MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Sinorhizobium meliloti AK83 plasmid pSINME01

Total Repeats: 436

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015597	TC	3	6	610	615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015597	GC	3	6	625	630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015597	GA	3	6	2029	2034	50 %	0 %	50 %	0 %	334321236
4	NC_015597	GA	3	6	2418	2423	50 %	0 %	50 %	0 %	334321236
5	NC_015597	GC	3	6	2747	2752	0 %	0 %	50 %	50 %	334321236
6	NC_015597	GA	3	6	2767	2772	50 %	0 %	50 %	0 %	334321236
7	NC_015597	GC	3	6	5491	5496	0 %	0 %	50 %	50 %	334321237
8	NC_015597	AG	3	6	5889	5894	50 %	0 %	50 %	0 %	334321238
9	NC_015597	TG	3	6	6275	6280	0 %	50 %	50 %	0 %	334321238
10	NC_015597	GC	3	6	9160	9165	0 %	0 %	50 %	50 %	334321239
11	NC_015597	AC	3	6	9852	9857	50 %	0 %	0 %	50 %	334321239
12	NC_015597	GC	3	6	9994	9999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015597	CG	3	6	11165	11170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015597	CT	3	6	13058	13063	0 %	50 %	0 %	50 %	334321241
15	NC_015597	GT	3	6	13934	13939	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015597	CG	3	6	14977	14982	0 %	0 %	50 %	50 %	334321242
17	NC_015597	CG	3	6	15157	15162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015597	CG	3	6	15291	15296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015597	CG	3	6	15366	15371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015597	CT	3	6	15753	15758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015597	GC	3	6	15827	15832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015597	CG	3	6	16054	16059	0 %	0 %	50 %	50 %	334321243
23	NC_015597	AT	3	6	17708	17713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015597	CG	3	6	18285	18290	0 %	0 %	50 %	50 %	334321244
25	NC_015597	GC	3	6	19094	19099	0 %	0 %	50 %	50 %	334321244
26	NC_015597	AC	3	6	19623	19628	50 %	0 %	0 %	50 %	334321245
27	NC_015597	CT	3	6	19764	19769	0 %	50 %	0 %	50 %	334321245
28	NC_015597	GA	3	6	20277	20282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015597	TC	3	6	21485	21490	0 %	50 %	0 %	50 %	334321246
30	NC_015597	GA	3	6	22705	22710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015597	GC	3	6	24278	24283	0 %	0 %	50 %	50 %	334321247
32	NC_015597	CG	3	6	25420	25425	0 %	0 %	50 %	50 %	334321247
33	NC_015597	CG	3	6	25866	25871	0 %	0 %	50 %	50 %	334321248
34	NC_015597	GC	3	6	26735	26740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015597	GC	3	6	27024	27029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015597	TC	3	6	27672	27677	0 %	50 %	0 %	50 %	334321249
37	NC_015597	CT	3	6	27827	27832	0 %	50 %	0 %	50 %	334321249
38	NC_015597	CG	3	6	28005	28010	0 %	0 %	50 %	50 %	334321249
39	NC_015597	GC	4	8	30759	30766	0 %	0 %	50 %	50 %	334321250
40	NC_015597	TC	3	6	32729	32734	0 %	50 %	0 %	50 %	334321250
41	NC_015597	GC	4	8	32746	32753	0 %	0 %	50 %	50 %	334321250
42	NC_015597	GC	3	6	33018	33023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015597	GC	3	6	33917	33922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015597	CG	3	6	34504	34509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015597	GA	3	6	35170	35175	50 %	0 %	50 %	0 %	334321251
46	NC_015597	GA	3	6	36339	36344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015597	GC	3	6	36492	36497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015597	GC	3	6	37385	37390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015597	GC	3	6	37589	37594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015597	AT	3	6	40568	40573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015597	CG	3	6	40993	40998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015597	GC	3	6	41376	41381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015597	CA	3	6	41502	41507	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015597	GC	3	6	41860	41865	0 %	0 %	50 %	50 %	334321253
55	NC_015597	GC	3	6	42222	42227	0 %	0 %	50 %	50 %	334321253
56	NC_015597	TC	3	6	42656	42661	0 %	50 %	0 %	50 %	334321254
57	NC_015597	CG	3	6	42827	42832	0 %	0 %	50 %	50 %	334321254
58	NC_015597	AT	3	6	43299	43304	50 %	50 %	0 %	0 %	334321255
59	NC_015597	CG	3	6	43468	43473	0 %	0 %	50 %	50 %	334321255
60	NC_015597	CA	3	6	43506	43511	50 %	0 %	0 %	50 %	334321255
61	NC_015597	CG	3	6	44393	44398	0 %	0 %	50 %	50 %	334321256
62	NC_015597	CG	3	6	45066	45071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015597	GC	3	6	47154	47159	0 %	0 %	50 %	50 %	334321258
64	NC_015597	GC	3	6	48235	48240	0 %	0 %	50 %	50 %	334321259
65	NC_015597	CT	3	6	49412	49417	0 %	50 %	0 %	50 %	334321259
66	NC_015597	TC	3	6	50777	50782	0 %	50 %	0 %	50 %	334321261
67	NC_015597	GC	3	6	51865	51870	0 %	0 %	50 %	50 %	334321262
68	NC_015597	CG	3	6	52327	52332	0 %	0 %	50 %	50 %	334321262
69	NC_015597	TC	4	8	53413	53420	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015597	GC	3	6	54142	54147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015597	GT	3	6	54588	54593	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015597	CA	3	6	54897	54902	50 %	0 %	0 %	50 %	334321263
73	NC_015597	GA	3	6	54961	54966	50 %	0 %	50 %	0 %	334321263
74	NC_015597	TC	3	6	54990	54995	0 %	50 %	0 %	50 %	334321263
75	NC_015597	AT	3	6	55701	55706	50 %	50 %	0 %	0 %	334321263
76	NC_015597	TG	3	6	56224	56229	0 %	50 %	50 %	0 %	334321264
77	NC_015597	GC	3	6	56241	56246	0 %	0 %	50 %	50 %	334321264
78	NC_015597	GC	3	6	56664	56669	0 %	0 %	50 %	50 %	334321264
79	NC_015597	TG	4	8	57019	57026	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015597	CG	3	6	57062	57067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015597	TC	4	8	57888	57895	0 %	50 %	0 %	50 %	334321265
82	NC_015597	GC	4	8	58428	58435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015597	CG	3	6	59311	59316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015597	GC	3	6	59571	59576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015597	GC	3	6	59678	59683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015597	TG	3	6	59701	59706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015597	GA	3	6	60016	60021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015597	CT	3	6	60210	60215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015597	CA	3	6	61014	61019	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015597	GA	3	6	61067	61072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015597	CT	3	6	61390	61395	0 %	50 %	0 %	50 %	334321266
92	NC_015597	GC	3	6	62587	62592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015597	CG	3	6	63161	63166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015597	CG	3	6	63336	63341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_015597	TG	3	6	63347	63352	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015597	CG	3	6	64158	64163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015597	CG	3	6	66122	66127	0 %	0 %	50 %	50 %	334321269
98	NC_015597	TC	3	6	66793	66798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_015597	AG	3	6	67412	67417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015597	AG	3	6	68125	68130	50 %	0 %	50 %	0 %	334321270
101	NC_015597	CG	3	6	68247	68252	0 %	0 %	50 %	50 %	334321271
102	NC_015597	GC	3	6	68837	68842	0 %	0 %	50 %	50 %	334321271
103	NC_015597	GC	3	6	68916	68921	0 %	0 %	50 %	50 %	334321271
104	NC_015597	GA	4	8	69273	69280	50 %	0 %	50 %	0 %	334321271
105	NC_015597	CG	3	6	70224	70229	0 %	0 %	50 %	50 %	334321272
106	NC_015597	GC	3	6	70316	70321	0 %	0 %	50 %	50 %	334321272
107	NC_015597	CG	3	6	71276	71281	0 %	0 %	50 %	50 %	334321273
108	NC_015597	CG	3	6	71456	71461	0 %	0 %	50 %	50 %	334321273
109	NC_015597	CG	3	6	71651	71656	0 %	0 %	50 %	50 %	334321273
110	NC_015597	GC	3	6	71884	71889	0 %	0 %	50 %	50 %	334321273
111	NC_015597	CG	3	6	71960	71965	0 %	0 %	50 %	50 %	334321273
112	NC_015597	GC	3	6	72376	72381	0 %	0 %	50 %	50 %	334321273
113	NC_015597	AT	3	6	72546	72551	50 %	50 %	0 %	0 %	334321273
114	NC_015597	CG	3	6	72575	72580	0 %	0 %	50 %	50 %	334321273
115	NC_015597	CG	3	6	72735	72740	0 %	0 %	50 %	50 %	334321274
116	NC_015597	TG	3	6	72808	72813	0 %	50 %	50 %	0 %	334321274
117	NC_015597	GC	3	6	73321	73326	0 %	0 %	50 %	50 %	334321274
118	NC_015597	CG	3	6	73402	73407	0 %	0 %	50 %	50 %	334321274
119	NC_015597	CG	3	6	73442	73447	0 %	0 %	50 %	50 %	334321274
120	NC_015597	AT	3	6	73736	73741	50 %	50 %	0 %	0 %	334321274
121	NC_015597	TG	3	6	73892	73897	0 %	50 %	50 %	0 %	334321274
122	NC_015597	CG	3	6	73998	74003	0 %	0 %	50 %	50 %	334321274
123	NC_015597	GT	3	6	74309	74314	0 %	50 %	50 %	0 %	334321275
124	NC_015597	GC	3	6	74546	74551	0 %	0 %	50 %	50 %	334321275
125	NC_015597	AG	3	6	74645	74650	50 %	0 %	50 %	0 %	334321275
126	NC_015597	GC	3	6	74804	74809	0 %	0 %	50 %	50 %	334321275
127	NC_015597	GC	3	6	75792	75797	0 %	0 %	50 %	50 %	334321277
128	NC_015597	CA	3	6	76118	76123	50 %	0 %	0 %	50 %	334321277
129	NC_015597	GC	3	6	76902	76907	0 %	0 %	50 %	50 %	334321278
130	NC_015597	GA	3	6	77082	77087	50 %	0 %	50 %	0 %	334321278
131	NC_015597	AG	3	6	77257	77262	50 %	0 %	50 %	0 %	334321278
132	NC_015597	CG	3	6	77487	77492	0 %	0 %	50 %	50 %	334321278
133	NC_015597	GC	3	6	78272	78277	0 %	0 %	50 %	50 %	334321279
134	NC_015597	CA	3	6	78717	78722	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015597	GA	3	6	79415	79420	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015597	GA	3	6	79814	79819	50 %	0 %	50 %	0 %	334321280
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138	NC_015597	GA	3	6	80829	80834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015597	GC	3	6	80930	80935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_015597	GA	4	8	82296	82303	50 %	0 %	50 %	0 %	334321281
141	NC_015597	TC	3	6	82688	82693	0 %	50 %	0 %	50 %	334321281
142	NC_015597	CA	3	6	83005	83010	50 %	0 %	0 %	50 %	334321282
143	NC_015597	TC	3	6	83508	83513	0 %	50 %	0 %	50 %	334321282
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145	NC_015597	CG	3	6	84631	84636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_015597	CG	3	6	85452	85457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_015597	AG	4	8	86084	86091	50 %	0 %	50 %	0 %	334321283
148	NC_015597	GC	3	6	86779	86784	0 %	0 %	50 %	50 %	334321283
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434	NC_015597	CA	4	8	255209	255216	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
435	NC_015597	GC	3	6	255703	255708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
436	NC_015597	GC	4	8	256106	256113	0 %	0 %	50 %	50 %	334321431

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.