MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus kefiranofaciens ZW3 plasmid pWW2

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015603	AAAG	2	8	389	396	75 %	0 %	25 %	0 %	336055420
2	NC_015603	TGGT	2	8	702	709	0 %	50 %	50 %	0 %	336055420
3	NC_015603	GAAA	2	8	882	889	75 %	0 %	25 %	0 %	336055420
4	NC_015603	TTAA	2	8	1113	1120	50 %	50 %	0 %	0 %	336055420
5	NC_015603	TAAA	2	8	1204	1211	75 %	25 %	0 %	0 %	336055420
6	NC_015603	AATT	2	8	1285	1292	50 %	50 %	0 %	0 %	336055420
7	NC_015603	AACA	2	8	1309	1316	75 %	0 %	0 %	25 %	336055420
8	NC_015603	AACG	2	8	1338	1345	50 %	0 %	25 %	25 %	336055420
9	NC_015603	GCAA	2	8	1760	1767	50 %	0 %	25 %	25 %	336055420
10	NC_015603	TTAT	2	8	1814	1821	25 %	75 %	0 %	0 %	336055420
11	NC_015603	AGTT	2	8	2697	2704	25 %	50 %	25 %	0 %	336055422
12	NC_015603	GTGA	2	8	2927	2934	25 %	25 %	50 %	0 %	336055422
13	NC_015603	GCAG	2	8	3223	3230	25 %	0 %	50 %	25 %	336055422
14	NC_015603	ATTT	2	8	3324	3331	25 %	75 %	0 %	0 %	336055423
15	NC_015603	AAGC	2	8	3383	3390	50 %	0 %	25 %	25 %	336055423
16	NC_015603	TATT	2	8	3463	3470	25 %	75 %	0 %	0 %	336055423
17	NC_015603	TTTA	2	8	3930	3937	25 %	75 %	0 %	0 %	336055424
18	NC_015603	GTAT	2	8	4078	4085	25 %	50 %	25 %	0 %	336055425
19	NC_015603	ATTT	2	8	4659	4666	25 %	75 %	0 %	0 %	336055426
20	NC_015603	TGAT	2	8	4752	4759	25 %	50 %	25 %	0 %	336055426
21	NC_015603	TGAG	2	8	6751	6758	25 %	25 %	50 %	0 %	336055427
22	NC_015603	GGCA	2	8	7252	7259	25 %	0 %	50 %	25 %	336055427
23	NC_015603	AGGC	2	8	8025	8032	25 %	0 %	50 %	25 %	336055427
24	NC_015603	ACCC	2	8	8805	8812	25 %	0 %	0 %	75 %	336055428
25	NC_015603	CCAA	2	8	9392	9399	50 %	0 %	0 %	50 %	336055429
26	NC_015603	GCAA	2	8	10146	10153	50 %	0 %	25 %	25 %	336055430
27	NC_015603	ACCA	2	8	10166	10173	50 %	0 %	0 %	50 %	336055430
28	NC_015603	ATTA	2	8	10420	10427	50 %	50 %	0 %	0 %	336055431
29	NC_015603	ATTT	2	8	10457	10464	25 %	75 %	0 %	0 %	336055431
30	NC_015603	AGCA	2	8	10481	10488	50 %	0 %	25 %	25 %	336055431
31	NC_015603	GGCG	2	8	11123	11130	0 %	0 %	75 %	25 %	336055432
32	NC_015603	TTTG	2	8	11701	11708	0 %	75 %	25 %	0 %	336055432
33	NC_015603	AGCC	2	8	12020	12027	25 %	0 %	25 %	50 %	336055432
34	NC_015603	ACTT	2	8	12208	12215	25 %	50 %	0 %	25 %	336055432
35	NC_015603	TCAG	2	8	12440	12447	25 %	25 %	25 %	25 %	336055433
36	NC_015603	GATA	2	8	12609	12616	50 %	25 %	25 %	0 %	336055433
37	NC_015603	TGTT	2	8	12617	12624	0 %	75 %	25 %	0 %	336055434
38	NC_015603	TTAG	2	8	13596	13603	25 %	50 %	25 %	0 %	336055435
39	NC_015603	ATTG	2	8	15700	15707	25 %	50 %	25 %	0 %	336055436
40	NC_015603	TAAA	2	8	15822	15829	75 %	25 %	0 %	0 %	336055436
41	NC_015603	ATTG	2	8	18111	18118	25 %	50 %	25 %	0 %	336055440
42	NC_015603	AATT	2	8	18422	18429	50 %	50 %	0 %	0 %	336055440
43	NC_015603	TAAA	2	8	18791	18798	75 %	25 %	0 %	0 %	336055440
44	NC_015603	GATT	2	8	19277	19284	25 %	50 %	25 %	0 %	336055440
45	NC_015603	ACCT	2	8	19945	19952	25 %	25 %	0 %	50 %	336055441
46	NC_015603	TAAT	2	8	20178	20185	50 %	50 %	0 %	0 %	336055441
47	NC_015603	TAGT	2	8	20624	20631	25 %	50 %	25 %	0 %	336055441
48	NC_015603	ATTT	2	8	20761	20768	25 %	75 %	0 %	0 %	336055441
49	NC_015603	AGAT	2	8	21064	21071	50 %	25 %	25 %	0 %	336055441
50	NC_015603	ATTT	2	8	21318	21325	25 %	75 %	0 %	0 %	336055442
51	NC_015603	AATG	2	8	22574	22581	50 %	25 %	25 %	0 %	336055445
52	NC_015603	GATT	2	8	22784	22791	25 %	50 %	25 %	0 %	336055445
53	NC_015603	TTTA	2	8	23551	23558	25 %	75 %	0 %	0 %	336055446
54	NC_015603	AATT	2	8	23841	23848	50 %	50 %	0 %	0 %	336055446
55	NC_015603	AATT	2	8	24015	24022	50 %	50 %	0 %	0 %	336055446
56	NC_015603	CTTT	2	8	25024	25031	0 %	75 %	0 %	25 %	336055446
57	NC_015603	GAAT	2	8	25070	25077	50 %	25 %	25 %	0 %	336055446
58	NC_015603	AATA	2	8	25129	25136	75 %	25 %	0 %	0 %	336055446
59	NC_015603	ATTG	2	8	25227	25234	25 %	50 %	25 %	0 %	336055446
60	NC_015603	ATGC	2	8	25308	25315	25 %	25 %	25 %	25 %	336055446
61	NC_015603	AGAT	2	8	25775	25782	50 %	25 %	25 %	0 %	336055447
62	NC_015603	ATTT	2	8	25902	25909	25 %	75 %	0 %	0 %	336055448
63	NC_015603	TATT	2	8	25930	25937	25 %	75 %	0 %	0 %	336055448
64	NC_015603	AATT	2	8	26059	26066	50 %	50 %	0 %	0 %	336055448
65	NC_015603	TGTT	2	8	26357	26364	0 %	75 %	25 %	0 %	336055448
66	NC_015603	TAAA	2	8	26401	26408	75 %	25 %	0 %	0 %	336055448
67	NC_015603	TAAA	2	8	27190	27197	75 %	25 %	0 %	0 %	336055448
68	NC_015603	TACA	2	8	27442	27449	50 %	25 %	0 %	25 %	336055448
69	NC_015603	AATT	2	8	27903	27910	50 %	50 %	0 %	0 %	336055450
70	NC_015603	TTTG	2	8	27917	27924	0 %	75 %	25 %	0 %	336055450
71	NC_015603	CCAA	2	8	28810	28817	50 %	0 %	0 %	50 %	336055451
72	NC_015603	TGAT	2	8	28923	28930	25 %	50 %	25 %	0 %	336055451
73	NC_015603	CGTC	2	8	29400	29407	0 %	25 %	25 %	50 %	336055452
74	NC_015603	GATA	2	8	29882	29889	50 %	25 %	25 %	0 %	336055453
75	NC_015603	AAAG	2	8	31241	31248	75 %	0 %	25 %	0 %	336055455
76	NC_015603	AACA	2	8	31369	31376	75 %	0 %	0 %	25 %	336055455
77	NC_015603	TGGT	2	8	31881	31888	0 %	50 %	50 %	0 %	336055456
78	NC_015603	TTAT	2	8	32418	32425	25 %	75 %	0 %	0 %	336055456
79	NC_015603	TAAT	2	8	32993	33000	50 %	50 %	0 %	0 %	336055456
80	NC_015603	TGAT	2	8	33329	33336	25 %	50 %	25 %	0 %	336055456
81	NC_015603	ACAA	2	8	33657	33664	75 %	0 %	0 %	25 %	336055456
82	NC_015603	AAAG	2	8	33693	33700	75 %	0 %	25 %	0 %	336055456
83	NC_015603	AACG	2	8	33715	33722	50 %	0 %	25 %	25 %	336055456
84	NC_015603	GGAA	2	8	33746	33753	50 %	0 %	50 %	0 %	336055456
85	NC_015603	GTAC	2	8	33809	33816	25 %	25 %	25 %	25 %	336055456
86	NC_015603	AACC	2	8	33820	33827	50 %	0 %	0 %	50 %	336055456
87	NC_015603	CAAG	2	8	33936	33943	50 %	0 %	25 %	25 %	336055456
88	NC_015603	GTAT	2	8	33993	34000	25 %	50 %	25 %	0 %	336055456
89	NC_015603	CTGG	2	8	34022	34029	0 %	25 %	50 %	25 %	336055456
90	NC_015603	CAGT	2	8	34393	34400	25 %	25 %	25 %	25 %	336055456
91	NC_015603	GAAA	2	8	34470	34477	75 %	0 %	25 %	0 %	336055457
92	NC_015603	ATAA	2	8	34675	34682	75 %	25 %	0 %	0 %	336055457
93	NC_015603	GTTT	2	8	35405	35412	0 %	75 %	25 %	0 %	336055457
94	NC_015603	AATT	2	8	35426	35433	50 %	50 %	0 %	0 %	336055457
95	NC_015603	TAAT	2	8	35654	35661	50 %	50 %	0 %	0 %	336055457
96	NC_015603	TCTT	2	8	35754	35761	0 %	75 %	0 %	25 %	336055457
97	NC_015603	TAAA	2	8	35876	35883	75 %	25 %	0 %	0 %	336055457
98	NC_015603	GAAA	2	8	35958	35965	75 %	0 %	25 %	0 %	336055457
99	NC_015603	AAAT	2	8	36751	36758	75 %	25 %	0 %	0 %	336055458
100	NC_015603	AGCA	2	8	36815	36822	50 %	0 %	25 %	25 %	336055458
101	NC_015603	AGCC	2	8	37017	37024	25 %	0 %	25 %	50 %	336055458
102	NC_015603	TGGT	2	8	38238	38245	0 %	50 %	50 %	0 %	336055459
103	NC_015603	TGGC	2	8	38427	38434	0 %	25 %	50 %	25 %	336055459
104	NC_015603	AATC	2	8	39572	39579	50 %	25 %	0 %	25 %	336055462
105	NC_015603	GCTT	2	8	39717	39724	0 %	50 %	25 %	25 %	336055462
106	NC_015603	AGGA	2	8	39847	39854	50 %	0 %	50 %	0 %	336055462
107	NC_015603	TACC	2	8	40867	40874	25 %	25 %	0 %	50 %	336055463
108	NC_015603	ATGA	2	8	40904	40911	50 %	25 %	25 %	0 %	336055463
109	NC_015603	TATT	2	8	42287	42294	25 %	75 %	0 %	0 %	336055465
110	NC_015603	TTTA	2	8	42313	42320	25 %	75 %	0 %	0 %	336055465
111	NC_015603	AGAA	2	8	42804	42811	75 %	0 %	25 %	0 %	336055466
112	NC_015603	TAAG	2	8	45491	45498	50 %	25 %	25 %	0 %	336055472
113	NC_015603	AAAG	2	8	45601	45608	75 %	0 %	25 %	0 %	336055472
114	NC_015603	GATT	2	8	46003	46010	25 %	50 %	25 %	0 %	336055474

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.