MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Erysipelothrix rhusiopathiae str. Fujisawa chromosome

Total Repeats: 22619

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015601	AGA	2	6	15	20	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065243
2	NC_015601	TGC	2	6	108	113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336065243
3	NC_015601	ACG	2	6	194	199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336065243
4	NC_015601	TTA	2	6	200	205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065243
5	NC_015601	GTC	2	6	307	312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336065243
6	NC_015601	ATG	2	6	320	325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065243
7	NC_015601	TGT	2	6	357	362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065243
8	NC_015601	GCA	2	6	391	396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336065243
9	NC_015601	GAT	2	6	637	642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065243
10	NC_015601	TTC	2	6	682	687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336065243
11	NC_015601	TAA	2	6	779	784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065243
12	NC_015601	TGA	2	6	894	899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065243
13	NC_015601	CTT	2	6	975	980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336065243
14	NC_015601	ACT	2	6	1106	1111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065243
15	NC_015601	TAA	2	6	1218	1223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065243
16	NC_015601	GCA	2	6	1674	1679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336065244
17	NC_015601	AAG	2	6	1777	1782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065244
18	NC_015601	GAA	2	6	1821	1826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065244
19	NC_015601	AGT	2	6	1832	1837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065244
20	NC_015601	ATT	2	6	1902	1907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065244
21	NC_015601	GTA	2	6	1960	1965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065244
22	NC_015601	CAA	2	6	1981	1986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336065244
23	NC_015601	CAA	2	6	2049	2054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336065244
24	NC_015601	ATT	2	6	2342	2347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065244
25	NC_015601	GAA	2	6	2532	2537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065244
26	NC_015601	TGG	2	6	2561	2566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336065244
27	NC_015601	AGA	2	6	2684	2689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065244
28	NC_015601	TCG	2	6	2848	2853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336065245
29	NC_015601	TGG	2	6	2899	2904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336065245
30	NC_015601	ACG	2	6	2961	2966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336065245
31	NC_015601	CAT	2	6	3006	3011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065245
32	NC_015601	TGT	2	6	3028	3033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065245
33	NC_015601	GAT	2	6	3064	3069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065245
34	NC_015601	CAT	2	6	3116	3121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065245
35	NC_015601	GGT	2	6	3164	3169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336065245
36	NC_015601	TGC	2	6	3190	3195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336065245
37	NC_015601	CAA	2	6	3321	3326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336065245
38	NC_015601	ATC	2	6	3337	3342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065245
39	NC_015601	TAA	2	6	3376	3381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065245
40	NC_015601	CAT	2	6	3402	3407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065245
41	NC_015601	ATG	2	6	3411	3416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065245
42	NC_015601	TTA	2	6	3423	3428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065245
43	NC_015601	ATA	2	6	3453	3458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065245
44	NC_015601	GAA	3	9	3677	3685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065246
45	NC_015601	TGG	2	6	3697	3702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336065246
46	NC_015601	CAA	2	6	3730	3735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336065246
47	NC_015601	CGG	2	6	3769	3774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336065246
48	NC_015601	GAA	2	6	3797	3802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065246
49	NC_015601	TTG	2	6	3822	3827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065246
50	NC_015601	ATC	2	6	4113	4118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065246
51	NC_015601	TAA	2	6	4125	4130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065246
52	NC_015601	ATT	2	6	4195	4200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065246
53	NC_015601	ATT	2	6	4241	4246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065246
54	NC_015601	TGA	2	6	4282	4287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065246
55	NC_015601	GCA	2	6	4358	4363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336065246
56	NC_015601	ATT	2	6	4386	4391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065246
57	NC_015601	TGC	2	6	4420	4425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336065246
58	NC_015601	ATC	2	6	4449	4454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065246
59	NC_015601	AAT	2	6	4492	4497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065246
60	NC_015601	CAT	2	6	4576	4581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065247
61	NC_015601	GTT	2	6	4752	4757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065247
62	NC_015601	GAT	2	6	4854	4859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065247
63	NC_015601	TGA	2	6	4894	4899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065247
64	NC_015601	AAG	2	6	4912	4917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065247
65	NC_015601	ATG	2	6	4939	4944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065247
66	NC_015601	ATC	2	6	5123	5128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065247
67	NC_015601	TTG	2	6	5182	5187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065247
68	NC_015601	TCT	2	6	5319	5324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336065247
69	NC_015601	TTC	2	6	5330	5335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336065247
70	NC_015601	TGT	2	6	5405	5410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065247
71	NC_015601	TGG	3	9	5411	5419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336065247
72	NC_015601	TTG	2	6	5605	5610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065247
73	NC_015601	GGT	2	6	5625	5630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336065247
74	NC_015601	AGG	2	6	5642	5647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336065247
75	NC_015601	TGG	2	6	5672	5677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336065247
76	NC_015601	TAA	2	6	5809	5814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065247
77	NC_015601	CTT	2	6	5852	5857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336065247
78	NC_015601	TTG	2	6	5886	5891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065247
79	NC_015601	ATG	2	6	5910	5915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065247
80	NC_015601	GGT	2	6	5928	5933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336065247
81	NC_015601	TAA	2	6	5939	5944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065247
82	NC_015601	GCT	2	6	5946	5951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336065247
83	NC_015601	GCT	2	6	5976	5981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336065247
84	NC_015601	CAG	3	9	5983	5991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336065247
85	NC_015601	GCA	2	6	6024	6029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336065247
86	NC_015601	TCC	2	6	6038	6043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336065247
87	NC_015601	TTG	2	6	6055	6060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065247
88	NC_015601	ATT	3	9	6065	6073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065247
89	NC_015601	CTT	2	6	6133	6138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336065247
90	NC_015601	TGT	2	6	6200	6205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065247
91	NC_015601	CAC	2	6	6259	6264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336065247
92	NC_015601	TTC	2	6	6283	6288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336065247
93	NC_015601	ATT	2	6	6324	6329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065247
94	NC_015601	TGT	2	6	6335	6340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065247
95	NC_015601	GTT	2	6	6377	6382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065247
96	NC_015601	GTG	2	6	6582	6587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336065248
97	NC_015601	GAA	2	6	6632	6637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065248
98	NC_015601	TGT	3	9	6673	6681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065248
99	NC_015601	TAA	2	6	6691	6696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065248
100	NC_015601	TAA	2	6	6779	6784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065249
101	NC_015601	AAT	2	6	6948	6953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065249
102	NC_015601	AGT	2	6	6968	6973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065249
103	NC_015601	AGT	2	6	6978	6983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065249
104	NC_015601	CAA	2	6	7008	7013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336065249
105	NC_015601	TGT	2	6	7052	7057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065249
106	NC_015601	ATT	2	6	7278	7283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065249
107	NC_015601	TAT	2	6	7332	7337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065249
108	NC_015601	TCT	2	6	7340	7345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336065249
109	NC_015601	ATT	2	6	7418	7423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065249
110	NC_015601	GAT	2	6	7491	7496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065249
111	NC_015601	TGT	2	6	7523	7528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065249
112	NC_015601	ATC	2	6	7535	7540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065249
113	NC_015601	GAT	2	6	7635	7640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065249
114	NC_015601	GAA	2	6	7695	7700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065249
115	NC_015601	ACT	2	6	7716	7721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065249
116	NC_015601	AGG	2	6	7789	7794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336065249
117	NC_015601	TAC	2	6	7900	7905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065250
118	NC_015601	CAT	2	6	7922	7927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065250
119	NC_015601	TGA	2	6	7957	7962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065250
120	NC_015601	ATT	2	6	7988	7993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065250
121	NC_015601	GGT	2	6	8126	8131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336065250
122	NC_015601	GGT	2	6	8150	8155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336065250
123	NC_015601	TGT	2	6	8176	8181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065250
124	NC_015601	TAC	2	6	8234	8239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065250
125	NC_015601	AAG	2	6	8280	8285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065250
126	NC_015601	TAA	2	6	8518	8523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065250
127	NC_015601	GAA	2	6	8537	8542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065250
128	NC_015601	GAA	3	9	8561	8569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065250
129	NC_015601	TTG	2	6	8577	8582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065250
130	NC_015601	ATG	2	6	8601	8606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065250
131	NC_015601	TAA	2	6	8635	8640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065250
132	NC_015601	GAT	2	6	8741	8746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065250
133	NC_015601	GAT	2	6	8762	8767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065250
134	NC_015601	ATT	2	6	8789	8794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065250
135	NC_015601	ATC	2	6	8933	8938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065250
136	NC_015601	CGT	2	6	9002	9007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336065250
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138	NC_015601	TCG	2	6	9090	9095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336065250
139	NC_015601	CTG	2	6	9105	9110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336065250
140	NC_015601	TTA	2	6	9174	9179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065250
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143	NC_015601	TTA	3	9	9347	9355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065250
144	NC_015601	TTC	2	6	9359	9364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336065250
145	NC_015601	GAA	2	6	9467	9472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065250
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152	NC_015601	GAA	2	6	9782	9787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065251
153	NC_015601	CCG	2	6	9874	9879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336065251
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162	NC_015601	ATT	3	9	10514	10522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065251
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164	NC_015601	TAG	2	6	10557	10562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065251
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255	NC_015601	ATG	2	6	17290	17295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065256
256	NC_015601	ATG	2	6	17326	17331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065256
257	NC_015601	ATT	2	6	17472	17477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065256
258	NC_015601	TAA	2	6	17562	17567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065256
259	NC_015601	AAG	2	6	17683	17688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065256
260	NC_015601	GAA	2	6	17719	17724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065256
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