MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus kefiranofaciens ZW3 plasmid pWW1

Total Repeats: 165

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015598	GAAAA	2	10	757	766	80 %	0 %	20 %	0 %	336053280
2	NC_015598	CAGAT	2	10	1225	1234	40 %	20 %	20 %	20 %	336053280
3	NC_015598	ATAAA	2	10	3144	3153	80 %	20 %	0 %	0 %	336053281
4	NC_015598	GCGAG	2	10	5433	5442	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_015598	CATGG	2	10	7364	7373	20 %	20 %	40 %	20 %	336053286
6	NC_015598	TGAAT	2	10	7443	7452	40 %	40 %	20 %	0 %	336053286
7	NC_015598	ATTAA	2	10	8101	8110	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015598	CTTTA	2	10	10180	10189	20 %	60 %	0 %	20 %	336053289
9	NC_015598	AAGTC	2	10	10862	10871	40 %	20 %	20 %	20 %	336053289
10	NC_015598	ATTTA	2	10	11769	11778	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015598	TTTCG	2	10	13211	13220	0 %	60 %	20 %	20 %	336053290
12	NC_015598	ACAAA	2	10	13953	13962	80 %	0 %	0 %	20 %	336053290
13	NC_015598	AATTT	2	10	14866	14875	40 %	60 %	0 %	0 %	336053290
14	NC_015598	GAATC	2	10	16514	16523	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_015598	ATTCA	2	10	20013	20022	40 %	40 %	0 %	20 %	336053291
16	NC_015598	AAAAG	2	10	22153	22162	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015598	ATTTT	2	10	23332	23341	20 %	80 %	0 %	0 %	336053296
18	NC_015598	ATTTT	2	10	23590	23599	20 %	80 %	0 %	0 %	336053296
19	NC_015598	TTTTG	2	10	25567	25576	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015598	TTAAT	2	10	26055	26064	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015598	AAACC	2	10	27737	27746	60 %	0 %	0 %	40 %	336053303
22	NC_015598	AATCT	2	10	28288	28297	40 %	40 %	0 %	20 %	336053304
23	NC_015598	AATAG	2	10	28396	28405	60 %	20 %	20 %	0 %	336053304
24	NC_015598	ATTTT	2	10	29941	29950	20 %	80 %	0 %	0 %	336053306
25	NC_015598	TTTAG	2	10	30464	30473	20 %	60 %	20 %	0 %	336053307
26	NC_015598	CAAAA	2	10	31118	31127	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_015598	TAAAT	2	10	32366	32375	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015598	CAATT	2	10	33297	33306	40 %	40 %	0 %	20 %	336053313
29	NC_015598	TCATG	2	10	34703	34712	20 %	40 %	20 %	20 %	336053315
30	NC_015598	TTAGT	2	10	38260	38269	20 %	60 %	20 %	0 %	336053319
31	NC_015598	TTGTG	2	10	39554	39563	0 %	60 %	40 %	0 %	336053322
32	NC_015598	TGACT	2	10	40041	40050	20 %	40 %	20 %	20 %	336053322
33	NC_015598	TATTG	2	10	42354	42363	20 %	60 %	20 %	0 %	336053325
34	NC_015598	AGGAT	2	10	42550	42559	40 %	20 %	40 %	0 %	336053325
35	NC_015598	TGAAA	2	10	43031	43040	60 %	20 %	20 %	0 %	336053327
36	NC_015598	CGAAT	2	10	44817	44826	40 %	20 %	20 %	20 %	336053327
37	NC_015598	TTAAA	2	10	46393	46402	60 %	40 %	0 %	0 %	336053328
38	NC_015598	TTTAG	2	10	46434	46443	20 %	60 %	20 %	0 %	336053328
39	NC_015598	TTTTA	2	10	47455	47464	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015598	ATCAA	2	10	48264	48273	60 %	20 %	0 %	20 %	336053331
41	NC_015598	TCACT	2	10	50017	50026	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_015598	GAAGA	2	10	51209	51218	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015598	ATTTT	2	10	51528	51537	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015598	CTCTT	2	10	51916	51925	0 %	60 %	0 %	40 %	336053333
45	NC_015598	AGTCA	2	10	54006	54015	40 %	20 %	20 %	20 %	336053334
46	NC_015598	ATGAT	2	10	56551	56560	40 %	40 %	20 %	0 %	336053335
47	NC_015598	CTGAA	2	10	56905	56914	40 %	20 %	20 %	20 %	336053335
48	NC_015598	AATTC	2	10	58009	58018	40 %	40 %	0 %	20 %	336053335
49	NC_015598	AAATT	2	10	60558	60567	60 %	40 %	0 %	0 %	336053338
50	NC_015598	ATTAG	2	10	60765	60774	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015598	TTTAT	2	10	62031	62040	20 %	80 %	0 %	0 %	336053340
52	NC_015598	CCAAT	2	10	63193	63202	40 %	20 %	0 %	40 %	336053341
53	NC_015598	AAGGA	2	10	65188	65197	60 %	0 %	40 %	0 %	336053342
54	NC_015598	ATTTT	2	10	65388	65397	20 %	80 %	0 %	0 %	336053342
55	NC_015598	AAGTA	2	10	66099	66108	60 %	20 %	20 %	0 %	336053343
56	NC_015598	ACTTA	2	10	66417	66426	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_015598	ATTTT	2	10	67241	67250	20 %	80 %	0 %	0 %	336053345
58	NC_015598	TGCAA	2	10	68195	68204	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_015598	CAAAA	2	10	68803	68812	80 %	0 %	0 %	20 %	336053348
60	NC_015598	CTTTT	2	10	68994	69003	0 %	80 %	0 %	20 %	336053348
61	NC_015598	TAGAA	2	10	69189	69198	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015598	AAGTC	2	10	72859	72868	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_015598	TTAAG	2	10	74176	74185	40 %	40 %	20 %	0 %	336053354
64	NC_015598	AGTAA	2	10	74831	74840	60 %	20 %	20 %	0 %	336053354
65	NC_015598	CTGAA	2	10	75034	75043	40 %	20 %	20 %	20 %	336053354
66	NC_015598	CATTA	2	10	78032	78041	40 %	40 %	0 %	20 %	336053354
67	NC_015598	AATAA	2	10	78386	78395	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015598	TTATT	2	10	79537	79546	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015598	AAATT	2	10	81167	81176	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015598	ACCAT	2	10	82369	82378	40 %	20 %	0 %	40 %	336053359
71	NC_015598	TCTCT	2	10	82874	82883	0 %	60 %	0 %	40 %	336053360
72	NC_015598	TAAGT	2	10	85505	85514	40 %	40 %	20 %	0 %	336053362
73	NC_015598	ATTTA	2	10	86080	86089	40 %	60 %	0 %	0 %	336053362
74	NC_015598	AACAT	2	10	86995	87004	60 %	20 %	0 %	20 %	336053364
75	NC_015598	AATCA	2	10	87930	87939	60 %	20 %	0 %	20 %	336053366
76	NC_015598	GTCCA	2	10	89484	89493	20 %	20 %	20 %	40 %	336053369
77	NC_015598	TGCCT	2	10	91338	91347	0 %	40 %	20 %	40 %	336053369
78	NC_015598	AAGGA	2	10	91872	91881	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015598	CTATT	2	10	91916	91925	20 %	60 %	0 %	20 %	336053370
80	NC_015598	AATGT	2	10	93150	93159	40 %	40 %	20 %	0 %	336053371
81	NC_015598	AAATC	2	10	93284	93293	60 %	20 %	0 %	20 %	336053371
82	NC_015598	TTTGT	2	10	94888	94897	0 %	80 %	20 %	0 %	336053372
83	NC_015598	AAGCC	2	10	95139	95148	40 %	0 %	20 %	40 %	336053372
84	NC_015598	TCATC	2	10	95614	95623	20 %	40 %	0 %	40 %	336053373
85	NC_015598	CTTTG	2	10	95830	95839	0 %	60 %	20 %	20 %	336053373
86	NC_015598	TTTTC	2	10	98598	98607	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_015598	TAATT	2	10	98668	98677	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015598	AATCA	2	10	98686	98695	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_015598	CAAGC	2	10	98943	98952	40 %	0 %	20 %	40 %	336053375
90	NC_015598	TAATT	2	10	99076	99085	40 %	60 %	0 %	0 %	336053375
91	NC_015598	CTAAT	2	10	99426	99435	40 %	40 %	0 %	20 %	336053375
92	NC_015598	TTACT	2	10	100832	100841	20 %	60 %	0 %	20 %	336053378
93	NC_015598	TCAAA	2	10	102017	102026	60 %	20 %	0 %	20 %	336053381
94	NC_015598	CTTGC	2	10	103345	103354	0 %	40 %	20 %	40 %	336053382
95	NC_015598	ATCTC	2	10	103686	103695	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_015598	TTTTG	2	10	105363	105372	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015598	CTTTT	2	10	110800	110809	0 %	80 %	0 %	20 %	336053387
98	NC_015598	TCTGC	2	10	113634	113643	0 %	40 %	20 %	40 %	336053389
99	NC_015598	TTTTA	2	10	116134	116143	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015598	CTATT	2	10	117031	117040	20 %	60 %	0 %	20 %	336053394
101	NC_015598	TTTTG	2	10	117846	117855	0 %	80 %	20 %	0 %	336053396
102	NC_015598	AATTG	2	10	118323	118332	40 %	40 %	20 %	0 %	336053396
103	NC_015598	TAGCT	2	10	118662	118671	20 %	40 %	20 %	20 %	336053396
104	NC_015598	CTTTT	2	10	119976	119985	0 %	80 %	0 %	20 %	336053398
105	NC_015598	TTTCC	2	10	120615	120624	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_015598	AGAAA	2	10	122034	122043	80 %	0 %	20 %	0 %	336053402
107	NC_015598	TGGAC	2	10	122455	122464	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_015598	TAAAA	2	10	122509	122518	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015598	TTGAG	2	10	123389	123398	20 %	40 %	40 %	0 %	336053405
110	NC_015598	AAGGT	2	10	124900	124909	40 %	20 %	40 %	0 %	336053406
111	NC_015598	TTATT	2	10	127255	127264	20 %	80 %	0 %	0 %	336053408
112	NC_015598	TATTC	2	10	127418	127427	20 %	60 %	0 %	20 %	336053408
113	NC_015598	CCATA	2	10	127474	127483	40 %	20 %	0 %	40 %	336053408
114	NC_015598	AAAAG	2	10	129225	129234	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015598	TAAAA	2	10	129796	129805	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015598	GTATT	2	10	130716	130725	20 %	60 %	20 %	0 %	336053412
117	NC_015598	CCTTT	2	10	132297	132306	0 %	60 %	0 %	40 %	336053414
118	NC_015598	TAAAA	2	10	133705	133714	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015598	ATTCC	2	10	133977	133986	20 %	40 %	0 %	40 %	336053415
120	NC_015598	AGTAA	2	10	134748	134757	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015598	TGATT	2	10	134866	134875	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015598	CTCTT	2	10	135817	135826	0 %	60 %	0 %	40 %	336053416
123	NC_015598	CAAAA	2	10	135924	135933	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_015598	AATTG	2	10	139056	139065	40 %	40 %	20 %	0 %	336053420
125	NC_015598	TCGCT	2	10	139095	139104	0 %	40 %	20 %	40 %	336053420
126	NC_015598	GCAAA	2	10	141304	141313	60 %	0 %	20 %	20 %	336053422
127	NC_015598	TGAAG	2	10	141922	141931	40 %	20 %	40 %	0 %	336053423
128	NC_015598	AATTA	2	10	144867	144876	60 %	40 %	0 %	0 %	336053426
129	NC_015598	TGCAA	2	10	149849	149858	40 %	20 %	20 %	20 %	336053427
130	NC_015598	TTTTC	2	10	150848	150857	0 %	80 %	0 %	20 %	336053430
131	NC_015598	CATTT	2	10	155453	155462	20 %	60 %	0 %	20 %	336053434
132	NC_015598	ATTTC	2	10	156439	156448	20 %	60 %	0 %	20 %	336053434
133	NC_015598	AATCA	2	10	156488	156497	60 %	20 %	0 %	20 %	336053434
134	NC_015598	TTCTT	2	10	157567	157576	0 %	80 %	0 %	20 %	336053434
135	NC_015598	ATCTT	2	10	157830	157839	20 %	60 %	0 %	20 %	336053434
136	NC_015598	AACAA	2	10	158585	158594	80 %	0 %	0 %	20 %	336053435
137	NC_015598	ATATT	2	10	163152	163161	40 %	60 %	0 %	0 %	336053443
138	NC_015598	TTTTC	2	10	164418	164427	0 %	80 %	0 %	20 %	336053444
139	NC_015598	GATTA	2	10	165513	165522	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_015598	TGGAT	2	10	167445	167454	20 %	40 %	40 %	0 %	336053446
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143	NC_015598	TTTTG	2	10	168679	168688	0 %	80 %	20 %	0 %	336053448
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146	NC_015598	AAATA	2	10	172247	172256	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_015598	TACAT	2	10	176896	176905	40 %	40 %	0 %	20 %	336053454
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163	NC_015598	AGCTA	2	10	191879	191888	40 %	20 %	20 %	20 %	336053474
164	NC_015598	AGCCT	2	10	192216	192225	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
165	NC_015598	AAGAC	2	10	193181	193190	60 %	0 %	20 %	20 %	336053477

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.