MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus kefiranofaciens ZW3 plasmid pWW1

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015598	GCGAG	2	10	5433	5442	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015598	ATTAA	2	10	8101	8110	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015598	ATTTA	2	10	11769	11778	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015598	GAATC	2	10	16514	16523	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_015598	AAAAG	2	10	22153	22162	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015598	TTTTG	2	10	25567	25576	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015598	TTAAT	2	10	26055	26064	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015598	CAAAA	2	10	31118	31127	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_015598	TAAAT	2	10	32366	32375	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015598	TTTTA	2	10	47455	47464	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015598	TCACT	2	10	50017	50026	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_015598	GAAGA	2	10	51209	51218	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015598	ATTTT	2	10	51528	51537	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015598	ATTAG	2	10	60765	60774	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015598	ACTTA	2	10	66417	66426	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015598	TGCAA	2	10	68195	68204	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015598	TAGAA	2	10	69189	69198	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015598	AAGTC	2	10	72859	72868	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_015598	AATAA	2	10	78386	78395	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015598	TTATT	2	10	79537	79546	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015598	AAATT	2	10	81167	81176	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015598	AAGGA	2	10	91872	91881	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015598	TTTTC	2	10	98598	98607	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015598	TAATT	2	10	98668	98677	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015598	AATCA	2	10	98686	98695	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015598	ATCTC	2	10	103686	103695	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_015598	TTTTG	2	10	105363	105372	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015598	TTTTA	2	10	116134	116143	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015598	TTTCC	2	10	120615	120624	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_015598	TGGAC	2	10	122455	122464	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_015598	TAAAA	2	10	122509	122518	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015598	AAAAG	2	10	129225	129234	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015598	TAAAA	2	10	129796	129805	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015598	TAAAA	2	10	133705	133714	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015598	AGTAA	2	10	134748	134757	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015598	TGATT	2	10	134866	134875	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015598	CAAAA	2	10	135924	135933	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_015598	GATTA	2	10	165513	165522	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015598	AATTT	2	10	167111	167120	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015598	TATAT	2	10	172032	172041	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015598	AAATA	2	10	172247	172256	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015598	TAAAT	2	10	180228	180237	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015598	GATGT	2	10	189065	189074	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015598	AGCCT	2	10	192216	192225	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.