MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti AK83 plasmid pSINME01

Total Repeats: 289

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015597	GA	3	6	2029	2034	50 %	0 %	50 %	0 %	334321236
2	NC_015597	GA	3	6	2418	2423	50 %	0 %	50 %	0 %	334321236
3	NC_015597	GC	3	6	2747	2752	0 %	0 %	50 %	50 %	334321236
4	NC_015597	GA	3	6	2767	2772	50 %	0 %	50 %	0 %	334321236
5	NC_015597	GC	3	6	5491	5496	0 %	0 %	50 %	50 %	334321237
6	NC_015597	AG	3	6	5889	5894	50 %	0 %	50 %	0 %	334321238
7	NC_015597	TG	3	6	6275	6280	0 %	50 %	50 %	0 %	334321238
8	NC_015597	GC	3	6	9160	9165	0 %	0 %	50 %	50 %	334321239
9	NC_015597	AC	3	6	9852	9857	50 %	0 %	0 %	50 %	334321239
10	NC_015597	CT	3	6	13058	13063	0 %	50 %	0 %	50 %	334321241
11	NC_015597	CG	3	6	14977	14982	0 %	0 %	50 %	50 %	334321242
12	NC_015597	CG	3	6	16054	16059	0 %	0 %	50 %	50 %	334321243
13	NC_015597	CG	3	6	18285	18290	0 %	0 %	50 %	50 %	334321244
14	NC_015597	GC	3	6	19094	19099	0 %	0 %	50 %	50 %	334321244
15	NC_015597	AC	3	6	19623	19628	50 %	0 %	0 %	50 %	334321245
16	NC_015597	CT	3	6	19764	19769	0 %	50 %	0 %	50 %	334321245
17	NC_015597	TC	3	6	21485	21490	0 %	50 %	0 %	50 %	334321246
18	NC_015597	GC	3	6	24278	24283	0 %	0 %	50 %	50 %	334321247
19	NC_015597	CG	3	6	25420	25425	0 %	0 %	50 %	50 %	334321247
20	NC_015597	CG	3	6	25866	25871	0 %	0 %	50 %	50 %	334321248
21	NC_015597	TC	3	6	27672	27677	0 %	50 %	0 %	50 %	334321249
22	NC_015597	CT	3	6	27827	27832	0 %	50 %	0 %	50 %	334321249
23	NC_015597	CG	3	6	28005	28010	0 %	0 %	50 %	50 %	334321249
24	NC_015597	GC	4	8	30759	30766	0 %	0 %	50 %	50 %	334321250
25	NC_015597	TC	3	6	32729	32734	0 %	50 %	0 %	50 %	334321250
26	NC_015597	GC	4	8	32746	32753	0 %	0 %	50 %	50 %	334321250
27	NC_015597	GA	3	6	35170	35175	50 %	0 %	50 %	0 %	334321251
28	NC_015597	GC	3	6	41860	41865	0 %	0 %	50 %	50 %	334321253
29	NC_015597	GC	3	6	42222	42227	0 %	0 %	50 %	50 %	334321253
30	NC_015597	TC	3	6	42656	42661	0 %	50 %	0 %	50 %	334321254
31	NC_015597	CG	3	6	42827	42832	0 %	0 %	50 %	50 %	334321254
32	NC_015597	AT	3	6	43299	43304	50 %	50 %	0 %	0 %	334321255
33	NC_015597	CG	3	6	43468	43473	0 %	0 %	50 %	50 %	334321255
34	NC_015597	CA	3	6	43506	43511	50 %	0 %	0 %	50 %	334321255
35	NC_015597	CG	3	6	44393	44398	0 %	0 %	50 %	50 %	334321256
36	NC_015597	GC	3	6	47154	47159	0 %	0 %	50 %	50 %	334321258
37	NC_015597	GC	3	6	48235	48240	0 %	0 %	50 %	50 %	334321259
38	NC_015597	CT	3	6	49412	49417	0 %	50 %	0 %	50 %	334321259
39	NC_015597	TC	3	6	50777	50782	0 %	50 %	0 %	50 %	334321261
40	NC_015597	GC	3	6	51865	51870	0 %	0 %	50 %	50 %	334321262
41	NC_015597	CG	3	6	52327	52332	0 %	0 %	50 %	50 %	334321262
42	NC_015597	CA	3	6	54897	54902	50 %	0 %	0 %	50 %	334321263
43	NC_015597	GA	3	6	54961	54966	50 %	0 %	50 %	0 %	334321263
44	NC_015597	TC	3	6	54990	54995	0 %	50 %	0 %	50 %	334321263
45	NC_015597	AT	3	6	55701	55706	50 %	50 %	0 %	0 %	334321263
46	NC_015597	TG	3	6	56224	56229	0 %	50 %	50 %	0 %	334321264
47	NC_015597	GC	3	6	56241	56246	0 %	0 %	50 %	50 %	334321264
48	NC_015597	GC	3	6	56664	56669	0 %	0 %	50 %	50 %	334321264
49	NC_015597	TC	4	8	57888	57895	0 %	50 %	0 %	50 %	334321265
50	NC_015597	CT	3	6	61390	61395	0 %	50 %	0 %	50 %	334321266
51	NC_015597	CG	3	6	66122	66127	0 %	0 %	50 %	50 %	334321269
52	NC_015597	AG	3	6	68125	68130	50 %	0 %	50 %	0 %	334321270
53	NC_015597	CG	3	6	68247	68252	0 %	0 %	50 %	50 %	334321271
54	NC_015597	GC	3	6	68837	68842	0 %	0 %	50 %	50 %	334321271
55	NC_015597	GC	3	6	68916	68921	0 %	0 %	50 %	50 %	334321271
56	NC_015597	GA	4	8	69273	69280	50 %	0 %	50 %	0 %	334321271
57	NC_015597	CG	3	6	70224	70229	0 %	0 %	50 %	50 %	334321272
58	NC_015597	GC	3	6	70316	70321	0 %	0 %	50 %	50 %	334321272
59	NC_015597	CG	3	6	71276	71281	0 %	0 %	50 %	50 %	334321273
60	NC_015597	CG	3	6	71456	71461	0 %	0 %	50 %	50 %	334321273
61	NC_015597	CG	3	6	71651	71656	0 %	0 %	50 %	50 %	334321273
62	NC_015597	GC	3	6	71884	71889	0 %	0 %	50 %	50 %	334321273
63	NC_015597	CG	3	6	71960	71965	0 %	0 %	50 %	50 %	334321273
64	NC_015597	GC	3	6	72376	72381	0 %	0 %	50 %	50 %	334321273
65	NC_015597	AT	3	6	72546	72551	50 %	50 %	0 %	0 %	334321273
66	NC_015597	CG	3	6	72575	72580	0 %	0 %	50 %	50 %	334321273
67	NC_015597	CG	3	6	72735	72740	0 %	0 %	50 %	50 %	334321274
68	NC_015597	TG	3	6	72808	72813	0 %	50 %	50 %	0 %	334321274
69	NC_015597	GC	3	6	73321	73326	0 %	0 %	50 %	50 %	334321274
70	NC_015597	CG	3	6	73402	73407	0 %	0 %	50 %	50 %	334321274
71	NC_015597	CG	3	6	73442	73447	0 %	0 %	50 %	50 %	334321274
72	NC_015597	AT	3	6	73736	73741	50 %	50 %	0 %	0 %	334321274
73	NC_015597	TG	3	6	73892	73897	0 %	50 %	50 %	0 %	334321274
74	NC_015597	CG	3	6	73998	74003	0 %	0 %	50 %	50 %	334321274
75	NC_015597	GT	3	6	74309	74314	0 %	50 %	50 %	0 %	334321275
76	NC_015597	GC	3	6	74546	74551	0 %	0 %	50 %	50 %	334321275
77	NC_015597	AG	3	6	74645	74650	50 %	0 %	50 %	0 %	334321275
78	NC_015597	GC	3	6	74804	74809	0 %	0 %	50 %	50 %	334321275
79	NC_015597	GC	3	6	75792	75797	0 %	0 %	50 %	50 %	334321277
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81	NC_015597	GC	3	6	76902	76907	0 %	0 %	50 %	50 %	334321278
82	NC_015597	GA	3	6	77082	77087	50 %	0 %	50 %	0 %	334321278
83	NC_015597	AG	3	6	77257	77262	50 %	0 %	50 %	0 %	334321278
84	NC_015597	CG	3	6	77487	77492	0 %	0 %	50 %	50 %	334321278
85	NC_015597	GC	3	6	78272	78277	0 %	0 %	50 %	50 %	334321279
86	NC_015597	GA	3	6	79814	79819	50 %	0 %	50 %	0 %	334321280
87	NC_015597	TG	3	6	80033	80038	0 %	50 %	50 %	0 %	334321280
88	NC_015597	GA	4	8	82296	82303	50 %	0 %	50 %	0 %	334321281
89	NC_015597	TC	3	6	82688	82693	0 %	50 %	0 %	50 %	334321281
90	NC_015597	CA	3	6	83005	83010	50 %	0 %	0 %	50 %	334321282
91	NC_015597	TC	3	6	83508	83513	0 %	50 %	0 %	50 %	334321282
92	NC_015597	AG	4	8	86084	86091	50 %	0 %	50 %	0 %	334321283
93	NC_015597	GC	3	6	86779	86784	0 %	0 %	50 %	50 %	334321283
94	NC_015597	CG	3	6	86898	86903	0 %	0 %	50 %	50 %	334321284
95	NC_015597	GA	3	6	88389	88394	50 %	0 %	50 %	0 %	334321286
96	NC_015597	CG	3	6	88737	88742	0 %	0 %	50 %	50 %	334321286
97	NC_015597	GC	3	6	88849	88854	0 %	0 %	50 %	50 %	334321286
98	NC_015597	AG	3	6	88964	88969	50 %	0 %	50 %	0 %	334321286
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100	NC_015597	CA	3	6	89396	89401	50 %	0 %	0 %	50 %	334321287
101	NC_015597	CG	3	6	89521	89526	0 %	0 %	50 %	50 %	334321287
102	NC_015597	GC	3	6	92662	92667	0 %	0 %	50 %	50 %	334321289
103	NC_015597	AC	3	6	93013	93018	50 %	0 %	0 %	50 %	334321289
104	NC_015597	AC	3	6	96716	96721	50 %	0 %	0 %	50 %	334321293
105	NC_015597	CG	3	6	97709	97714	0 %	0 %	50 %	50 %	334321295
106	NC_015597	GA	3	6	97787	97792	50 %	0 %	50 %	0 %	334321295
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108	NC_015597	AG	3	6	99385	99390	50 %	0 %	50 %	0 %	334321296
109	NC_015597	AG	3	6	99782	99787	50 %	0 %	50 %	0 %	334321296
110	NC_015597	CG	3	6	113573	113578	0 %	0 %	50 %	50 %	334321307
111	NC_015597	CG	3	6	113602	113607	0 %	0 %	50 %	50 %	334321307
112	NC_015597	GA	3	6	113847	113852	50 %	0 %	50 %	0 %	334321308
113	NC_015597	GC	3	6	114117	114122	0 %	0 %	50 %	50 %	334321308
114	NC_015597	TA	3	6	114246	114251	50 %	50 %	0 %	0 %	334321308
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116	NC_015597	CG	3	6	114527	114532	0 %	0 %	50 %	50 %	334321308
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122	NC_015597	AT	3	6	119259	119264	50 %	50 %	0 %	0 %	334321311
123	NC_015597	GC	4	8	119995	120002	0 %	0 %	50 %	50 %	334321311
124	NC_015597	CA	3	6	120303	120308	50 %	0 %	0 %	50 %	334321311
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128	NC_015597	AT	3	6	121626	121631	50 %	50 %	0 %	0 %	334321312
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141	NC_015597	GA	3	6	131113	131118	50 %	0 %	50 %	0 %	334321320
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.