MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus kefiranofaciens ZW3 chromosome

Total Repeats: 439

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015602	ACGTT	2	10	9130	9139	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015602	TAGTA	2	10	13985	13994	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015602	ATACA	2	10	15092	15101	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_015602	TTAAG	2	10	15261	15270	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015602	AAAAG	2	10	30302	30311	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015602	AAATT	2	10	37421	37430	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015602	ATTAC	2	10	37474	37483	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_015602	TATAA	2	10	37528	37537	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015602	ATATA	2	10	54414	54423	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015602	AATCG	2	10	63646	63655	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015602	ATAAA	2	10	67343	67352	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015602	GCCTT	2	10	69492	69501	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_015602	TTCAT	2	10	69624	69633	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_015602	TTATG	2	10	79382	79391	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015602	TTAAA	2	10	80867	80876	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015602	AGTTA	2	10	81992	82001	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015602	TTCAA	2	10	83693	83702	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_015602	GGCTT	2	10	83997	84006	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_015602	GATCG	2	10	84881	84890	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_015602	TTGAA	2	10	85057	85066	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015602	GAAAA	2	10	85191	85200	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015602	TTTTG	2	10	99593	99602	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015602	GGTAA	2	10	125571	125580	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015602	TCGTG	2	10	126388	126397	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_015602	GGCAG	2	10	126787	126796	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015602	GAGAA	2	10	127047	127056	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015602	AAGGC	2	10	128445	128454	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_015602	TTGAA	2	10	128954	128963	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015602	CAAAG	2	10	129968	129977	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_015602	AGGAA	2	10	130140	130149	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015602	AAGAT	2	10	136527	136536	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015602	GGTAA	2	10	142714	142723	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015602	TCGTG	2	10	143531	143540	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_015602	GGCAG	2	10	143930	143939	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
35	NC_015602	GAGAA	2	10	144190	144199	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015602	AAGGC	2	10	145588	145597	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_015602	TTGAA	2	10	146097	146106	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015602	CAAAG	2	10	147111	147120	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_015602	AGGAA	2	10	147283	147292	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015602	TAATA	2	10	148472	148481	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015602	TAGAA	2	10	163467	163476	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015602	CGTTA	2	10	176787	176796	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_015602	GTACA	2	10	180765	180774	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_015602	GCACG	2	10	185797	185806	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_015602	AAGTT	2	10	192562	192571	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015602	AATAA	2	10	216215	216224	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015602	GCAAG	2	10	222087	222096	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_015602	ATAAA	2	10	223202	223211	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015602	TAAAA	2	10	224099	224108	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015602	TATAA	2	10	242434	242443	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015602	CAAAA	2	10	246203	246212	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_015602	CCGCG	2	10	247778	247787	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
53	NC_015602	TTTTA	2	10	248941	248950	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015602	TAAGT	2	10	261973	261982	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015602	ATTAG	2	10	288736	288745	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015602	AAAGT	2	10	291432	291441	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015602	GACCA	2	10	291529	291538	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_015602	TTTTG	2	10	296554	296563	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015602	TTAAT	2	10	297934	297943	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015602	AGAAA	2	10	306217	306226	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015602	AATAA	2	10	307361	307370	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015602	TTGAG	2	10	315163	315172	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015602	CTTTT	2	10	315264	315273	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_015602	TAAGT	2	10	315293	315302	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015602	AATTG	2	10	318577	318586	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015602	TTGGT	2	10	318750	318759	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015602	ATTTA	2	10	321661	321670	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015602	TTGCC	2	10	322039	322048	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_015602	TTTGA	2	10	322561	322570	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015602	ATTTT	2	10	335189	335198	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015602	TAAAT	2	10	335634	335643	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015602	GAAAA	2	10	338359	338368	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015602	AAAAC	2	10	339322	339331	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_015602	ATATT	2	10	341576	341585	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015602	AAGTT	2	10	345783	345792	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015602	TAATA	2	10	351256	351265	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015602	TGATT	2	10	353510	353519	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015602	GAAAA	2	10	353555	353564	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015602	TTTAC	2	10	356247	356256	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_015602	ATAGA	2	10	363510	363519	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015602	TTCCA	2	10	367875	367884	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_015602	AAAGC	2	10	367994	368003	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_015602	TTGGT	2	10	368188	368197	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015602	ATTTT	2	10	372524	372533	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015602	AACGC	2	10	373786	373795	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_015602	ACAAG	2	10	378215	378224	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_015602	ATTTT	2	10	378390	378399	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015602	TAAAT	2	10	381043	381052	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015602	ATTTG	2	10	381131	381140	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015602	AATTA	2	10	389850	389859	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015602	CTTCA	2	10	430903	430912	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_015602	GTTAA	2	10	431799	431808	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015602	GGGAT	2	10	441599	441608	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015602	TTATT	2	10	442173	442182	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015602	AAGAA	2	10	450745	450754	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015602	ATTTA	2	10	451224	451233	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015602	CAGAT	2	10	452617	452626	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_015602	GCTTT	2	10	455192	455201	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_015602	AGAGA	2	10	480680	480689	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015602	TCTTT	2	10	480707	480716	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_015602	TTCTG	2	10	495604	495613	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_015602	ATTTT	2	10	514974	514983	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015602	TAAAA	2	10	521709	521718	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015602	AAAAT	2	10	536071	536080	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015602	TAAAA	2	10	540627	540636	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015602	AGCTC	2	10	562541	562550	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_015602	TTATA	2	10	575199	575208	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015602	TAAAT	2	10	577466	577475	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015602	AACAA	2	10	577649	577658	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_015602	AATAA	2	10	577833	577842	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015602	ATAAA	2	10	582637	582646	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015602	TATTT	2	10	586732	586741	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015602	TTTTG	2	10	587790	587799	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015602	TTTTA	2	10	590419	590428	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015602	TCTAG	2	10	608811	608820	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_015602	CTAAT	2	10	609052	609061	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_015602	TAGAC	2	10	610017	610026	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_015602	TAAAG	2	10	610240	610249	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015602	TCTTT	2	10	611184	611193	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_015602	TTTTC	2	10	613147	613156	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_015602	TAAAT	2	10	616167	616176	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015602	TCTAT	2	10	621293	621302	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_015602	AGTGA	2	10	626903	626912	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015602	GAATT	2	10	627588	627597	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015602	ATTTT	2	10	627898	627907	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015602	CAAAA	2	10	655522	655531	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_015602	TATCT	2	10	660188	660197	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_015602	ACTGA	2	10	666288	666297	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_015602	ACTGT	2	10	666498	666507	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_015602	ATTGC	2	10	667005	667014	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_015602	TTCAT	2	10	667350	667359	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_015602	TTTAT	2	10	667610	667619	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015602	ATTTT	2	10	670066	670075	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015602	CTTTT	2	10	671629	671638	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_015602	ATTCA	2	10	671883	671892	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_015602	TGTTT	2	10	673840	673849	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015602	AAAGA	2	10	674204	674213	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015602	GTAAT	2	10	682953	682962	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015602	ATTCA	2	10	685300	685309	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_015602	TTTAG	2	10	689318	689327	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015602	TTTTA	2	10	695468	695477	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015602	TTGAT	2	10	695651	695660	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015602	TAAAT	2	10	697275	697284	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015602	ATTAA	3	15	709897	709911	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015602	CTTAT	2	10	710040	710049	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_015602	CAAAA	2	10	717005	717014	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_015602	TAAAA	2	10	722455	722464	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015602	AAATT	2	10	725755	725764	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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429	NC_015602	GAAAA	2	10	2034504	2034513	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
430	NC_015602	TATCT	2	10	2044991	2045000	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
431	NC_015602	CTTGA	2	10	2047493	2047502	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
432	NC_015602	CTTAA	2	10	2058449	2058458	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
433	NC_015602	TAAGC	2	10	2067513	2067522	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
434	NC_015602	TATAA	2	10	2068604	2068613	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_015602	TTATA	2	10	2070784	2070793	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
436	NC_015602	TTTTA	2	10	2070906	2070915	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
437	NC_015602	TTTTA	2	10	2080466	2080475	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
438	NC_015602	TTATA	2	10	2082455	2082464	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_015602	ACTTA	2	10	2086806	2086815	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.