MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Methanothermococcus okinawensis IH1 plasmid pMETOK01

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015632	AT	3	6	260	265	50 %	50 %	0 %	0 %	336120991
2	NC_015632	TA	3	6	377	382	50 %	50 %	0 %	0 %	336120991
3	NC_015632	AT	3	6	513	518	50 %	50 %	0 %	0 %	336120991
4	NC_015632	AT	3	6	1562	1567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015632	TA	3	6	1740	1745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015632	TA	3	6	1783	1788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015632	AT	3	6	1968	1973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015632	TA	3	6	2012	2017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015632	TA	3	6	2191	2196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015632	TA	3	6	2314	2319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015632	TA	3	6	2417	2422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015632	AT	3	6	2471	2476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015632	AC	3	6	2525	2530	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015632	AT	3	6	2535	2540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015632	AC	3	6	2551	2556	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015632	AT	3	6	2632	2637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015632	AT	3	6	2710	2715	50 %	50 %	0 %	0 %	336120992
18	NC_015632	TA	3	6	2716	2721	50 %	50 %	0 %	0 %	336120992
19	NC_015632	AT	4	8	3145	3152	50 %	50 %	0 %	0 %	336120992
20	NC_015632	AT	3	6	3164	3169	50 %	50 %	0 %	0 %	336120992
21	NC_015632	AT	3	6	3721	3726	50 %	50 %	0 %	0 %	336120992
22	NC_015632	AT	4	8	3773	3780	50 %	50 %	0 %	0 %	336120992
23	NC_015632	AT	3	6	3813	3818	50 %	50 %	0 %	0 %	336120992
24	NC_015632	AT	3	6	4306	4311	50 %	50 %	0 %	0 %	336120992
25	NC_015632	TA	3	6	4312	4317	50 %	50 %	0 %	0 %	336120992
26	NC_015632	AT	3	6	4335	4340	50 %	50 %	0 %	0 %	336120992
27	NC_015632	CA	3	6	4442	4447	50 %	0 %	0 %	50 %	336120992
28	NC_015632	TG	3	6	4615	4620	0 %	50 %	50 %	0 %	336120992
29	NC_015632	TA	3	6	5094	5099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015632	TA	3	6	5751	5756	50 %	50 %	0 %	0 %	336120993
31	NC_015632	AT	3	6	6179	6184	50 %	50 %	0 %	0 %	336120993
32	NC_015632	GA	4	8	6890	6897	50 %	0 %	50 %	0 %	336120993
33	NC_015632	AT	3	6	6942	6947	50 %	50 %	0 %	0 %	336120993
34	NC_015632	AG	4	8	7268	7275	50 %	0 %	50 %	0 %	336120993
35	NC_015632	AT	3	6	7310	7315	50 %	50 %	0 %	0 %	336120993
36	NC_015632	AT	3	6	7875	7880	50 %	50 %	0 %	0 %	336120993
37	NC_015632	AT	3	6	8122	8127	50 %	50 %	0 %	0 %	336120993
38	NC_015632	AT	3	6	8605	8610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015632	TA	3	6	8724	8729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015632	TA	4	8	8731	8738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015632	AT	3	6	9360	9365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015632	TA	3	6	9533	9538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015632	AT	3	6	9554	9559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015632	AT	3	6	9933	9938	50 %	50 %	0 %	0 %	336120995
45	NC_015632	TA	3	6	11154	11159	50 %	50 %	0 %	0 %	336120995
46	NC_015632	AT	3	6	11206	11211	50 %	50 %	0 %	0 %	336120995
47	NC_015632	AT	3	6	11318	11323	50 %	50 %	0 %	0 %	336120995
48	NC_015632	AT	3	6	12079	12084	50 %	50 %	0 %	0 %	336120995
49	NC_015632	AG	3	6	12106	12111	50 %	0 %	50 %	0 %	336120995
50	NC_015632	TA	3	6	12145	12150	50 %	50 %	0 %	0 %	336120995
51	NC_015632	TA	3	6	12726	12731	50 %	50 %	0 %	0 %	336120996
52	NC_015632	TA	3	6	13351	13356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015632	TA	3	6	14721	14726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015632	TA	3	6	14749	14754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015632	TA	3	6	14759	14764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.