MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Methanothermococcus okinawensis IH1 plasmid pMETOK01

Total Repeats: 87

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015632	T	7	7	245	251	0 %	100 %	0 %	0 %	336120991
2	NC_015632	A	6	6	416	421	100 %	0 %	0 %	0 %	336120991
3	NC_015632	T	6	6	491	496	0 %	100 %	0 %	0 %	336120991
4	NC_015632	A	7	7	749	755	100 %	0 %	0 %	0 %	336120991
5	NC_015632	T	6	6	769	774	0 %	100 %	0 %	0 %	336120991
6	NC_015632	T	6	6	1039	1044	0 %	100 %	0 %	0 %	336120991
7	NC_015632	A	6	6	1119	1124	100 %	0 %	0 %	0 %	336120991
8	NC_015632	T	6	6	1157	1162	0 %	100 %	0 %	0 %	336120991
9	NC_015632	T	6	6	1227	1232	0 %	100 %	0 %	0 %	336120991
10	NC_015632	T	7	7	1238	1244	0 %	100 %	0 %	0 %	336120991
11	NC_015632	T	6	6	1367	1372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015632	A	6	6	1453	1458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015632	T	7	7	1620	1626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015632	T	7	7	1665	1671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015632	T	6	6	1695	1700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015632	A	8	8	1803	1810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015632	A	8	8	1978	1985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015632	A	7	7	2025	2031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015632	A	8	8	2047	2054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015632	A	6	6	2059	2064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015632	A	6	6	2134	2139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015632	A	8	8	2259	2266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015632	A	7	7	2343	2349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015632	A	7	7	2376	2382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015632	A	6	6	2721	2726	100 %	0 %	0 %	0 %	336120992
26	NC_015632	T	6	6	2816	2821	0 %	100 %	0 %	0 %	336120992
27	NC_015632	A	6	6	2836	2841	100 %	0 %	0 %	0 %	336120992
28	NC_015632	A	7	7	3195	3201	100 %	0 %	0 %	0 %	336120992
29	NC_015632	A	7	7	3732	3738	100 %	0 %	0 %	0 %	336120992
30	NC_015632	A	7	7	4353	4359	100 %	0 %	0 %	0 %	336120992
31	NC_015632	A	6	6	4781	4786	100 %	0 %	0 %	0 %	336120992
32	NC_015632	A	6	6	4845	4850	100 %	0 %	0 %	0 %	336120992
33	NC_015632	T	6	6	5163	5168	0 %	100 %	0 %	0 %	336120993
34	NC_015632	A	6	6	5274	5279	100 %	0 %	0 %	0 %	336120993
35	NC_015632	A	7	7	5412	5418	100 %	0 %	0 %	0 %	336120993
36	NC_015632	A	6	6	5421	5426	100 %	0 %	0 %	0 %	336120993
37	NC_015632	A	7	7	5435	5441	100 %	0 %	0 %	0 %	336120993
38	NC_015632	T	6	6	5769	5774	0 %	100 %	0 %	0 %	336120993
39	NC_015632	A	7	7	5894	5900	100 %	0 %	0 %	0 %	336120993
40	NC_015632	A	6	6	6137	6142	100 %	0 %	0 %	0 %	336120993
41	NC_015632	A	6	6	6188	6193	100 %	0 %	0 %	0 %	336120993
42	NC_015632	A	7	7	6287	6293	100 %	0 %	0 %	0 %	336120993
43	NC_015632	A	7	7	6693	6699	100 %	0 %	0 %	0 %	336120993
44	NC_015632	A	6	6	6870	6875	100 %	0 %	0 %	0 %	336120993
45	NC_015632	A	6	6	6884	6889	100 %	0 %	0 %	0 %	336120993
46	NC_015632	T	6	6	7091	7096	0 %	100 %	0 %	0 %	336120993
47	NC_015632	A	6	6	7341	7346	100 %	0 %	0 %	0 %	336120993
48	NC_015632	A	6	6	7373	7378	100 %	0 %	0 %	0 %	336120993
49	NC_015632	A	6	6	7384	7389	100 %	0 %	0 %	0 %	336120993
50	NC_015632	T	6	6	7425	7430	0 %	100 %	0 %	0 %	336120993
51	NC_015632	A	7	7	7473	7479	100 %	0 %	0 %	0 %	336120993
52	NC_015632	G	6	6	7488	7493	0 %	0 %	100 %	0 %	336120993
53	NC_015632	A	6	6	7529	7534	100 %	0 %	0 %	0 %	336120993
54	NC_015632	A	6	6	7673	7678	100 %	0 %	0 %	0 %	336120993
55	NC_015632	A	6	6	7691	7696	100 %	0 %	0 %	0 %	336120993
56	NC_015632	A	6	6	7767	7772	100 %	0 %	0 %	0 %	336120993
57	NC_015632	A	6	6	8214	8219	100 %	0 %	0 %	0 %	336120993
58	NC_015632	T	7	7	8627	8633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015632	T	6	6	8636	8641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015632	A	6	6	8840	8845	100 %	0 %	0 %	0 %	336120994
61	NC_015632	A	6	6	8851	8856	100 %	0 %	0 %	0 %	336120994
62	NC_015632	A	7	7	8891	8897	100 %	0 %	0 %	0 %	336120994
63	NC_015632	A	7	7	8995	9001	100 %	0 %	0 %	0 %	336120994
64	NC_015632	T	6	6	9740	9745	0 %	100 %	0 %	0 %	336120995
65	NC_015632	T	6	6	10121	10126	0 %	100 %	0 %	0 %	336120995
66	NC_015632	A	6	6	10139	10144	100 %	0 %	0 %	0 %	336120995
67	NC_015632	T	7	7	10232	10238	0 %	100 %	0 %	0 %	336120995
68	NC_015632	A	6	6	10445	10450	100 %	0 %	0 %	0 %	336120995
69	NC_015632	A	6	6	10501	10506	100 %	0 %	0 %	0 %	336120995
70	NC_015632	A	6	6	10657	10662	100 %	0 %	0 %	0 %	336120995
71	NC_015632	A	6	6	10835	10840	100 %	0 %	0 %	0 %	336120995
72	NC_015632	A	6	6	11353	11358	100 %	0 %	0 %	0 %	336120995
73	NC_015632	A	7	7	11440	11446	100 %	0 %	0 %	0 %	336120995
74	NC_015632	A	6	6	11480	11485	100 %	0 %	0 %	0 %	336120995
75	NC_015632	A	7	7	11930	11936	100 %	0 %	0 %	0 %	336120995
76	NC_015632	A	6	6	12128	12133	100 %	0 %	0 %	0 %	336120995
77	NC_015632	A	7	7	12672	12678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015632	T	7	7	12891	12897	0 %	100 %	0 %	0 %	336120996
79	NC_015632	T	6	6	12925	12930	0 %	100 %	0 %	0 %	336120996
80	NC_015632	T	6	6	12938	12943	0 %	100 %	0 %	0 %	336120996
81	NC_015632	A	7	7	13438	13444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015632	T	7	7	13540	13546	0 %	100 %	0 %	0 %	336120998
83	NC_015632	T	7	7	13781	13787	0 %	100 %	0 %	0 %	336120998
84	NC_015632	T	7	7	13964	13970	0 %	100 %	0 %	0 %	336120999
85	NC_015632	A	6	6	14137	14142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015632	T	6	6	14165	14170	0 %	100 %	0 %	0 %	336121000
87	NC_015632	T	7	7	14190	14196	0 %	100 %	0 %	0 %	336121000

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.