MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus kefiranofaciens ZW3 plasmid pWW1

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015598	ATAAAG	2	12	952	963	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	336053280
2	NC_015598	CTGATC	2	12	2039	2050	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	336053280
3	NC_015598	GCAAAA	2	12	3652	3663	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	336053282
4	NC_015598	GTAGAT	2	12	3805	3816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053282
5	NC_015598	ATGAAT	2	12	9421	9432	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	336053288
6	NC_015598	ATTTTT	2	12	11053	11064	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	336053289
7	NC_015598	AGCTAA	2	12	11500	11511	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	336053289
8	NC_015598	CTGAAC	2	12	12245	12256	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	336053290
9	NC_015598	TTTGGT	2	12	12511	12522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053290
10	NC_015598	ATTAAT	2	12	15187	15198	50 %	50 %	0 %	0 %	336053290
11	NC_015598	TACCTA	2	12	15218	15229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336053290
12	NC_015598	TATTTT	2	12	23562	23573	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	336053296
13	NC_015598	TTGCTA	2	12	25971	25982	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	336053300
14	NC_015598	ATATTT	2	12	32001	32012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053312
15	NC_015598	AATATT	2	12	39927	39938	50 %	50 %	0 %	0 %	336053322
16	NC_015598	CGCCCA	2	12	42460	42471	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	336053325
17	NC_015598	TACGAT	2	12	43482	43493	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	336053327
18	NC_015598	ATTTTA	2	12	45816	45827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053328
19	NC_015598	TAACTT	2	12	52744	52755	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	336053333
20	NC_015598	AGTTAC	2	12	53085	53096	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	336053334
21	NC_015598	CCTAAA	2	12	56130	56141	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	336053335
22	NC_015598	AGTGAA	2	12	59328	59339	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	336053337
23	NC_015598	TCTCCA	2	12	64205	64216	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	336053342
24	NC_015598	TTTTAA	2	12	64710	64721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053342
25	NC_015598	TTCCTT	2	12	65413	65424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336053342
26	NC_015598	ATCAAT	2	12	69422	69433	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	336053349
27	NC_015598	TACCAG	2	12	71761	71772	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	336053352
28	NC_015598	ATCGTT	2	12	74447	74458	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	336053354
29	NC_015598	GTTTGA	2	12	77658	77669	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	336053354
30	NC_015598	GTTTGT	2	12	77685	77696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053354
31	NC_015598	GTTTGA	2	12	77724	77735	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	336053354
32	NC_015598	GTTTGT	2	12	77751	77762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053354
33	NC_015598	TTAGCT	2	12	77952	77963	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	336053354
34	NC_015598	TGACTA	2	12	82294	82305	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	336053359
35	NC_015598	ATTATC	2	12	87957	87968	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	336053366
36	NC_015598	CTGATT	2	12	89156	89167	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	336053369
37	NC_015598	TTCTTT	2	12	89391	89402	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	336053369
38	NC_015598	GTAATT	2	12	93432	93443	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	336053371
39	NC_015598	TTAAAA	2	12	105205	105216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336053385
40	NC_015598	AAAAGC	2	12	105817	105828	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	336053386
41	NC_015598	AAACCA	2	12	105848	105859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336053386
42	NC_015598	TATTGC	2	12	106057	106068	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	336053386
43	NC_015598	CATATC	2	12	106916	106927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336053387
44	NC_015598	ATAATC	2	12	109767	109778	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	336053387
45	NC_015598	CTTCTG	2	12	110215	110226	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	336053387
46	NC_015598	TCCAAT	2	12	110753	110764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336053387
47	NC_015598	ATTTTG	2	12	112112	112123	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	336053388
48	NC_015598	ACCTGA	2	12	112138	112149	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	336053388
49	NC_015598	AATTAA	2	12	114692	114703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336053390
50	NC_015598	TTTTTG	2	12	116800	116811	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	336053394
51	NC_015598	ATTTTA	2	12	117548	117559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053396
52	NC_015598	TTATCT	2	12	119398	119409	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	336053397
53	NC_015598	TACTTC	2	12	119541	119552	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	336053397
54	NC_015598	AATTCC	2	12	119796	119807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336053398
55	NC_015598	AACGAA	2	12	122299	122310	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	336053402
56	NC_015598	GTTTAA	2	12	123408	123419	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	336053405
57	NC_015598	TAACTG	2	12	123693	123704	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	336053405
58	NC_015598	CGTTAT	2	12	123954	123965	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	336053405
59	NC_015598	TTACAA	2	12	125140	125151	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	336053406
60	NC_015598	AAAGCA	2	12	126354	126365	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	336053407
61	NC_015598	CACGAT	2	12	133366	133377	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	336053414
62	NC_015598	ACCATA	2	12	136412	136423	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	336053417
63	NC_015598	ACTTAT	2	12	137195	137206	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	336053418
64	NC_015598	CAGTGG	2	12	138254	138265	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	336053420
65	NC_015598	ATATCA	2	12	139224	139235	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	336053420
66	NC_015598	GCTATT	2	12	145264	145275	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	336053426
67	NC_015598	ATTGTT	2	12	145612	145623	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	336053426
68	NC_015598	AGGTTA	2	12	145851	145862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053426
69	NC_015598	TAGAAA	2	12	150120	150131	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	336053428
70	NC_015598	TTTAAT	2	12	151624	151635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053431
71	NC_015598	ATAATT	2	12	151696	151707	50 %	50 %	0 %	0 %	336053431
72	NC_015598	GTTCAG	2	12	155467	155478	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	336053434
73	NC_015598	ATCATT	2	12	155855	155866	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	336053434
74	NC_015598	TCTACT	2	12	157524	157535	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	336053434
75	NC_015598	AGGTTG	2	12	160556	160567	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	336053441
76	NC_015598	GATAAT	2	12	163626	163637	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	336053443
77	NC_015598	TTATCA	2	12	167425	167436	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	336053446
78	NC_015598	ATTTTG	2	12	168136	168147	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	336053447
79	NC_015598	GCCACC	2	12	171317	171328	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	336053451
80	NC_015598	TTTTGC	2	12	171549	171560	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	336053451
81	NC_015598	TCTTGT	2	12	172808	172819	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	336053453
82	NC_015598	AGTTAA	2	12	174408	174419	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	336053453
83	NC_015598	AGTAAT	2	12	176990	177001	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	336053454
84	NC_015598	TGATAA	2	12	181853	181864	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	336053462
85	NC_015598	GCCTGA	2	12	184605	184616	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336053467
86	NC_015598	GATAAA	2	12	186744	186755	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	336053469
87	NC_015598	TATACT	2	12	186918	186929	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	336053469
88	NC_015598	ATAAAA	2	12	188724	188735	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	336053470

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.