MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Erysipelothrix rhusiopathiae str. Fujisawa chromosome

Total Repeats: 683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015601	AAAAAT	2	12	7209	7220	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	336065249
2	NC_015601	GTGATT	2	12	7450	7461	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	336065249
3	NC_015601	CCGATG	2	12	9312	9323	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336065250
4	NC_015601	AAATTG	2	12	10812	10823	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	336065251
5	NC_015601	TGATAT	2	12	11209	11220	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	336065251
6	NC_015601	AGAAAT	2	12	12217	12228	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	336065251
7	NC_015601	TGTTGA	2	12	13547	13558	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	336065252
8	NC_015601	ATCTAC	2	12	14190	14201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065253
9	NC_015601	AACAAG	2	12	15432	15443	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	336065254
10	NC_015601	AAGTGT	2	12	15858	15869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065255
11	NC_015601	CATCAA	2	12	19979	19990	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	336065259
12	NC_015601	ACAATA	2	12	21729	21740	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	336065261
13	NC_015601	ATTTAA	2	12	22545	22556	50 %	50 %	0 %	0 %	336065262
14	NC_015601	CGTGAT	2	12	23797	23808	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	336065262
15	NC_015601	GTTTTA	2	12	25060	25071	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	336065263
16	NC_015601	TCCCGT	2	12	27471	27482	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	336065264
17	NC_015601	TGATTT	2	12	32096	32107	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	336065268
18	NC_015601	GAATAT	2	12	32294	32305	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	336065268
19	NC_015601	CATCCA	2	12	33696	33707	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	336065269
20	NC_015601	CGGATA	2	12	38021	38032	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336065274
21	NC_015601	TGGATA	2	12	38252	38263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065274
22	NC_015601	ACCTAA	2	12	43474	43485	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	336065280
23	NC_015601	TAAAGA	2	12	46668	46679	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	336065285
24	NC_015601	AACTTA	2	12	50462	50473	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	336065289
25	NC_015601	CGACCA	2	12	51385	51396	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	336065290
26	NC_015601	ATCAGC	2	12	58999	59010	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	336065298
27	NC_015601	ATTCCC	2	12	59132	59143	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	336065298
28	NC_015601	TAAGCG	2	12	59440	59451	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336065298
29	NC_015601	AAATCA	2	12	61357	61368	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	336065300
30	NC_015601	CAAATT	2	12	68255	68266	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	336065306
31	NC_015601	CGATGC	2	12	75647	75658	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336065315
32	NC_015601	GAAAGC	2	12	75993	76004	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	336065315
33	NC_015601	GCAATT	2	12	76675	76686	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	336065316
34	NC_015601	TCGAAA	2	12	93584	93595	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	336065317
35	NC_015601	TATTTA	2	12	98837	98848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065322
36	NC_015601	ATCTAT	2	12	99427	99438	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	336065322
37	NC_015601	TTAATG	2	12	101171	101182	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	336065324
38	NC_015601	AATCGT	2	12	104133	104144	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	336065328
39	NC_015601	TGAACG	2	12	105279	105290	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336065329
40	NC_015601	TGATTT	3	18	108264	108281	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	336065331
41	NC_015601	GTTTTA	2	12	108409	108420	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	336065331
42	NC_015601	ATTGCA	2	12	111031	111042	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	336065335
43	NC_015601	CATAAA	2	12	111577	111588	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	336065335
44	NC_015601	GAAAAA	2	12	112933	112944	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	336065336
45	NC_015601	TAAAGA	2	12	120581	120592	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	336065341
46	NC_015601	AGCATT	2	12	120638	120649	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	336065341
47	NC_015601	GATTGC	2	12	128812	128823	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	336065348
48	NC_015601	TTTGGA	2	12	133030	133041	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	336065353
49	NC_015601	ATCTTT	2	12	134280	134291	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	336065354
50	NC_015601	CTTGAA	2	12	136093	136104	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	336065355
51	NC_015601	TGAACT	2	12	142983	142994	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	336065360
52	NC_015601	AAGGCG	2	12	144400	144411	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	336065361
53	NC_015601	TTGATG	2	12	146422	146433	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	336065364
54	NC_015601	CCAAAT	2	12	148044	148055	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	336065366
55	NC_015601	GAGTAC	2	12	151114	151125	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336065371
56	NC_015601	ACCAAC	2	12	154687	154698	50 %	0 %	0 %	50 %	336065375
57	NC_015601	TCTAAA	2	12	156004	156015	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	336065376
58	NC_015601	CAGTTG	2	12	163531	163542	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	336065384
59	NC_015601	CATATT	2	12	166206	166217	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	336065386
60	NC_015601	GCACTT	2	12	168434	168445	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	336065386
61	NC_015601	AAGCAG	2	12	170027	170038	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	336065387
62	NC_015601	GGTTGC	2	12	171564	171575	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	336065387
63	NC_015601	CGTTAT	2	12	174701	174712	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	336065390
64	NC_015601	ATTATG	2	12	175214	175225	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	336065391
65	NC_015601	AAGATG	2	12	175357	175368	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	336065391
66	NC_015601	TCAAGG	2	12	179851	179862	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336065393
67	NC_015601	ACAGAA	2	12	179889	179900	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	336065393
68	NC_015601	GCAAGC	2	12	180221	180232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336065393
69	NC_015601	GAAATT	2	12	185468	185479	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	336065398
70	NC_015601	TCTCAT	2	12	186335	186346	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	336065399
71	NC_015601	ACTTTC	2	12	186924	186935	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	336065399
72	NC_015601	GATTGT	2	12	187997	188008	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	336065401
73	NC_015601	ATTAAA	2	12	188758	188769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065402
74	NC_015601	ATGCGG	2	12	190270	190281	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	336065403
75	NC_015601	AAATGG	2	12	190301	190312	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	336065403
76	NC_015601	TAAAGA	2	12	198305	198316	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	336065407
77	NC_015601	GATGGT	2	12	198411	198422	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	336065407
78	NC_015601	GAACCA	2	12	201134	201145	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	336065408
79	NC_015601	TTTAAG	2	12	202580	202591	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	336065411
80	NC_015601	CCAATT	2	12	213197	213208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065423
81	NC_015601	TTACAA	2	12	222153	222164	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	336065435
82	NC_015601	CGATTG	2	12	224450	224461	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	336065437
83	NC_015601	TAAAAT	2	12	224781	224792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065437
84	NC_015601	TCAAGA	2	12	229204	229215	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	336065441
85	NC_015601	ATGGTA	2	12	233717	233728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065443
86	NC_015601	TAATTT	2	12	237745	237756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065446
87	NC_015601	TTTTGA	2	12	239116	239127	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	336065448
88	NC_015601	TTTCTG	2	12	240710	240721	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	336065449
89	NC_015601	TTATGG	2	12	242914	242925	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	336065451
90	NC_015601	TTTTCT	2	12	244320	244331	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	336065453
91	NC_015601	AATCAC	2	12	244797	244808	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	336065454
92	NC_015601	GTGGAT	2	12	244984	244995	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	336065454
93	NC_015601	TTGAGA	2	12	245858	245869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065454
94	NC_015601	ACCTAA	2	12	246282	246293	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	336065455
95	NC_015601	GATTAA	2	12	246714	246725	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	336065457
96	NC_015601	TGAATT	2	12	247148	247159	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	336065457
97	NC_015601	TTGCGA	2	12	249056	249067	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	336065458
98	NC_015601	GAAATC	2	12	252212	252223	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	336065461
99	NC_015601	GTTGAA	2	12	256030	256041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065463
100	NC_015601	AAAAAT	2	12	261242	261253	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	336065468
101	NC_015601	GTTAAA	2	12	263008	263019	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	336065470
102	NC_015601	CTTTAA	2	12	264057	264068	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	336065470
103	NC_015601	AAAACT	2	12	281837	281848	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	336065484
104	NC_015601	TGTGGA	2	12	282710	282721	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	336065484
105	NC_015601	ATCCAA	2	12	286813	286824	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	336065490
106	NC_015601	TTAGGT	2	12	287314	287325	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	336065490
107	NC_015601	TATTTT	2	12	294854	294865	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	336065500
108	NC_015601	CGGAAC	2	12	295465	295476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336065500
109	NC_015601	GATGTG	2	12	299384	299395	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	336065502
110	NC_015601	ATTAAA	2	12	299654	299665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065502
111	NC_015601	TGAAGT	2	12	299902	299913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065502
112	NC_015601	AAACCA	2	12	300599	300610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336065502
113	NC_015601	ATTTGT	2	12	302247	302258	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	336065504
114	NC_015601	GTTGAA	2	12	302601	302612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065504
115	NC_015601	GTTGAA	2	12	302703	302714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065504
116	NC_015601	AAATTC	2	12	306163	306174	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	336065512
117	NC_015601	ATGAAG	2	12	312021	312032	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	336065519
118	NC_015601	GCCATC	2	12	319983	319994	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	336065528
119	NC_015601	AAACAT	2	12	320606	320617	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	336065529
120	NC_015601	CAAAAC	2	12	323766	323777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336065533
121	NC_015601	TGGATG	2	12	324273	324284	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	336065533
122	NC_015601	CTTGAT	2	12	327527	327538	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	336065537
123	NC_015601	ATTGGG	2	12	328720	328731	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	336065539
124	NC_015601	ACTTGA	2	12	329025	329036	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	336065539
125	NC_015601	ACGTTA	2	12	332979	332990	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	336065540
126	NC_015601	AGACTT	2	12	333053	333064	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	336065540
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129	NC_015601	TAAGGG	2	12	336230	336241	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	336065541
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146	NC_015601	TTAAAT	2	12	418629	418640	50 %	50 %	0 %	0 %	336065629
147	NC_015601	CGATCT	2	12	419568	419579	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	336065631
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227	NC_015601	TGGTTG	2	12	596465	596476	0 %	50 %	50 %	0 %	336065794
228	NC_015601	CTTGAT	2	12	597266	597277	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	336065795
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231	NC_015601	TACACT	2	12	605148	605159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065801
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233	NC_015601	TTAGGA	2	12	606817	606828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065801
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345	NC_015601	AGTACA	2	12	920815	920826	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	336066103
346	NC_015601	GCACTT	2	12	921998	922009	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	336066103
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450	NC_015601	CTTTTG	2	12	1167592	1167603	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	336066323
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454	NC_015601	AGAATA	2	12	1170295	1170306	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	336066326
455	NC_015601	TACGTT	2	12	1178067	1178078	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	336066331
456	NC_015601	CTTCAA	2	12	1178394	1178405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336066331
457	NC_015601	CTTTAA	2	12	1178803	1178814	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	336066332
458	NC_015601	AAACTC	2	12	1180150	1180161	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	336066333
459	NC_015601	TGCATC	2	12	1182961	1182972	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	336066337
460	NC_015601	CGATAA	2	12	1185345	1185356	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	336066338
461	NC_015601	CGTTAA	2	12	1190149	1190160	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	336066343
462	NC_015601	TGATGG	2	12	1190662	1190673	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	336066343
463	NC_015601	ACAATC	2	12	1193438	1193449	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	336066347
464	NC_015601	CGCAAC	2	12	1193827	1193838	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	336066347
465	NC_015601	TTTCGT	2	12	1198566	1198577	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	336066352
466	NC_015601	AAAGAA	2	12	1199283	1199294	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	336066353
467	NC_015601	GCATTC	2	12	1201857	1201868	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	336066355
468	NC_015601	TTTTTC	3	18	1205052	1205069	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	336066359
469	NC_015601	TTTCTC	2	12	1205079	1205090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336066359
470	NC_015601	GTTCAA	2	12	1207810	1207821	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	336066362
471	NC_015601	GTTTTT	2	12	1209021	1209032	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	336066363
472	NC_015601	TTAACA	2	12	1216909	1216920	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	336066369
473	NC_015601	GTTTTT	2	12	1217106	1217117	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	336066369
474	NC_015601	GAATAA	2	12	1228610	1228621	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	336066383
475	NC_015601	CTTTTG	2	12	1231275	1231286	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	336066386
476	NC_015601	TACGTG	2	12	1231358	1231369	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	336066387
477	NC_015601	CAACTA	2	12	1235620	1235631	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	336066393
478	NC_015601	GATTTC	2	12	1236547	1236558	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	336066395
479	NC_015601	AATTGT	2	12	1236913	1236924	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	336066396
480	NC_015601	ACGAAT	2	12	1243789	1243800	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	336066411
481	NC_015601	CCTGTA	2	12	1246941	1246952	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	336066414
482	NC_015601	ACGTTT	2	12	1247051	1247062	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	336066414
483	NC_015601	ACGTGA	2	12	1248260	1248271	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336066415
484	NC_015601	CTTGTT	2	12	1259662	1259673	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	336066425
485	NC_015601	GTTCTT	2	12	1261597	1261608	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	336066427
486	NC_015601	TTTTCA	2	12	1272755	1272766	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	336066436
487	NC_015601	CAAAAT	2	12	1277961	1277972	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	336066439
488	NC_015601	CTTACA	2	12	1278325	1278336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336066439
489	NC_015601	GTTGAT	2	12	1278462	1278473	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	336066439
490	NC_015601	CTGAAG	2	12	1282996	1283007	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336066445
491	NC_015601	TTGAAA	2	12	1290001	1290012	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	336066450
492	NC_015601	AATATC	2	12	1299153	1299164	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	336066459
493	NC_015601	ATGTTG	2	12	1301033	1301044	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	336066461
494	NC_015601	CTTTAA	2	12	1301166	1301177	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	336066461
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497	NC_015601	TCCATC	2	12	1309127	1309138	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	336066468
498	NC_015601	CCATAC	2	12	1310106	1310117	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	336066471
499	NC_015601	ATTTAA	2	12	1310859	1310870	50 %	50 %	0 %	0 %	336066471
500	NC_015601	GATTTG	2	12	1311864	1311875	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	336066472

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