MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus kefiranofaciens ZW3 plasmid pWW1

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015598	ATTG	2	8	87	94	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015598	TAAA	2	8	577	584	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015598	AAAT	2	8	626	633	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015598	CTTT	2	8	3276	3283	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015598	CTTT	2	8	3323	3330	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015598	GATT	2	8	3341	3348	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015598	ATAA	2	8	3446	3453	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015598	TGAA	2	8	6850	6857	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015598	ATAC	2	8	8226	8233	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015598	AATT	2	8	8592	8599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015598	TGAC	2	8	8667	8674	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015598	ATTA	2	8	11916	11923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015598	TTAA	2	8	15697	15704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015598	AAGG	2	8	15904	15911	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015598	TATT	2	8	15967	15974	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015598	AAGC	2	8	16930	16937	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015598	GCTG	2	8	17451	17458	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015598	AATC	2	8	17874	17881	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015598	ATCA	2	8	17990	17997	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015598	CAGT	2	8	18003	18010	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015598	TGAT	2	8	18551	18558	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015598	AAAG	2	8	18883	18890	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015598	GGTT	2	8	25653	25660	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015598	TAAA	2	8	25766	25773	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015598	AGAA	2	8	26129	26136	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015598	ATTA	2	8	27329	27336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015598	ATTT	2	8	27359	27366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015598	ATTT	2	8	29280	29287	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015598	AATT	2	8	29311	29318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015598	TGCT	2	8	32567	32574	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015598	ATTA	2	8	32592	32599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015598	AATT	2	8	33861	33868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015598	AGAA	2	8	33933	33940	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015598	CATT	2	8	35234	35241	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015598	ATTT	3	12	35246	35257	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015598	TTTA	2	8	36613	36620	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015598	ATGA	2	8	37981	37988	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015598	AGTT	2	8	39336	39343	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015598	TACT	2	8	47668	47675	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_015598	AAAG	2	8	48538	48545	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015598	TTGT	2	8	49781	49788	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015598	ATCA	2	8	49848	49855	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015598	TAAT	2	8	51453	51460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015598	TCAT	2	8	51585	51592	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015598	AGCC	2	8	54989	54996	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015598	ATTA	2	8	59063	59070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015598	ATAA	2	8	59159	59166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015598	TTAC	2	8	59176	59183	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015598	AATA	2	8	60856	60863	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015598	ATTT	2	8	62946	62953	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015598	TTAA	2	8	65637	65644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015598	CAAA	2	8	66359	66366	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015598	CTTT	2	8	68138	68145	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015598	TAAA	2	8	68244	68251	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015598	ATTA	2	8	68274	68281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015598	TTTC	2	8	69158	69165	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015598	AAAT	2	8	70642	70649	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015598	TTTA	2	8	70712	70719	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015598	AATA	2	8	72070	72077	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015598	ATTG	2	8	72169	72176	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015598	TGAA	2	8	72903	72910	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015598	TTTA	2	8	72949	72956	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015598	TAAA	2	8	78202	78209	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015598	AGTA	2	8	78305	78312	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015598	TAAA	2	8	79615	79622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015598	TAAA	2	8	79866	79873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015598	GATT	2	8	79885	79892	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015598	AATT	2	8	79898	79905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015598	CAGT	2	8	80969	80976	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_015598	TTGA	2	8	81042	81049	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015598	TCAT	2	8	81079	81086	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_015598	TTTA	2	8	81221	81228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015598	CTTA	2	8	81403	81410	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015598	AAAC	2	8	83527	83534	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015598	AATA	2	8	83614	83621	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015598	ATTT	2	8	83680	83687	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015598	ATTT	2	8	86148	86155	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015598	TTTA	2	8	87898	87905	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015598	TTAA	2	8	91861	91868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015598	TTTG	2	8	92594	92601	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015598	AGCC	2	8	94080	94087	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015598	TTTC	2	8	96211	96218	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015598	AAAT	2	8	97269	97276	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015598	TTCT	2	8	97302	97309	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015598	ATTT	2	8	97398	97405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015598	ATTT	2	8	97407	97414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015598	TCTT	2	8	97499	97506	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015598	TCTT	2	8	98026	98033	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015598	AAAC	2	8	98144	98151	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_015598	GACA	2	8	98535	98542	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_015598	TTTG	2	8	98837	98844	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015598	AATT	2	8	98881	98888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015598	TTTG	2	8	99585	99592	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015598	TTCA	2	8	102285	102292	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_015598	ATTA	2	8	105387	105394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015598	TTTA	2	8	115223	115230	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015598	CTTG	2	8	117508	117515	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_015598	ATTA	2	8	119130	119137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015598	GAAA	2	8	120791	120798	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015598	AATA	2	8	120820	120827	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015598	GCAA	2	8	122318	122325	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_015598	TTAC	2	8	122415	122422	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_015598	TACA	2	8	124591	124598	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_015598	ATTT	2	8	124667	124674	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015598	ATGA	2	8	128252	128259	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015598	TAAA	2	8	129723	129730	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015598	ATTA	2	8	134075	134082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015598	AATT	2	8	134115	134122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015598	CTTA	2	8	135329	135336	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_015598	ATCA	2	8	135542	135549	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_015598	TACT	2	8	135597	135604	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015598	TTAA	2	8	135916	135923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015598	CTTT	2	8	137449	137456	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_015598	AATA	2	8	143873	143880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015598	TTAA	2	8	143886	143893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015598	TAAA	2	8	143939	143946	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015598	AGGA	2	8	149879	149886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015598	ATCA	2	8	158369	158376	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_015598	TGTT	2	8	158923	158930	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015598	CTTT	2	8	162051	162058	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_015598	TGGG	2	8	165355	165362	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015598	TCGA	2	8	166051	166058	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_015598	TTTA	2	8	167865	167872	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015598	ACTT	2	8	167966	167973	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_015598	TAAA	2	8	171993	172000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015598	AATA	2	8	172178	172185	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015598	TAAA	2	8	172235	172242	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015598	AATA	2	8	176425	176432	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015598	ATAA	2	8	177876	177883	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015598	TAAA	2	8	177884	177891	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015598	GTTT	2	8	177951	177958	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015598	ATAA	2	8	178071	178078	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015598	ATAA	2	8	178082	178089	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015598	TTAA	2	8	178105	178112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015598	AGGA	2	8	179185	179192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015598	TAAA	2	8	180315	180322	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015598	ATTA	2	8	180342	180349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015598	ATAA	2	8	180402	180409	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015598	ATAA	2	8	180993	181000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015598	AATG	2	8	184301	184308	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015598	GCCA	2	8	184402	184409	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_015598	CTTT	2	8	185884	185891	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_015598	TAAG	2	8	187158	187165	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015598	CATA	2	8	190737	190744	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_015598	AAGC	2	8	192232	192239	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_015598	TGTA	2	8	192515	192522	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015598	ATGA	2	8	192566	192573	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015598	TTTA	2	8	194640	194647	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.