MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Sinorhizobium meliloti AK83 plasmid pSINME01

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015597	GGAGGG	2	12	2043	2054	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	334321236
2	NC_015597	GAGGGG	4	24	2055	2078	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	334321236
3	NC_015597	GGGAGG	2	12	3975	3986	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015597	CGGTTG	2	12	6018	6029	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	334321238
5	NC_015597	CTCGAT	2	12	8382	8393	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015597	GCCGAA	2	12	11128	11139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015597	CGGCAA	2	12	25036	25047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321247
8	NC_015597	CGGCAA	2	12	27177	27188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015597	CTGATG	2	12	30595	30606	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	334321250
10	NC_015597	GAAATC	2	12	30892	30903	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	334321250
11	NC_015597	CGGCCG	2	12	31818	31829	0 %	0 %	50 %	50 %	334321250
12	NC_015597	GATCAG	2	12	32110	32121	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	334321250
13	NC_015597	CGGCTA	2	12	32625	32636	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334321250
14	NC_015597	GGGCCT	2	12	35382	35393	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	334321251
15	NC_015597	ATCCGA	2	12	36600	36611	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015597	TCTCGA	2	12	41508	41519	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015597	CATCAA	2	12	47603	47614	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	334321258
18	NC_015597	GGAAAA	2	12	48775	48786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334321259
19	NC_015597	TTGCAA	2	12	50451	50462	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	334321260
20	NC_015597	CGAGGC	2	12	51418	51429	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	334321262
21	NC_015597	TAGTCT	2	12	57222	57233	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_015597	TCGAAG	2	12	59220	59231	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_015597	CAATCT	2	12	62481	62492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015597	GCCAAG	2	12	65857	65868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321269
25	NC_015597	TCACCA	2	12	68089	68100	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	334321270
26	NC_015597	GATGCG	2	12	70986	70997	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	334321273
27	NC_015597	CGGCAT	3	18	72530	72547	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334321273
28	NC_015597	GGCGAC	2	12	74289	74300	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	334321275
29	NC_015597	GCTGAG	2	12	80978	80989	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_015597	GACACC	2	12	81550	81561	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015597	CAATCT	2	12	90208	90219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334321288
32	NC_015597	TCGGTG	2	12	91619	91630	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_015597	ATGCCC	2	12	92676	92687	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	334321289
34	NC_015597	ATCGAT	2	12	97264	97275	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	334321294
35	NC_015597	GCTGGC	2	12	97503	97514	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	334321295
36	NC_015597	GCAGAT	2	12	98908	98919	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	334321295
37	NC_015597	CAGTCG	2	12	111413	111424	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015597	GGCTCT	2	12	113608	113619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321307
39	NC_015597	CGGCAG	2	12	115924	115935	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	334321310
40	NC_015597	CCGATC	2	12	119452	119463	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	334321311
41	NC_015597	CTGCCG	2	12	119626	119637	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	334321311
42	NC_015597	GATCAG	2	12	123965	123976	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	334321313
43	NC_015597	GTGACG	2	12	125965	125976	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_015597	GATCGG	2	12	136808	136819	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	334321324
45	NC_015597	CCAGCG	2	12	137582	137593	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	334321324
46	NC_015597	TCCGGG	2	12	138267	138278	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	334321325
47	NC_015597	ATGCCC	2	12	143199	143210	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	334321329
48	NC_015597	GGGCAT	2	12	146695	146706	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	334321330
49	NC_015597	GCCAAG	2	12	154571	154582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015597	AAGACG	2	12	160639	160650	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_015597	TTCGTC	2	12	162007	162018	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015597	GATGCC	2	12	162373	162384	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015597	GCGGGT	2	12	163454	163465	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	334321344
54	NC_015597	AGCTGA	2	12	165285	165296	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_015597	GGCAGC	2	12	170595	170606	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	334321350
56	NC_015597	ATCGCC	2	12	170690	170701	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	334321350
57	NC_015597	TCGCCC	2	12	176048	176059	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	334321355
58	NC_015597	CCGCTG	2	12	181517	181528	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	334321360
59	NC_015597	CGCCCA	2	12	182537	182548	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	334321361
60	NC_015597	GATCGA	2	12	188460	188471	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	334321366
61	NC_015597	GCTCGG	2	12	189350	189361	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	334321367
62	NC_015597	ATCCAG	2	12	190908	190919	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	334321368
63	NC_015597	TCGGCG	2	12	196540	196551	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	334321373
64	NC_015597	CAGGGC	2	12	212128	212139	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	334321387
65	NC_015597	AAGACG	2	12	213648	213659	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	334321389
66	NC_015597	GAGCCG	2	12	213823	213834	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015597	TATAGG	2	12	214605	214616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334321390
68	NC_015597	TTTATG	2	12	215565	215576	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	334321392
69	NC_015597	GGCCAG	2	12	218128	218139	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015597	TCTCGA	2	12	218154	218165	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015597	AGGCCG	2	12	219269	219280	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	334321400
72	NC_015597	GGCCGA	2	12	220412	220423	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	334321401
73	NC_015597	TCGCGC	2	12	223176	223187	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015597	AGCGCC	2	12	230658	230669	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	334321411
75	NC_015597	GGCACG	2	12	230945	230956	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	334321411
76	NC_015597	CAAGAT	2	12	237075	237086	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_015597	ACATCG	2	12	238002	238013	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	334321416
78	NC_015597	AGCGCC	2	12	238586	238597	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	334321416
79	NC_015597	TCGCCT	2	12	242849	242860	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	334321420
80	NC_015597	CGCCGG	2	12	247165	247176	0 %	0 %	50 %	50 %	334321425
81	NC_015597	GCAAGA	2	12	248434	248445	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	334321427
82	NC_015597	CTGGCG	2	12	255620	255631	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.