MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus kefiranofaciens ZW3 plasmid pWW1

Total Repeats: 224

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015598	TA	3	6	110	115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015598	CA	3	6	1507	1512	50 %	0 %	0 %	50 %	336053280
3	NC_015598	AG	3	6	1833	1838	50 %	0 %	50 %	0 %	336053280
4	NC_015598	TA	3	6	3455	3460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015598	AT	3	6	3645	3650	50 %	50 %	0 %	0 %	336053282
6	NC_015598	GA	3	6	5671	5676	50 %	0 %	50 %	0 %	336053283
7	NC_015598	GT	3	6	6011	6016	0 %	50 %	50 %	0 %	336053283
8	NC_015598	AT	3	6	7167	7172	50 %	50 %	0 %	0 %	336053286
9	NC_015598	AT	3	6	7978	7983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015598	CG	3	6	8511	8516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015598	AT	3	6	13674	13679	50 %	50 %	0 %	0 %	336053290
12	NC_015598	CT	3	6	13786	13791	0 %	50 %	0 %	50 %	336053290
13	NC_015598	TA	3	6	14360	14365	50 %	50 %	0 %	0 %	336053290
14	NC_015598	AG	3	6	14700	14705	50 %	0 %	50 %	0 %	336053290
15	NC_015598	AT	3	6	16505	16510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015598	GT	3	6	19258	19263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015598	AG	3	6	20062	20067	50 %	0 %	50 %	0 %	336053291
18	NC_015598	CT	3	6	20558	20563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015598	AG	3	6	21239	21244	50 %	0 %	50 %	0 %	336053292
20	NC_015598	AT	3	6	21307	21312	50 %	50 %	0 %	0 %	336053292
21	NC_015598	CA	3	6	22029	22034	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015598	TA	3	6	22605	22610	50 %	50 %	0 %	0 %	336053294
23	NC_015598	AT	4	8	22660	22667	50 %	50 %	0 %	0 %	336053295
24	NC_015598	AG	3	6	23806	23811	50 %	0 %	50 %	0 %	336053296
25	NC_015598	TA	3	6	23969	23974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015598	TA	3	6	24819	24824	50 %	50 %	0 %	0 %	336053298
27	NC_015598	CT	3	6	24888	24893	0 %	50 %	0 %	50 %	336053298
28	NC_015598	AC	3	6	26407	26412	50 %	0 %	0 %	50 %	336053301
29	NC_015598	TA	3	6	26642	26647	50 %	50 %	0 %	0 %	336053301
30	NC_015598	TA	3	6	26682	26687	50 %	50 %	0 %	0 %	336053301
31	NC_015598	GA	3	6	28210	28215	50 %	0 %	50 %	0 %	336053304
32	NC_015598	AT	3	6	28893	28898	50 %	50 %	0 %	0 %	336053304
33	NC_015598	AG	3	6	28953	28958	50 %	0 %	50 %	0 %	336053304
34	NC_015598	CA	3	6	29602	29607	50 %	0 %	0 %	50 %	336053305
35	NC_015598	TC	3	6	29651	29656	0 %	50 %	0 %	50 %	336053305
36	NC_015598	TA	3	6	29842	29847	50 %	50 %	0 %	0 %	336053306
37	NC_015598	TA	3	6	30343	30348	50 %	50 %	0 %	0 %	336053307
38	NC_015598	TA	3	6	32090	32095	50 %	50 %	0 %	0 %	336053312
39	NC_015598	AT	3	6	32307	32312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015598	TG	3	6	32605	32610	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015598	AG	3	6	32938	32943	50 %	0 %	50 %	0 %	336053313
42	NC_015598	CA	3	6	33754	33759	50 %	0 %	0 %	50 %	336053313
43	NC_015598	AT	3	6	33780	33785	50 %	50 %	0 %	0 %	336053313
44	NC_015598	GA	3	6	34462	34467	50 %	0 %	50 %	0 %	336053315
45	NC_015598	AT	3	6	35220	35225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015598	AG	3	6	35305	35310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015598	AC	3	6	36606	36611	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015598	AT	3	6	37380	37385	50 %	50 %	0 %	0 %	336053318
49	NC_015598	GT	3	6	37515	37520	0 %	50 %	50 %	0 %	336053318
50	NC_015598	AT	3	6	39198	39203	50 %	50 %	0 %	0 %	336053321
51	NC_015598	AT	3	6	40837	40842	50 %	50 %	0 %	0 %	336053323
52	NC_015598	GT	3	6	41705	41710	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015598	TA	3	6	42031	42036	50 %	50 %	0 %	0 %	336053325
54	NC_015598	AT	3	6	42564	42569	50 %	50 %	0 %	0 %	336053326
55	NC_015598	TA	3	6	43435	43440	50 %	50 %	0 %	0 %	336053327
56	NC_015598	TA	3	6	44779	44784	50 %	50 %	0 %	0 %	336053327
57	NC_015598	GA	3	6	44969	44974	50 %	0 %	50 %	0 %	336053327
58	NC_015598	AC	3	6	45550	45555	50 %	0 %	0 %	50 %	336053328
59	NC_015598	TA	3	6	47677	47682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015598	AT	3	6	48670	48675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015598	CT	3	6	49620	49625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015598	AT	3	6	50228	50233	50 %	50 %	0 %	0 %	336053332
63	NC_015598	AG	3	6	50611	50616	50 %	0 %	50 %	0 %	336053332
64	NC_015598	CA	3	6	50804	50809	50 %	0 %	0 %	50 %	336053332
65	NC_015598	TA	3	6	51742	51747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015598	AT	4	8	54879	54886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015598	CT	3	6	55169	55174	0 %	50 %	0 %	50 %	336053335
68	NC_015598	GT	3	6	56219	56224	0 %	50 %	50 %	0 %	336053335
69	NC_015598	AT	3	6	56506	56511	50 %	50 %	0 %	0 %	336053335
70	NC_015598	AG	3	6	56835	56840	50 %	0 %	50 %	0 %	336053335
71	NC_015598	AG	3	6	59920	59925	50 %	0 %	50 %	0 %	336053338
72	NC_015598	AT	3	6	61868	61873	50 %	50 %	0 %	0 %	336053340
73	NC_015598	AT	3	6	62746	62751	50 %	50 %	0 %	0 %	336053340
74	NC_015598	CT	3	6	63004	63009	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015598	AC	3	6	63744	63749	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015598	CT	3	6	63931	63936	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015598	AT	3	6	64703	64708	50 %	50 %	0 %	0 %	336053342
78	NC_015598	AT	3	6	64976	64981	50 %	50 %	0 %	0 %	336053342
79	NC_015598	TC	3	6	69913	69918	0 %	50 %	0 %	50 %	336053349
80	NC_015598	CA	3	6	70873	70878	50 %	0 %	0 %	50 %	336053350
81	NC_015598	AT	3	6	70899	70904	50 %	50 %	0 %	0 %	336053350
82	NC_015598	GA	3	6	71257	71262	50 %	0 %	50 %	0 %	336053352
83	NC_015598	CT	3	6	72120	72125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015598	TA	3	6	72244	72249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015598	TA	3	6	72998	73003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015598	TA	3	6	74743	74748	50 %	50 %	0 %	0 %	336053354
87	NC_015598	CT	4	8	78072	78079	0 %	50 %	0 %	50 %	336053354
88	NC_015598	GA	3	6	78096	78101	50 %	0 %	50 %	0 %	336053354
89	NC_015598	AT	3	6	80545	80550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015598	TA	3	6	80586	80591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015598	CT	5	10	80735	80744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_015598	GT	3	6	80821	80826	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015598	TA	3	6	81238	81243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015598	TC	3	6	81745	81750	0 %	50 %	0 %	50 %	336053358
95	NC_015598	TA	3	6	82077	82082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015598	AT	3	6	82092	82097	50 %	50 %	0 %	0 %	336053359
97	NC_015598	AC	3	6	82568	82573	50 %	0 %	0 %	50 %	336053359
98	NC_015598	AT	3	6	86120	86125	50 %	50 %	0 %	0 %	336053362
99	NC_015598	AT	3	6	86571	86576	50 %	50 %	0 %	0 %	336053364
100	NC_015598	AT	3	6	87624	87629	50 %	50 %	0 %	0 %	336053365
101	NC_015598	TA	3	6	89025	89030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015598	TC	3	6	90666	90671	0 %	50 %	0 %	50 %	336053369
103	NC_015598	AT	3	6	90696	90701	50 %	50 %	0 %	0 %	336053369
104	NC_015598	CA	3	6	93664	93669	50 %	0 %	0 %	50 %	336053371
105	NC_015598	CA	3	6	93731	93736	50 %	0 %	0 %	50 %	336053371
106	NC_015598	TC	3	6	95544	95549	0 %	50 %	0 %	50 %	336053373
107	NC_015598	AT	3	6	96112	96117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015598	CA	3	6	96458	96463	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015598	TC	3	6	96766	96771	0 %	50 %	0 %	50 %	336053374
110	NC_015598	GA	3	6	98390	98395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015598	AT	3	6	99304	99309	50 %	50 %	0 %	0 %	336053375
112	NC_015598	AT	3	6	99676	99681	50 %	50 %	0 %	0 %	336053376
113	NC_015598	CA	3	6	99812	99817	50 %	0 %	0 %	50 %	336053376
114	NC_015598	TC	3	6	100197	100202	0 %	50 %	0 %	50 %	336053377
115	NC_015598	GA	3	6	101180	101185	50 %	0 %	50 %	0 %	336053379
116	NC_015598	TA	4	8	101878	101885	50 %	50 %	0 %	0 %	336053380
117	NC_015598	AT	3	6	104702	104707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015598	TG	3	6	106872	106877	0 %	50 %	50 %	0 %	336053387
119	NC_015598	TC	3	6	108666	108671	0 %	50 %	0 %	50 %	336053387
120	NC_015598	AT	3	6	109425	109430	50 %	50 %	0 %	0 %	336053387
121	NC_015598	TA	3	6	113584	113589	50 %	50 %	0 %	0 %	336053389
122	NC_015598	CT	3	6	114213	114218	0 %	50 %	0 %	50 %	336053389
123	NC_015598	TC	3	6	114753	114758	0 %	50 %	0 %	50 %	336053390
124	NC_015598	TA	3	6	114943	114948	50 %	50 %	0 %	0 %	336053391
125	NC_015598	AT	3	6	115206	115211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015598	TA	3	6	116437	116442	50 %	50 %	0 %	0 %	336053394
127	NC_015598	AT	3	6	116769	116774	50 %	50 %	0 %	0 %	336053394
128	NC_015598	AT	3	6	117896	117901	50 %	50 %	0 %	0 %	336053396
129	NC_015598	AT	3	6	118081	118086	50 %	50 %	0 %	0 %	336053396
130	NC_015598	AT	3	6	119335	119340	50 %	50 %	0 %	0 %	336053397
131	NC_015598	AT	3	6	119731	119736	50 %	50 %	0 %	0 %	336053398
132	NC_015598	TC	3	6	119949	119954	0 %	50 %	0 %	50 %	336053398
133	NC_015598	CA	3	6	120135	120140	50 %	0 %	0 %	50 %	336053398
134	NC_015598	AT	3	6	120268	120273	50 %	50 %	0 %	0 %	336053398
135	NC_015598	AT	3	6	120744	120749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015598	CA	3	6	121036	121041	50 %	0 %	0 %	50 %	336053399
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138	NC_015598	CA	3	6	121312	121317	50 %	0 %	0 %	50 %	336053399
139	NC_015598	AT	3	6	121478	121483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015598	CA	3	6	121858	121863	50 %	0 %	0 %	50 %	336053401
141	NC_015598	TA	3	6	124095	124100	50 %	50 %	0 %	0 %	336053405
142	NC_015598	AT	3	6	125975	125980	50 %	50 %	0 %	0 %	336053407
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144	NC_015598	TA	3	6	129188	129193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015598	TA	3	6	129856	129861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.