MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus kefiranofaciens ZW3 chromosome

Total Repeats: 159

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015602	TAGGAT	2	12	3367	3378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015602	CTTTTT	2	12	15036	15047	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015602	ATATTT	2	12	23689	23700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015602	AAAAAG	2	12	68599	68610	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015602	ACCAGT	3	18	69845	69862	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015602	TGGCTG	2	12	108549	108560	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_015602	CGGAGC	2	12	127715	127726	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015602	ATATTT	2	12	131720	131731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015602	CGGAGC	2	12	144858	144869	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015602	CTTTTT	2	12	147524	147535	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015602	GATAAT	2	12	176079	176090	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015602	GAAGGC	2	12	176877	176888	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_015602	TAATGC	2	12	178797	178808	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015602	TCAAGT	2	12	180018	180029	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_015602	CTGATG	2	12	221915	221926	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015602	AATTAA	2	12	235707	235718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015602	AATTAA	2	12	292918	292929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015602	TAAATA	2	12	301743	301754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015602	TTAGTT	2	12	337711	337722	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015602	TCTATT	2	12	367383	367394	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015602	TTCTTT	2	12	374436	374447	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_015602	GATTTT	2	12	384570	384581	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015602	TGTTTT	2	12	430273	430284	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015602	GAATAC	2	12	430848	430859	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015602	TCATAC	2	12	431388	431399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015602	TAATTA	2	12	441340	441351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015602	TTTAGT	2	12	441860	441871	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015602	TAATGC	2	12	441920	441931	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_015602	ATTGCC	2	12	449967	449978	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015602	AAATAT	2	12	509551	509562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015602	CAAAAA	2	12	577420	577431	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015602	GATATA	2	12	584840	584851	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015602	TAAATT	2	12	586665	586676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015602	GATTTA	2	12	586705	586716	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015602	AAAAAT	2	12	608406	608417	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015602	TGCTGG	2	12	618324	618335	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015602	TGGTGT	2	12	625710	625721	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015602	TTGGAG	2	12	625955	625966	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015602	GTTGTG	2	12	626386	626397	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015602	ATTGAA	2	12	637935	637946	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015602	TTAATT	2	12	644193	644204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015602	TATTAA	2	12	644316	644327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015602	TTCTTT	2	12	652289	652300	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_015602	AATTGC	2	12	665400	665411	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_015602	TGATCC	2	12	665855	665866	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015602	TTGATA	2	12	673630	673641	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015602	GCTAAA	2	12	696176	696187	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_015602	ATTTAT	2	12	700462	700473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015602	TATTTA	2	12	709915	709926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015602	TTTTAT	2	12	724232	724243	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015602	ATTAGT	2	12	726803	726814	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015602	GCTATC	2	12	734799	734810	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015602	TTTATT	2	12	742161	742172	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015602	TAAAAA	2	12	763461	763472	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015602	TGCTTT	2	12	782223	782234	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015602	ATAAAA	2	12	798337	798348	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015602	CCTAAT	2	12	821502	821513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015602	TGTTTA	2	12	827163	827174	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015602	CTTTTT	2	12	840775	840786	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015602	AGATGA	2	12	842101	842112	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015602	CCCTAG	2	12	842151	842162	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015602	TTAATT	2	12	855989	856000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015602	AATTTT	2	12	871816	871827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015602	AGTTTG	2	12	879737	879748	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015602	AAAAGA	2	12	879800	879811	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015602	TTAGCT	2	12	897872	897883	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_015602	TCAGTA	2	12	898589	898600	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_015602	TTTCCT	2	12	935246	935257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015602	TAAAAA	2	12	989974	989985	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015602	ATTTTT	2	12	1009412	1009423	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015602	GATATA	2	12	1033381	1033392	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015602	TATTTT	2	12	1033642	1033653	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015602	TTATGG	2	12	1040688	1040699	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015602	GCTTAA	2	12	1040965	1040976	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_015602	TTCTAT	2	12	1054179	1054190	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_015602	ATTACT	2	12	1095396	1095407	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_015602	TTCAGT	2	12	1098325	1098336	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_015602	TAACAC	2	12	1103455	1103466	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015602	AATATT	2	12	1106459	1106470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015602	TAAAAA	2	12	1108823	1108834	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015602	CGCTTC	2	12	1162108	1162119	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015602	AATCTG	2	12	1179076	1179087	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_015602	AATATT	2	12	1186855	1186866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015602	AGCGAT	2	12	1202055	1202066	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_015602	ATTTTT	2	12	1206385	1206396	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015602	AAAATC	2	12	1208917	1208928	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_015602	ACTGAG	2	12	1240664	1240675	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_015602	GTAACT	2	12	1250353	1250364	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_015602	CTTTTA	2	12	1266200	1266211	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_015602	GCATGC	2	12	1277809	1277820	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015602	TTTTTA	2	12	1286336	1286347	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015602	AGTCCA	2	12	1290569	1290580	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015602	TTATTT	2	12	1312201	1312212	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015602	TCGTTT	2	12	1326027	1326038	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_015602	CTAAAT	2	12	1341759	1341770	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_015602	GCTCCG	2	12	1349839	1349850	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015602	AGAAAA	2	12	1352858	1352869	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015602	CAAAAA	2	12	1354259	1354270	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_015602	AAAAGA	2	12	1372469	1372480	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015602	TGTTTT	2	12	1377811	1377822	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015602	ATTGCC	2	12	1381209	1381220	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015602	TTTTTA	2	12	1381862	1381873	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015602	TTTTGT	2	12	1398575	1398586	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015602	TTTGTT	2	12	1405064	1405075	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015602	AGCTTT	2	12	1409766	1409777	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_015602	CAACTT	2	12	1412278	1412289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015602	CAATCG	2	12	1413872	1413883	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015602	AAAATA	2	12	1446973	1446984	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015602	ATCAAC	2	12	1459117	1459128	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015602	ATCTAT	2	12	1460393	1460404	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_015602	AATTAG	2	12	1461760	1461771	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015602	CAAATT	2	12	1461871	1461882	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_015602	TTTTAA	2	12	1499583	1499594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015602	AATCGT	2	12	1503910	1503921	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_015602	CATCAG	2	12	1505421	1505432	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015602	AAAAGA	2	12	1525861	1525872	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015602	AGCCGA	2	12	1527488	1527499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015602	AAAAAC	2	12	1527939	1527950	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_015602	TAAATT	2	12	1532375	1532386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015602	GCAAAG	2	12	1537803	1537814	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_015602	TTGATC	2	12	1562539	1562550	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_015602	ATTTTT	2	12	1568031	1568042	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015602	CCAGTA	2	12	1607238	1607249	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015602	GAATCT	2	12	1608432	1608443	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_015602	TTCCTG	2	12	1609355	1609366	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015602	CAAATT	2	12	1609490	1609501	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_015602	TAACGT	2	12	1638616	1638627	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_015602	GAATTT	2	12	1639354	1639365	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015602	CAGCTG	2	12	1689437	1689448	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015602	TTTACT	2	12	1700090	1700101	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_015602	TTAATA	2	12	1700170	1700181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015602	ATATGA	2	12	1734723	1734734	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015602	GATCAT	2	12	1739647	1739658	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_015602	ACTAAA	2	12	1740296	1740307	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_015602	AAGTTG	2	12	1740939	1740950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015602	CTTAAG	2	12	1763828	1763839	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_015602	AATTTT	2	12	1771033	1771044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015602	TTTTGC	2	12	1783639	1783650	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_015602	ATACAG	2	12	1784056	1784067	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_015602	TCTAGA	2	12	1790960	1790971	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_015602	GAATAT	2	12	1795169	1795180	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015602	TCACCG	2	12	1797064	1797075	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
143	NC_015602	CTTTTT	2	12	1810851	1810862	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_015602	AGAGTT	2	12	1820225	1820236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015602	CGGAGC	2	12	1821102	1821113	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_015602	ATTAAA	2	12	1824722	1824733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015602	GATTTT	2	12	1840603	1840614	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015602	AAAATT	2	12	1859646	1859657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015602	TAGATA	2	12	1865099	1865110	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015602	CTGCTT	2	12	1911792	1911803	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_015602	GCATTG	2	12	1931538	1931549	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_015602	TTTTAA	2	12	1949042	1949053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015602	AAATTC	2	12	1960850	1960861	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_015602	CGATTG	2	12	1974120	1974131	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
155	NC_015602	TTTAAT	2	12	1981418	1981429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015602	GGCTTA	2	12	2003699	2003710	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
157	NC_015602	TCATCG	2	12	2035346	2035357	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_015602	TGAATT	2	12	2040689	2040700	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015602	TTGGAA	2	12	2060213	2060224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.