MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti AK83 plasmid pSINME01

Total Repeats: 214

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015597	GCCC	2	8	134	141	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2	NC_015597	AACG	2	8	711	718	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015597	CACC	2	8	3118	3125	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NC_015597	GCTC	2	8	3289	3296	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015597	TTGT	2	8	4728	4735	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015597	GGCC	2	8	5158	5165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015597	GTTC	2	8	6968	6975	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015597	GGCT	2	8	7170	7177	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015597	CGGC	2	8	7343	7350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015597	GTCC	2	8	8334	8341	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015597	ACGA	2	8	8622	8629	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015597	CGGG	2	8	8721	8728	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015597	TCGA	2	8	10688	10695	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015597	TGTT	2	8	11015	11022	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015597	AGGA	2	8	11273	11280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015597	TGTT	2	8	12789	12796	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015597	AAGG	2	8	12869	12876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015597	CAAT	2	8	12943	12950	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015597	ATGA	2	8	17782	17789	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015597	GACC	2	8	21949	21956	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015597	CTTC	2	8	22666	22673	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015597	AGGA	2	8	22683	22690	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015597	AGGC	2	8	22904	22911	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015597	CGGC	2	8	23114	23121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015597	ATCA	2	8	26498	26505	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015597	GACC	2	8	26544	26551	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015597	CTGA	2	8	26561	26568	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015597	GCGA	2	8	27146	27153	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015597	ATCC	2	8	27456	27463	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015597	TGAA	2	8	28321	28328	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015597	TTGT	2	8	28756	28763	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015597	GCCT	2	8	29184	29191	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015597	TCCG	2	8	29214	29221	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015597	ATGG	2	8	29812	29819	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015597	ATTG	2	8	29920	29927	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015597	GTAA	2	8	29961	29968	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015597	CGGG	2	8	33779	33786	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015597	GCGA	2	8	34510	34517	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015597	TTCC	2	8	34602	34609	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015597	TCAA	2	8	35687	35694	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015597	TGCG	2	8	36203	36210	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015597	CCGC	2	8	37019	37026	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43	NC_015597	CAAT	2	8	37648	37655	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015597	CCAT	2	8	37756	37763	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015597	CGGA	2	8	38354	38361	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015597	AGGC	2	8	38384	38391	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015597	CGCA	2	8	40041	40048	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015597	TAAG	2	8	40250	40257	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015597	TTAA	2	8	40531	40538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015597	AAGC	2	8	41022	41029	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015597	GAGC	2	8	44717	44724	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015597	CAAC	2	8	45037	45044	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015597	AATA	2	8	45045	45052	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015597	GGTG	2	8	53646	53653	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015597	GATC	2	8	57128	57135	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015597	CGAT	2	8	58046	58053	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015597	ACGG	2	8	58096	58103	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015597	GCCA	2	8	58206	58213	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015597	TGAG	2	8	58235	58242	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015597	AGAA	2	8	58500	58507	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015597	GGGT	2	8	59810	59817	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015597	TGGA	2	8	60898	60905	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015597	TGCC	2	8	61074	61081	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015597	TTGT	2	8	61205	61212	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015597	CGAT	2	8	61971	61978	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015597	GGCG	2	8	63178	63185	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015597	TGCT	2	8	63225	63232	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015597	CTTC	2	8	64811	64818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015597	GGCA	2	8	67593	67600	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_015597	GCTG	2	8	69913	69920	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015597	CTGC	2	8	76528	76535	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015597	CTTG	2	8	77701	77708	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015597	GCCG	2	8	78746	78753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015597	GTTC	2	8	78787	78794	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015597	AGTA	2	8	79723	79730	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015597	CGGC	2	8	81247	81254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015597	TCGC	2	8	81260	81267	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015597	TCGT	2	8	81370	81377	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015597	CCTT	2	8	81468	81475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015597	TCGA	2	8	81603	81610	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015597	GATC	2	8	81715	81722	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015597	TCTA	2	8	81849	81856	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015597	CCAT	2	8	82027	82034	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015597	CGGC	2	8	84175	84182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015597	AACG	2	8	84533	84540	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015597	CAAC	2	8	85566	85573	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015597	GCCA	2	8	91417	91424	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015597	CAGA	2	8	91667	91674	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015597	CCTG	2	8	91886	91893	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015597	GGAT	2	8	93569	93576	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015597	TGAG	2	8	96489	96496	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015597	GAGC	2	8	100910	100917	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015597	GGAT	2	8	103555	103562	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015597	CTGG	2	8	103967	103974	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_015597	ACCG	2	8	103996	104003	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015597	GAGC	2	8	106980	106987	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_015597	TCCG	2	8	111593	111600	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015597	CACG	2	8	111898	111905	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_015597	AGCA	2	8	112456	112463	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015597	ATGA	2	8	112551	112558	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015597	AAGC	2	8	115249	115256	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_015597	ACAG	2	8	121552	121559	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_015597	ACGG	2	8	123090	123097	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_015597	GTCA	2	8	123143	123150	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_015597	TGGC	2	8	123175	123182	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_015597	CCCG	2	8	125440	125447	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
107	NC_015597	TCGC	2	8	125491	125498	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015597	CCGT	2	8	125674	125681	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015597	CTCC	2	8	125747	125754	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
110	NC_015597	CCTG	2	8	125843	125850	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015597	AAGC	2	8	126342	126349	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015597	GTTG	2	8	126726	126733	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015597	CAAG	2	8	134217	134224	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_015597	TTGC	2	8	134228	134235	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015597	GAAC	2	8	134864	134871	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_015597	TGGG	2	8	135087	135094	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015597	GTTG	2	8	142214	142221	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015597	GCTC	2	8	144312	144319	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015597	GCCA	2	8	144567	144574	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015597	CCAT	2	8	144859	144866	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015597	CATC	2	8	145070	145077	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015597	GATG	2	8	145334	145341	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015597	ACTT	2	8	145511	145518	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015597	GCCG	2	8	147720	147727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015597	CATC	2	8	148903	148910	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015597	GCCG	2	8	149027	149034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_015597	TCGG	2	8	152773	152780	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_015597	AAGG	2	8	152781	152788	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015597	CCGG	2	8	153016	153023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015597	CGGC	2	8	154100	154107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015597	ATCC	2	8	155837	155844	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015597	CGGG	2	8	156635	156642	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
133	NC_015597	CGAT	2	8	156982	156989	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015597	ATCA	2	8	157284	157291	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_015597	GGAA	2	8	157463	157470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015597	CAAC	2	8	157990	157997	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_015597	CTGC	2	8	158514	158521	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_015597	CGTC	2	8	159625	159632	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_015597	GGCG	2	8	159972	159979	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015597	GCCG	2	8	160287	160294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_015597	CATC	2	8	160496	160503	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_015597	AAGT	2	8	160983	160990	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015597	GGCT	2	8	161233	161240	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_015597	GTAT	2	8	161524	161531	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015597	AGAA	2	8	161716	161723	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015597	GGCG	2	8	161726	161733	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
147	NC_015597	GGCG	2	8	162040	162047	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
148	NC_015597	GGCG	2	8	162088	162095	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
149	NC_015597	CGCT	2	8	162200	162207	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_015597	CCCA	2	8	162304	162311	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
151	NC_015597	ATCG	2	8	162358	162365	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_015597	GGCC	2	8	162481	162488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_015597	TTGC	2	8	164371	164378	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
154	NC_015597	GTTG	2	8	167133	167140	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015597	GAGC	2	8	168128	168135	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
156	NC_015597	GGCA	2	8	168188	168195	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
157	NC_015597	GAAT	2	8	168310	168317	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015597	GCTG	2	8	168341	168348	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
159	NC_015597	CATT	2	8	169471	169478	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
160	NC_015597	CCCT	2	8	169591	169598	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
161	NC_015597	GCTT	2	8	171869	171876	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
162	NC_015597	GTCA	2	8	172503	172510	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
163	NC_015597	GATC	2	8	173066	173073	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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165	NC_015597	TTCA	2	8	173957	173964	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
166	NC_015597	GGCG	2	8	176334	176341	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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170	NC_015597	ATGG	2	8	183191	183198	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
171	NC_015597	CATC	2	8	183251	183258	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
172	NC_015597	TGAT	2	8	183320	183327	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
173	NC_015597	CAGC	2	8	183895	183902	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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176	NC_015597	GTCG	2	8	185771	185778	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
177	NC_015597	GGCT	2	8	193254	193261	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
178	NC_015597	CGAA	2	8	193367	193374	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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181	NC_015597	CTAG	2	8	207965	207972	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
182	NC_015597	CAGG	2	8	208015	208022	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
183	NC_015597	TCGA	2	8	208240	208247	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
184	NC_015597	CGCC	2	8	210172	210179	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
185	NC_015597	GCGG	2	8	210209	210216	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
186	NC_015597	CTAT	2	8	210302	210309	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
187	NC_015597	AATG	2	8	213094	213101	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_015597	GTTG	2	8	215385	215392	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
190	NC_015597	CATC	2	8	216138	216145	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
191	NC_015597	GCCT	2	8	216257	216264	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
192	NC_015597	TCCT	2	8	217191	217198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
193	NC_015597	AGCG	2	8	217360	217367	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
194	NC_015597	GCCC	2	8	219112	219119	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
195	NC_015597	TCGG	2	8	221041	221048	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
196	NC_015597	TGCC	2	8	221475	221482	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
197	NC_015597	CTTC	2	8	221670	221677	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
198	NC_015597	CGAG	2	8	222187	222194	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
199	NC_015597	CGCA	2	8	224414	224421	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
200	NC_015597	GGAA	2	8	224431	224438	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
201	NC_015597	TCAT	2	8	225841	225848	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
202	NC_015597	GCGG	2	8	226017	226024	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
203	NC_015597	AAGC	2	8	226390	226397	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
204	NC_015597	CGAG	2	8	226429	226436	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
205	NC_015597	CCCG	2	8	228011	228018	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
206	NC_015597	TGGC	2	8	228399	228406	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
207	NC_015597	GGCC	2	8	247355	247362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
208	NC_015597	CAGG	2	8	247456	247463	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
209	NC_015597	CCCT	2	8	249728	249735	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
210	NC_015597	GCGG	2	8	249741	249748	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
211	NC_015597	GCTC	2	8	253930	253937	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
212	NC_015597	CCGA	2	8	254642	254649	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
213	NC_015597	ATCA	2	8	255043	255050	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
214	NC_015597	ACGC	2	8	255655	255662	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.