MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti AK83 plasmid pSINME01

Total Repeats: 2500

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015597	GCC	2	6	352	357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321233
2	NC_015597	TGC	2	6	360	365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321233
3	NC_015597	CCG	2	6	398	403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321233
4	NC_015597	CAA	2	6	1057	1062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334321234
5	NC_015597	GAA	2	6	1079	1084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334321234
6	NC_015597	CCA	3	9	1126	1134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334321234
7	NC_015597	CGT	2	6	1180	1185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321234
8	NC_015597	TCG	2	6	1277	1282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321235
9	NC_015597	CAG	2	6	1348	1353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321235
10	NC_015597	GAC	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321235
11	NC_015597	ATT	2	6	1667	1672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334321236
12	NC_015597	CTG	2	6	1688	1693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321236
13	NC_015597	CCG	2	6	1865	1870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321236
14	NC_015597	CGC	2	6	1925	1930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321236
15	NC_015597	GTC	2	6	1981	1986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321236
16	NC_015597	CGG	2	6	2100	2105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321236
17	NC_015597	GTT	2	6	2117	2122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334321236
18	NC_015597	GCC	2	6	2157	2162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321236
19	NC_015597	CAG	2	6	2232	2237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321236
20	NC_015597	GCA	2	6	2243	2248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321236
21	NC_015597	CCG	2	6	2394	2399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321236
22	NC_015597	TCG	2	6	2443	2448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321236
23	NC_015597	AGC	3	9	2524	2532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321236
24	NC_015597	AGC	2	6	2682	2687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321236
25	NC_015597	TCG	2	6	2697	2702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321236
26	NC_015597	CGG	2	6	2722	2727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321236
27	NC_015597	TTC	2	6	2774	2779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334321236
28	NC_015597	CCA	2	6	5294	5299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334321237
29	NC_015597	CTC	2	6	5356	5361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334321237
30	NC_015597	ATC	2	6	5404	5409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334321237
31	NC_015597	CGT	2	6	5412	5417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321237
32	NC_015597	TCG	2	6	5534	5539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321237
33	NC_015597	ACG	2	6	5540	5545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321237
34	NC_015597	AAG	2	6	5546	5551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334321237
35	NC_015597	GGC	2	6	5630	5635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321237
36	NC_015597	CGC	2	6	5733	5738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321237
37	NC_015597	TTC	2	6	5782	5787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334321237
38	NC_015597	TGC	3	9	5804	5812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321238
39	NC_015597	GAC	2	6	5932	5937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321238
40	NC_015597	AGT	2	6	5949	5954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334321238
41	NC_015597	AGC	2	6	5956	5961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321238
42	NC_015597	GCC	2	6	5996	6001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321238
43	NC_015597	GCG	2	6	6088	6093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321238
44	NC_015597	TCT	2	6	6101	6106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334321238
45	NC_015597	CCA	2	6	6165	6170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334321238
46	NC_015597	TCG	2	6	6230	6235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321238
47	NC_015597	CTT	2	6	6303	6308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334321238
48	NC_015597	AAG	2	6	6325	6330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334321238
49	NC_015597	TTC	2	6	6460	6465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334321238
50	NC_015597	ACC	2	6	6488	6493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334321238
51	NC_015597	AGC	2	6	6500	6505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321238
52	NC_015597	TTG	2	6	6516	6521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334321238
53	NC_015597	AGG	2	6	6618	6623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334321238
54	NC_015597	GCA	2	6	9098	9103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321239
55	NC_015597	CCG	3	9	9149	9157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321239
56	NC_015597	GAA	2	6	9178	9183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334321239
57	NC_015597	TGG	2	6	9240	9245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334321239
58	NC_015597	GAT	2	6	9253	9258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334321239
59	NC_015597	TTC	2	6	9282	9287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334321239
60	NC_015597	CGA	2	6	9646	9651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321239
61	NC_015597	CAA	2	6	9677	9682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334321239
62	NC_015597	TTC	2	6	9869	9874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334321239
63	NC_015597	ATA	2	6	11295	11300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334321240
64	NC_015597	TTC	2	6	11306	11311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334321240
65	NC_015597	AGG	2	6	11364	11369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334321240
66	NC_015597	TTG	2	6	11394	11399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334321240
67	NC_015597	GCT	2	6	11423	11428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321240
68	NC_015597	TGG	2	6	11448	11453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334321240
69	NC_015597	CGA	2	6	11460	11465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321240
70	NC_015597	CGG	2	6	11557	11562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321240
71	NC_015597	AAC	2	6	11737	11742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334321240
72	NC_015597	ATG	2	6	11763	11768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334321240
73	NC_015597	AGC	2	6	11775	11780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321240
74	NC_015597	TCG	2	6	11811	11816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321240
75	NC_015597	CGA	2	6	11859	11864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321240
76	NC_015597	TGC	2	6	11866	11871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321240
77	NC_015597	CAG	2	6	11930	11935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321240
78	NC_015597	CAA	2	6	11980	11985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334321240
79	NC_015597	GCC	2	6	12029	12034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321240
80	NC_015597	CAG	2	6	12054	12059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321240
81	NC_015597	GGA	2	6	12227	12232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334321240
82	NC_015597	CAA	2	6	12562	12567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334321240
83	NC_015597	GCG	2	6	12577	12582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321240
84	NC_015597	ACT	2	6	12977	12982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334321241
85	NC_015597	TTC	2	6	13021	13026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334321241
86	NC_015597	TCA	2	6	13038	13043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334321241
87	NC_015597	GCG	2	6	13051	13056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321241
88	NC_015597	CTG	2	6	13080	13085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321241
89	NC_015597	TGT	2	6	13184	13189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334321241
90	NC_015597	AAG	2	6	13294	13299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334321241
91	NC_015597	ACG	2	6	13356	13361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321241
92	NC_015597	TGA	2	6	13427	13432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334321241
93	NC_015597	GAA	2	6	13530	13535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334321241
94	NC_015597	AGT	2	6	13604	13609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334321241
95	NC_015597	CGG	2	6	13687	13692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321241
96	NC_015597	ATG	2	6	13708	13713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334321241
97	NC_015597	CTG	2	6	13891	13896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321241
98	NC_015597	CAG	2	6	14665	14670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321242
99	NC_015597	AGG	2	6	14689	14694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334321242
100	NC_015597	AAT	2	6	14722	14727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334321242
101	NC_015597	TCT	2	6	14823	14828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334321242
102	NC_015597	ATG	2	6	14922	14927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334321242
103	NC_015597	GCC	2	6	15035	15040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321242
104	NC_015597	GAA	2	6	15042	15047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334321242
105	NC_015597	GCG	3	9	16057	16065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321243
106	NC_015597	AAG	2	6	16095	16100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334321243
107	NC_015597	ACC	2	6	16127	16132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334321243
108	NC_015597	GCT	2	6	16407	16412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321243
109	NC_015597	TGC	2	6	16467	16472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321243
110	NC_015597	GCT	2	6	16493	16498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321243
111	NC_015597	GCG	2	6	16545	16550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321243
112	NC_015597	GAG	2	6	16647	16652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334321243
113	NC_015597	CTG	2	6	16674	16679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321243
114	NC_015597	GAA	2	6	16722	16727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334321243
115	NC_015597	GCC	3	9	16802	16810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321243
116	NC_015597	GTC	2	6	16962	16967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321243
117	NC_015597	TGG	2	6	16988	16993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334321243
118	NC_015597	GGC	2	6	17171	17176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321243
119	NC_015597	TCA	2	6	17230	17235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334321243
120	NC_015597	CGC	2	6	17273	17278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321243
121	NC_015597	CAA	2	6	17962	17967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334321244
122	NC_015597	CTC	2	6	18066	18071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334321244
123	NC_015597	GAA	2	6	18353	18358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334321244
124	NC_015597	GCT	2	6	18411	18416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321244
125	NC_015597	TGC	2	6	18491	18496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321244
126	NC_015597	CCG	2	6	18500	18505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321244
127	NC_015597	TCG	2	6	18631	18636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321244
128	NC_015597	TCG	2	6	18691	18696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321244
129	NC_015597	CGG	2	6	18743	18748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321244
130	NC_015597	TCG	2	6	18763	18768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321244
131	NC_015597	TCG	2	6	18871	18876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321244
132	NC_015597	CCG	2	6	19055	19060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321244
133	NC_015597	GCT	2	6	19117	19122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321244
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141	NC_015597	GCA	2	6	19594	19599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321245
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143	NC_015597	TTC	2	6	19700	19705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334321245
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239	NC_015597	TGC	2	6	32957	32962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321250
240	NC_015597	CGA	2	6	34899	34904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321251
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243	NC_015597	CGT	2	6	35065	35070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321251
244	NC_015597	CCA	2	6	35115	35120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334321251
245	NC_015597	CAT	3	9	35125	35133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334321251
246	NC_015597	GCC	2	6	35141	35146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321251
247	NC_015597	ACG	2	6	35264	35269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321251
248	NC_015597	TTC	2	6	35341	35346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334321251
249	NC_015597	AGA	2	6	38974	38979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334321252
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251	NC_015597	GGT	2	6	38992	38997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334321252
252	NC_015597	GGT	2	6	39089	39094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334321252
253	NC_015597	CAC	2	6	39098	39103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334321252
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256	NC_015597	TCA	2	6	39326	39331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334321252
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497	NC_015597	ATG	4	12	68712	68723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334321271
498	NC_015597	GCC	2	6	68744	68749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321271
499	NC_015597	GAC	2	6	68787	68792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321271
500	NC_015597	GGC	2	6	68807	68812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321271

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