MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus kefiranofaciens ZW3 plasmid pWW1

Total Repeats: 472

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015598	ATT	2	6	664	669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015598	GTG	2	6	706	711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015598	TAT	2	6	712	717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015598	ATA	2	6	2302	2307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015598	TAA	2	6	2320	2325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015598	TAT	2	6	2347	2352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015598	TTA	2	6	3572	3577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015598	TAT	2	6	3591	3596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015598	TAA	2	6	5427	5432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015598	GTA	2	6	5447	5452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015598	GCT	2	6	6783	6788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015598	ATT	2	6	7964	7969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015598	CAT	2	6	8194	8199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015598	CCT	2	6	8489	8494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_015598	AGA	2	6	8535	8540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015598	TTG	2	6	8627	8632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015598	ATG	2	6	8770	8775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015598	ATT	2	6	8801	8806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015598	ATG	2	6	11574	11579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015598	CGT	2	6	11587	11592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015598	TCA	3	9	11682	11690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015598	CCT	2	6	11750	11755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_015598	TAT	2	6	11788	11793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015598	GTA	2	6	11857	11862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015598	TGG	2	6	12007	12012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015598	GAA	2	6	15547	15552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015598	TGA	2	6	15864	15869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015598	TCT	2	6	16018	16023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015598	ATT	2	6	16082	16087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015598	TTG	2	6	16153	16158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015598	GAA	2	6	16167	16172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015598	ATT	2	6	16299	16304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015598	CGG	2	6	16407	16412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015598	TTG	2	6	16460	16465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015598	AGA	2	6	16494	16499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015598	TGA	2	6	16611	16616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015598	AAC	2	6	16636	16641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015598	AAT	2	6	16726	16731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015598	CTC	2	6	16813	16818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_015598	TAA	2	6	16833	16838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015598	GAT	2	6	16861	16866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015598	TCT	2	6	16895	16900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015598	GGT	2	6	16924	16929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015598	CTA	2	6	17113	17118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015598	TTC	2	6	17130	17135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015598	CAT	2	6	17166	17171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015598	CAG	2	6	17324	17329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015598	TAA	2	6	17364	17369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015598	ATC	2	6	17545	17550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015598	TAC	2	6	17623	17628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015598	GAA	2	6	17740	17745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015598	CAA	2	6	17782	17787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015598	TGA	3	9	17793	17801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015598	TAG	3	9	17816	17824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015598	ATG	2	6	17945	17950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015598	GTA	2	6	18032	18037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015598	TGT	2	6	18075	18080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015598	ACT	2	6	18098	18103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015598	AGA	2	6	18159	18164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015598	AAG	2	6	18407	18412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015598	AGT	2	6	18417	18422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015598	AGC	2	6	18607	18612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015598	AAG	2	6	18613	18618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015598	TGC	2	6	18627	18632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015598	GAT	2	6	18675	18680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015598	CTT	2	6	18725	18730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015598	GAT	2	6	18760	18765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015598	TAG	2	6	18779	18784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015598	ATT	2	6	18787	18792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015598	TTA	2	6	18940	18945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015598	AGA	2	6	18987	18992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015598	CAT	2	6	18993	18998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015598	GTA	3	9	19015	19023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015598	GGA	2	6	19200	19205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015598	TAA	2	6	19218	19223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015598	ATT	2	6	21966	21971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015598	ATA	2	6	21977	21982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015598	ATA	2	6	21987	21992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015598	ATC	2	6	22069	22074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015598	ATA	2	6	22129	22134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015598	TCC	2	6	22630	22635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_015598	GAT	2	6	23237	23242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015598	TAA	2	6	24041	24046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015598	CTT	2	6	25011	25016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015598	CAT	2	6	25028	25033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015598	CTT	2	6	25046	25051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015598	GTT	2	6	25052	25057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015598	ACT	2	6	25556	25561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015598	TTA	2	6	25821	25826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015598	TTA	2	6	25840	25845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015598	TAC	2	6	25894	25899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015598	ATT	2	6	26047	26052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015598	CAT	2	6	27986	27991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015598	ATT	2	6	28035	28040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015598	AAT	2	6	28120	28125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015598	TTA	2	6	29366	29371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015598	AAG	2	6	29451	29456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015598	GAA	2	6	30059	30064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015598	TAA	2	6	30161	30166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015598	GTA	2	6	30171	30176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015598	ATT	2	6	31045	31050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015598	GTA	2	6	31052	31057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015598	AAT	2	6	31082	31087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015598	GAT	2	6	31525	31530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015598	GTT	2	6	31568	31573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015598	ATT	2	6	31580	31585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015598	TAA	2	6	31652	31657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015598	TTA	2	6	32282	32287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015598	ATA	2	6	32348	32353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015598	AAC	2	6	32392	32397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015598	ACT	2	6	32402	32407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015598	TAT	2	6	35216	35221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015598	AAT	2	6	35261	35266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015598	TAG	2	6	36630	36635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015598	TCC	2	6	36664	36669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_015598	TCA	2	6	36717	36722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015598	TAG	2	6	36751	36756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015598	CTA	2	6	36762	36767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015598	ATG	2	6	36816	36821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015598	GAG	2	6	36824	36829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015598	TAT	2	6	37938	37943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015598	TGT	2	6	38867	38872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015598	ATA	2	6	38891	38896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015598	CAG	2	6	40073	40078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015598	ACC	2	6	40101	40106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_015598	AGT	2	6	40137	40142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015598	TTA	2	6	40147	40152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015598	ATT	2	6	40156	40161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015598	TAG	2	6	40945	40950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015598	TTA	2	6	41088	41093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015598	TTA	2	6	41717	41722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015598	TTA	2	6	41737	41742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015598	GTT	2	6	41753	41758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015598	GGA	2	6	45150	45155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015598	AGT	2	6	47319	47324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015598	ATC	2	6	47407	47412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015598	TTA	2	6	47436	47441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015598	AAG	2	6	47466	47471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015598	TTG	2	6	47509	47514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015598	TAA	2	6	47759	47764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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412	NC_015598	GCT	2	6	166006	166011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
413	NC_015598	TAA	2	6	166035	166040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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415	NC_015598	TTA	2	6	168020	168025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
416	NC_015598	GCA	2	6	171603	171608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
417	NC_015598	ATT	2	6	171615	171620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
418	NC_015598	TAC	2	6	171635	171640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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429	NC_015598	TCC	2	6	176249	176254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
430	NC_015598	CAA	2	6	176274	176279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
431	NC_015598	ATT	2	6	176379	176384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_015598	TAC	2	6	176504	176509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
433	NC_015598	ACT	2	6	176558	176563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
434	NC_015598	ACA	2	6	176629	176634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
435	NC_015598	TAT	2	6	177924	177929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
436	NC_015598	TAC	2	6	178001	178006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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438	NC_015598	TCC	2	6	179053	179058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
439	NC_015598	ACA	2	6	179169	179174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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442	NC_015598	ATT	2	6	180305	180310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_015598	TAA	2	6	180386	180391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_015598	ATA	2	6	180924	180929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_015598	ATA	2	6	180934	180939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_015598	AAT	2	6	181008	181013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.