MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Erysipelothrix rhusiopathiae str. Fujisawa chromosome

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015601	AAAGGA	2	12	20308	20319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015601	AACTAA	2	12	69953	69964	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015601	ATCATT	2	12	76546	76557	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015601	AAGCGA	2	12	81206	81217	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015601	AAGCGA	2	12	86638	86649	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_015601	TTCGAA	2	12	100055	100066	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_015601	ATAAAA	2	12	152140	152151	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015601	TTTTAA	2	12	152190	152201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015601	TGCTTT	2	12	226036	226047	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015601	TTTTAT	2	12	257829	257840	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015601	TATGAT	2	12	264319	264330	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015601	ATCCAA	2	12	330213	330224	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015601	CACAAA	2	12	337623	337634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015601	ATAAAT	2	12	360083	360094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015601	ATTGAA	2	12	378114	378125	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015601	TTCTTT	2	12	435883	435894	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_015601	AAGCGA	2	12	448885	448896	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015601	TCTTTT	2	12	489320	489331	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_015601	ATTTAA	2	12	555467	555478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015601	TATCAA	2	12	662462	662473	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015601	ATTGTG	2	12	679040	679051	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015601	GTTTTT	2	12	710190	710201	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015601	TTTAAG	2	12	723087	723098	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015601	ATTTAA	2	12	735354	735365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015601	TTTCAA	2	12	746978	746989	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_015601	TTATGT	2	12	747728	747739	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015601	GCGAAA	3	18	780065	780082	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_015601	AATGAA	2	12	789378	789389	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015601	AAAAGA	2	12	817773	817784	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015601	AATGTA	2	12	845685	845696	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015601	GATTAA	2	12	850658	850669	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015601	TTTAAA	2	12	855847	855858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015601	ACTTTA	2	12	875352	875363	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_015601	AGTAAA	2	12	886637	886648	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015601	TTAATA	2	12	974682	974693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015601	TTTATT	2	12	1008973	1008984	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015601	TACTAA	2	12	1018532	1018543	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015601	ACTTTA	2	12	1062397	1062408	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_015601	TCGCTT	2	12	1120094	1120105	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015601	TCTTTT	2	12	1120952	1120963	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015601	TCGCTT	2	12	1125526	1125537	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015601	TCTTTT	2	12	1126384	1126395	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_015601	TCGCTT	2	12	1130958	1130969	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015601	TCTTTT	2	12	1131816	1131827	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_015601	TCGCTT	2	12	1136390	1136401	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015601	TCTTTT	2	12	1137248	1137259	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_015601	GGCCTT	2	12	1162052	1162063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015601	TAAAAA	2	12	1206492	1206503	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015601	TTGAAG	2	12	1215954	1215965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015601	AAACAC	2	12	1276016	1276027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015601	GTTTTT	2	12	1333721	1333732	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015601	AAAAAG	2	12	1361005	1361016	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015601	ACAAAT	2	12	1398828	1398839	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_015601	CTTTTT	2	12	1495708	1495719	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_015601	ATCTTA	2	12	1500471	1500482	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015601	ATCGTT	2	12	1519683	1519694	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_015601	TAAACT	2	12	1537529	1537540	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_015601	TTTATT	2	12	1545469	1545480	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015601	TTCATC	2	12	1548151	1548162	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015601	TTTGAG	2	12	1570466	1570477	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015601	TTTAAT	2	12	1580109	1580120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015601	TAAAAA	2	12	1585081	1585092	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015601	TCATTT	2	12	1597416	1597427	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_015601	ATCACA	2	12	1615200	1615211	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015601	TATTTT	2	12	1697152	1697163	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015601	AAGATT	2	12	1703908	1703919	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015601	CTATCT	2	12	1718617	1718628	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015601	TTGATA	2	12	1726389	1726400	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015601	CATTAA	2	12	1728362	1728373	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.