTTG	2	12	1441204	1441215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015633	TGAAAT	2	12	1445522	1445533	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015633	CCATCA	2	12	1445547	1445558	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015633	ATAATG	2	12	1446018	1446029	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015633	AGGTGC	2	12	1475035	1475046	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_015633	AAAAAT	2	12	1528025	1528036	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015633	AAAATC	2	12	1559110	1559121	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_015633	TAAAAT	2	12	1582211	1582222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015633	TTTGTG	2	12	1597215	1597226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015633	TAAAAA	2	12	1660547	1660558	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015633	GAATAA	2	12	1735591	1735602	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015633	ACGTAG	2	12	1764015	1764026	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_015633	AAGTAA	2	12	1827775	1827786	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015633	AGAAGT	2	12	1846689	1846700	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015633	TCCTTT	2	12	1860777	1860788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015633	AAGATG	2	12	1863836	1863847	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015633	TTTAAT	2	12	1865083	1865094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015633	TGGCGA	2	12	1865532	1865543	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_015633	AAATTA	2	12	1879268	1879279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015633	TCCCTT	2	12	1906594	1906605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015633	GGTATT	2	12	1908750	1908761	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015633	TTTTAA	2	12	1979368	1979379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015633	GTGATG	2	12	2023301	2023312	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015633	AGATAC	2	12	2064825	2064836	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_015633	TTGTTA	2	12	2095072	2095083	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015633	CATATA	2	12	2099459	2099470	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015633	TCAACA	2	12	2151145	2151156	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015633	CTCTTT	2	12	2157039	2157050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015633	GCCAGC	2	12	2188059	2188070	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015633	TGCATC	2	12	2233815	2233826	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015633	CAGAAA	2	12	2265342	2265353	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_015633	CCAACA	2	12	2327401	2327412	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015633	ACAAAT	2	12	2334620	2334631	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_015633	AAAATG	2	12	2359937	2359948	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015633	ACGGAT	2	12	2390084	2390095	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_015633	TTAATT	2	12	2445695	2445706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015633	AAATAA	2	12	2446127	2446138	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015633	CTTTTT	2	12	2469466	2469477	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_015633	TCAATC	2	12	2474924	2474935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015633	GATTTG	2	12	2476551	2476562	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015633	ATTTCA	2	12	2527270	2527281	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_015633	CTGAGC	2	12	2584726	2584737	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015633	CGTTTC	2	12	2603879	2603890	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015633	ATCTAA	2	12	2611588	2611599	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_015633	CTCTGA	2	12	2642741	2642752	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015633	TCTCGA	2	12	2736557	2736568	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015633	ACAAAA	2	12	2750166	2750177	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_015633	ATGGAT	2	12	2799519	2799530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015633	AGTCGA	2	12	2799888	2799899	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_015633	CATTTA	2	12	2810557	2810568	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_015633	TTGAAG	2	12	2853934	2853945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015633	CTCTAC	2	12	2892112	2892123	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015633	AAATAA	2	12	2969175	2969186	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015633	TCAAGC	2	12	2977022	2977033	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015633	TCAGCA	2	12	2977734	2977745	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015633	ATTTCA	2	12	2987650	2987661	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_015633	GAATAA	2	12	3027414	3027425	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015633	ATTTCG	2	12	3027616	3027627	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.