MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti AK83 chromosome 2

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015596	CCGGCG	2	12	136699	136710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015596	CTCGAC	2	12	137855	137866	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015596	TCCCGG	2	12	138111	138122	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015596	CCGCTC	2	12	142712	142723	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_015596	TTTTGG	2	12	157445	157456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015596	GCCATC	2	12	201712	201723	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015596	AGGCGA	2	12	271501	271512	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_015596	GCTTAT	2	12	324451	324462	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_015596	GTTTCG	2	12	451563	451574	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015596	TGGGGC	2	12	468963	468974	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015596	CGAAAC	2	12	469750	469761	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015596	TGTAGA	2	12	497225	497236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015596	GAAAGG	2	12	574296	574307	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015596	CGATTG	2	12	599375	599386	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_015596	GCCTGT	2	12	632150	632161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015596	TTGCAC	2	12	639210	639221	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015596	TGAAGC	2	12	643007	643018	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015596	CGGCGC	2	12	668698	668709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015596	TTTGGG	2	12	681899	681910	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015596	GGTGCC	2	12	725699	725710	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015596	TCCGCA	2	12	727561	727572	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015596	AGCTCA	2	12	741067	741078	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015596	CCCGCG	2	12	757691	757702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_015596	CGGAAG	2	12	794044	794055	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015596	GAGATT	2	12	806335	806346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015596	AGCCAC	2	12	833881	833892	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015596	GTCTCG	2	12	834686	834697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015596	CCGCGA	2	12	842740	842751	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015596	GGAATC	2	12	848497	848508	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_015596	GCCAAT	2	12	868762	868773	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015596	CCGGGT	2	12	875259	875270	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015596	GCGCCG	2	12	884257	884268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015596	CCCGCT	2	12	927119	927130	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_015596	TGCCTG	2	12	934828	934839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015596	CCGGGA	2	12	949404	949415	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015596	GAAGCG	2	12	1095547	1095558	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015596	GATCTT	2	12	1118931	1118942	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015596	GCCTTC	2	12	1121393	1121404	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015596	GCCTCC	2	12	1223877	1223888	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_015596	TTCATT	2	12	1274903	1274914	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015596	CCTTGT	2	12	1419106	1419117	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015596	GGCAAA	2	12	1434943	1434954	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_015596	GCTGCA	2	12	1436961	1436972	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015596	GCCTTC	2	12	1437214	1437225	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015596	GGCTTC	2	12	1445793	1445804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015596	CGGCAA	2	12	1451169	1451180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015596	CAATCA	2	12	1469957	1469968	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015596	CGGCAT	2	12	1501324	1501335	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015596	TCGTCA	2	12	1505231	1505242	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015596	AGGATC	2	12	1505680	1505691	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_015596	TTGGGG	2	12	1527037	1527048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015596	ATTGCG	2	12	1545587	1545598	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_015596	TAGGGG	2	12	1568514	1568525	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015596	AGTTCA	2	12	1597771	1597782	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_015596	GCCAAA	2	12	1603971	1603982	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015596	TCACGC	2	12	1627158	1627169	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015596	GAAAGG	2	12	1655818	1655829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015596	GCGGCC	2	12	1672564	1672575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015596	CGACCG	2	12	1672758	1672769	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.