MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus kefiranofaciens ZW3 chromosome

Total Repeats: 24629

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015602	GCT	2	6	146	151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053511
2	NC_015602	GTA	2	6	335	340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053511
3	NC_015602	GGT	2	6	609	614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336053512
4	NC_015602	TTG	2	6	679	684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053512
5	NC_015602	TAG	2	6	715	720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053512
6	NC_015602	AAG	2	6	860	865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053512
7	NC_015602	ACT	2	6	942	947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336053512
8	NC_015602	GGA	2	6	1035	1040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336053512
9	NC_015602	CGT	2	6	1079	1084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053513
10	NC_015602	GTG	2	6	1104	1109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336053513
11	NC_015602	GGT	2	6	1118	1123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336053513
12	NC_015602	AGC	2	6	1195	1200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336053513
13	NC_015602	GTA	2	6	1337	1342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053513
14	NC_015602	TGG	2	6	1369	1374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336053513
15	NC_015602	GAA	2	6	1382	1387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053513
16	NC_015602	TGA	2	6	1511	1516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053514
17	NC_015602	AGA	2	6	1544	1549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053514
18	NC_015602	CAA	2	6	1569	1574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336053514
19	NC_015602	TCG	2	6	1718	1723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053515
20	NC_015602	GTT	3	9	1776	1784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053515
21	NC_015602	ACC	2	6	1798	1803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336053515
22	NC_015602	ACA	2	6	1810	1815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336053515
23	NC_015602	TAC	2	6	1839	1844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336053515
24	NC_015602	TTA	2	6	2054	2059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053516
25	NC_015602	CGT	2	6	2200	2205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053516
26	NC_015602	CGA	2	6	2229	2234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336053516
27	NC_015602	AAG	2	6	2436	2441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053517
28	NC_015602	GTT	2	6	2480	2485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053517
29	NC_015602	AAG	2	6	2504	2509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053517
30	NC_015602	TGG	2	6	2539	2544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336053517
31	NC_015602	TTA	2	6	2589	2594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053517
32	NC_015602	AGG	2	6	2613	2618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336053517
33	NC_015602	AGT	2	6	2664	2669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053518
34	NC_015602	AAG	2	6	2842	2847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053518
35	NC_015602	GTG	2	6	2975	2980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336053518
36	NC_015602	ACT	2	6	3103	3108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336053518
37	NC_015602	TGA	2	6	3117	3122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053518
38	NC_015602	ACA	2	6	3560	3565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336053519
39	NC_015602	CTT	2	6	3722	3727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336053519
40	NC_015602	TTA	2	6	3734	3739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053519
41	NC_015602	AAG	2	6	3746	3751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053519
42	NC_015602	GGC	2	6	3769	3774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336053519
43	NC_015602	CAA	2	6	3885	3890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336053520
44	NC_015602	CAA	2	6	4116	4121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336053520
45	NC_015602	TGA	2	6	4311	4316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053520
46	NC_015602	CTG	2	6	4453	4458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053521
47	NC_015602	AGA	2	6	4571	4576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053521
48	NC_015602	CTG	2	6	4600	4605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053521
49	NC_015602	TGT	2	6	4652	4657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053521
50	NC_015602	ATT	2	6	4658	4663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053521
51	NC_015602	TGC	2	6	4712	4717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053521
52	NC_015602	TAA	2	6	4782	4787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336053522
53	NC_015602	GTT	2	6	4846	4851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053522
54	NC_015602	TGC	2	6	4875	4880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053522
55	NC_015602	TTG	4	12	4883	4894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053522
56	NC_015602	AAG	2	6	4937	4942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053522
57	NC_015602	AGA	2	6	4968	4973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053522
58	NC_015602	AAG	2	6	4978	4983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053522
59	NC_015602	TAC	2	6	5010	5015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336053522
60	NC_015602	TGC	2	6	5091	5096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053522
61	NC_015602	TGG	2	6	5097	5102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336053522
62	NC_015602	GTT	2	6	5182	5187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053522
63	NC_015602	GAA	2	6	5208	5213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053522
64	NC_015602	GAA	2	6	5227	5232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053522
65	NC_015602	TGC	2	6	5314	5319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053523
66	NC_015602	TGT	2	6	5383	5388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053523
67	NC_015602	GCT	2	6	5402	5407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053523
68	NC_015602	GTG	2	6	5412	5417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336053523
69	NC_015602	ATT	2	6	5419	5424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053523
70	NC_015602	CTG	2	6	5513	5518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053524
71	NC_015602	GGT	2	6	5644	5649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336053524
72	NC_015602	ATT	2	6	5658	5663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053524
73	NC_015602	TAA	2	6	5865	5870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336053524
74	NC_015602	GCT	2	6	5881	5886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053524
75	NC_015602	GAA	2	6	5945	5950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053525
76	NC_015602	TGG	3	9	6110	6118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336053525
77	NC_015602	GAC	2	6	6244	6249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336053525
78	NC_015602	GTT	2	6	6285	6290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053525
79	NC_015602	TAT	2	6	6389	6394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053525
80	NC_015602	TGT	2	6	6412	6417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053525
81	NC_015602	TGA	2	6	6431	6436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053525
82	NC_015602	ATT	2	6	6474	6479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053525
83	NC_015602	ATT	2	6	6489	6494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053525
84	NC_015602	ATT	2	6	6537	6542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053525
85	NC_015602	AAT	2	6	6543	6548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336053525
86	NC_015602	TTC	2	6	6579	6584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336053525
87	NC_015602	TCG	2	6	6647	6652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053525
88	NC_015602	AGA	2	6	6672	6677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053525
89	NC_015602	CGA	2	6	6679	6684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336053525
90	NC_015602	CAA	2	6	6775	6780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336053525
91	NC_015602	ACT	2	6	6855	6860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336053525
92	NC_015602	TTA	2	6	6868	6873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053525
93	NC_015602	TCT	2	6	6904	6909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336053525
94	NC_015602	TTA	2	6	7071	7076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053525
95	NC_015602	GTT	2	6	7155	7160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053525
96	NC_015602	TCA	2	6	7216	7221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336053525
97	NC_015602	TCG	2	6	7298	7303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053526
98	NC_015602	TAA	2	6	7359	7364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336053526
99	NC_015602	GAA	2	6	7444	7449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053526
100	NC_015602	AAG	2	6	7472	7477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053526
101	NC_015602	AAG	2	6	7549	7554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053526
102	NC_015602	TGA	2	6	7584	7589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053526
103	NC_015602	ACA	2	6	7649	7654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336053526
104	NC_015602	GAT	2	6	7726	7731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053526
105	NC_015602	AGT	2	6	7740	7745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053526
106	NC_015602	TAA	2	6	7881	7886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336053526
107	NC_015602	GAT	2	6	7975	7980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053527
108	NC_015602	GTA	2	6	8002	8007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053527
109	NC_015602	CTA	2	6	8054	8059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336053527
110	NC_015602	TTG	3	9	8390	8398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053528
111	NC_015602	AAG	2	6	8437	8442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053528
112	NC_015602	AGA	2	6	8466	8471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053528
113	NC_015602	CGT	2	6	8554	8559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053528
114	NC_015602	CCG	2	6	8619	8624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336053528
115	NC_015602	AAT	2	6	8656	8661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336053528
116	NC_015602	CGT	2	6	8749	8754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053529
117	NC_015602	GAA	2	6	8757	8762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053529
118	NC_015602	TAA	2	6	8802	8807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336053529
119	NC_015602	ACC	2	6	9087	9092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336053529
120	NC_015602	CGT	3	9	9097	9105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053529
121	NC_015602	GTT	2	6	9187	9192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053530
122	NC_015602	AAG	2	6	9197	9202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053530
123	NC_015602	TGT	2	6	9219	9224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053530
124	NC_015602	TAC	2	6	9249	9254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336053530
125	NC_015602	AGA	2	6	9366	9371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053530
126	NC_015602	ATT	2	6	9382	9387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053530
127	NC_015602	CTG	2	6	9473	9478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053530
128	NC_015602	TGA	2	6	9618	9623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053530
129	NC_015602	AAG	2	6	9670	9675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053530
130	NC_015602	TGC	2	6	9786	9791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053530
131	NC_015602	TGG	2	6	9860	9865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336053530
132	NC_015602	AAG	2	6	9889	9894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053530
133	NC_015602	ATG	2	6	10003	10008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053530
134	NC_015602	GAA	2	6	10039	10044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053530
135	NC_015602	AAG	2	6	10085	10090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053530
136	NC_015602	ACT	2	6	10181	10186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336053531
137	NC_015602	ACT	2	6	10214	10219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336053531
138	NC_015602	AAG	2	6	10233	10238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053531
139	NC_015602	CTG	2	6	10248	10253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053531
140	NC_015602	GAT	2	6	10258	10263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053531
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143	NC_015602	GCA	2	6	10307	10312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336053531
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145	NC_015602	TGT	3	9	10357	10365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053531
146	NC_015602	TGG	2	6	10423	10428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336053531
147	NC_015602	TGC	2	6	10471	10476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053531
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151	NC_015602	TTA	2	6	11184	11189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053532
152	NC_015602	ATT	2	6	11246	11251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053532
153	NC_015602	ATT	2	6	11282	11287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053532
154	NC_015602	GAA	2	6	11306	11311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053532
155	NC_015602	ATG	2	6	11343	11348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053532
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162	NC_015602	AAG	2	6	11881	11886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053533
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165	NC_015602	TAT	2	6	12014	12019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053533
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169	NC_015602	ATA	2	6	12125	12130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336053533
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240	NC_015602	TGG	2	6	17772	17777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336053542
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243	NC_015602	CAG	2	6	18092	18097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336053543
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246	NC_015602	TGG	2	6	18373	18378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336053543
247	NC_015602	CTT	2	6	18466	18471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336053543
248	NC_015602	TGA	2	6	18732	18737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053544
249	NC_015602	TCT	2	6	18798	18803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336053544
250	NC_015602	TAA	2	6	18829	18834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336053544
251	NC_015602	GCA	2	6	18857	18862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336053544
252	NC_015602	GAT	2	6	18878	18883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053544
253	NC_015602	GCT	2	6	18929	18934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053544
254	NC_015602	TGA	2	6	18979	18984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053544
255	NC_015602	GTT	2	6	19042	19047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053544
256	NC_015602	TTA	2	6	19065	19070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053544
257	NC_015602	TAA	2	6	19129	19134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336053544
258	NC_015602	TTG	2	6	19182	19187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053544
259	NC_015602	TGT	2	6	19328	19333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053545
260	NC_015602	GGT	2	6	19356	19361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336053545
261	NC_015602	TAG	2	6	19454	19459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053545
262	NC_015602	AAG	2	6	19460	19465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053545
263	NC_015602	GCT	2	6	19512	19517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053545
264	NC_015602	ATT	2	6	19629	19634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053545
265	NC_015602	GTA	2	6	19749	19754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053545
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267	NC_015602	GTC	2	6	19938	19943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053545
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271	NC_015602	CAG	2	6	20208	20213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336053546
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274	NC_015602	TAT	2	6	20314	20319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053546
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278	NC_015602	TAT	2	6	20604	20609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053547
279	NC_015602	GGC	2	6	20631	20636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336053547
280	NC_015602	GGC	2	6	20721	20726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336053547
281	NC_015602	ATT	2	6	20765	20770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053547
282	NC_015602	TAG	2	6	20872	20877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053547
283	NC_015602	GAT	2	6	21017	21022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053547
284	NC_015602	ATT	2	6	21032	21037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053547
285	NC_015602	ATT	2	6	21174	21179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053548
286	NC_015602	TTA	2	6	21181	21186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053548
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290	NC_015602	TGG	2	6	21365	21370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336053548
291	NC_015602	TTG	2	6	21377	21382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053548
292	NC_015602	TGT	2	6	21492	21497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053548
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376	NC_015602	TAA	2	6	28715	28720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336053553
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378	NC_015602	AAT	2	6	28792	28797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336053553
379	NC_015602	ACG	2	6	28803	28808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336053553
380	NC_015602	AAC	2	6	28875	28880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336053553
381	NC_015602	TGA	2	6	28901	28906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053553
382	NC_015602	GAC	2	6	28952	28957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336053553
383	NC_015602	ATC	2	6	29010	29015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336053553
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393	NC_015602	TTG	2	6	29800	29805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053553
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403	NC_015602	GAT	2	6	30727	30732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053555
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407	NC_015602	GAA	2	6	30994	30999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053556
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500	NC_015602	TGG	2	6	39088	39093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336053563

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