MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sinorhizobium meliloti AK83 chromosome 2

Total Repeats: 1195

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015596	ACTCC	2	10	187	196	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_015596	GCCGT	2	10	6833	6842	0 %	20 %	40 %	40 %	334319659
3	NC_015596	GAGAC	2	10	7419	7428	40 %	0 %	40 %	20 %	334319660
4	NC_015596	CACGC	2	10	10574	10583	20 %	0 %	20 %	60 %	334319662
5	NC_015596	CGCGC	2	10	11218	11227	0 %	0 %	40 %	60 %	334319663
6	NC_015596	ATCGG	2	10	12363	12372	20 %	20 %	40 %	20 %	334319663
7	NC_015596	GAAGC	2	10	14132	14141	40 %	0 %	40 %	20 %	334319664
8	NC_015596	GTCGG	2	10	14885	14894	0 %	20 %	60 %	20 %	334319665
9	NC_015596	TTTTC	2	10	15492	15501	0 %	80 %	0 %	20 %	334319665
10	NC_015596	GCGGT	2	10	17191	17200	0 %	20 %	60 %	20 %	334319667
11	NC_015596	GCCGC	2	10	17552	17561	0 %	0 %	40 %	60 %	334319667
12	NC_015596	CCGAT	2	10	17792	17801	20 %	20 %	20 %	40 %	334319667
13	NC_015596	GGCAT	2	10	19394	19403	20 %	20 %	40 %	20 %	334319669
14	NC_015596	GATCG	2	10	19588	19597	20 %	20 %	40 %	20 %	334319669
15	NC_015596	CTGCG	2	10	20626	20635	0 %	20 %	40 %	40 %	334319669
16	NC_015596	CGGCG	2	10	20638	20647	0 %	0 %	60 %	40 %	334319669
17	NC_015596	CGATT	2	10	31424	31433	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_015596	CGAGC	2	10	32399	32408	20 %	0 %	40 %	40 %	334319681
19	NC_015596	GCAGC	2	10	35086	35095	20 %	0 %	40 %	40 %	334319685
20	NC_015596	TTTCG	2	10	35724	35733	0 %	60 %	20 %	20 %	334319685
21	NC_015596	CGGCT	2	10	36173	36182	0 %	20 %	40 %	40 %	334319686
22	NC_015596	CTCAC	2	10	40423	40432	20 %	20 %	0 %	60 %	334319689
23	NC_015596	TGTCG	2	10	42691	42700	0 %	40 %	40 %	20 %	334319691
24	NC_015596	TTCCG	2	10	42725	42734	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_015596	CTGCG	2	10	44133	44142	0 %	20 %	40 %	40 %	334319692
26	NC_015596	CCGCG	2	10	44483	44492	0 %	0 %	40 %	60 %	334319693
27	NC_015596	AAACG	2	10	47269	47278	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_015596	TGTGG	2	10	47834	47843	0 %	40 %	60 %	0 %	334319696
29	NC_015596	TCGCG	2	10	48469	48478	0 %	20 %	40 %	40 %	334319697
30	NC_015596	CGCCA	2	10	50881	50890	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
31	NC_015596	GAGGC	2	10	52045	52054	20 %	0 %	60 %	20 %	334319700
32	NC_015596	CCGCG	2	10	52674	52683	0 %	0 %	40 %	60 %	334319700
33	NC_015596	CGTCG	2	10	52743	52752	0 %	20 %	40 %	40 %	334319700
34	NC_015596	GGTTG	2	10	53180	53189	0 %	40 %	60 %	0 %	334319700
35	NC_015596	ATGAG	2	10	53424	53433	40 %	20 %	40 %	0 %	334319701
36	NC_015596	CGCGC	2	10	55051	55060	0 %	0 %	40 %	60 %	334319702
37	NC_015596	CCGAG	2	10	56584	56593	20 %	0 %	40 %	40 %	334319704
38	NC_015596	GCCGT	2	10	59641	59650	0 %	20 %	40 %	40 %	334319708
39	NC_015596	TTGCG	2	10	59661	59670	0 %	40 %	40 %	20 %	334319708
40	NC_015596	GGCGG	2	10	60645	60654	0 %	0 %	80 %	20 %	334319708
41	NC_015596	GTGTC	2	10	60662	60671	0 %	40 %	40 %	20 %	334319708
42	NC_015596	TGCGC	2	10	60961	60970	0 %	20 %	40 %	40 %	334319709
43	NC_015596	GGCAG	2	10	61273	61282	20 %	0 %	60 %	20 %	334319709
44	NC_015596	CATGG	2	10	62892	62901	20 %	20 %	40 %	20 %	334319710
45	NC_015596	CCTGA	2	10	62944	62953	20 %	20 %	20 %	40 %	334319710
46	NC_015596	GAAAG	2	10	63053	63062	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015596	TCCCG	2	10	64539	64548	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
48	NC_015596	GCCGG	2	10	65294	65303	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
49	NC_015596	CTGCC	2	10	65585	65594	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
50	NC_015596	GGCAG	2	10	65596	65605	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_015596	GCTTG	2	10	69586	69595	0 %	40 %	40 %	20 %	334319716
52	NC_015596	TAGAG	2	10	70774	70783	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015596	GTCAA	2	10	70859	70868	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015596	TCGGC	2	10	70994	71003	0 %	20 %	40 %	40 %	334319717
55	NC_015596	CCGGC	2	10	71052	71061	0 %	0 %	40 %	60 %	334319717
56	NC_015596	TTTTC	2	10	72398	72407	0 %	80 %	0 %	20 %	334319718
57	NC_015596	GGCCG	2	10	75124	75133	0 %	0 %	60 %	40 %	334319722
58	NC_015596	TGTTC	2	10	76685	76694	0 %	60 %	20 %	20 %	334319724
59	NC_015596	AGGCC	2	10	85581	85590	20 %	0 %	40 %	40 %	334319730
60	NC_015596	TGCGG	2	10	85710	85719	0 %	20 %	60 %	20 %	334319731
61	NC_015596	GGAGA	2	10	86020	86029	40 %	0 %	60 %	0 %	334319732
62	NC_015596	GCCAT	2	10	87241	87250	20 %	20 %	20 %	40 %	334319734
63	NC_015596	GATGC	2	10	88216	88225	20 %	20 %	40 %	20 %	334319735
64	NC_015596	TCGAC	2	10	89489	89498	20 %	20 %	20 %	40 %	334319736
65	NC_015596	CGGCG	2	10	90085	90094	0 %	0 %	60 %	40 %	334319736
66	NC_015596	GGCTC	2	10	90728	90737	0 %	20 %	40 %	40 %	334319736
67	NC_015596	TCGAA	2	10	92169	92178	40 %	20 %	20 %	20 %	334319737
68	NC_015596	AGCCG	2	10	94236	94245	20 %	0 %	40 %	40 %	334319739
69	NC_015596	GGATC	2	10	95893	95902	20 %	20 %	40 %	20 %	334319740
70	NC_015596	TCGTC	2	10	95941	95950	0 %	40 %	20 %	40 %	334319740
71	NC_015596	TCAAT	2	10	98211	98220	40 %	40 %	0 %	20 %	334319742
72	NC_015596	AAGAC	2	10	98447	98456	60 %	0 %	20 %	20 %	334319742
73	NC_015596	GGCGC	2	10	99690	99699	0 %	0 %	60 %	40 %	334319743
74	NC_015596	AATGA	2	10	101281	101290	60 %	20 %	20 %	0 %	334319744
75	NC_015596	CGAGC	2	10	101662	101671	20 %	0 %	40 %	40 %	334319745
76	NC_015596	CGCTG	2	10	101894	101903	0 %	20 %	40 %	40 %	334319745
77	NC_015596	GCCGC	2	10	102615	102624	0 %	0 %	40 %	60 %	334319745
78	NC_015596	GAGCC	2	10	103009	103018	20 %	0 %	40 %	40 %	334319745
79	NC_015596	GCACG	2	10	103721	103730	20 %	0 %	40 %	40 %	334319746
80	NC_015596	ATCGC	2	10	104030	104039	20 %	20 %	20 %	40 %	334319747
81	NC_015596	CGCAG	2	10	105087	105096	20 %	0 %	40 %	40 %	334319748
82	NC_015596	CTCGG	2	10	106782	106791	0 %	20 %	40 %	40 %	334319749
83	NC_015596	AGCCG	2	10	107689	107698	20 %	0 %	40 %	40 %	334319750
84	NC_015596	GGGAG	2	10	114564	114573	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015596	ACGCC	2	10	114911	114920	20 %	0 %	20 %	60 %	334319758
86	NC_015596	CTCGA	2	10	116040	116049	20 %	20 %	20 %	40 %	334319759
87	NC_015596	TGTTA	2	10	119826	119835	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015596	CGGGG	2	10	120819	120828	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
89	NC_015596	GCCAC	2	10	121205	121214	20 %	0 %	20 %	60 %	334319765
90	NC_015596	CTATC	2	10	121226	121235	20 %	40 %	0 %	40 %	334319765
91	NC_015596	GGTCA	2	10	121254	121263	20 %	20 %	40 %	20 %	334319765
92	NC_015596	ATCTG	2	10	122388	122397	20 %	40 %	20 %	20 %	334319766
93	NC_015596	CGCGG	2	10	122944	122953	0 %	0 %	60 %	40 %	334319766
94	NC_015596	GCCTT	2	10	124219	124228	0 %	40 %	20 %	40 %	334319767
95	NC_015596	GCGCT	2	10	127796	127805	0 %	20 %	40 %	40 %	334319770
96	NC_015596	ATCGA	2	10	128722	128731	40 %	20 %	20 %	20 %	334319771
97	NC_015596	TCCGA	2	10	131004	131013	20 %	20 %	20 %	40 %	334319773
98	NC_015596	TTCAT	2	10	132672	132681	20 %	60 %	0 %	20 %	334319774
99	NC_015596	CGATC	2	10	132770	132779	20 %	20 %	20 %	40 %	334319775
100	NC_015596	GTGCG	2	10	133477	133486	0 %	20 %	60 %	20 %	334319775
101	NC_015596	TGGTC	2	10	133876	133885	0 %	40 %	40 %	20 %	334319775
102	NC_015596	TTCCG	2	10	133933	133942	0 %	40 %	20 %	40 %	334319775
103	NC_015596	CCGCT	2	10	134645	134654	0 %	20 %	20 %	60 %	334319775
104	NC_015596	CGGGC	2	10	135439	135448	0 %	0 %	60 %	40 %	334319775
105	NC_015596	ACGCC	2	10	138960	138969	20 %	0 %	20 %	60 %	334319777
106	NC_015596	GCGCC	2	10	141819	141828	0 %	0 %	40 %	60 %	334319779
107	NC_015596	GACAG	2	10	142591	142600	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_015596	TCGGC	2	10	147438	147447	0 %	20 %	40 %	40 %	334319785
109	NC_015596	CGAGC	2	10	150111	150120	20 %	0 %	40 %	40 %	334319786
110	NC_015596	ACTCG	2	10	151915	151924	20 %	20 %	20 %	40 %	334319788
111	NC_015596	GCAGG	2	10	152052	152061	20 %	0 %	60 %	20 %	334319788
112	NC_015596	CGGGA	2	10	153294	153303	20 %	0 %	60 %	20 %	334319788
113	NC_015596	TTCGG	2	10	153440	153449	0 %	40 %	40 %	20 %	334319788
114	NC_015596	CGATG	2	10	153673	153682	20 %	20 %	40 %	20 %	334319788
115	NC_015596	CGACC	2	10	155887	155896	20 %	0 %	20 %	60 %	334319793
116	NC_015596	AAATA	2	10	156746	156755	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015596	TTGCA	2	10	157162	157171	20 %	40 %	20 %	20 %	334319794
118	NC_015596	GCGAA	2	10	160164	160173	40 %	0 %	40 %	20 %	334319797
119	NC_015596	CAAAG	2	10	160925	160934	60 %	0 %	20 %	20 %	334319797
120	NC_015596	CTGCC	2	10	161392	161401	0 %	20 %	20 %	60 %	334319798
121	NC_015596	GGGCC	2	10	162672	162681	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
122	NC_015596	GGTCG	2	10	163252	163261	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_015596	GCACA	2	10	164160	164169	40 %	0 %	20 %	40 %	334319801
124	NC_015596	ACGGG	2	10	164322	164331	20 %	0 %	60 %	20 %	334319801
125	NC_015596	CGCGC	2	10	164666	164675	0 %	0 %	40 %	60 %	334319802
126	NC_015596	GCCGG	2	10	165303	165312	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
127	NC_015596	CACTC	2	10	165640	165649	20 %	20 %	0 %	60 %	334319803
128	NC_015596	GGAAA	2	10	165728	165737	60 %	0 %	40 %	0 %	334319803
129	NC_015596	GTGCC	2	10	167182	167191	0 %	20 %	40 %	40 %	334319804
130	NC_015596	GTCCC	2	10	170975	170984	0 %	20 %	20 %	60 %	334319807
131	NC_015596	GCGCC	2	10	174375	174384	0 %	0 %	40 %	60 %	334319811
132	NC_015596	GGAAG	2	10	175382	175391	40 %	0 %	60 %	0 %	334319812
133	NC_015596	CGGCT	2	10	175446	175455	0 %	20 %	40 %	40 %	334319812
134	NC_015596	CCGCC	2	10	175511	175520	0 %	0 %	20 %	80 %	334319812
135	NC_015596	GGCTC	2	10	177500	177509	0 %	20 %	40 %	40 %	334319814
136	NC_015596	TTTCA	2	10	180972	180981	20 %	60 %	0 %	20 %	334319816
137	NC_015596	CGATC	2	10	184468	184477	20 %	20 %	20 %	40 %	334319819
138	NC_015596	CGGCG	2	10	184658	184667	0 %	0 %	60 %	40 %	334319819
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150	NC_015596	GCGTC	2	10	202199	202208	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
151	NC_015596	GGATG	2	10	203826	203835	20 %	20 %	60 %	0 %	334319835
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175	NC_015596	GCTCT	2	10	231550	231559	0 %	40 %	20 %	40 %	334319864
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250	NC_015596	AAATT	2	10	331178	331187	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_015596	CGGCC	2	10	332021	332030	0 %	0 %	40 %	60 %	334319969
252	NC_015596	CGGCG	2	10	332496	332505	0 %	0 %	60 %	40 %	334319970
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256	NC_015596	CGATC	2	10	338552	338561	20 %	20 %	20 %	40 %	334319975
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262	NC_015596	CGACC	2	10	345385	345394	20 %	0 %	20 %	60 %	334319981
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264	NC_015596	GCGGT	2	10	349186	349195	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
265	NC_015596	TCCGG	2	10	349236	349245	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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267	NC_015596	GAGCG	2	10	349840	349849	20 %	0 %	60 %	20 %	334319985
268	NC_015596	TCGTT	2	10	350393	350402	0 %	60 %	20 %	20 %	334319986
269	NC_015596	CCGAG	2	10	353739	353748	20 %	0 %	40 %	40 %	334319988
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271	NC_015596	AGATT	2	10	354888	354897	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
272	NC_015596	GAAAT	2	10	355045	355054	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
273	NC_015596	GCACT	2	10	355182	355191	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
274	NC_015596	GGAAT	2	10	355322	355331	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
275	NC_015596	CATCG	2	10	360114	360123	20 %	20 %	20 %	40 %	334319993
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285	NC_015596	GCCCC	2	10	372003	372012	0 %	0 %	20 %	80 %	334320003
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289	NC_015596	ATCGC	2	10	376895	376904	20 %	20 %	20 %	40 %	334320007
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295	NC_015596	GAGCG	2	10	381465	381474	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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378	NC_015596	CGTGC	2	10	490421	490430	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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380	NC_015596	GCAGG	2	10	497652	497661	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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382	NC_015596	TGCCG	2	10	501317	501326	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
383	NC_015596	CGGGT	2	10	503495	503504	0 %	20 %	60 %	20 %	334320120
384	NC_015596	CTCGA	2	10	504815	504824	20 %	20 %	20 %	40 %	334320121
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386	NC_015596	CGGCG	2	10	514257	514266	0 %	0 %	60 %	40 %	334320128
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390	NC_015596	GGCGG	2	10	522258	522267	0 %	0 %	80 %	20 %	334320136
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392	NC_015596	TGCGC	2	10	526010	526019	0 %	20 %	40 %	40 %	334320139
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396	NC_015596	GATCG	2	10	533054	533063	20 %	20 %	40 %	20 %	334320146
397	NC_015596	TGTCG	2	10	534109	534118	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
398	NC_015596	GATGC	2	10	535561	535570	20 %	20 %	40 %	20 %	334320149
399	NC_015596	CGGAG	2	10	536145	536154	20 %	0 %	60 %	20 %	334320149
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440	NC_015596	GCCCT	2	10	586867	586876	0 %	20 %	20 %	60 %	334320191
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497	NC_015596	TGCGA	2	10	669909	669918	20 %	20 %	40 %	20 %	334320265
498	NC_015596	GTCGC	2	10	670104	670113	0 %	20 %	40 %	40 %	334320265
499	NC_015596	GCATG	2	10	675655	675664	20 %	20 %	40 %	20 %	334320271
500	NC_015596	GGCCG	2	10	676812	676821	0 %	0 %	60 %	40 %	334320271

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