MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Methanothermococcus okinawensis IH1 plasmid pMETOK01

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015632	TTTA	2	8	464	471	25 %	75 %	0 %	0 %	336120991
2	NC_015632	CTTT	2	8	1095	1102	0 %	75 %	0 %	25 %	336120991
3	NC_015632	ATTG	2	8	1201	1208	25 %	50 %	25 %	0 %	336120991
4	NC_015632	CTCC	2	8	1214	1221	0 %	25 %	0 %	75 %	336120991
5	NC_015632	AATT	2	8	2947	2954	50 %	50 %	0 %	0 %	336120992
6	NC_015632	TACA	2	8	3101	3108	50 %	25 %	0 %	25 %	336120992
7	NC_015632	CTAA	2	8	3438	3445	50 %	25 %	0 %	25 %	336120992
8	NC_015632	TAAA	2	8	3448	3455	75 %	25 %	0 %	0 %	336120992
9	NC_015632	ATTA	2	8	3510	3517	50 %	50 %	0 %	0 %	336120992
10	NC_015632	ACTA	2	8	3899	3906	50 %	25 %	0 %	25 %	336120992
11	NC_015632	AATA	2	8	4232	4239	75 %	25 %	0 %	0 %	336120992
12	NC_015632	TGAA	2	8	4291	4298	50 %	25 %	25 %	0 %	336120992
13	NC_015632	AATA	2	8	4367	4374	75 %	25 %	0 %	0 %	336120992
14	NC_015632	TAAA	2	8	4405	4412	75 %	25 %	0 %	0 %	336120992
15	NC_015632	ACTA	2	8	4422	4429	50 %	25 %	0 %	25 %	336120992
16	NC_015632	TTTA	2	8	4544	4551	25 %	75 %	0 %	0 %	336120992
17	NC_015632	AAGT	2	8	4693	4700	50 %	25 %	25 %	0 %	336120992
18	NC_015632	AAAT	2	8	4762	4769	75 %	25 %	0 %	0 %	336120992
19	NC_015632	ATTT	2	8	5313	5320	25 %	75 %	0 %	0 %	336120993
20	NC_015632	TAAA	2	8	5962	5969	75 %	25 %	0 %	0 %	336120993
21	NC_015632	ATTT	2	8	6208	6215	25 %	75 %	0 %	0 %	336120993
22	NC_015632	TGGG	2	8	6632	6639	0 %	25 %	75 %	0 %	336120993
23	NC_015632	TAAT	2	8	6682	6689	50 %	50 %	0 %	0 %	336120993
24	NC_015632	TAAA	2	8	6748	6755	75 %	25 %	0 %	0 %	336120993
25	NC_015632	TAAT	2	8	7021	7028	50 %	50 %	0 %	0 %	336120993
26	NC_015632	TTGG	2	8	7129	7136	0 %	50 %	50 %	0 %	336120993
27	NC_015632	TATT	2	8	7390	7397	25 %	75 %	0 %	0 %	336120993
28	NC_015632	CAAG	2	8	7504	7511	50 %	0 %	25 %	25 %	336120993
29	NC_015632	CCTA	2	8	7925	7932	25 %	25 %	0 %	50 %	336120993
30	NC_015632	AAAG	2	8	7946	7953	75 %	0 %	25 %	0 %	336120993
31	NC_015632	TTAA	2	8	8532	8539	50 %	50 %	0 %	0 %	336120993
32	NC_015632	TGAT	2	8	9116	9123	25 %	50 %	25 %	0 %	336120994
33	NC_015632	CTAT	2	8	9612	9619	25 %	50 %	0 %	25 %	336120995
34	NC_015632	CTAA	2	8	9887	9894	50 %	25 %	0 %	25 %	336120995
35	NC_015632	TAAT	2	8	10929	10936	50 %	50 %	0 %	0 %	336120995
36	NC_015632	TTAA	2	8	10952	10959	50 %	50 %	0 %	0 %	336120995
37	NC_015632	GAAA	2	8	11213	11220	75 %	0 %	25 %	0 %	336120995
38	NC_015632	ATAA	2	8	11609	11616	75 %	25 %	0 %	0 %	336120995
39	NC_015632	AAAG	2	8	11864	11871	75 %	0 %	25 %	0 %	336120995
40	NC_015632	AAAT	2	8	11995	12002	75 %	25 %	0 %	0 %	336120995
41	NC_015632	TTAT	2	8	12117	12124	25 %	75 %	0 %	0 %	336120995
42	NC_015632	AAAT	2	8	12438	12445	75 %	25 %	0 %	0 %	336120995
43	NC_015632	TAAA	2	8	12567	12574	75 %	25 %	0 %	0 %	336120995
44	NC_015632	CTCC	2	8	12989	12996	0 %	25 %	0 %	75 %	336120997
45	NC_015632	TTTC	2	8	13032	13039	0 %	75 %	0 %	25 %	336120997
46	NC_015632	TTAT	2	8	13119	13126	25 %	75 %	0 %	0 %	336120997
47	NC_015632	TCTT	2	8	14204	14211	0 %	75 %	0 %	25 %	336121000
48	NC_015632	TACA	2	8	14438	14445	50 %	25 %	0 %	25 %	336121000

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.