MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus kefiranofaciens ZW3 chromosome

Total Repeats: 1654

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015602	GTAGA	2	10	5367	5376	40 %	20 %	40 %	0 %	336053523
2	NC_015602	GTTAA	2	10	5845	5854	40 %	40 %	20 %	0 %	336053524
3	NC_015602	TACCT	2	10	8010	8019	20 %	40 %	0 %	40 %	336053527
4	NC_015602	ACGTT	2	10	9130	9139	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_015602	TATTT	2	10	12451	12460	20 %	80 %	0 %	0 %	336053534
6	NC_015602	TGTTT	2	10	12513	12522	0 %	80 %	20 %	0 %	336053534
7	NC_015602	TAGTA	2	10	13985	13994	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015602	TTAAT	2	10	14496	14505	40 %	60 %	0 %	0 %	336053536
9	NC_015602	CATTC	2	10	14636	14645	20 %	40 %	0 %	40 %	336053537
10	NC_015602	ATACA	2	10	15092	15101	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015602	TTAAG	2	10	15261	15270	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015602	GGTGA	2	10	17064	17073	20 %	20 %	60 %	0 %	336053541
13	NC_015602	CTTTA	2	10	18140	18149	20 %	60 %	0 %	20 %	336053543
14	NC_015602	TCAAT	2	10	22050	22059	40 %	40 %	0 %	20 %	336053548
15	NC_015602	TTGGT	2	10	23224	23233	0 %	60 %	40 %	0 %	336053549
16	NC_015602	AGTTT	2	10	23573	23582	20 %	60 %	20 %	0 %	336053549
17	NC_015602	TTCTG	2	10	24692	24701	0 %	60 %	20 %	20 %	336053550
18	NC_015602	CAATT	2	10	26259	26268	40 %	40 %	0 %	20 %	336053550
19	NC_015602	GTCTT	2	10	26514	26523	0 %	60 %	20 %	20 %	336053550
20	NC_015602	ACTTA	2	10	26989	26998	40 %	40 %	0 %	20 %	336053551
21	NC_015602	GAACC	2	10	28864	28873	40 %	0 %	20 %	40 %	336053553
22	NC_015602	TTTCA	2	10	28914	28923	20 %	60 %	0 %	20 %	336053553
23	NC_015602	AAAAG	2	10	30302	30311	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015602	ATTAA	2	10	31285	31294	60 %	40 %	0 %	0 %	336053556
25	NC_015602	TCGAT	2	10	31403	31412	20 %	40 %	20 %	20 %	336053556
26	NC_015602	ATTAA	2	10	31972	31981	60 %	40 %	0 %	0 %	336053556
27	NC_015602	AAGGC	2	10	32643	32652	40 %	0 %	40 %	20 %	336053557
28	NC_015602	AAATT	2	10	37421	37430	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015602	ATTAC	2	10	37474	37483	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_015602	TATAA	2	10	37528	37537	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015602	ATTAT	2	10	37899	37908	40 %	60 %	0 %	0 %	336053563
32	NC_015602	ATTTG	2	10	38367	38376	20 %	60 %	20 %	0 %	336053563
33	NC_015602	ATGAA	2	10	42505	42514	60 %	20 %	20 %	0 %	336053567
34	NC_015602	AGTTA	2	10	43460	43469	40 %	40 %	20 %	0 %	336053569
35	NC_015602	GGTAA	2	10	43728	43737	40 %	20 %	40 %	0 %	336053569
36	NC_015602	AGCAG	2	10	44923	44932	40 %	0 %	40 %	20 %	336053571
37	NC_015602	GATCG	2	10	47960	47969	20 %	20 %	40 %	20 %	336053574
38	NC_015602	TTGAA	2	10	52463	52472	40 %	40 %	20 %	0 %	336053580
39	NC_015602	ATATA	2	10	54414	54423	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015602	CAACA	2	10	54903	54912	60 %	0 %	0 %	40 %	336053583
41	NC_015602	GACGA	2	10	56341	56350	40 %	0 %	40 %	20 %	336053584
42	NC_015602	AAGAG	2	10	59372	59381	60 %	0 %	40 %	0 %	336053589
43	NC_015602	ACAAG	2	10	59519	59528	60 %	0 %	20 %	20 %	336053590
44	NC_015602	ATCAT	2	10	62230	62239	40 %	40 %	0 %	20 %	336053593
45	NC_015602	TAAAA	2	10	62849	62858	80 %	20 %	0 %	0 %	336053594
46	NC_015602	AATCG	2	10	63646	63655	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_015602	CAAGG	2	10	64755	64764	40 %	0 %	40 %	20 %	336053596
48	NC_015602	ATAAA	2	10	67343	67352	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015602	GCCTT	2	10	69492	69501	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_015602	TTCAT	2	10	69624	69633	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_015602	TTTCA	2	10	70138	70147	20 %	60 %	0 %	20 %	336053599
52	NC_015602	TGACG	2	10	71376	71385	20 %	20 %	40 %	20 %	336053599
53	NC_015602	TTTTC	2	10	72052	72061	0 %	80 %	0 %	20 %	336053600
54	NC_015602	GTTGC	2	10	72101	72110	0 %	40 %	40 %	20 %	336053600
55	NC_015602	CCAAT	2	10	73193	73202	40 %	20 %	0 %	40 %	336053600
56	NC_015602	AAATT	2	10	73404	73413	60 %	40 %	0 %	0 %	336053600
57	NC_015602	TGGTT	2	10	73540	73549	0 %	60 %	40 %	0 %	336053600
58	NC_015602	GATTA	2	10	74506	74515	40 %	40 %	20 %	0 %	336053601
59	NC_015602	TAATT	2	10	75498	75507	40 %	60 %	0 %	0 %	336053602
60	NC_015602	ATTTG	2	10	75924	75933	20 %	60 %	20 %	0 %	336053603
61	NC_015602	TTATG	2	10	79382	79391	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015602	TTAAA	2	10	80867	80876	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015602	AGTTA	2	10	81992	82001	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015602	TAATT	2	10	82506	82515	40 %	60 %	0 %	0 %	336053611
65	NC_015602	AACTC	2	10	83230	83239	40 %	20 %	0 %	40 %	336053611
66	NC_015602	TTCAA	2	10	83693	83702	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_015602	GGCTT	2	10	83997	84006	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_015602	GATCG	2	10	84881	84890	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_015602	TTGAA	2	10	85057	85066	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015602	GAAAA	2	10	85191	85200	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015602	AATTG	2	10	85871	85880	40 %	40 %	20 %	0 %	336053612
72	NC_015602	TAAAT	2	10	86230	86239	60 %	40 %	0 %	0 %	336053612
73	NC_015602	ATCGT	2	10	87777	87786	20 %	40 %	20 %	20 %	336053614
74	NC_015602	ATTTT	2	10	87876	87885	20 %	80 %	0 %	0 %	336053614
75	NC_015602	AATAG	2	10	87905	87914	60 %	20 %	20 %	0 %	336053614
76	NC_015602	CAATC	2	10	90257	90266	40 %	20 %	0 %	40 %	336053618
77	NC_015602	CTTTG	2	10	92273	92282	0 %	60 %	20 %	20 %	336053620
78	NC_015602	CTTTT	2	10	92959	92968	0 %	80 %	0 %	20 %	336053622
79	NC_015602	GCTTA	2	10	93310	93319	20 %	40 %	20 %	20 %	336053622
80	NC_015602	ATCAA	2	10	93811	93820	60 %	20 %	0 %	20 %	336053622
81	NC_015602	AATTT	2	10	96540	96549	40 %	60 %	0 %	0 %	336053623
82	NC_015602	AAGTA	2	10	97698	97707	60 %	20 %	20 %	0 %	336053624
83	NC_015602	TTTTA	2	10	98958	98967	20 %	80 %	0 %	0 %	336053625
84	NC_015602	TTTTG	2	10	99593	99602	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015602	TTAGT	2	10	104178	104187	20 %	60 %	20 %	0 %	336053630
86	NC_015602	TTTTC	2	10	111462	111471	0 %	80 %	0 %	20 %	336053637
87	NC_015602	GCAAT	2	10	113715	113724	40 %	20 %	20 %	20 %	336053640
88	NC_015602	TGAAT	2	10	115081	115090	40 %	40 %	20 %	0 %	336053642
89	NC_015602	AGGGC	2	10	116582	116591	20 %	0 %	60 %	20 %	336053644
90	NC_015602	AGTAA	2	10	116665	116674	60 %	20 %	20 %	0 %	336053644
91	NC_015602	AGAAA	2	10	116995	117004	80 %	0 %	20 %	0 %	336053645
92	NC_015602	TGAAA	2	10	118808	118817	60 %	20 %	20 %	0 %	336053646
93	NC_015602	ATACC	2	10	120468	120477	40 %	20 %	0 %	40 %	336053648
94	NC_015602	GAAGT	2	10	121104	121113	40 %	20 %	40 %	0 %	336053648
95	NC_015602	TTATT	2	10	121466	121475	20 %	80 %	0 %	0 %	336053649
96	NC_015602	TATTT	2	10	122818	122827	20 %	80 %	0 %	0 %	336053651
97	NC_015602	GGTTT	2	10	124296	124305	0 %	60 %	40 %	0 %	336053653
98	NC_015602	GGTAA	2	10	125571	125580	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015602	TCGTG	2	10	126388	126397	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_015602	GGCAG	2	10	126787	126796	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
101	NC_015602	GAGAA	2	10	127047	127056	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015602	AAGGC	2	10	128445	128454	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_015602	TTGAA	2	10	128954	128963	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015602	CAAAG	2	10	129968	129977	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_015602	AGGAA	2	10	130140	130149	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015602	AGAAA	2	10	133883	133892	80 %	0 %	20 %	0 %	336053654
107	NC_015602	ACAAA	2	10	134300	134309	80 %	0 %	0 %	20 %	336053654
108	NC_015602	CTTTT	2	10	136184	136193	0 %	80 %	0 %	20 %	336053656
109	NC_015602	TTTCA	2	10	136351	136360	20 %	60 %	0 %	20 %	336053656
110	NC_015602	AAGAT	2	10	136527	136536	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015602	AAACT	2	10	136596	136605	60 %	20 %	0 %	20 %	336053657
112	NC_015602	TATTT	2	10	136649	136658	20 %	80 %	0 %	0 %	336053657
113	NC_015602	GTTTG	2	10	137506	137515	0 %	60 %	40 %	0 %	336053657
114	NC_015602	GAAAA	2	10	139152	139161	80 %	0 %	20 %	0 %	336053659
115	NC_015602	ATTGT	2	10	140343	140352	20 %	60 %	20 %	0 %	336053659
116	NC_015602	TGGCT	2	10	140675	140684	0 %	40 %	40 %	20 %	336053659
117	NC_015602	GGTAA	2	10	142714	142723	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015602	TCGTG	2	10	143531	143540	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_015602	GGCAG	2	10	143930	143939	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
120	NC_015602	GAGAA	2	10	144190	144199	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015602	AAGGC	2	10	145588	145597	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_015602	TTGAA	2	10	146097	146106	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015602	CAAAG	2	10	147111	147120	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_015602	AGGAA	2	10	147283	147292	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015602	AATGG	2	10	148311	148320	40 %	20 %	40 %	0 %	336053661
126	NC_015602	TAATA	2	10	148472	148481	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015602	GATGC	2	10	148943	148952	20 %	20 %	40 %	20 %	336053662
128	NC_015602	GAAAA	2	10	152017	152026	80 %	0 %	20 %	0 %	336053664
129	NC_015602	CTGGC	2	10	154831	154840	0 %	20 %	40 %	40 %	336053665
130	NC_015602	CTTTG	2	10	155579	155588	0 %	60 %	20 %	20 %	336053666
131	NC_015602	TTGTT	2	10	156464	156473	0 %	80 %	20 %	0 %	336053667
132	NC_015602	CTACA	2	10	158726	158735	40 %	20 %	0 %	40 %	336053668
133	NC_015602	TAGGT	2	10	159661	159670	20 %	40 %	40 %	0 %	336053670
134	NC_015602	AATAA	2	10	163107	163116	80 %	20 %	0 %	0 %	336053673
135	NC_015602	TAGAA	2	10	163467	163476	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015602	GCTTA	2	10	164065	164074	20 %	40 %	20 %	20 %	336053674
137	NC_015602	GTTTG	2	10	164681	164690	0 %	60 %	40 %	0 %	336053674
138	NC_015602	TAAGT	2	10	166044	166053	40 %	40 %	20 %	0 %	336053674
139	NC_015602	CAAAG	2	10	169554	169563	60 %	0 %	20 %	20 %	336053677
140	NC_015602	TAAAT	2	10	170309	170318	60 %	40 %	0 %	0 %	336053679
141	NC_015602	TAAAT	2	10	170417	170426	60 %	40 %	0 %	0 %	336053679
142	NC_015602	GGCAA	2	10	172378	172387	40 %	0 %	40 %	20 %	336053680
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149	NC_015602	CATTA	2	10	175509	175518	40 %	40 %	0 %	20 %	336053685
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152	NC_015602	GCACG	2	10	185797	185806	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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180	NC_015602	TAAAA	2	10	224099	224108	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_015602	TAATT	2	10	243680	243689	40 %	60 %	0 %	0 %	336053744
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198	NC_015602	CCGCG	2	10	247778	247787	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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244	NC_015602	CTATT	2	10	307823	307832	20 %	60 %	0 %	20 %	336053805
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249	NC_015602	TAAGT	2	10	315293	315302	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
250	NC_015602	AATTG	2	10	318577	318586	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
251	NC_015602	TTGGT	2	10	318750	318759	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
252	NC_015602	AGTTT	2	10	320762	320771	20 %	60 %	20 %	0 %	336053812
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270	NC_015602	TAAAT	2	10	335634	335643	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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